Method Article

Одновременное Многоцветный изображений биологических структур с флуоресцентной фотоактивации локализации микроскопии

DOI:

10.3791/50680

December 9th, 2013

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Мы демонстрируем использование флуоресцентной фотоактивационной микроскопии локализации (FPALM) для одновременного изображения нескольких типов флуоресцентно меченных молекул в клетках. Описанные методы позволяют локализовать от тысяч до сотен тысяч отдельных флуоресцентных меченых белков с точностью до десятков нанометров в пределах отдельных клеток.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Микроскопия сверхвысокого разрешения на основе локализации может быть применена для получения пространственной карты (изображения) распределения отдельных флуоресцентно меченых одиночных молекул в образце с пространственным разрешением в десятки нанометров. Используя либо фотоактивируемые (PAFP), либо фотопереключаемые (PSFP) флуоресцентные белки, слитые с представляющими интерес белками, или органические красители, конъюгированные с антителами или другими молекулами, представляющими интерес, флуоресцентная фотоактивационная локализация микроскопия (FPALM) может одновременно визуализировать несколько видов молекул в отдельных клетках. Используя следующий подход, популяции большого числа (от тысяч до сотен тысяч) отдельных молекул визуализируются в отдельных клетках и локализуются с точностью ~10-30 нм. Полученные данные могут быть применены для понимания наноразмерных пространственных распределений нескольких типов белков в клетке. Одним из основных преимуществ этого метода является резкое увеличение пространственного разрешения: в то время как дифракция ограничивает разрешение до ~200-250 нм в обычной световой микроскопии, FPALM может получать изображения в масштабах длины более чем на порядок меньше. Поскольку многие биологические гипотезы касаются пространственных отношений между различными биомолекулами, улучшенное разрешение FPALM может дать представление о вопросах клеточной организации, которые ранее были недоступны для традиционной флуоресцентной микроскопии. В дополнение к подробному описанию методов пробоподготовки и сбора данных, мы опишем здесь оптическую установку для FPALM. Еще одним фактором для исследователей, желающих проводить микроскопию со сверхвысоким разрешением, является стоимость: собственные установки значительно дешевле, чем большинство коммерчески доступных машин для визуализации. Ограничения этого метода включают необходимость оптимизации маркировки интересующих молекул в образцах клеток, а также потребность в программном обеспечении для последующей обработки для визуализации результатов. В данной работе мы описываем использование экспрессии PAFP и PSFP для визуализации двух видов белков в фиксированных клетках. Также описывается распространение метода на живые клетки.

Introduction

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

В то время как клеточные структуры существуют в широком диапазоне пространственных масштабов, флуоресцентная визуализация клеточной организации на масштабах длины менее ~250 нм ограничена в обычной микроскопии из-за физического ограничения дифракционного предела. Этот предел был преодолен с появлением флуоресцентной фотоактивационной локализионной микроскопии (FPALM1) и аналогичных методов2,3, которые позволяют локализовать большое количество отдельных молекул с точностью ~10 нм, для получения изображений с разрешением в несколько десятков нанометров. FPALM основан на использовании оптического управления для активации и инактивации подмножеств мо....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Обратите внимание: Схематическое представление оптических компонентов, на которые ссылается этот протокол, можно найти на рисунке 1.

1. Подготовка образцов клеток

  1. Пластинчатые ячейки с оптимизированной плотностью (для ячеек NIH-3T3 это примерно 2-5 х 104 ячейки/см2) в лунках 8-луночной камеры. Клетки должны быть покрыты сплошной средой, соответствующей типу клеток, хотя среды должны быть изготовлены без антибиотиков и без фенолового красного, который способствует фоновой флуоресценции. Обратите внимание, что условия для экспериментов с клетками, такие как оптимальный диапазон номеров пассаж....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Гемагглютинин гриппа (HA) образует кластеры порядка от десятков нанометров до микрометров, и эти кластеры вариабельно колокализуются с актином (Рисунок 5). Эти пространственные распределения подтверждают более грубую визуализацию этих двух белков28 и зависимость пространственных распределений HA от актина19. Многоцветные изображения FPALM могут быть дополнительно использованы для описания плотности, площади и периметра этих кластеров, а также степени колокализации между двумя видами.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Визуализация сверхвысокого разрешения на основе локализации предоставляет множество мощных возможностей для биологической визуализации. Переход от отдельных оптических компонентов, размещенных на столе, к функциональному микроскопу сверхвысокого разрешения, способному одновременно визуализировать несколько флуоресцентных веществ в биологическом образце, сопряжен с рядом проблем. Некоторые аспекты выравнивания более важны, чем другие; Ниже мы постараемся предоставить рекомендации потенциальным пользователям, имеющим дело .......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

S.T.H. и M.J.M. владеют патентами в области микроскопии сверхвысокого разрешения. S.T.H. является членом научно-консультативного совета Vutara, Inc.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Авторы хотели бы поблагодарить Филипа Андресена, Мэтью Пэрента и Шона Картера за компьютерное программирование, техническую помощь и полезные беседы, а также Пэта Байарда за административную помощь. Эта работа была профинансирована премией NIH Career Award K25-AI65459, NIH R15 GM094713, NSF MRI CHE-0722759, Технологическим институтом штата Мэн MTAF 1106 и 2061, а также Фондом экономического улучшения штата Мэн.

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Камеры LabTek II Nunc
Флуоресцентные бусиныInvitrogenF-8801Бусины для калибровки Бусины
TetraspeckInvitrogenT-7279Четырехцветные бусины для калибровки
Объектив Иммерсионное маслоZeiss518FИммерсионное масло для высокого NA объектива (в зависимости от выбора объектива)
ВЭЖХ водаFisher ScientificW5-4
MediaATCC30-2003Or Cellgro 10-090
АнтибиотикиGIBCO15070-063
сывороткаThermo ScientificSH30087.03
ЛипофектаминInvitrogen52887
Optimem IGIBCO11058-021
ТрипсинMPBiomedicals
параформальдегидFisher ScientificAA433689MВНИМАНИЕ: Токсичен
1689149

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Hess, S. T., Girirajan, T. P., Mason, M. D. Ultra-high resolution imaging by fluorescence photoactivation localization microscopy. Biophys. J. 91, 4258-4272 (2006).
  2. Rust, M. J., Bates, M., Zhuang, X. Sub-diffraction-limit imaging by stochastic Opt.....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Fluorescence Photoactivation Localization MicroscopyMulticolor ImagingSuper Resolution MicroscopyPhotoactivatable Fluorescent ProteinsPhotoswitchable Fluorescent ProteinsTotal Internal Reflection FluorescenceNanometer Precision ImagingLive Cell ImagingFixed Cell ImagingOptical Setup Alignment

Related Articles