Анализ функций малого ГТФаз по микроинъекции Плазмиды в поляризованных эпителиальных клеток

Краткое содержание

Эта статья подробно описывает процедуры, связанные с гиперэкспрессией и анализа малых ГТФаз в поляризованных эпителиальных клеток с помощью микроинъекции техники.

Аннотация

Эпителиальные клетки поляризуют свою плазматическую мембрану на биохимически и функционально различные апикальный и базолатеральный домены, где апикальный домен обращен к «свободным» поверхностям, а базолатеральная мембрана контактирует с субстратом и соседними клетками. Оба мембранных домена разделены плотными контактами, которые образуют диффузионный барьер. Апико-базолатеральная поляризация может быть успешно воспроизведена в культуре, если эпителиальные клетки, такие как клетки почек собаки линии Madin-Darby (MDCK), высевают с высокой плотностью на поликарбонатные фильтры и культивируют в течение нескольких дней ^{1 2}. Установление и поддержание полярности клеток регулируется набором малых ГТФаз семейства Ras, таких как RalA, Cdc42, Rab8, Rab10 и Rab13 ^{3 4 5 6 7}. Как и все ГТФазы, эти белки циклически переходят из неактивного состояния, связанного с GDP, в активное состояние, связанное с GTP. Специфические мутации в областях связывания нуклеотидов препятствуют этому циклу ⁸. Например, Rab13T22N permanently заблокирован в GDP-форме и поэтому называется «доминантно-негативным», в то время как Rab13Q67L больше не может гидролизовать GTP и таким образом заблокирован в «доминантно-активном» состоянии ⁷. Чтобы проанализировать их функцию в клетках, доминантно-негативные и доминантно-активные аллели ГТФаз обычно экспрессируют на высоком уровне, чтобы вмешаться в функцию эндогенных белков ⁹. Элегантным способом достижения высокого уровня сверхэкспрессии за короткий промежуток времени является введение плазмид, кодирующих соответствующие белки, непосредственно в ядра поляризованных клеток, выращенных на фильтрующих подложках, с использованием метода микроинъекций. Это часто сочетают с ко-инъекцией репортерных плазмид, кодирующих рецепторы плазматической мембраны, которые специфически сортируются в апикальный или базолатеральный домен. Грузом, часто используемым для анализа сортировки в базолатеральный домен, является температурно-чувствительный аллель гликопротеина вируса везикулярного стоматита (VSVGts045) ¹⁰. Этот белок не может правильно свернуться при 39°C и, следовательно, задерживается в эндоплазматическом ретикулуме (ЭР), пока в цитозоле собирается интересующий регуляторный белок. Переход к 31°C затем позволяет VSVGts045 правильно свернуться, покинуть ЭР и переместиться к плазматической мембране ¹¹. Этот этап вымывания («чейз») обычно проводят в присутствии циклогексимида, чтобы предотвратить дальнейший синтез белка, что позволяет получить более чистые результаты. Здесь мы подробно описываем процедуру микроинъекции плазмид в поляризованные клетки и последующие инкубации, включая температурные сдвиги, которые позволяют провести комплексный анализ регуляторных белков, участвующих в базолатеральной сортировке.

Протокол

1. Выделение плазмидной ДНК

1. Используйте Sigma-Aldrich эндотоксина бесплатный комплект maxiprep подготовить эндотоксина свободной ДНК в соответствии с протоколом производителя. Этот комплект работает на нас, потому что она надежно удаляет любые эндотоксинов из препаратов ДНК. Эндотоксины, которые вводили ДНК в ядрах клеток приводит к гибели клеток.
2. Добавить 100 мкл фенола / chlorofom / изоамилового спирта (25:24:1), чтобы выделенной ДНК, вихревые и спина в течение 1 мин при 13000 оборотов в минуту в микроцентрифужных Эппендорф. Передача верхней фазы воды в новую пробирку и добавить 100 мкл хлороформа / изоамилового спирта (24:1), вихревые и спин, что и выше. Передача верхней фазе воды, содержащие ДНК, чтобы новые трубы. Этот шаг необходим для удаления белка из ДНК, которая предотвращает засорение микроинъекции иглы.
3. Осадок ДНК, добавив Na ацетат (рН 6,0) до конечной концентрации 300 мМ и 2 х т. 100% этанола. Инкубировать при температуре -20 ° С в течение ночи. Спиновые ДНК в течение 20 мин при 13000 оборотов в минуту в микроцентрифужных Эппендорф, мыть один раз с 70% этанола, и ресуспендируют в 300 мкл эндотоксина без воды (Sigma-Aldrich).
4. Определение концентрации ДНК. Типичная концентрация ДНК составляет от 1 до 5 мкг / мкл.

2. Культура MDCK клетках

1. Сплит MDCK клеток. Граф клеток и семян 4 х 10 ⁵ клеток на ясно 12-мм фильтры Transwell (0,4 мкм, размер пор, Corning Costar, 3460). Для эксперимента содержащие макет инъекции управления и двух различных мутантных белков Раб нужно семян трех фильтров.
2. Культуры MDCK клеток в среде MEM с 2 мМ L-глутамина, 0,1 мг / мл пенициллина / стрептомицина и 7% (об / об) эмбриональной телячьей сыворотки (= СМИ MEM роста) при 37 ° С и 5% СО _2.
3. Изменение информации в базолатеральной камеру каждый день. Это способствует поляризации процесс, так как он имитирует ситуацию эпителиальных клеток у животных.
4. 2-х дней после посева проверки в микроскоп ли клетки растут в закрытой монослоя. Если вы не можете обнаружения возможных дыр в монослой, выполнить свой эксперимент на 3 день. Если Есть еще дыры, выполнить свой эксперимент на 4-й день.

3. Процедура Микроинъекция и после инъекции Инкубации

1. В день эксперимента подготовить 5 мл MEM питательной среды плюс 50 мМ HEPES в одном 60 х 15 мм пластины для каждого фильтра и поместить в 39 ° C инкубатора. Кроме того, создать одну лунку 12-луночного планшета с 1 мл MEM питательной среды плюс 50 мМ HEPES и 0,1 мг / мл циклогексимид в фильтр, и поместите в 31 ° C инкубатора.
2. Включите микроинъекции микроскопа и установить его нагревают этапе до 39 ° C. Мы используем инвертированного микроскопа (Axiovert 200, объективом Carl Zeiss MicroImaging, Inc) с подогревом этапе, 10X и 32X цели и Эппендорф Femtojet (Injectman Ni2). И наконец, открыть резервуар азота, которая поставляет воздух стол с азотом.
3. Развести ДНК с фильтрованной водой (используйте фильтр 0,2 мкм) до конечной концентрации 0,2 мг / мл в общем объеме 10 - 100 мкл. Впоследствии, спина ДНК в микроцентрифужных Эппендорф при 13000 оборотов в минуту в течение 30 мин. Снимите верхнюю часть и место в новой трубки. Этот шаг гарантирует, что при загрузке вашего разбавленный ДНК в микроинъекции иглы вы можете точно нагрузки "чистым" ДНК. Ваша ДНК готов к микроинъекции.
4. Подготовка клетки, взяв первый из фильтра его культуры блюдо. При хирургическом лезвия (перо Хирургическое Blade, нержавеющая сталь, № 11), вырезать фильтр из держателя фильтра и поместить в 5 мл, 39 ° С теплыми питательной среды MEM плюс 50 мМ HEPES (60 х 15 мм пластины). Взвесьте вниз фильтра в культуре пластину с лезвием хирургического вы использовали для резки его. Поставьте его на фильтр так, что отверстие хирургические лезвия окружает середине фильтра. Наведите культуры пластины на нагревательный столик микроскопа.
5. Нагрузка 2-3 мкл разбавленного вашей ДНК (в данном случае кодирования плазмид VSVGts045-GFP = макет контроль инъекций) в микроинъекции иглы (Femtotip II, Эппендорф, 930000043), твист защитную крышку иглы и дать ему упасть на пол . Теперь игла готова быть пьяным в держатель. Для этого нажмите клавишу меню вашего injectman и убедитесь, что клапан закрыт. Винт иглу в держатель, будьте осторожны, чтобы не винт в иглу слишком сильно, поскольку это может привести к поломке. Теперь, нажмите клавишу меню снова, применяемые Р _С предотвратит СМИ от того, всасывается в иглу во время процедуры microinjeciton. Наконец, нажмите джойстик, чтобы стереть хранится самонаведения.
6. Чтобы опустить иглу на клетки, используйте 10X цель и принести иглу в луч света над жидкостью. Теперь акцент на клетки, довести фокус снова, повернув колесо фокус 180 ° вверх, и найти иголку. Впоследствии, медленно перемещайте иглы в центр внимания, а затем привести в фокусе снова (рабочие по приведению клетки в центре внимания снова), сбить иглу длякли снова. Повторяйте, пока игла не коснется поверхности средствах массовой информации, и в этот момент все, что вы увидите, это гало. Когда вы дойдете до точки, в которой клетки находятся в центре внимания, но иглы все еще нечеткое (то есть из фокальной плоскости) изменение целей 32X и тонкой грубой настройки.
7. Установите Z-лимит, касаясь апикальной мембраны с кончиком иглы и вычитая около 10 мкм, как ядер закладываем около 10 мкм под апикальной мембраны.
8. После установки Z-предел, найти правильное давление впрыска. Начало в 95 PSI. Если давление слишком высокое, ваши клетки взорвется. Если давление слишком низкое, то вы увидите белую точку, которая остается, но ничего не происходит. При успешной инъекции, вы увидите изменения фазы без изменения размера ячейки. Для инъекций, принесите иглу пару микрон из фокальной плоскости как можно быстрее. Цель с иглой над ядром (т.е. середина отдельной клетки) и нажмите инъекции клавишу джойстика, но не удерживайте кнопку нажатой.
9. Inject 100-500 клеток в отверстие вашего хирургического лезвия, которая лежит на ваших клеток. Когда вы закончите, поместите клеток с блюдом культуры и хирургические лезвия в 39 ° C инкубатор, и инкубировать в течение 2 ч. За это время VSVGts045-GFP выражается и выделяются в ER. Тем не менее, на 39 ° C, VSVGts045-GFP не раз правильно и, следовательно, не могут оставлять ER. Между тем, небольшие ГТФ интерес будет накапливаться в цитозоле в сотрудничестве инъекции экспериментов.
10. Через 2 ч, разместить клеток в 1 мл MEM питательной среды плюс 50 мМ HEPES и 0,1 мг / мл циклогексимид в 12-луночного планшета и инкубировать в течение 2 ч при 31 ° C. За это время погони, VSVGts045-GFP сбросят правильно, оставьте ER и поставляется на поверхности клетки.
11. Повторите шаги с 3,1 - 3,10 для фильтров два (плазмиды вводить кодировку VSVGts045-GFP и, например, V5 с метками Rab13T22N) и три (вводят плазмиды кодирования VSVGts045-GFP и, например, V5 с метками Rab13Q67L). Каждая инъекция займет около 20 - 60 мин. Тем не менее, она имеет решающее значение для лечения каждого фильтра так же всей температурный сдвиг инкубации и поверхностные окрашивания до устранения клеток. После фиксации, вы можете выполнять всю оставшуюся окрашивание протокола для всех фильтров в то же время.

4. Поверхностное окрашивание для иммунофлуоресценции анализа

Обратите внимание, во избежание отбеливания GFP сигнал VSVGts045-GFP, защищают образцы от света, покрывая с алюминиевой фольгой в течение всех последующих процедур.

1. Если вы хотите выполнить окрашивание поверхности, поместите клеток в культуре блюдо на металлическую пластину на льду и мыть клетки 1X с ледяным PBS ^{2 +} (PBS [0,2 г / л KCl, 0,2 г / л KH ₂ PO _4, 8 г / л NaCl и 2,17 г / л Na ₂ HPO ₄ х 7 H ₂ O] плюс 0,1 г / л CaCl ₂ и 0,1 г / л MgCl ₂ х 6 H ₂ O). Впоследствии, место 30 мкл антител, которая признает эктодомена вашего белка, в данном случае мышиных моноклональных антител TK1 (IgG _1, полученные с конца Томас Kreis), на чистую парафильмом размещены на металлическую пластину на льду. Место фильтр с вашим клеткам с ног на голову на капли и добавить несколько капель антител на обратной стороне фильтра. Инкубируйте в течение 1 часа на льду.
2. Место клеток в 12-луночного планшета, мыть 3X с ледяным PBS ^{2 +} (или RT теплой PBS ^{2 +} без предварительного окрашивания поверхности), и исправить с 3% параформальдегида в течение 15 мин при комнатной температуре.
3. Вымойте клетки сразу с PBS ^{2 +} и оставить в PBS ^{2 +} в течение 5 мин.
4. Инкубируйте клетки в блокировании / пермеабилизации буфера (BPB) (2% [вес / объем] БСА, 0,4% [вес / объем] сапонина в PBS ^{2 +)} с 10% [об / об] козу сыворотки. Инкубируйте 1 час при комнатной температуре.
5. Развести первичных антител для обнаружения выразил Раб ГТФ, в этом примере анти-V5 (мышиное моноклональное антитело IgG _2а, Invitrogen), 1:200 в BPB. Спиновые разбавленного антитела в микроцентрифужных Эппендорф в течение 10 мин при 13000 оборотах в минуту. Место 30 мкл раствора антител на чистую парафильмом помещен в мокрой камеры. Место клеток на фильтре с ног на голову на антитела падение и инкубировать в течение 1 часа при комнатной температуре.
6. Место клетки обратно (правой стороной вверх) в 12-луночного планшета и промыть 5 раз в течение 30 минут с BPB при комнатной температуре.
7. Развести соответствующие вторичные антитела, в данном случае антимышиного IgG ₁ Alexa 594-меченых (для VSVG обнаружения на поверхности, Invitrogen), и Cy5 меченых вторичных антител для распознавания вашего Раб ГТФ, в этом примере антимышиного IgG _2а Cy5 меченных (Jackson ImmunoResearch), 1:200 в BPB и спин, что и выше. Место 30 мкл раствора антител на чистую парафильмом в мокрую камеру и поместить клетки на фильтр вверх дном на антитела капли. Инкубируйте 1 час при комнатной температуре.
8. Повторите шаг 4.6.
9. Dip клеток на фильтре 3X в деионизированной воды и место тIGHT стороной вверх на microslides. Добавить 10-15 мкл горы (10% [вес / объем] DABCO, 50% [вес / объем] глицерина в дистиллированной воде) в верхней части клетки. Место 18x18 мм микро покровного стекла на вершине и использованием тканей лица слегка нажмите на микро стеклянной крышкой на клетки. Печать с лаком для ногтей.
10. Анализ образцов с конфокальной микроскопии. Мы использовали микросистемная LSM 510, объективом Carl Zeiss MicroImaging, Inc, которая была оснащена 63x объектив погружением в воду.
11. Для подготовки цифры, настраивать и комбинировать изображения с помощью таких программ, как Adobe Photoshop и Adobe Illustrator.

5. Представитель Результаты

Примеры того, как коэкспрессией малого ГТФаз мешает VSVG сортировки просьба ссылаться на опубликованные статьи или для апикальной missorting ^{3, 4} или ингибирование поверхности доставки ^7.

Рисунок 1. В макете инъекции, то есть введение только плазмиды, кодирующей VSVGts045-GFP, белка доставляется базолатеральной поверхности хорошо поляризованного MDCK клетках можно судить по поверхности окраски (красные, Рисунок 1). Обратите внимание, что не все VSVGts045-GFP доставляется базолатеральной мембраны во время погони на 31 ° C, о чем свидетельствует обширная внутриклеточный сигнал для общего белка (в зеленом, рисунках 1 и В). В клетках, которые не так-поляризованного VSVGts045-GFP будет поставляться также на апикальной мембране (рис. 1 б). Если ваши образцы контроль выглядеть ячейки на рисунке 1 В, вы не можете доверять свои данные и придется повторить эксперимент с более-поляризованных клеток. Шкала баров 5 мкм.

Обсуждение

Наиболее важных шагов для успешного эксперимента микроинъекции являются качество и чистоту ДНК и полярность ваших клеток. Без поляризованных клеток, инъекции ваш контроль будет уже mistargeted VSVG и эксперимент не может быть использован. Если ДНК имеет низкое качество, ДНК может засорить инъекционной иглой, ведущих к бедным или нет выражение нужный белок вообще. Кроме того, желательно, по выражению плазмиды, которые, как известно, приводит к высокому уровню выражения, такие как pRKV.

Если в...

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье

Имя	Компания	Каталожный номер	Комментарии
Название реагента	Компания	Номер в каталоге
Axiovert 200 Микроскоп с подогревом этапе	Carl Zeiss Inc	Индивидуальный заказ
Injectman Ni2 Femtojet микроманипулятора	Эппендорф	Индивидуальный заказ
Femtotips II (Микроинъекция иглы)	Эппендорф	930000043
Microloader советы	Эппендорф	930001007
Открытый 12-мм transwell фильтр поддерживает	Corning Costar	3460
Эндотоксина без плазмиды комплект maxiprep	Sigma-Aldrich	NA0400