Авторы не имеют конфликтов интересов, подлежащих раскрытию.

Холерный вибрион: Модель Организм по изучению бактериальных Патогенез - Интервью

Vibrio cholerae: Model Organism to Study Bacterial Pathogenesis - Interview

Я — Эс. В MindUP мы изучаем биологию патогенов человека во внешней среде. Многим патогенам человека после выхода из организма хозяина необходимо выжить в окружающей среде, прежде чем они заразят следующего хозяина. Таким образом, наша цель — лучше понять процессы, которые контролируют выживание патогенов человека во внешней среде.Наша цель — лучше понять динамику передачи инфекционных агентов. Поэтому в качестве модельного организма мы используем Vibrio cholerae, возбудителя диарейного заболевания — холеры. Vibrio cholerae является факультативным патогеном человека и имеет водный жизненный цикл.Таким образом, это дает нам отличную возможность изучить выживаемость патогена человека в естественной среде. Существует множество инструментов для изучения этого организма. Его геном полностью секвенирован, и имеются микрочипы, представляющие каждый ген в геноме.Кроме того, существует множество инструментов, позволяющих манипулировать геномом этого организма. Моя исследовательская программа использует эти инструменты и интегрирует их для изучения водного жизненного цикла холеры. Таким образом, в наших экспериментах мы стремимся имитировать водную среду, в которой живет этот организм.Далее мы хотели бы выяснить, как этот организм воспринимает колебания параметров окружающей среды, такие как содержание питательных веществ, температура, соленость или другие биологические стрессоры, например, фаги и TZO? В водной среде V. cholerae встречается либо в свободноплавающей форме, либо в форме, прикрепленной к поверхности. Формы, прикрепленные к поверхности, известны как биопленки, которые состоят из микроорганизмов и вырабатываемых ими внеклеточных полимерных веществ, таких как экзополисахариды, белки, а иногда и ДНК.Эта матрица действует как клей, удерживающий организм вместе. При росте в режиме биопленки такие организмы фактически становятся устойчивыми к колебаниям параметров окружающей среды и могут быть лучше защищены, например, от воздействия фагов и протеасом. Именно эти факторы контролируют численность микроорганизмов в окружающей среде.Некоторые из последних технологических достижений, которые помогли нам в наших исследованиях, — это завершение секвенирования генома организма и развитие технологии микрочипов. Используя эти технологии, мы можем на уровне всего генома определить, как данный организм реагирует на значительные колебания условий окружающей среды, такие как дефицит питательных веществ или изменение температуры. Кроме того, одной из наших основных целей является интеграция данных исследований экспрессии всего генома в сетевой анализ.Таким образом, мы стремимся выявить генетическую регуляторную сеть, которая контролирует ответ на колебания параметров окружающей среды. Мы хотим иметь возможность моделировать поведение организма в окружающей среде. Кроме того, нам до сих пор неизвестно, с кем именно взаимодействует Vibrio cholerae в данной среде.Мы мало знаем об экологии этого организма, а также о том, насколько гены и процессы, которые мы определили как важные для выживания этого организма в лабораторных условиях, значимы в реальном мире. Нам также неизвестно, экспрессируются ли выявленные нами гены, когда Vibrio cholera находится в естественной среде. Кроме того, мы хотели бы иметь возможность идентифицировать и культивировать организмы, с которыми взаимодействует Vibrio cholera, поскольку в окружающей среде Vibrio cholera является частью сложного микробного сообщества.Поэтому я считаю, что понимание биологии Vibrio cholerae в естественной среде будет сложной, но крайне важной задачей для нас. В ближайшие пять лет я надеюсь, что мы сможем лучше охарактеризовать компоненты экзополисахаридов биопленок. Например, в случае с Vibrio cholerae мы до сих пор не знаем структуру экзополисахарида, который удерживает клетки вместе.Мы также не знаем всех компонентов показателей биопленки. В конечном итоге, я считаю, что было бы полезно иметь возможность количественно оценить компоненты показателей биопленок этих организмов в естественных условиях. Я полагаю, что еще одной серьезной проблемой является изучение OC в естественной среде.И я надеюсь, что мы сможем воспользоваться преимуществами сравнительных геномных исследований и объединить профилирование экспрессии всего генома со сравнительной геномикой, чтобы лучше понять эволюцию холеры IBR как патогена.

Холерный вибрион: Модель Организм по изучению бактериальных Патогенез - Интервью

В этой статье

Раскрытие информации

Перепечатки и разрешения

Теги

Похожие статьи