Позвоночные паразитируют на четырех основных группах гельминтов (червей). Две группы, трематоды, или сосальщики, и цестоды, или ленточные черви, относятся к типу Platyhelminthes. Две другие группы — это нематоды, или круглые черви (Nematoda) и акантоцефалы, или колючеголовые черви (Acanthocephala). Многие из этих паразитов были зарегистрированы как причины заболеваемости и смертности среди диких птиц и млекопитающих1,2.
Большинство гельминтов имеют сложные жизненные циклы, включающие более одного хозяина1,2 . Например, у трематод есть один или два промежуточных хозяина (обычно беспозвоночных) и конечный хозяин. Для завершения цикла должны быть доступны все хозяева и, таким образом, взрослые гельминты должны присутствовать в последних хозяевах (которые являются темой данной рукописи). Поэтому важно иметь в виду, что сезонные колебания распространенности и интенсивности некоторых видов гельминтов могут возникать и желательно проводить долгосрочный мониторинг для захвата всего гельминта ауны конкретного хозяина.
Оптимальный метод сбора гельминтов - это осмотр хозяина, который был усыплен. Это позволяет собирать гельминтов, пока они еще живы, и правильно расслаблять и фиксировать их. Материал от хозяев, которые были мертвы более 24 часов назад или были заморожены и разморожены для исследования, часто хуже и его трудно идентифицировать. Трематоды и цестоды от замороженных или формалинизированных хозяев часто сильно заражены и утратили структуры, имеющие решающее значение для идентификации, такие как оральные шипы у трематод или крючки на сколексе ленточных червей. Однако реальность такова, что большая часть материала, доступного от позвоночных хозяев в наши дни, заморожена или сохранена.
Базы данных, содержащие информацию о последовательности ДНК гельминтов, быстро растут, и таким образом таксономическая идентификация уже возможна для многих видов. Поэтому гельминты должны быть максимально сохранены для потенциальных анализов ДНК. Однако ДНК хорошего качества невозможна, если образцы зафиксированы в формалине. Описанные здесь методы сбора и уничтожения гельминтов позволят получить материал, пригодный для экстракции ДНК и генетического анализа.
Ниже мы подробно описываем методы вскрытия позвоночных (амфибий, рептилий, птиц и млекопитающих; моногенные трематоды из рыб не включены) для сбора гельминтов, а затем процедуры по их сохранению и обработке для таксономической идентификации.