1. Культивирование клеток
- Подготовка облученных фидерных клеток SNL76/7 (irSNL76/7) для культивирования.
Клетки SNL76/7 обычно поддерживают в среде DMEM (модифицированная среда Игла в модификации Дульбекко) с добавлением 10% эмбриональной бычьей сыворотки (FBS).
- Чашку или флакон для культивирования покрывают 0,1% раствором желатина при 37 °C в инкубаторе в течение 30 минут перед извлечением клеток SNL76/7 из жидкого азота.
- При достижении клетками SNL76/7 конфлюэнтности их отделяют трипсинизацией, центрифугируют при 400 g в течение 5 мин и ресуспендируют в свежей среде.
- Ресуспендированные клетки SNL76/7 облучают в 60Co-ирадиаторе с дозой 5000 Rads.
В качестве альтернативного подхода клетки SNL76/7 можно заменить эмбриональными фибробластами мыши (MEF), а облучение — инактивацией митомицином.
- После облучения клетки центрифугируют при 400 g в течение 5 мин, ресуспендируют в буфере для замораживания, состоящем из FBS и 10% диметилсульфоксида (DMSO), раздают по криопробиркам и хранят в жидком азоте для дальнейшего использования.
- Подготовка клеток OP9-DL1 для дифференцировки in vitro.
Клетки OP9-DL1 обычно поддерживают в среде α-MEM (минимальная эссенциальная среда α) с добавлением 20% FBS. При достижении конфлюэнтности клетки пересевают в разведении 1:5.
- Подготовка клеток тимомы E.G7.
Клетки тимомы E.G7 обычно поддерживают в среде RPMI-1640 (среда Института памяти Розуэлла Парка) с добавлением 10% FBS. При достижении конфлюэнтности клетки пересевают в разведении 1:10.
- Общее содержание и поддержка иПСК и TCR-трансдуцированных иПСК.
- Чашку для культивирования покрывают 0,1% раствором желатина при 37 °C в течение 30 минут перед высевом фидерных клеток irSNL76/7, который проводят за один день до размораживания или пересева иПСК.
- Для пересева иПСК клетки отделяют трипсинизацией, центрифугируют при 400 g в течение 5 мин и ресуспендируют в среде DMEM с 15% FBS.
- Трипсинизированные иПСК инкубируют в новой чашке для культивирования в течение 30 минут в инкубаторе при 37 °C перед высевом на свежую предварительно покрытую фидерными клетками irSNL76/7 чашку, чтобы исключить дифференцированные клетки и остатки фидерных клеток.
- После инкубации 4×106 клеток высевают в чашку для культивирования диаметром 100 мм.
2. Программирование in vitro
- Система совместного культивирования in vitro.
- В день 0 5x104 иПСК высевают в чашку для культивирования 100 мм, содержащую конфлюэнтный монослой клеток OP9-DL1 в среде α-MEM с 20% FBS.
- На 3-й день культуральную среду заменяют свежей.
-
- На 5-й день клетки снимают с поверхности трипсинизацией и центрифугируют при 400 g в течение 5 мин, после чего инкубируют в свежей чашке для культивирования 100 мм в течение 30 минут в инкубаторе при 37 °C.
- Собрали и подсчитали плавающие клетки; 5x105 клеток переносят в свежую чашку для культивирования, содержащую конфлюэнтный монослой клеток OP9-DL1 в среде α-MEM с 20% FBS. В культуру добавляют цитокин mFlt-3L (конечная концентрация: 5 ng/mL).
-
- На 8-й день слабо прикрепившиеся клетки осторожно снимают с поверхности с помощью пипетки.
- Слой-фидер OP9-DL1 промывают 10 mL PBS еще раз для максимального извлечения частично дифференцированных иПСК.
- После сбора клеток из совместной культуры их центрифугируют при 400 g в течение 5 мин и ресуспендируют в среде α-MEM с 20% FBS, дополненной mFlt-3L (5 ng/mL) и mIL-7 (1 ng/mL).
- Клетки переносят в 6-луночный планшет для культивирования, покрытый конфлюэнтными клетками OP9-DL1. Обычно иПСК, полученные из одной чашки 100 мм, переносят в одну лунку 6-луночного планшета.
-
- Начиная с 10-го дня, культуральную среду заменяют через день (среда α-MEM с 20% FBS, дополненная mFlt-3L (5 ng/mL) и mIL-7 (1 ng/mL)).
- Планшеты для культивирования, покрытые фидерными клетками OP9-DL1, меняют каждые 4-6 дней в зависимости от роста фидерных клеток.
- Созревание частично дифференцированных иПСК in vivo.
- На 22-й день совместного культивирования иПСК снимают трипсинизацией, центрифугируют при 400 g в течение 5 мин и инкубируют в свежей чашке для культивирования при 37 °C в течение 30 минут.
- Собрали плавающие клетки, пропустили их через нейлоновый фильтр 70 μm для удаления клеточных агрегатов, которые могут вызвать тромбоэмболию легочной артерии у мышей, и трижды промыли в холодном PBS.
- Клетки ресуспендируют в PBS до концентрации 1.5x107 клеток/mL.
- Клетки хранят на льду до момента инъекции.
- Перед внутривенной (i.v.) инъекцией в хвостовую вену мышей помещают под инфракрасную лампу для расширения хвостовой вены.
- После расширения вены 200 μl клеточной суспензии или 3x106 клеток адаптивно переносят в хвостовую вену 4-недельной мыши линии B6.129S7-Rag1tm1Mom/J. Для созревания частично дифференцированных иПСК in vivo выдерживают три недели.
- Оценка.
- Морфологические изменения дифференцированных клеток и скорость восстановления клеток. Рисунок 1.
- На разные дни совместного культивирования с клетками OP9-DL1 делают снимки живых клеток с помощью обычного микроскопа.
- Скорость восстановления клеток рассчитывают на основе количества клеток, собранных из культуры.
- Проточный цитометрический анализ изменений поверхностных маркеров. Рисунок 2a.
- На разные дни совместного культивирования клетки удаляют из культуры путем трипсинизации и промывают холодным PBS перед окрашиванием поверхности клеток.
- Перед окрашиванием антителами, конъюгированными с различными флуорохромами, клетки блокируют Fc-блокатором 24G2 при 4 °C в течение 20 минут.
- После 20-минутного окрашивания при 4 °C клетки трижды промывают в холодном PBS перед анализом методом проточной цитометрии.
- Активация иПСК, дифференцированных in vitro. Рисунок 2b.
- За один день до анализа активации 24-луночный планшет покрывают анти-CD3 (конечная концентрация: 4 μg/mL в PBS) при 4 °C на ночь.
- На 22-й день совместного культивирования полученные из иПСК Т-клетки собирают из культуры и промывают холодным PBS перед стимуляцией анти-CD3, нанесенным на планшет, и растворимыми антителами анти-CD28 (конечная концентрация: 4 μg/mL).
- Инкубацию проводят в инкубаторе при 37 °C, 5% CO2 в течение 40 часов, после чего в культуру добавляют бефелдин А еще на 4 часа.
- По окончании совместного культивирования клетки собирают, промывают и блокируют Fc-блокатором, как описано выше. Заблокированные клетки окрашивают на поверхностные маркеры, такие как CD8 и цепь TCR Vβ, с использованием конъюгированных с флуорохромом антител.
- После окрашивания поверхности клеток их фиксируют 4% формальдегидом и пермеабилизируют с помощью набора для пермеабилизации Biolegend.
- После пермеабилизации внутриклеточные молекулы, такие как IL-2 и IFN-γ, окрашивают с помощью конъюгированных с флуорохромом антител.
- Перед окончательным анализом методом проточной цитометрии клетки трижды промывают в холодном PBS для удаления избытка антител.
- Созревание у мышей Rag-/-.
- После трех недель развития in vivo мышей Rag-/- усыпляют, извлекают селезенку и лимфатические узлы.
- Одиночные клетки получают путем механического разрушения. Эритроциты лизируют с помощью буфера для лизиса ACK, после чего собирают мононуклеары и дважды промывают в холодном PBS.
- После промывки клетки блокируют Fc-блокатором 24G2 при 4 °C в течение 20 минут, затем окрашивают различными конъюгированными с флуорохромом антителами анти-CD3, анти-CD4, анти-CD8 и анти-TCRβ при 4 °C в течение 20 минут.
- По окончании окрашивания клетки трижды промывают в холодном PBS перед анализом методом проточной цитометрии.
3. Программирование in vivo
- Создание ретровирусной конструкции.
- Вектор MSCV-IRES-DsRED (MiDR) сконструирован на основе вектора MSCV-IRES-GFP путем замены гена GFP геном DsRED.
- Ген Т-клеточного рецептора OT-I субклонируют в вектор MiDR для создания конструкции OT-I/MiDR.
- Ретровирусная трансдукция и сортировка клеток.
- Клетки упаковки Plat-E используются для получения псевдовирусов, которые будут применяться для последующей трансдукции.
- 3x106 Клетки Plat-E высевают в чашку для культивирования диаметром 100 мм за один день до трансфекции.
- В день 0 клетки Plat-E трансфецируют плазмидой OT-I MiDR с использованием реагента для трансфекции GeneJamma.
- В 1-й день 1x106 иПСК высевают в одну лунку 24-луночного планшета, предварительно покрытого 0,1% раствором желатина.
-
- На 2-й день супернатант, содержащий псевдовирусы, будет собран из культуры Plat-E и пропущен через 0.4 μm фильтровать для удаления потенциальных загрязняющих веществ.
- Трансдукцию будут проводить в условиях 32 °C центрифугируйте при 1400 об/мин в течение 1 часа в присутствии 5 μg/ml полибрен
- После трансдукции с использованием центрифугирования клетки помещают в 32 °C, 5% CO22 инкубировать в течение ночи.
- На 3-й день повторите процедуру трансдукции, описанную для 2-го дня. Для последующего использования будет подготовлен 6-луночный планшет с предварительным нанесением фидерных клеток irSNL76/7.
- На 4-й день трансдуцированные иПСК снимают с подложки с помощью трипсина, центрифугируют при 400 g в течение 5 мин и высевают на предварительно нанесенные фидерные клетки irSNL76/7.
- При достижении конфлюэнтности клетки отделяют с помощью трипсина, центрифугируют при 400 g в течение 5 мин и подготавливают к сортингу. Клетки, двойные положительные по GFP и DsRED, сортируют на клеточном сортере MoFlo. Отсортированные клетки культивируют на фидерных клетках irSNL76/7 для последующего использования.
- Адоптивный перенос и введение опухолевых клеток.
Клетки iPS, трансдуцированные TCR мышей линии OT-I (OT-I/iPS), обычно поддерживают на фидерных клетках irSNL76/7, как описано выше.
- В день адаптивного переноса клетки OT-I/iPS отделяют с помощью трипсинизации, центрифугируют при 400 g в течение 5 мин и ресуспендируют в свежей среде.
- инкубация в течение 30 минут в чашке с новой культурой в 37 °C инкубатор необходим для удаления дифференцированных клеток и остаточных фидерных клеток.
- По окончании инкубации следует собрать плавающие клетки и центрифугировать их при 400 g в течение 5 мин.
- Осадок клеток промоют холодным PBS трижды, после чего клетки пропустят через 70 μm нейлоновый фильтр между двумя промывками для удаления клеточных агрегатов (двойная фильтрация).
- После промывки клетки подсчитывают и ресуспендируют в холодном PBS до концентрации 1,5x10^6 клеток/мл.7 клеток/мл.
- Перед инъекцией клетки следует хранить на льду.
- Для адаптивного переноса будут использованы самки мышей линии C57BL/6J в возрасте 4–6 недель. Перед в/в для осуществления инъекции в хвостовую вену мышей помещают под инфракрасную лампу для расширения вен хвоста.
- После расширения вены, 200 μl суспензия клеток или 3x106 клетки будут перенесены адаптивно через хвостовую вену. В течение шести недель будет предоставлено время для in vivo созревание индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, трансдуцированных ТКР мышей линии OT-I.
-
- После шести недель в/в инъекция, 4x106 Клетки тимомы E.G7 будут введены внутрибрюшинно.
- Клетки тимомы E.G7 будет собрано из культуры и промыто трижды в PBS.
- По завершении промывки клетки суспендируют в холодном PBS до концентрации 8x107 клеток/мл.
- 50 μl суспензия клеток или 4x106 клетки будут введены в брюшную полость.
- Оценка.
- In vitro характеристика iPS-клеток, трансдуцированных TCR OT-I.
- Флуоресцентная микроскопия клеток, двойных положительных по DsRED и GFP, будет проведена с использованием стандартного флуоресцентного микроскопа на неффиксированных живых клетках.
- Интеграция и экспрессия гена будут проанализированы с помощью ПЦР и ОТ-ПЦР.
- Клеточную ДНК или РНК будут изолировать из образцов раздельно с использованием набора для изоляции ДНК или РНК компании Qiagen.
- ПЦР и ОТ-ПЦР будут проведены с использованием праймеров, специфически распознающих рекомбинированный VDJ-регион цепи TCR Vβ5.
- Развитие и созревание Т-клеток. Рисунок 3а.
- На 2-й, 4-й и 6-й неделях после переноса клеток животных подвергают эвтаназии, после чего извлекают селезенку и лимфатические узлы.
- Суспензия единичных клеток будет получена путем механического разрушения. Эритроциты подвергнут лизису с использованием лизирующего буфера ACK, после чего мононуклеары соберут и дважды промоют в холодном PBS.
- После промывки клетки блокируют с помощью Fc-блокера 24G2 в 4 °C в течение 20 минут; по завершении блокировки клетки разделят на аликвоты и окрасят различными антителами, конъюгированными с флуорохромами, в 4 °C в течение 20 минут.
- По окончании окрашивания клетки трижды промывают холодным PBS перед загрузкой в проточный цитометр.
- Стимуляция пептидами. Рисунок 3b.
- На 50-й день после введения опухолевых клеток животных забивают, после чего извлекают селезенку и лимфатические узлы.
- Одноклеточная суспензия будет получена путем механического разрушения. Эритроциты подвергнут лизису с использованием лизирующего буфера ACK, после чего мононуклеарные клетки соберут и дважды промоют в холодном PBS.
- CD8+ Т-клетки будут изолированы с использованием набора CD8 компании Miltenyi Biotec+ Набор для выделения Т-клеток. Выделенные CD8+ Т-клетки смешивают с облученными спленоцитами, выделенными из наивных мышей линии C57BL/6J, в соотношении 1:10, и подвергают пульсации с 0.5 μmol/ml OVA257-264 пептидом в течение 40 часов. После этого в культуру добавят брефелдин А еще на 4 часа.
- По завершении совместного культивирования клетки собирают, промывают и подвергают блокировке с помощью Fc-блокатора, как описано выше.
- Блокированные клетки будут окрашены на поверхностные маркеры, такие как CD8 и цепь TCR Vβ5, с использованием конъюгированных с флуорохромом антител.
- После окрашивания поверхностных антигенов клеток проведите их фиксацию с помощью 4% формальдегида и пермеабилизацию с использованием набора для пермеабилизации клеток.
- После пермеабилизации внутриклеточные молекулы, такие как IL-2 и IFN-γ, окрашивают с помощью антител, конъюгированных с флуорохромами.
- Перед окончательным анализом методом проточной цитометрии клетки промывают трижды в холодном PBS для удаления избытка антител.
- In vivo анализ цитотоксичности (тест на гибель клеток) Рисунок 3C.
- Спленоциты наивных мышей линии C57BL/6J будут выделены и маркированы карбоксифлуоресцеиновым сукцинимидным эфиром (CFSE) в качестве таргетных клеток.
- Клетки, меченные 5 μmol/ml CFSE (карбоксифлуоресцеин сукцинимидэфир)Привет клетки) подвергнут воздействию импульса 10 μg/ml овальбумин257-264 пептид и клетки, меченые 0.5 μmol/ml CFSE (карбоксифлуоресцеин сукцинимидэфир)ло клетки) не будут подвергнуты воздействию импульсов.
- Смесь из 2,5x106 CFSE (карбоксифлуоресцеин сукцинимилэфир)Здравствуйте клетки плюс 2,5x106 CFSEло клетки будут перенесены путем адаптивного переноса посредством внутривенной инъекции указанному реципиенту.
- Через 16 часов у этих мышей будет выделено количество спленоцитов, после чего CFSE+-клетки будут проанализированы методом проточной цитометрии.
- Подсчет количества опухолевых клеток в брюшной полости. Рисунок 4.
На 20-й день после введения опухолевых клеток мышей эвтаназируют и проведут промывание брюшной полости охлажденным PBS. Затем подсчитают количество опухолевых клеток, полученных в результате промывания брюшной полости.
- Идентификация опухоль-инфильтрирующих Т-клеток. Рисунок 5.
- На поздней стадии опухолевого процесса мышей из разных групп подвергнут эвтаназии, после чего из брюшной полости будет удалена опухоль.
- Опухоль следует разрезать на фрагменты: один фрагмент помещают в криопробирку и немедленно переносят на сухой лед, вторую часть фиксируют в формальдегиде, а третий фрагмент сохраняют в кондиционированной среде RPMI-1640 для последующего использования.
- H&Окрашивание на E будет выполнено в соответствии с общим протоколом с использованием образцов, фиксированных формальдегидом и залитых парафином.
- Иммунофлуоресцентное окрашивание будет проведено на криоконсервированных образцах.
- Ткань будет подвергнута секционированию и законсервирована в -20 °C перед использованием.
- Срезы тканей подвергнут высушиванию на воздухе в течение 15 минут с последующей 15-минутной фиксацией в холодном ацетоне.
- После фиксации срезы высушивают на воздухе еще в течение 15 минут, после чего промывают в PBS в течение 5 минут.
- После промывки поместите предметные стекла в увлажненную камеру и нанесите на срез ткани 30 μl 3% раствор BSA в PBS в течение 30 минут для блокирования неспецифического связывания.
- По завершении блокировки удалите остатки блокирующего буфера промакиванием и покройте срезы ткани 50 μl смесь антител PE-анти-TCR Vα2 и антител FITC-анти-OVA, разведенных в 3% растворе BSA в PBS.
- Инкубируйте в увлажненной камере в течение 2 часов, после чего slides промойте трижды в холодном PBS и закройте водойным заключающим средством перед исследованием с помощью флуоресцентного микроскопа.
- Проточная цитометрическая analiza опухоль-инфильтрирующих T-клеток.
- Опухоль будет гомогенизирована до состояния суспензии одиночных клеток, после чего эритроциты будут лизированы с помощью лизирующего буфера ACK.
- После промывки и блокировки клетки будут маркированы различными антителами, конъюгированными с флуорохромами, которые специфически распознают молекулы CD8, TCR Vα2 и TCR Vβ5, экспрессируемые на поверхности клеток.
- Выживаемость мышей. Рисунок 6.
После введения опухолевых клеток будет вестись тщательный мониторинг выживаемости мышей.
4. Репрезентативные результаты
CD3 и TCRβ используются в качестве маркеров T-клеток. Чтобы определить, может ли стимуляция iPS-клеток лигандом Notch DL1 способствовать дифференцировке T-клеток, мы оценили экспрессию CD3 и TCRβ+ на клетках, полученных из iPS-клеток, и далее проанализировали экспрессию CD4 и CD8, выделив популяцию CD3+ и TCRβ+. Как показано здесь, на 22-й день из iPS-клеток in vitro были получены одинарные положительные (SP) T-клетки CD3+ TCRβ+ CD4- CD8+. Кроме того, SP-клетки, полученные из iPS-клеток, были способны вырабатывать IL-2 и IFN-γ при стимуляции in vitro антителами к CD3, нанесенными на планшет, и растворимыми антителами к CD28 (Рис. 2), что свидетельствует о функциональности T-клеток, полученных из iPS-клеток.
После адаптивного переноса реципиентным мышам большинство iPS-клеток, трансдуцированных геном TCR, дифференцировались в CD8+ CTL, которые реагировали in vitro на пептидную стимуляцию секрецией IL-2 и IFN-γ (Рис. 3). Что наиболее важно, адаптивный перенос iPS-клеток, трансдуцированных TCR, вызвал инфильтрацию OVA-реактивных CTL в ткани опухоли и защитил животных от развития опухоли (Рис. 5-6). Таким образом, iPS-клетки, трансдуцированные геном TCR, могут дифференцироваться в функциональные антигенспецифические CTL in vivo.

Рисунок 1. Морфология дифференцировки иПСК. В разные дни иПСК мыши совместно культивировали с клетками OP9-DL1 в среде α-MEM с добавлением 20% FCS и 2,2 g/L бикарбоната натрия в присутствии 5 ng/ml mFlt3L и 1 ng/ml mIL-7.

Рисунок 2. Дифференцировка Т-клеток из иПСК. Мышиные иПСК совместно культивировали с клетками OP9-DL1, как описано на Рисунке 1. На 22-й день производные иПСК клетки были изолированы и проанализированы. A) Клетки CD4+ CD8- или CD4- CD8+ после гейтирования по популяциям CD3+ и TCRβ+. B) Клетки стимулировали антителами к CD3, нанесенными на поверхность планшета, и растворимыми антителами к CD28 в течение 5 часов при 37 °C и 5% CO2. Анализ экспрессии IL-2 и IFN-γ проводили методом внутриклеточного окрашивания после гейтирования живых Т-клеток CD4- CD8+.

Рисунок 3. Антигенспецифичные CD8+ Дифференцировка Т-клеток из иПСК in vivoБыли введены иПСК, трансдуцированные геном ТCR клеток OT-I. в/в мышам линии C57BL/6. Через шесть-десять недель OVA-специфические CD8+ Vβ5+ Был определен процесс развития Т-клеток. А) CD8+ Vβ5+ Т-клетки из объединенных образцов лимфоузлов и селезенки анализировали методом проточной цитометрии после выделения популяции CD8+ клеток.+ популяций. B) Продукция IL-2 и IFN-γ (темные линии; заштрихованные области обозначают изотипический контроль) определялась методом внутриклеточного окрашивания на цитокины после гейтирования по CD8+ Vβ5+ популяции. C) In vivo анализ пролиферации/цитотоксичности. CFSEЗдравствуйте (правые пики) и CFSEПожалуйста, предоставьте текст для перевода. (левые пики) целевые клетки подвергались электропорации OVA257-264 пептид и контрольный препарат соответственно, и вводились мышам через десять недель после переноса иПК или через один день после переноса ЦТЛ OT-I.

Рисунок 4. Адоптивный перенос iPS-клеток, трансдуцированных геном OT-I TCR, подавляет рост опухоли. iPS-клетки, трансдуцированные геном OT-I TCR, были адоптивно перенесены мышам линии C57BL/6. Одной группе мышей вводили OVA-реактивные CD8+ T-клетки от трансгенных мышей OT-I TCR, а в другой группе перенос клеток не проводился. Через шесть недель или на следующий день после переноса клеток мышам вводили опухолевые клетки E. G7. На 20-й день проводили подсчет опухолевых клеток в брюшной полости.

Рисунок 5. Инфильтрация опухолевых тканей антигенспецифическими CTL, полученными из иПСК. На 30–35 день после введения опухолевых клеток ткани опухоли были исследованы на предмет инфильтрации опухоль-реактивными Т-клетками. A) Окрашивание гематоксилином и эозином (H&E). Инфильтрация воспалительных клеток в опухолевые ткани (↓). B) Иммуногистохимическое окрашивание. OVA-специфические Vα2+ CTL (красный цвет) инфильтрировали опухолевые ткани, экспрессирующие OVA (зеленый цвет). C) Суспензии одиночных клеток из опухолевых тканей были проанализированы методом проточной цитометрии на экспрессию Vα2+ и Vβ5+ после гейтирования по популяции CD8+.

Рисунок 6. Адоптивный перенос iPS-клеток, трансдуцированных геном TCR OT-I, поддерживает выживаемость мышей. iPS-клетки, трансдуцированные геном TCR OVA, были адоптивно перенесены мышам линии C57BL/6, которым была проведена индукция опухоли клетками E. G7, как описано на рис. 4. Выживаемость мышей на 50-й день представлена кривыми выживаемости Каплана-Мейера (n=6).