Визуальный аналитики (VA) представляет собой новый подход анализа данных в интерактивном режиме. В этом видео, мы обсуждаем проблемы перегрузки данных вызванные высокой пропускной биологические эксперименты, и предложить В.А. в качестве решения такой проблемы. Видео показывает анализ внутри и между наборами данных иммунологических использованием В. А. инструмент под названием таблицы.
Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.
Методическая статья
Содействие Анализ иммунологических данных с визуальными Аналитические методы
В этой статье
Краткое содержание
Аннотация
Визуальный аналитики (VA) появился как новый способ анализа больших наборов данных с помощью интерактивного визуального отображения. Мы показали полезность и гибкость В. А. подход в анализе биологических данных. Примерами таких данных в иммунологии включают проточной цитометрии, Luminex данных и генотипирование (например, одиночных нуклеотидных полиморфизма) данных. В отличие от традиционного подхода визуализации информации, В. А. восстанавливает анализ власти в руках аналитика, позволяя аналитикам заниматься в режиме реального времени процесс исследования данных. Мы выбрали программное обеспечение под названием В. А. Таблицы после оценки нескольких В. А. инструментов. Два вида анализа задач анализа внутри и между наборами данных были продемонстрированы в видео-презентации с использованием подхода, называемого парного анализа. Парный анализ, как это определено в В.А., является анализ подход, при котором В. А. эксперта инструмент работает бок о бок с эксперт предметной области во время анализа. Эксперт предметной области является тот, кто понимает значение данных и задает вопросы, что собранные данные могли бы решить. Инструмент Эксперт затем создает визуализацию, чтобы помочь найти закономерности в данных, которые могли бы ответить на эти вопросы. Короткий промежуток времени между поколения гипотезы и быстрого визуального отображения данных является основным преимуществом В. А. подход.
Протокол
1. Исследование основе анализа на Tableau
- У вас есть набор данных, и вы хотите, чтобы изучить различные отношения между столбцами в данных.
- (Рис. 1) Импорт данных, нажав на "Подключение к данным". Выберите тип источника данных и следуйте инструкциям, чтобы импортировать набор данных.
- (Рис. 1) Убедитесь, что размеры полки содержит категорический столбцов в то время как меры шельфе содержит числовые столбцы из набора данных. Иногда столбец измерения, например, тема идентификатор может быть указан как меру, если она пронумерованы. Замените ее на размеры, щелкнув правой кнопкой мыши и выберите "Преобразовать в измерении". На рисунке 1, катег....
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Обсуждение
Появление высокопроизводительных технологий в современных биомедицинских исследований привели к взрыву данные исследования, которое требует более эффективный способ анализа. Визуальный аналитики (VA) это наука о аналитического мышления способствует интерактивных визуальных интерфейсов (1). В. А. подход восстанавливает аналитического власть в руках человека аналитик, в отличие от традиционного подхода для выявления шаблонов с помощью компьютера. Визуальный аналитики был применен к исследованиям в различных областях, таки.......
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Раскрытие информации
Нет конфликта интересов объявлены.
Благодарности
Мы хотели бы поблагодарить членов Ванкувере Институт визуальных Analytics (VIVA) для предоставления замечаний и советов для проекта. В частности, мы хотели бы поблагодарить Джона Укроп, Брайан Фишер, и Дэвид Дарвилл. Мы также хотели бы поблагодарить членов Кольман лаборатории за поддержку и полезные обсуждения. Эта работа была выполнена при частичной поддержке Национального института аллергии и инфекционных заболеваний, Национальный институт здравоохранения грант N01 AI50023; аллергена NCE гранты 07-A1A и 07-B2B, а также Майкл Смит фонда исследований в области здравоохранения. ТРК поддерживается частично Карьера премии в области биомедицинских наук в объявлении Burro....
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Ссылки
- Thomas, J., Cook, K. Illuminating the Path: The Research and Development Agenda for Visual Analytics. , IEEE CS Press. (2005).
- Steed, C., Swan, J., Jankun-Kelly, T., Fitzpatrick, P. Guided Analysis of Hurricane Trends Using Statistical Processes Integrated with Interactive Parallel Coordinates. IEEE Symposium on Visual Analytics Science and Technology. , IEEE. Atlantic City. 19-26 (2009).
- Saraiya, P., North, C., Lam, V., Duca, K.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Перепечатки и разрешения
