$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. Иммунофлюоресценция
Следующий протокол выполняется на корональных криосекциях мозга, полученных от транскардиально перфузиированных мышей (20 мл PBS, 0,1 моль/литр, pH 7,4, затем 50 мл охлажденного параформальдегида 4% в PBS). После перфузии мозг осторожно удаляют и переносят до 30% сахарозы в PBS при 4 °C на ночь для криозащиты. Затем мозг быстро замораживают погружением в изопентан при температуре -45 °C на 3 минуты, а затем запечатывают в флаконы и хранят при -70 °C до использования. Корональные криоссекции головного мозга (20 мкм) разрезают серийно и подвергают иммунофлюоресцентному протоколу 11, 6.
Доведите все реагенты и образцы до комнатной температуры перед использованием. Обратите внимание, что представленные рабочие разведения антител и сыворотки получены в результате испытаний, проведенных с целью получения наилучших результатов. При использовании различных антител и сыворотки протокол должен быть валидирован.
Обратите внимание, что поскольку первичные антитела против CD11b и против CD68 вырабатываются у крыс, чтобы избежать перекрестного сигнала от анти-крысиного Alexa 546, мы использовали сильное разведение анти-CD11b с последующим усилением флуоресцентного сигнала с помощью набора TSA (Cy5 Tyramide). Мы установили оптимальное рабочее разведение анти-CD11b, выполнив описанный протокол, за исключением шага 1.17, и используя, по меньшей мере, 7 различных разведений анти-CD11b, как показано в таблице 1. В результате было выбрано значение 1:30 000 в качестве единственного разбавления, обеспечивающего: 1) видимый сигнал с Cy5 на длине волны возбуждения 646 нм; 2) отсутствует сигнал с Alexa 546 на длине волны возбуждения 532 нм. Таким образом, флуоресцентный сигнал Alexa 546 избирательно связан с экспрессией CD68.
Оптимальные разведения антител против CD11b и анти-CD68 могут варьироваться в зависимости от типа ткани и должны быть определены до начала протокола совместного мечения.
- Дважды промойте криосекцию мозга PBS.
- Инкубируйте криосекции в течение 5 мин в PBS, содержащем 1% H2O2 (этап необходим, так как флуоресцентная амплификация требует инкубации с пероксидазой хрена, стрептавидином-HRP, см. шаг 1.12).
- Промыть криосекции 2 раза с PBS.
- Инкубировать криосекции в течение 60 мин в PBS, содержащем 10% NGS и 0,3% тритона.
- Инкубируйте криосекции при 4 °C в течение ночи в PBS, содержащем первичный анти-CD11b Ab Rat [1:30,000], 10% NGS и 0,3% тритона.
- Промыть криоучастки 2x (5 мин) PBS.
- Инкубировать криосекции в течение 60 мин в PBS, содержащем биотинилированный вторичный анти-Rat Ab [1:200] и 1% NGS.
- Промыть криосекции 2 раза с PBS.
- Промыть криорезы тротилом (Tris-HCl, NaCl, Tween: 0,1 М TRIS-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, 0,05% Tween 20).
- Инкубировать криосекции в течение 1,5 ч в TNB (Tris-HCl-NaCl-блокирующий буфер: 0,1 М TRIS-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, 0,5% блокирующий реагент из соответствующего набора (см. таблицу реактивов)).
- Промойте криосекцию 3 раза тротилом.
- Инкубируйте криосекции в TNB, содержащей стрептавидин-HRP [1:100].
- Промыть криосекции 3 раза тротилом.
- Инкубируйте криосекции в течение 8 минут в разбавителе амплификации, содержащем тирамид цианина 5 [1:300].
- Промойте криосекции 3 раза с PBS.
- Инкубируйте криосекции в течение 60 минут в PBS, содержащем 10% NGS и 0,1% тритона.
- Инкубируйте криоссекции при 4 °C в течение ночи в PBS, содержащем первичный анти-CD68 Ab Rat [1:200], 3% NGS и 0,3% тритона.
- Промойте криосекции 3 раза с PBS.
- Инкубировать криосекции в течение 60 мин в PBS, содержащем фторконъюгированный вторичный Ab Alexa 546 anti-Rat [1:500] и 1% NGS.
- Промойте криосекции 3 раза с PBS.
- Инкубировать криосекции в течение 10 мин в PBS, содержащем Hoechst 1 мкг/мл.
- Промойте криосекции 3 раза с PBS.
- Монтируйте криосекции в Prolong Gold.
2. Получение трехмерных изображений с помощью конфокальной микроскопии
Здесь использовался микроскоп IX81, оснащенный конфокальным сканирующим блоком FV500 с 3 лазерными линиями: Ar-Kr (488 нм), He-Ne красный (646 нм) и He-Ne зеленый (532 нм) и УФ-диодом.
- Выбор возбуждающих лазеров зависит от длин волн возбуждаемых флуоресцентных красителей (He-Ne красный для Cy5, CD11b; He-Ne зеленый для Alexa546, CD68 и УФ-диод для Hoechst, ядра).
- Выберите наилучшую комбинацию дихроичных зеркал для сбора светового сигнала.
- Установите разрешение изображения не менее 800 x 600 пикселей.
- Определите интересующую область с помощью эпифлуоресценции и постепенно увеличивайте увеличение до 40-кратного объектива.
- Переключитесь на метод лазерной сканирующей микроскопии (LSM).
- Выполняйте повторяющиеся сканирования для регулировки фотоумножителя (ФЭУ) и усиления для каждого канала. Лазеры могут быть включены по отдельности для облегчения настройки. Держите коэффициент усиления как можно ниже, чтобы избежать нежелательных неспецифических сигналов.
- При выполнении повторяющегося сканирования перемещайте регулятор фокусировки, чтобы определить нижнюю и верхнюю крайние точки оси Z (общая длина оси Z = 10 мкм).
- Остановите повторное сканирование.
- Определите размер шага. Оно должно быть максимально приближено к размеру пикселя (0,225 мкм) для получения стандартного соотношения размеров 1:1 по оси z.
- Активируйте фильтр Калмана не менее 2 раз.
- Активируйте режим последовательного сканирования, чтобы избежать эффектов просвечивания.
- Пройдите половину пути по оси Z и запустите последовательное сканирование по оси xy. Проверьте настройку ФЭУ и усиление (хорошее соотношение сигнал/шум). Если это не устраивает, повторите шаг 2.6.
- Запустите сбор xyz.
- Экспортируйте данные в виде файла multitiff. Каждый файл multitiff обычно содержит 3 цветовых канала (синий, зеленый и красный) и 44 фокальные плоскости.
3. Трехмерное представление конфокальных захватов и трехмерного рендеринга
Загрузите файлы multitiff в программу Imaris и обработайте их следующим образом:
- Открытое программное обеспечение.
- Выберите вид за пределами поля.
- Загрузите файл multitiff.
- Выберите нужный цвет для каждого канала.
- Уберите шум из фона, увеличив минимальное значение на панели настройки дисплея. Настраивайте каждый канал индивидуально.
- Перейдите к виду раздела. Перемещайтесь по оси z в поисках колокализации (желтые пиксели).
- Щелкните по желтой области, чтобы увидеть, присутствует ли колокализация вдоль оси z (т.е. принадлежит ли она твердотельному объекту). Проекции по оси Z видны в правой и нижней части рисунка.
- Сделайте снимок.
- Вернитесь к превосходному виду.
- Обрезайте 3D, чтобы изолировать клетку или кластер клеток.
- Выберите один канал на панели настройки дисплея.
- Выберите построитель алгоритмов выхода/поверхностей. Шаги алгоритма:
- Выберите канал.
- Определите порог (используйте то же минимальное значение на панели настройки дисплея).
- Определите изменение размера.
- Определите сглаживание (best = 0.200).
- Определите внешний вид цвета.
- Конечный алгоритм.
- Повторите шаг 3.12 для каждого канала.
- Отмените выбор флуоресцентных каналов на панели настройки дисплея и выберите все три поверхности.
- Перемещайте громкость, чтобы найти наилучший вид.
- Сделайте снимок.