Октябрьский выпуск журнала "Journal of Visualized Experiments" (JoVE) за 2011 год представляет первую попытку журнала исследовать океанографическую физику и инженерию. Исследователи из Океанографического института Вудс-Хоул демонстрируют использование автономного подводного велосиметрического аппарата, или SCUVA. Основными компонентами этого инструмента являются HD-камера и лазер, который при совмещении с оптической линзой создает вертикальный слой света. После выравнивания и тестирования водонепроницаемого уплотнения эти исследователи ищут обитателей водной толщи для анализа. Необходимы ночные эксперименты, чтобы естественный свет не мешал лазерному листу. SCUVA специально разработан для улавливания движения частиц в воде, чтобы можно было определить поля скоростей - векторное поле, описывающее движение жидкости - вокруг организма в его естественной среде.
В клинической и трансляционной медицине исследователи ортодонтии из Университета Граца определяют состав биопленок полости рта - совокупности микроорганизмов, адгезивных к поверхности - которые образуются на небных экспандерах их пациентов. Эти авторы используют флуоресцентную гибридизацию in situ в сочетании с конфокальной микроскопией для обнаружения специфических бактерий в биопленке, а также для визуализации ее трехмерной структуры.
JoVE также посещает Грац для изучения иммунологии и инфекций, где исследователи из Университета Граца и Технологического института Граца используют просвечивающую электронную микроскопию, или TEM, для анализа ультраструктурных изменений, происходящих в листьях растений в результате вирусной инфекции. Небольшие участки листьев срезаются с растения и подвергаются процедуре фиксации с помощью микроволновой печи, что значительно сокращает время подготовки образца для ПЭМ. После встраивания и среза образцы загружаются в электронный микроскоп и визуализируются. С помощью программного обеспечения для анализа изображений эти авторы могут рассчитать размеры вирусных частиц, а также оценить ультраструктурные изменения в листе растения, что имеет решающее значение для идентификации вируса-заразителя.
В журнале "Нейронаука" исследователи из Калифорнийского университета в Ирвайне представляют серию поведенческих парадигм, направленных на измерение степени когнитивных нарушений у грызунов, получавших черепную лучевую терапию. Эти авторы демонстрируют новую задачу на распознавание места (для пространственной памяти), задачу на возвышение плюс лабиринт (для измерения тревоги), задачу на обусловливание страха (обучение и память) и водный лабиринт Морриса (для пространственного обучения). Когнитивные дефициты у грызунов напоминают те, которые проявляются у выживших после черепной лучевой терапии, и поэтому стандартизация таких когнитивно-поведенческих парадигм имеет решающее значение для оценки терапии. Одной из потенциальных терапий является трансплантация стволовых клеток в гиппокамп, которую авторы демонстрируют в отдельной видеостатье в октябре.
На тему стволовых клеток, исследователи из Калифорнийского университета в Риверсайде демонстрируют методы генетической манипуляции с индуцированными плюрипотентными стволовыми клетками человека. Индуцированные плуорипотентные стволовые клетки, IPSC, могут быть получены из соматических клеток, таких как фибробласты, которые вы видите здесь, после принудительной экспрессии определенных транскрипционных факторов, которые заставляют клетки трансформироваться в плюрипотентное состояние. Эти авторы показывают, как iPSCs могут быть культивированы в условиях без фидеров, и дают полезные советы по подъему и посеву клеток в концентрациях, оптимальных для трансфекции и нуклеофекции
В дополнение к этим публикациям, JoVE представляет методы проведения физиологических измерений у людей с психосоциальным стрессом, отслеживание лизиса бактерий после заражения фагами, визуализацию в обонятельной луковице через краниальное окно и десятки других видео-статей о сложных методах.