Name: Software de Mapeamento de Parâmetros Microgliais (MMPS): Uma ferramenta de código aberto e fácil de usar para análise quantitativa de morfologia da microglia (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-07-24T12:55:00.000+00:00
Duration: 8 min 35 s
Description: Aprenda a usar o MMPS para análise quantitativa da morfologia microglial em imagens de imunofluorescência. Este software de código aberto permite análise semi-automatizada em nível de célula única sem necessidade de programação.

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<table><tbody><tr><td>12-well plate</td><td>Fisher Scientific</td><td>07-200-82</td><td>Placa usada para incubação e lavagem de secções de tecido.</td></tr><tr><td>Aluminum foil</td><td>Fisher Scientific</td><td>01-213-101</td><td>Usado para proteger amostras fluorescentes da exposição à luz.</td></tr><tr><td>Antigen Retrieval Buffer (10×)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4955-58</td><td>Usado para melhorar a acessibilidade ao antígeno durante a coloração de imunofluorescência.</td></tr><tr><td>Anti-Iba1 primary antibody</td><td>FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation</td><td>019-19741</td><td>Anticorpo primário usado para marcação imunofluorescente de microglia.</td></tr><tr><td>Cryostat</td><td>Fisher Scientific</td><td>95-710-0L</td><td>Instrumento usado para secionar tecido cerebral congelado em espessuras definidas.</td></tr><tr><td>Donkey anti-Rabbit IgG, Alexa Fluor 555</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>A-21428</td><td>Anticorpo secundário fluorescente usado para visualização de anticorpos primários de coelho.</td></tr><tr><td>Donkey Serum</td><td>Fisher Scientific</td><td>50-413-115</td><td>Reagente de bloqueio usado para reduzir a ligação não específica do anticorpo.</td></tr><tr><td>EVOS FL Auto 2 Imaging System</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMAFD2000</td><td>Microscópio de fluorescência usado para aquisição de imagens.</td></tr><tr><td>Fiji (ImageJ) 2.16.0</td><td>NIH</td><td>fiji.sc</td><td>Plataforma de processamento de imagem usada para análises morfológicas e plugins de downstream.</td></tr><tr><td>Fluoromount-G</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4959-52</td><td>Meio de montagem usado para preservar a fluorescência e fixar lamínulas.</td></tr><tr><td>Isoflurane</td><td>EntirelyPets Pharmacy</td><td>MWI502017</td><td>Anestésico inalatório usado durante procedimentos em animais.</td></tr><tr><td>Lipopolysaccharide</td><td>Millipore Sigma</td><td>L2630</td><td>Usado para induzir neuroinflamação sistémica e ativação microglial em roedores.</td></tr><tr><td>Matplotlib</td><td>https://pypi.org/project/matplotlib/</td><td></td><td>Biblioteca de plotagem Python usada para visualização de dados e geração de figuras.</td></tr><tr><td>MMPS (Mapping Microglial Parameters Software) v1.00</td><td>This work</td><td>https://github.com/NeurodegenerativePharmaceuticalLab/Mapping-Microglia-Parameters-Software/releases/tag/v1.00</td><td>Plataforma de software de código aberto desenvolvida para análise morfológica de microglia.</td></tr><tr><td>Net wells</td><td>Millipore Sigma</td><td>CLS3477</td><td>Inserções usadas para manter secções de tecido flutuantes livres durante os procedimentos de coloração.</td></tr><tr><td>Numpy</td><td>https://pypi.org/project/numpy/</td><td></td><td>Biblioteca Python usada para cálculos numéricos dentro do MMPS.</td></tr><tr><td>Objective lens (4×)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4922</td><td>Objetivo de baixa magnificação usado para orientação anatômica e identificação de região.</td></tr><tr><td>Objective lens (40×)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4625</td><td>Objetivo de alta magnificação usado para imagem da morfologia microglial.</td></tr><tr><td>opencv-python</td><td>https://pypi.org/project/opencv-python/</td><td></td><td>Biblioteca de visão computacional usada para funções de processamento de imagem dentro do MMPS.</td></tr><tr><td>Paraformaldehyde</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>169650025</td><td>Fixativo usado para perfusão e preservação de tecido antes da secagem.</td></tr><tr><td>Permount</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-100</td><td>Meio de montagem permanente usado para preservação de lâminas.</td></tr><tr><td>Phosphate-buffered saline</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP3991</td><td>Solução tampão usada para lavagem de tecido e preparação de reagentes.</td></tr><tr><td>Pillow</td><td>https://pypi.org/project/Pillow/</td><td></td><td>Biblioteca de imagem Python usada para operações de processamento de imagem.</td></tr><tr><td>PyQt5</td><td>https://pypi.org/project/PyQt5/</td><td></td><td>Framework GUI Python usado para gerar a interface gráfica do usuário do MMPS.</td></tr><tr><td>Python 3.11</td><td>Python Software Foundation</td><td>python.org</td><td>Ambiente de linguagem de programação usado para desenvolver e executar o MMPS.</td></tr><tr><td>R 4.3.2</td><td>R Foundation for Statistical Computing</td><td>r-project.org</td><td>Software estatístico usado para análise de dados e geração de gráficos.</td></tr><tr><td>Scikit-image</td><td>https://pypi.org/project/scikit-image/</td><td></td><td>Biblioteca de análise de imagem Python usada para processamento de imagem e segmentação.</td></tr><tr><td>Scipy</td><td>https://pypi.org/project/scipy/</td><td></td><td>Pacote Python de computação científica usado para filtragem e operações de processamento de imagem.</td></tr><tr><td>Sprague-Dawley Rats</td><td>Evingo</td><td>002</td><td>Animais experimentais usados para validação do modelo de neuroinflamação.</td></tr><tr><td>Sucrose</td><td>Fisher Scientific</td><td>S5-3</td><td>Crioprotector usado antes de congelar o tecido cerebral.</td></tr><tr><td>Tifffile</td><td>https://pypi.org/project/tifffile/</td><td></td><td>Pacote Python usado para ler e escrever arquivos de imagem TIFF.</td></tr><tr><td>Tissue-Tek O.C.T. Compound</td><td>Sakura Finetek</td><td>4583</td><td>Meio de incorporação usado para crioseção de amostras de tecido congelado.</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP151-100</td><td>Detergente usado para permeabilização de membranas durante a imunofluorescência.</td></tr></tbody></table>

software de mapeamento de parâmetros microgliais (mmps): uma ferramenta de código aberto e fácil de usar para análise quantitativa de morfologia da microglia

Mapping Microglial Parameters Software (MMPS): An Open-Source, User-Friendly Tool for Quantitative Microglia Morphology Analysis

Software de Mapeamento de Parâmetros Microgliais (MMPS): Uma ferramenta de código aberto e fácil de usar para análise quantitativa de morfologia da microglia

Microglia are myeloid-derived immune cells of the central nervous system that mediate tissue degradation and remodeling following neurological injury and ...

mapping-microglial-parameters-software-mmps-an-open-source-user

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Neurociência

Fonte: Etienne, F. et al. Imagem de dois fótons da atração de processos microgliais por ATP ou serotonina em fatias cerebrais agudas. J. Vis. Exp. (2019)Este vídeo demonstra o uso da microscopia de dois fótons para estudar a atração de processos microgliais em direção a um composto injetado em fatias cerebrais. Ele fornece uma visão geral da preparação de fatias de cérebro de camundongo, injeção de um composto de teste quimioatraente e imagens de microglia marcada com fluorescência para...

Microscopia de dois fótons para estudar a atração do processo microglial em direção a um composto em uma fatia de cérebro de camundongo

Uma chave para o sucesso na investigação de biologia da microglia é a preservação do immunofunction microglial ex vivo durante o isolamento a partir de tecido do SNC. Isolando microglia através de resultados de agitação rotativos em culturas de células altamente puras e imuno avaliado pela imagem fluorescente, imunocitoquímica e ELISA após a ativação da microglia com o lipopolissacarídeo estímulos pró-inflamatória (LPS) e Pam 3 CSK 4 (Pam).

Isolamento de Cortical Microglia com Imunofenótipo preservada e funcionalidades de murino Os recém-nascidos

Microglia são as células do sistema imunológico residentes do sistema nervoso central (SNC), com uma elevada capacidade de fagocitar ou engolir o material no seu ambiente extracelular. Aqui, um ensaio amplamente aplicável, confiável e altamente quantitativa para visualizar e medir engulfment mediada por microglia de componentes sinápticas é descrito.

Uma imersão Ensaio: Um protocolo para avaliar Interações entre CNS fagócitos e Neurônios

Ativação da micróglia e microgliose são respostas fundamentais para a neurodegeneração crónica. Aqui, apresentamos métodos para in vivo, visualização de longo prazo de CX3CR1-GFP + células microgliais da retina por oftalmoscopia confocal, e para limiar e análises morfométricas para identificar e quantificar a sua activação. Monitoramos alterações microgliais durante estágios iniciais de glaucoma relacionada com a idade.

In Vivo Dinâmica da Retinal microglia Ativação Durante Neurodegeneration: confocal oftalmoscópico Imagem e morfometria celular no mouse Glaucoma

Este protocolo fornece uma análise das subpopulações de macrófagos no sistema nervoso central do mouse adulto por citometria de fluxo e é útil para o estudo de marcadores múltiplos expressos por essas células.

Análise de Microglia e Macropagos derivados de Monócitos do Sistema Nervoso Central por Citometria de Fluxo

Microglia são células imunes do cérebro que pesquisa e reagem a fisiologia do cérebro alteradas através de alterações morfológicas que podem ser avaliadas quantitativamente. Este protocolo descreve um ImageJ com base em protocolo de análise para representar microglia morfologia como dados contínuos de acordo com métricas como ramificação de célula, complexidade e forma.

Quantificar a Microglia morfologia de fotomicrografias de imuno-histoquímica preparado tecido usando o ImageJ

Este protocolo descreve um fluxo de trabalho passo a passo para a costainização imunofluorescente de IBA1 e TMEM119, além da análise da densidade microglial, distribuição e morfologia, bem como infiltração periférica de células mieloides no tecido cerebral do rato.

Imunofluorescência Manchausando IBA1 e TMEM119 para densidade microglial, morfologia e análise periférica de infiltração de células mieloides no cérebro do rato

Aqui, descrevemos um protocolo combinando injeção de vírus adenoassociado com implante de janela craniana para obtenção simultânea de imagens da dinâmica microglial e atividade neuronal em camundongos acordados.

Imagem Simultânea da Dinâmica Microglial e Atividade Neuronal em Camundongos Acordados

Aqui apresentamos dois protocolos para quantificar o engolfamento microglial de sinapses positivas para vGLUT1 e sinaptossomos brutos marcados com pHRodo Red usando citometria de fluxo.

Quantificação do engolfamento microglial de material sináptico usando citometria de fluxo

Este artigo demonstra um método para visualizar e quantificar a motilidade e o contato da microglia com pontos pós-sinápticos na retina usando microscopia confocal de disco giratório.

Imagem ao vivo e caracterização da dinâmica da microglia e interações com sinapses na retina murina doente

Este protocolo combina citometria de fluxo e sequenciamento de RNA de célula única para isolar e caracterizar os estados das células microgliais no cerebelo de cérebros de camundongos pós-natais precoces. Ele usa dissociação enzimática, centrifugação de Percoll e imunocoloração para revelar a heterogeneidade da microglia e melhorar a compreensão de seus papéis no desenvolvimento e doença cerebelar.

Citometria de fluxo e análise de célula única para caracterizar a ativação da micróglia no desenvolvimento cerebral de camundongos pós-natais precoces

Aprenda a usar o MMPS para análise quantitativa da morfologia microglial em imagens de imunofluorescência. Este software de código aberto permite análise semi-automatizada em nível de célula única sem necessidade de programação.

Software de Mapeamento de Parâmetros Microgliais (MMPS): Uma ferramenta de código aberto e fácil de usar para análise quantitativa de morfologia da microglia (Vídeo) | JoVE Journal

Software de Mapeamento de Parâmetros Microgliais (MMPS): Uma ferramenta de código aberto e fácil de usar para análise quantitativa de morfologia da microglia

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