Рыбка-зебра стала мощным модельным организмом для изучения развития кишечника1-5, физиологии6-11, заболеваний12-16 и взаимодействий между хозяином и микробами17-25. Экспериментальные подходы к изучению биологии кишечника часто требуют введения выбранных материалов в просвет кишечника in vivo. В модели личинок рыбки-зебры это обычно осуществляется путем погружения рыб в раствор выбранного вещества или путем инъекции через брюшную стенку. При использовании метода погружения трудно точно контролировать или отслеживать путь или время доставки материала в кишечник. По этой причине воздействие при погружении может вызвать непреднамеренную токсичность и другие эффекты в тканях вне кишечника, что ограничивает потенциальный диапазон количеств материала, которые могут быть доставлены в кишечник. Кроме того, количество материала, поглощаемого при погружении, может значительно варьироваться между отдельными личинками26. Хотя эти проблемы не возникают при прямой инъекции через брюшную стенку, правильное проведение инъекции затруднительно и вызывает повреждение тканей, что может повлиять на результаты эксперимента. Мы представляем метод микрозондажа (микрогаважа) личинок рыбки-зебры. Целью этого метода является обеспечение безопасного, эффективного и стабильного способа доставки материала непосредственно в просвет переднего отдела кишечника личинок рыбки-зебры с контролируемым временем введения. Микрозондаж использует стандартное оборудование для микроинъекций эмбрионов и стереомикроскопию, имеющиеся в большинстве лабораторий, занимающихся исследованиями рыбок-зебра. После того как рыбки правильно зафиксированы в метилцеллюлозе, зондирование может быть выполнено быстро, со скоростью примерно 7-10 рыб/мин, а выживаемость после процедуры приближается к 100% в зависимости от вводимого материала. Мы также показываем, что микрозондаж позволяет заполнять просвет кишечника высокими концентрациями веществ, которые летальны для рыб при воздействии методом погружения. Чтобы продемонстрировать полезность этого метода, мы представляем анализ микрозондажа с использованием флуоресцентного декстрана, который может быть использован для количественного определения переноса из просвета кишечника в экстракишечные пространства. Этот тест может быть использован для проверки правильности выполнения процедуры микрозондажа, а также представляет собой новый анализ на рыбках-зебра для изучения целостности кишечного эпителиального барьера при различных экспериментальных условиях (например, генетические манипуляции, лекарственная терапия или воздействие факторов окружающей среды). Кроме того, мы показываем, как зондирование может быть использовано для оценки моторики кишечника путем введения флуоресцентных микросфер и последующего мониторинга их перемещения. Микрозондаж может быть применен для доставки различных материалов, таких как живые микроорганизмы, секретируемые микробные факторы/токсины, фармакологические агенты и физиологические зонды. Благодаря этим возможностям метод микрозондажа личинок рыбки-зебры обладает потенциалом для расширения широкого спектра областей исследований с использованием модельной системы рыбки-зебры.