Обзор принципа работы устройства ImageStream представлен на Рисунке 1. Прибор делает несколько изображений каждой клетки в потоке с высоким разрешением, включая светлое поле (BF), темное поле (DF или боковое рассеяние света) и канал(ы) флуоресценции, что продемонстрировано на Рисунке 2 на примере трех различных клеток, меченных CNTs. Также показаны наложения этих каналов, которые на первый взгляд иллюстрируют корреляцию.
Поскольку весь последующий анализ основан на визуализации клеток, выбор сфокусированных клеток имеет решающее значение для исследования (Рисунок 3). Фактически, присутствие CNT вызывает изменения как контрастности, так и градиента по сравнению с немаркированными клетками: сфокусированные клетки, интернализовавшие значительное количество CNT, имеют тенденцию к низкому среднеквадратичному (rms) градиенту (который обычно является единственным параметром, используемым для разграничения сфокусированных и несфокусированных клеток), но при этом обладают высокой контрастностью; это объясняет, почему необходим двухпараметрический график. На Рисунке 3 показано разграничение между несфокусированными (желтая область) и сфокусированными клетками (синяя область).
Интернализованные клетками CNT четко различимы — в частности, на BF они выглядят как сильно поглощающие темные пятна (см. влияние различных концентраций метки, Рисунок 4). Кроме того, был проанализирован средний сигнал пикселей на BF, что позволило провести относительную количественную оценку поглощения: графики на Рисунке 5 демонстрируют его значительное увеличение при повышении концентрации CNT-метки (результаты для примерно 7 000 клеток на каждое экспериментальное условие).
Во-вторых, количественное определение CNT также возможно с помощью использования масок, применяемых либо к ограниченному диапазону темных пикселей в BF, либо к пикселям высокой интенсивности в DF (см. примеры на Рисунке 6), которые соответствуют пятнам, возникающим в результате присутствия CNT. Таким образом, построение графика площади этих масок позволяет выделить, а также продемонстрировать увеличение поглощения (приведено в примере на Рисунке 7 для площади маски в BF с выбором пикселей в диапазоне 0-533).
Кроме того, корреляцию между пятнами в BF и DF можно оценить, построив график зависимости интенсивности DF от среднего сигнала пикселя в BF (как на Рисунке 8) (анализ, не зависящий от маски) или площади маски в BF (Маска 1) от площади в DF (Маска 2).
Что касается процедуры, разработанной для локализации CNTs внутри клеток, на Рисунке 9A показаны созданные различные маски. Обратите внимание, что надежность масок локализации (основанных на эрозии маски клетки по умолчанию) необходимо визуально проверить на совокупности меченых и немеченых клеток. Одни и те же маски используются для всех образцов.
Построение графика зависимости общей площади черных пятен на клеточной мембране от их площади на всей клетке позволяет определить степень интернализации для клеток, инкубированных в течение 20 ч при 37 °C, по сравнению с инкубацией в течение 2 ч при 4 °C (см. Рисунок 9B); это указывает на то, что при 4 °C CNTs располагаются преимущественно на мембране, тогда как при 37 °C CNTs интернализируются более чем в 90% клеток.
Наконец, что касается флуоресценции, этот параметр не использовался в качестве индикатора для количественного определения CNT из-за слишком низкой корреляции между флуоресцентными пятнами и пятнами на BF (и DF). В действительности, корреляция между интенсивностью FITC и средним значением пикселя в светлом поле соответствует коэффициенту корреляции Пирсона -0,2. На Рисунке 10 проиллюстрированы два случая, в которых сигнал флуоресценции либо должным образом совпадает, либо не совпадает с черным пятном в светлом поле.

Рисунок 1. Обзор общего принципа работы ImageStream. Мультиспектральная система визуализации регистрирует до 12 изображений на одну клетку в трех различных режимах: в светлом поле, в темном поле и в режиме флуоресценции. Установка включает 5 лазеров возбуждения, в том числе с длинами волн 405, 488, 560 и 658 nm. Свет от клеток, протекающих через кювету, собирается с помощью различных объективов (в данном исследовании использовался объектив 40X) и передается на элемент спектрального разложения, который представляет собой набор длинноволновых фильтров, расположенных в угловом массиве. ПЗС-камера, регистрирующая изображения клеток, работает по методу интеграции с временной задержкой (time-delay-integration) во избежание размытия изображений. Доступна опция расширенной глубины резкости (EDF).

Рисунок 2. Галерея изображений клеток, маркированных углеродными нанотрубками (50 μg/mL), полученных с помощью ImageStream в различных каналах (светлое поле (BF), темное поле (DF), флуоресценция (FITC) и их совмещение). УНТ, локализованные внутри внутриклеточных лизосом, выглядят как крупные черные пятна на изображениях в светлом поле. Напротив, на изображениях в темном поле и флуоресцентных изображениях они создают яркие пятна.

Рисунок 3. Отбор клеток, находящихся в фокусе. Двумерная точечная диаграмма зависимости среднеквадратичного значения (RMS) градиента от контрастности на изображениях в светлом поле (BF) позволяет исключить расфокусированные клетки. Здесь желтой областью обозначены расфокусированные клетки, а синей — клетки, находящиеся в фокусе. Расфокусированные клетки характеризуются как низкой контрастностью, так и низким RMS градиента на изображении в светлом поле. Помимо RMS градиента, для дифференциации фокусированных клеток после их маркировки CNTs требуется параметр контрастности.

Рисунок 4. Дозозависимое поглощение CNT, визуализированное с помощью ImageStream. Количество и площадь черных пятен на изображениях в светлом поле увеличиваются с ростом дозы CNT во время инкубации с клетками (в диапазоне от 0-50 µg/ml). Обратите внимание, что контрольные клетки не содержат черных пятен.

Рисунок 5. Относительный количественный анализ поглощения CNT на основе изображений в светлом поле. Гистограммы средней интенсивности пикселей, примененные к маске «object», охватывающей всю клетку, четко демонстрируют дозозависимый характер, который может быть использован для количественного определения. Диапазон R9 охватывает CNT-положительные клетки.

Рисунок 6. Создание масок для выбора темных пятен на изображениях BF и светлых пятен на изображениях DF. Поскольку УНТ выглядят как сильно поглощающие темные пятна на изображении BF, создается пороговая маска для выбора ограниченного диапазона пикселей с низкой интенсивностью, которая в данном исследовании составляет 0-533 (Маска 1, обозначение: Intensity(M01, BF, 0-533)). И наоборот, маска, соответствующая пикселям с высокой интенсивностью (в данном случае 150-4095) на изображении DF (Маска 2, обозначение: Intensity (M06, DF, 150-4095)), используется для выбора светлых пятен на DF, соответствующих областям с высоким рассеянием.

Рисунок 7. Дозозависимое поглощение CNT демонстрируется путем количественного определения площади черных пятен на BF-изображениях. При использовании пороговой маски (mask 1), примененной к BF, можно количественно определить площадь черных пятен для каждой клетки, что демонстрирует дозозависимое распределение.

Рисунок 8. Корреляция методов количественного определения CNT на основе изображений в BF (абсорбция) и DF (рассеяние). Слева: среднее значение пикселя на BF-изображении в зависимости от интенсивности на DF-изображении демонстрирует хорошую корреляцию для клеток, меченных CNTs (50 µg/ml) (коэффициент корреляции Пирсона r = -0.68). Справа: площадь маски, соответствующей темным пятнам в BF, в зависимости от площади маски, соответствующей светлым пятнам в DF, для клеток, меченных CNTs (50 µg/ml). Коэффициент корреляции Пирсона r = -0.83. На графиках представлены значения для 7 000 клеток.

Рисунок 9. Локализация УНТ в клетках с использованием специфических масок. (A) Маски создаются в соответствии с определенной областью клетки, а именно слева направо: вся клетка, только мембрана и внутренняя часть клетки. Другая маска выделяет черные пятна благодаря пороговой интенсивности (Маска 1, обозначение: Intensity(M01, BF, 0-533)). (B) Оценку локализации УНТ можно получить путем измерения площади черных пятен в различных областях клеток с использованием масок локализации, описанных в пункте A. Инкубация с УНТ (50 µg/ml) проводилась как при 37 °C, так и при 4 °C для ингибирования пути интернализации. График зависимости площади черных пятен на мембране от площади черных пятен во всей клетке показывает дозозависимую абсорбцию УНТ на мембране при 4 °C, в то время как полная интернализация УНТ эффективно происходит при 37 °C.

Рисунок 10. Колокализация индуцированных CNT черных точек в светлом поле (BF) с яркими флуоресцентными точками на изображении FITC. Яркие флуоресцентные точки не всегда колокализованы с черными точками в BF. Они точно совпадают для первых двух представленных клеток, но не для двух последних.