1. Подготовить новую рабочую решения
- TBS: 0,05 М Трис-буферном растворе, рН 7,8 (TBS). Подготовить 60 мл TBS / планшет.
- СИЗ: свиной поджелудочной железы эластазы, тип 1 (СИЗ) предусмотрена в виде суспензии. Хорошо взболтать и развести СИЗ в TBS примерно 0,01 Ед / мл. Подготовить 6 мл рабочего раствора / планшет).
- SA 3 NA: сукцинил-L-Ala-L-Ala-L-Ala-р-нитроанилид (SA 3 NA). Подготовить 0,1 М акции SA 3 NA решение в диметилсульфоксид (ДМСО) и использовать сразу или хранить при температуре -20 ° C. Подготовить 6 мл рабочего раствора / планшет путем разбавления акции SA 3 NA решение 1/100 в TBS.
- Coomassie Blue: подготовка исходного раствора 10% Кумасси Brilliant Blue R-250 (Кумасси синий) в TBS и использовать сразу или хранить при -20 ° C. Подготовить 6 мл рабочего раствора путем разбавления исходного раствора, 1/1000 в TBS.
2. Подготовить слюны
СЛЮНЫ КОЛЛЕКЦИЯ: В положении стоя, стимулируют выделение сыворотки в слюне, поставив средство, стимулирующее слюноотделение, такие как лимонная кислота или жевательной резинкой во рту. Без сахара, лимонную дольку удобное для ВИЧ-1 пациентов, которые часто беззубой и не жевать резинку. Глотать по мере необходимости в течение первых 3 мин, а также собирать весь слюной рот крышками чашку в течение следующих 3 мин. Это даст примерно 2 мл слюны. Используйте сразу или хранить при температуре -80 ° C. СЛЮНЫ ОБРАЩЕНИЕ: Если замороженная, оттепель образца при 37 ° С и место на льду. Храните свежие или талой образца при температуре 2-4 ° C не более 3 дней. Не вихрь слюны и избежать пипетки муцина который не содержит сыворотку экссудата. Используйте стандартные меры предосторожности при обращении с слюна http://www.cdc.gov/hicpac/pdf/isolation/Isolation2007.pdf . 3. Микропланшетов Настройка
- буфер: Измерения проводились в трех экземплярах. Для каждой лунки пластины микротитровальных добавлено 130 мкл TBS.
- Образцов: Для каждого теста хорошо, добавляют 20 мкл слюны для конечного объема 150 мкл / лунку. Смешайте с помощью пипетки, не вводя пузыри.
- КОНТРОЛЬ: положительный контроль содержит средства индивидуальной защиты, а не слюна. Отрицательный контроль содержит слюны, но не PPE.To положительного контроля и добавляют 20 мкл TBS. Для отрицательного контроля и добавляют 20 мкл слюны.
- СИЗ инкубации: Shake средств индивидуальной защиты рабочим раствором хорошо. Добавить 50 мкл рабочего СИЗ раствора в каждую лунку исключая отрицательное скважин управления. К отрицательным скважин контроль, добавить 50 мкл TBS. Инкубировать 10 мин при 23 ° C.
- ОСНОВАНИЯ ИНКУБАЦИЯ: Добавить 50 мкл SA 3 NA рабочего раствора в каждую лунку. Инкубировать 45 мин при 23 ° C.
- Coomassie Blue. Добавить 50 мкл Кумасси синий рабочий раствор
- Считывание: абсорбцию в микропланшетов читателя, 405 нм для выявления SA 3 NA раскол, который представляет активный α 1 ИП и 595 нм для выявления Кумасси синий, которая представляет содержание белка.
4. Вычислить α 1 ИП Индекс
- НОРМАЛИЗАЦИИ в среднем 405 нм и 595 нм: для каждого х экземплярах, вычислить среднее. Вычтите отрицательные средние управления из образцов среднего. Чтобы свести к минимуму пластины к пластине изменения, нормализуют среднем путем деления каждого образца среднем на положительной средней управления следующим образом:

- РАСЧЕТ α 1 ИП INEX: Разделите нормированный 405 нм на нормированную 595 нм:

5. Представитель Результаты
Чтобы определить, α-тест может быть пригоден для использования в качестве отправной точки оказания медицинской помощи скрининг-теста для контроля лимфоцитов CD4 в эндемичных, с ограниченными ресурсами регионах, стимулировало слюны были собраны из 20 женщин и 11 мужчин ВИЧ-1 предметов посещать клинику ежедневного ухода в Камеруне. В соответствии с предварительными замечаниями при разработке α-тест с использованием слюны, собранных в Нью-Йорке, α 1 ИП Индекс в слюне, собранные в Камеруне коррелирует с уровнем CD4 (R 2 = 0,91, р <0,0001. П = 31). Отношение было определено 3 параметра сигмоидального кривой, которая соответствует доза-эффект (рис. 2A). 95% доверительный и прогнозирования интервалы изображены с синей и красной линиями, соответственно (рис. 2В).
Впредыдущего исследования мы выяснили, что CD4 + Т-клетки проявляют синусоидальной велосипедный с периодичностью 23 ± 3,5 дня в области ВИЧ-1 предметов и у пациентов с унаследованной версии α 1 ИП недостаточности (PIZZ) 3. Изображенный здесь является типичным примером компьютерной синусоиды анализ CD4 на велосипеде в не-ВИЧ-1 здоровым контролем выставки 27 дней периодичность (рис. 3А).
Созданные с помощью компьютера анализ кривой синус CD4 + Т-клеточных изменений в 6 предметов дали значения от пика до пика амплитуды и оси вращения 3. Как и следовало ожидать, ось колебаний коррелирует с амплитудой (R 2 = 0,96, р = 0,009, п = 6) (рис. 3В). У пациентов будет низким числом CD4 + T-клеток, циклические изменения клеток CD4 Т-клеток были маленькие, и у пациентов с высоким числом CD4 + Т-клеток, циклические изменения были большими.
Потому чтоЛиния регрессии изображено на рисунке 2 оценкам оси колебаний и ось колебаний коррелирует с амплитудой, амплитуда может быть вычислена для линии регрессии таким образом оценки, насколько выше и ниже линии регрессии CD4 + Т-клетки можно было бы ожидать, чтобы изменяться в зависимости от езда на велосипеде (рис. 3). Наложение амплитуды рассчитаны на рисунке 3C и доверительный интервал рассчитан на рисунке 2B, было установлено, что амплитуда (зеленая линия) находится в пределах 95% доверительного интервала (синяя линия) (рис. 3).

Рисунок 1. Процедура информация: Место лимонной кислоты во рту и сбора слюны. Добавить разбавленной слюной лунки планшета в трех экземплярах. Добавить СИЗ в каждую лунку и инкубировать 15 мин при 23 ° C. Добавить подложки СИЗ в каждую лунку и инкубировать в течение 45 мин при 23 ° C. Добавить Кумасси синий и 405 нм для выявления деятельности и средства индивидуальной защиты при 595 нм для обнаружения белка.

Рисунок 2. Сравнение α-тест со стандартным методом перечисления CD4. A) α-тест был проведен количественного α 1 ИП индекса в целом стимулировали слюны во рту. Лимфоцитов CD4 было проведено независимой медицинской лаборатории с использованием стандартных проточной цитометрии. Кровь для проточной цитометрии и слюны были собраны в одно посещение клиники. Отношения между α 1 ИП индекс и уровень CD4 был определен 3-параметр сигмоидального кривой (R 2 = 0,91, р <0,0001, п = 31). Б) 95% и прогнозирования интервалов изображен в синем и красном линий, соответственно.

Рисунок 3. Точность расчета с CD4ounts использованием α1PI Index.A) CD4 + Т-клеток выставлены синусоидальной езда на велосипеде с 27-дневная периодичность в не-ВИЧ-1 контрольная группа здоровых людей. Оси колебаний изображен (красная пунктирная линия). B) Компьютерная анализ синусоидальной CD4 Т-клеток, езда на велосипеде была использована для расчета пик-пик амплитуды и оси вращения в 4 ВИЧ-1 предметов, 1 без ВИЧ -1 PIzz тему, и не-ВИЧ-1 контрольная группа здоровых людей изображен в части А. Отношения между CD4 + Т клеток и амплитуда колебаний оси было определено 3 параметра сигмоидального кривой (R 2 = 0,96, р = 0,009, п = 6). C) сигмоидального связь между амплитудой и оси колебаний, полученных в части В) была использована для расчета ожидаемой амплитуды (зеленые линии) точек вдоль линии регрессии (черная линия) на рисунке 2. D) ожидаемая амплитуда Интервал (зеленые линии) существенно отличается от 95% доверительный интервал (синие линии), как это определено Манна-Уитни ранг Sum Test (на основе сравнения средняя разница между 95% доверительный интервал и линии регрессии (63 кл / мкл) и средняя разница между амплитудой линии и линии регрессии (37 ячеек / мкл), р = 0,001).