Методы микрофлюидного инкапсулирования ранее использовались для захвата клеток в водных монодисперсных каплях пиколитрового объема, что обеспечивало их изоляцию от объемной жидкой среды и находило применение в высокопроизводительном скрининге, цитометрии и масс-спектрометрии. Мы описываем метод, который позволяет не только инкапсулировать одиночные клетки, но и многократно захватывать определенное количество клеток (в данной работе продемонстрировано инкапсулирование одной и двух клеток) для изучения как изоляции, так и взаимодействий между клетками в группах контролируемого размера. Сочетая методы генерации капель с упорядочиванием клеток и частиц, мы демонстрируем контролируемое инкапсулирование частиц клеточного размера для эффективного непрерывного процесса. Используя водную суспензию частиц и несмешивающееся фторсодержащее масло, мы генерируем водные капли в масле с помощью сопла с фокусировкой потока. Скорость водного потока достаточно высока, чтобы создать упорядочивание частиц, которые поступают в сопло с частотой, кратной частоте генерации капель, что обеспечивает инкапсулирование контролируемого количества клеток в каждой капле. В качестве репрезентативных результатов используются полистирольные частицы размером 9.9 μm в качестве имитаторов клеток. Данное исследование показывает эффективность инкапсулирования одной частицы Pk=1 83.7% и эффективность инкапсулирования двух частиц Pk=2 79.5% по сравнению с соответствующими значениями распределения Пуассона 39.3% и 33.3% соответственно. Продемонстрировано, что поддержание постоянной концентрации клеток и частиц имеет большое значение для эффективной инкапсуляции; также рассмотрены переходы от режима капельного к струйному образованию.
Введение
Постоянные водные клеточные суспензии в среде имеют общую жидкую среду, что позволяет клеткам взаимодействовать параллельно, а также гомогенизирует эффекты отдельных клеток при измерениях в этой среде. Высокопроизводительное инкапсулирование клеток в капли пиколитрового объема ограничивает образцы, защищая капли от перекрестного загрязнения, обеспечивая возможность оценки клеточного разнообразия внутри образцов, предотвращая разбавление реагентов и экспрессируемых биомаркеров, а также усиливая сигналы от продуктов биореактора. Капли также предоставляют возможность повторного слияния капель в более крупные водные образцы или с другими каплями для изучения межклеточной сигнализации.1,2 Снижение степени разбавления означает более сильные сигналы детекции для повышения точности измерений, а также возможность сократить объемы потенциально дорогостоящих образцов и реагентов.3 Инкапсулирование клеток в капли использовалось для улучшения детекции экспрессии белков,4 антител,5,6 ферментов,7 и метаболической активности8 при высокопроизводительном скрининге, а также может быть использовано для совершенствования высокопроизводительной цитометрии.9 В дополнительных исследованиях представлены возможности применения биоэлектрораспыления капель, содержащих клетки, для масс-спектрометрии10 и направленного нанесения клеточных покрытий на поверхность.11 Однако некоторые области применения были ограничены отсутствием возможности контролировать количество клеток, инкапсулированных в каплях. Здесь мы представляем метод упорядоченного инкапсулирования12, который повышает продемонстрированную эффективность инкапсулирования одной и двух клеток и может быть экстраполирован на инкапсулирование большего количества клеток.
Для получения монодисперсных капель в микрофлюидике используется метод «фокусировки потока», который позволяет создавать капли одного флюида (водной смеси с клетками) определенного размера внутри другого (непрерывной масляной фазы) с помощью сопла, в котором сходятся потоки.13 При заданной геометрии сопла частота генерации капель f и размер капель могут быть изменены путем регулирования скоростей потоков масла и водной фазы Qoil и Qaq. При увеличении скоростей потока может произойти переход от генерации капель к нестабильному струйному режиму вытекания водного флюида из сопла.14
Когда водный раствор содержит взвешенные частицы, на сопле частицы инкапсулируются и изолируются друг от друга. При генерации капель с использованием случайно распределенной водной суспензии клеток средняя доля капель Dk, содержащих k клеток, определяется статистикой Пуассона, где Dk = λk exp(-λ)/(k!) и λ — среднее количество клеток на одну каплю. Доля клеток, оказывающихся в «правильно» инкапсулированных каплях, рассчитывается по формуле Pk = (k x Dk)/Σ(k' x Dk'). Тонкое различие между этими двумя показателями заключается в том, что Dk относится к использованию водной фазы и объему сортировки капель, которую необходимо провести после инкапсуляции, а Pk относится к степени использования образца клеток. Например, можно использовать разбавленную суспензию клеток (низкое λ) для инкапсуляции капель, в которых большинство капель с клетками содержат только одну клетку. В этом случае показатель эффективности Pk будет высоким, но большинство капель окажутся пустыми (низкое Dk), что потребует механизма сортировки для удаления пустых капель, что также снизит пропускную способность.15
Сочетание генерации капель с инерционным упорядочиванием позволяет инкапсулировать капли с более предсказуемым количеством клеток на каплю и более высокой пропускной способностью, чем при случайной инкапсуляции. Инерционная фокусировка была впервые обнаружена Сегре и Зильбербергом16 и представляет собой тенденцию частиц конечного размера мигрировать в боковые равновесные положения в потоке в канале. Инерционное упорядочивание относится к тенденции частиц и клеток пассивно организовываться в равноудаленные, шахматные цепочки с постоянной скоростью. Как фокусировка, так и упорядочивание требуют достаточно высоких скоростей потока (высокое число Рейнольдса) и размеров частиц (высокое число Рейнольдса для частиц).17,18 Здесь число Рейнольдса Re =uDh/ν и число Рейнольдса для частиц Rep =Re(a/Dh)2, где u — характерная скорость потока, Dh [=2wh/(w+h)] — гидравлический диаметр, ν — кинематическая вязкость, a — диаметр частицы, w — ширина канала, а h — высота канала. Эмпирически установлено, что длина, необходимая для формирования полностью упорядоченных цепочек, уменьшается при увеличении Re и Rep. Следует отметить, что требования к высоким Re и Rep (для данного исследования порядка 5 и 0,5 соответственно) могут противоречить необходимости поддерживать низкую скорость водного потока во избежание струйного режима в сопле генерации капель. Кроме того, высокие скорости потока приводят к более высоким напряжениям сдвига, воздействующим на клетки, что не рассматривается в данном протоколе. Предыдущее исследование упорядоченного инкапсулирования показало, что более 90% одиночно инкапсулированных клеток HL60 при условиях потока, аналогичных условиям в этом исследовании, сохранили целостность клеточной мембраны.12 Однако при экстраполяции на другие типы клеток и параметры потока необходимо будет тщательно учитывать влияние величины и временных масштабов напряжений сдвига. Пересечение ограничений по скорости водного потока для упорядочивания клеток, генерации капель и жизнеспособности клеток обеспечивает идеальный рабочий режим для контролируемой инкапсуляции одиночных и множественных клеток.
Поскольку лишь в немногих исследованиях рассматривается расстояние между цепочками частиц,19,20 определение этого расстояния проще всего провести эмпирическим путем; оно будет зависеть от геометрии канала, скорости потока, размера частиц и их концентрации. Тем не менее, равный боковой интервал между цепочками означает, что клетки поступают через предсказуемые, постоянные промежутки времени. Если генерация капель происходит с той же скоростью, с которой упорядоченные клетки поступают к соплу, клетки инкапсулируются в каплю контролируемым образом. Данный метод использовался для инкапсуляции одиночных клеток с пропускной способностью порядка 15 kHz,12 что является значительным улучшением по сравнению с предыдущими исследованиями, в которых сообщалось о скоростях инкапсуляции порядка 60-160 Hz.4,15 В работе по контролируемой инкапсуляции более 80% капель содержали одну и только одну клетку, что представляет собой значительное повышение эффективности по сравнению со статистикой Пуассона (случайным распределением), которая предсказывает в среднем менее 40% эффективности.12
В предыдущей работе по контролируемому инкапсулированию12 среднее число частиц на каплю λ подбирали таким образом, чтобы обеспечить инкапсулирование одной клетки. Мы предполагаем, что путем регулирования скоростей потока можно эффективно инкапсулировать любое количество клеток в одной капле, когда λ равно или близко к желаемому количеству клеток на каплю. В то время как инкапсулирование одиночных клеток ценно для определения индивидуального отклика клеток на стимулы, инкапсулирование нескольких клеток дает информацию о взаимодействии контролируемого количества и типов клеток. Здесь мы представляем протокол, репрезентативные результаты с использованием полистирольных микросфер и обсуждение метода контролируемого инкапсулирования нескольких клеток с помощью пассивного канала инерционного упорядочивания и сопла для генерации капель.