RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Эхокардиография обычно используется для неинвазивной характеристики и количественной оценки изменений в сердечной структуре и функции. Мы описываем ультразвуковой алгоритм визуализации, который предлагает улучшенную суррогатную меру микроструктуры миокарда и может быть выполнен с помощью программного обеспечения для анализа изображений с открытым доступом.
Эхокардиография является широко доступным методом визуализации, который обычно используется для неинвазивно охарактеризовать и количественно изменения в сердечной структуре и функции. Ультразвуковые оценки сердечной ткани могут включать анализ интенсивности сигнала backscatter в данной области, представляющие интерес. Ранее установленные методы опирались преимущественно на интегрированное или среднее значение интенсивности сигнала backscatter, которое может быть восприимчиво к изменчивости от данных, полученных под псевдонимом, от низких частот кадров и задержек времени для алгоритмов, основанных на циклических вариациях. В этом примере мы описываем ультразвуковой алгоритм визуализации, который простирается от предыдущих методов, может быть применен к одному кадру изображения и объясняет полное распределение значений интенсивности сигнала, полученных из данного образца миокарда. При применении к репрезентативным данным мыши и изображений человека алгоритм проводит различие между объектами с хроническим сопротивлением после нагрузки и без него. Алгоритм предлагает улучшенную суррогатную меру микроструктуры миокарда и может быть выполнен с помощью программного обеспечения для анализа изображений с открытым доступом.
Эхокардиография является широко доступным методом визуализации, который обычно используется для неинвазивно охарактеризовать и количественно изменения в сердечной структуре и функции. Ультразвуковые оценки сердечной ткани могут включать анализ интенсивности сигнала backscatter в данной области интереса в один момент времени, а также в течение сердечного цикла. Предыдущие исследования показали, что меры сонографической интенсивности сигнала может определить основное присутствие миокарда волокна беспорядка, жизнеспособной по сравнению с незвукими миокарда ткани, и интерстициальныйфиброз 1-3. Мы называем миокарда «микроструктурой» как архитектуру тканей, которую можно охарактеризовать, используя сонографический анализ, помимо линейных измерений валового размера и морфологии. Соответственно, анализы сонографической интенсивности сигнала были использованы для оценки микроструктурных изменений миокардной ткани в условиях гипертрофической и расширенныхкардиомиопатии 4,5,хронической ишемической болезни сердца 6,7и гипертоническойболезни сердца 8,9. Тем не менее, ранее установленные методы опирались преимущественно на интегрированное или среднее значение интенсивности сигнала backscatter, которые могут быть восприимчивы к изменчивости от случайногошума 5, псевдонимом данные из низкихчастот кадров 10, и задержки времени для алгоритмов, основанных на циклическихвариациях 11.
В этом случае мы описываем метод использования ультразвукового алгоритма анализа изображений, который простирается от предыдущих методов; этот алгоритм фокусируется на одном энд-диастолическом кадре для анализа изображений и объясняет полное распределение значений интенсивности сигнала, полученных из данного образца миокарда. Используя перикард в качестве в кадрессылки 12,13, алгоритм воспроизводит количественно изменения в сонографических распределения интенсивности сигнала и предлагает расширенную суррогатную меру микроструктуры миокарда. В пошаговом протоколе мы описываем методы подготовки изображений для использования, области выборки, представляющие интерес, и обработку данных в отдельных регионах, представляющих интерес. Мы также показываем репрезентативные результаты применения алгоритма к эхокардиографическим изображениям, полученным у мышей и людей с переменным воздействием нагрузки после нагрузки на левый желудочек.
1. Подготовка изображений для анализа
2. Выборка рентабельности инвестиций
3. Анализ и обработка данных
4. Количественная оценка циклической изменчивости
Анализ интенсивности сигнала выполняется в 4 основных шагах(рисунок 1), включая: 1) выборку изображения и форматирование, 2) рентабельность инвестиций и справочные области, 3) применение алгоритма и 4) обработку конечных значений для предоставления коэффициентов интенсивности миокарда к перикардиалу. Выбор и размер рентабельности инвестиций стандартизированы для ограничения интерпользователя, а также внутрипольной изменчивости(рисунок 2). Позиционирование каждой рентабельности инвестиций также стандартизировано в отношении анатомических структур каждого субъекта для ограничения межсубъектной, а также внутрисубъектной изменчивости.
В качестве меры плотности миокарда, алгоритм, как ожидается, выявить изменения интенсивности сигнала на протяжении всего сердечного цикла, что соответствует ожидаемому увеличению плотности миокарда в систоле по сравнению с диастолом. Как показано на рисунке 3, более высокие процентные значения интенсивности сигнала подчеркивают циклическую изменчивость у мышей с и без 7 недель воздействия сопротивления после нагрузки(т.е. мышь, которая подверглась восходящему сужению аорты по сравнению с мышью управления транспортным средством, которая перенесла фиктивную операцию).
Из анализа одного энд-диастолического кадра(рисунок 4), значительныеразличия также отмечены для мыши и человека, подверженных хроническому стрессу после нагрузки (случаи) по сравнению с их репрезентативными коллегами (контроль). Диапазон и величина интенсивности сигнала различаются между случаями и управления. Как видно из анализа циклической изменчивости, 80-е местопо сравнению с 50-мипроцентными значениями в рамках каждого распределения интенсивности сигнала свидетельствует о большей относительной разнице в интенсивности сигнала между случаями и контролем.
Алгоритм, представленный в настоящем, обеспечивает выход в виде миокарда к перикардиальным соотношениям интенсивности сигнала, где перикардиальные значения служат в качестве референта вкадре (рисунок 5). Коэффициент интенсивности сигнала миокарда к перикардиалу был определен на основе однокаумного анализа изображений, полученных от репрезентативного контроля, и случаев послезагрузочного стресса. Со согласием с результатами выше, миокарда к перикардиальной отношение80-й процентильной интенсивности сигнала значения предлагает наибольшую способность различать элементы управления и случаи. Ожидаемые различия в микроструктуре миокарда, основанные на результатах анализа изображений, соответствовали выводам гистологии миокардной ткани в контроле и случае мышей на 7 недель после фиктивной или аортальной хирургии, соответственно (Рисунок 6).

Рисунок 1. Процесс рабочего процесса для отдельного изображения. Этот процесс включает в себя четыре основных шага, которые могут быть повторены при сравнении предметов или при количественной оценке циклической изменчивости.
Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение большего размера.

Рисунок 2. Методика отбора проб по региону, представляющий интерес (ROI). Алгоритм анализа изображений стандартизирован для применения у мышей(A)и у людей(B). Показаны выбор миокарда и перикардиального выбора для репрезентативных изображений мыши и человека, соответственно.
Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение большего размера.

Рисунок 3. Изменение интенсивности сонографического сигнала на протяжении всего сердечного цикла. Алгоритм был применен к области миокарда, представляющие интерес для последовательных кадров изображений DICOM, полученных от репрезентативноймыши управления (A)и аортальной мыши(B). Частота кадров составила 212 для обоих изображений. Для этих изображений циклическая изменчивость оценивалась с помощью 3 огранок:20-й процентиль (алмаз), 50-йпроцентиль (квадрат) и 80-й процентиль (треугольник). Относительная циклическая изменчивость выше для значений80-го процента, чем для более низких значений точки разреза. Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение большего размера.

Рисунок 4. Распределение интенсивности сигнала показано на однока частотном анализе репрезентативных изображений мыши и человека. Гистограммы отображают распределение интенсивности сигнала, полученных из миокарда мыши управления на 7 недель после фиктивной хирургии (A), аорты полосатой мыши на 7 недель послеоперации( B ), нормотензивный человек (C), и гипертонической человека (D). Синие вертикальные линии обозначают20-й процентиль,50-й процентиль и 80-епроцентильное значения. Распределения интенсивности сигнала являются право-сдвинуты, и больше по диапазону, для субъектов с хроническим стрессом после нагрузки(т.е. аорты полосами по сравнению с контрольной мыши, и гипертонической по сравнению с нормотензивным человеком).
Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение большего размера.

Рисунок 5. Репрезентативные данные, полученные алгоритмом анализа изображений. (A) показывает данные из фиктивных работает (контроль) по сравнению с аорты полосатой (дело) мыши на 7 недель. (B) показывает данные от человека с нормальным кровяным давлением (контроль) по сравнению с человеком с хронической гипертензией (случай). Соотношение интенсивности миокарда к перикардиалу было определено с помощью 3 аналитических методов в алгоритме: соотношение20-процентных значений; соотношение 50-процентныхзначений; и соотношение 80-хпроцентилинных значений. Наибольшая разница между контролем и случаями демонстрируется с помощью соотношения80-х процентилинных значений интенсивности сигнала.
Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение большего размера.

Рисунок 6. Различия в гистологии миокарда тканей между мышами с и без воздействия после нагрузки стресса. Трихромные окрашенные участки левого желудочка представителя Массона показаны для мыши, которая перенесла фиктивную операцию(A: control) и мыши, которая подверглась полосированию аорты(B: case) через 7 недель после операции. Разделы показывают наличие существенного осаждения коллагена и интерстициального фиброза в случае по сравнению с контролем. Шкала баров составляет 50 мкм.
Нажмите здесь, чтобы просмотреть изображение большего размера.
Конфликт интересов не заявлен.
Эхокардиография обычно используется для неинвазивной характеристики и количественной оценки изменений в сердечной структуре и функции. Мы описываем ультразвуковой алгоритм визуализации, который предлагает улучшенную суррогатную меру микроструктуры миокарда и может быть выполнен с помощью программного обеспечения для анализа изображений с открытым доступом.
Мы благодарны за ресурсы, предоставляемые Гарвардской медицинской школы / Бригам и женской больницы сердечно-сосудистой физиологии Core Laboratory. Эта работа была частично поддержана финансированием из национальных институтов здравоохранения гранты HL088533, HL071775, HL093148, и HL099073 (RL). MB был получателем Американской ассоциации сердца основатель филиала постдокторской стипендии награду. KU является получателем Американской ассоциации сердца учредителей филиала постдокторской стипендии награду. SC была поддержана наградой от Фонда Эллисона.
| ImageJ v 1.46 | NIH (Bethesda, MD) | программное обеспечение | |
| открытого доступа Power ShowCase | Trillium Technology (Ann Arbor, MI) | коммерческое программное обеспечение |