Методическая статья

Анализ фотомоторной реакции: метод измерения поведенческой реакции личинок данио-рерио на внезапное изменение условий освещения

2.7K просмотров

30 апреля 2023 г.

В этой статье

Аннотация

Источник: Steele, W. B., et al. Экспериментальный протокол для изучения профилей поведенческих реакций у личинок рыб: применение нейростимулятора кофеина. J. Vis. Exp.(2018).

Это видео описывает анализ фотомоторной реакции личинок данио-рерио и толстоголового гольяна с помощью программного обеспечения для автоматического слежения. Протокол измеряет поведенческую реакцию личинок рыб на внезапное изменение условий освещения.

Протокол

1. Калибровка параметров видеослежения

  1. Перед проведением поведенческих измерений задайте параметры наблюдения и калибровки в программном обеспечении видеотрека (см. Таблицу материалов).
    1. Поместите в камеру записи луночную пластину с не менее чем 1 личинкой рыбы в отдельной лунке. Используйте пластину и связанную с ней рыбу в качестве представлений для установки параметров калибровки.
    2. В программе для видеодорожек нажмите «Файл | Generate Protocol", которое откроет диалоговое окно "мастер создания протокола". В поле «Количество местоположений» введите количество отдельных скважин пластины скважины и нажмите «ОК».
    3. В верхней части экрана нажмите «Просмотр | Полноэкранный режим», который предложит системе отобразить вид с камеры сверху на пластину скважины.
    4. Нажмите на значок «Нарисовать области», который отображается в виде трех разноцветных фигур. Справа от области просмотра пластины скважины выберите значок круга в поле с надписью «Площади».
    5. С помощью курсора очертите круглую область видеослежения в верхнем левом углублении пластины луночного колодца. Выберите «Отметка вверху-справа», а затем обведите область просмотра верхнего правого колодца. Затем выберите "Нижняя отметка", чтобы обвести нижний правый круг><. ПРИМЕЧАНИЕ: После рисования круглого контура, скорее всего, потребуется скорректировать его положение. Чтобы настроить положение контура, нажмите "выбрать", а затем переместите очерченную область с помощью курсора. Кроме того, контуры можно повторить, нажав «Копировать», а затем «Вставить».
    6. После того, как верхние левые, верхние правые и нижние правые области слежения за скважинами будут определены, нажмите «Построить», чтобы предложить программному обеспечению автоматически разграничить области обзора оставшихся скважин.
    7. В области с надписью «Калибровка» нажмите «Нарисовать шкалу». С помощью курсора нарисуйте горизонтальную линию поперек пластины. Как только линия будет нарисована, появится диалоговое окно с надписью «Калибровочное измерение». Введите длину луночной пластины и нажмите «OK».
    8. Выйдите из диспетчера рисования, нажав на иконку «Области рисования».
    9. Нажмите на иконку "Плитки". С помощью курсора выделите все поля, которые появятся на экране просмотра, так, чтобы каждая коробка была зеленого цвета.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Значок плитки отображается в виде группы из шести отдельных маленьких квадратов
    10. «Нажмите «Просмотр»| На весь экран». Справа от области просмотра пластины нажмите "Bkg" в поле с надписью "Порог обнаружения". Используйте панель регулировки порога, чтобы установить порог обнаружения пикселей. После выбора соответствующего порога обнаружения пикселей нажмите "Применить к группе".
      ПРИМЕЧАНИЕ: Этот протокол устанавливает порог обнаружения на уровне 13 в черном режиме для наблюдений за рыбками данио и на уровне 110 в прозрачном режиме для наблюдений за толстоголовым гольяном.
    11. В поле с надписью «Порог движения» введите желаемые параметры отслеживания скорости движения. После того, как параметры скорости установлены, нажмите "Применить к группе".
      ПРИМЕЧАНИЕ: Этот протокол устанавливает маленькие/большие движения со скоростью 20 мм/с и неактивные/малые движения со скоростью 5 мм/с. Эти выборки программируют программное обеспечение для отслеживания движения личинок рыб на трех различных уровнях скорости: неактивное (замерзание) = <5 мм/с, маленькое (круизное) = 5–20 мм/с и большое (лопающееся) = >20 мм/с.
    12. Нажмите "Параметры | Параметры протокола» из выпадающего меню. В диалоговом окне выберите вкладку "Время". Введите время наблюдения и время интеграции. После ввода параметров нажмите «Ок».
    13. Чтобы установить время светлого/темного фотопериода и интенсивность света для каждого фотопериода, откройте диалоговое окно настроек драйвера света, выбрав «Легкое вождение» в выпадающем меню «Параметры».
      ПРИМЕЧАНИЕ: Смотрите видео протокола для настройки нескольких светлых и темных фотопериодов.
    14. После того, как параметры видеослежения были установлены, сохраните протокол наблюдения.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Этот протокол наблюдает за поведением рыбы в течение 50-минутного периода, который включает в себя 10-минутную фазу акклиматизации, за которой следуют 4 меняющиеся светлые и темные фазы, состоящие из двух 10-минутных светлых периодов и двух 10-минутных темных периодов. Время интеграции установлено для измерения поведения для каждой минуты 50-минутного поведенческого испытания.

2. Наблюдение за локомоторным и фотомоторным поведением личинок рыб

  1. Поместите луночную пластину с подопытными рыбами в камеру регистрации поведения.
  2. В программном обеспечении для отслеживания видео откройте протокол отслеживания, разработанный на следующем шаге.
  3. В просмотрщике видеослежения убедитесь, что все личинки видны на экране компьютера, что в каждой лунке присутствует только одна отдельная личинка, и что отдельные лунки выровнены в пределах зон наблюдения, определенных в шагах 1.1.5 и 1.1.6.
  4. Нажмите на кнопку "Экспериментировать | Выполнить".
    ПРИМЕЧАНИЕ: Система попросит пользователя указать имя и местоположение для сохранения данных наблюдения.
  5. После того, как вы указали имя и место сохранения данных наблюдения, нажмите на значок «Несколько изображений в реальном времени», чтобы выделить все предварительно определенные зоны просмотра
    ПРИМЕЧАНИЕ: Этот значок расположен в верхней части экрана компьютера и выглядит в виде поля, разделенного на четыре меньших квадрата. При нажатии на этот значок будут выделены все предопределенные области просмотра.
  6. Закройте панель камеры записи и нажмите кнопку "Фон | Пуск» на мониторе компьютера.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
48-луночные планшетыНаучный центр ФишераТел.: 08-772-52Камеры записи поведения личинок данио-рерио
24-луночные планшетыВВР10062-896 (Английский)Камеры записи поведения личинок толстоголового гольяна

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE

Запросить разрешение

Теги

Похожие статьи