Протоколы, описанные здесь измерения зондирования Т-клеток, инфицированных GFP-тегами ВИЧ-1 вирусов, которые отличаются только в их способности выражать ВПУ, как описано в нашей последнего доклада 18. Тем не менее, эти методы можно легко модифицировать для изучения зондирование непомеченных вирусов, а также вирусов, не имеющих других вирусных генов, которые потенциально могут модулировать врожденный зондирования. Если вирусы, используемые не экспрессируют GFP, процент инфицированных клеток-мишеней должна быть определена другими способами предшествующих со-культуры, такие как р24 (капсида) внутриклеточного окрашивания и проточной цитометрии, или р24 ELISA. Кроме того, эти протоколы могут быть использованы с различными целевыми Т-клеток, в том числе различных доступных клеточных линий и первичных клеток.
Методы, описанные в этой рукописи имеют ряд преимуществ по сравнению с ранних методик, используемых для исследования ВИЧ-1 зондирования. В первую очередь он был создан ряд групп, которые бесклеточный ВИЧ-1 рстатьи бедные индукторы типа I IFN 2,13,14. Кроме того, ранние исследования опирались на старые методы IFN & ИФА на основе количественной оценки количества типа I IFN производится. Ограничение этого метода обнаружения, что большинство старых комплектов IFN & ELISA измерять только один тип alpha; -IFN, в то время как с видом на другие типы & alpha; -IFN и IFNβ. Применение описанных линий клеток репортерных преодолевает это ограничение, так как концентрация всех биологически активных форм интерферонов типа I. человека может быть измерен за один раз. Методика очень чувствительна, дешевле, чем новое поколение ИФН ELISA комплекта и в течение многих доноров большие количества типа I IFN могут быть легко обнаружены. Тем не менее, этот протокол может быть легко адаптирована для использования с другими типа-я ИФН методов чтения из таких, как ИФА.
Критические шаги: Важно, что качество всех клеточных компонентов (Обе цели и эффекторов) быть жестко контролируется. Потенциал загрязнения, даже когда asymptomatic, нужно контролировать и управлять. Как упоминалось ранее, антибиотик управлением бессимптомной бактериальное заражение, и, возможно, другие внутриклеточных возбудителей, таких как микоплазмы, может генерировать подобные иммунные ответы на те наблюдаемые после инфекции ВИЧ-1, а именно производства типа I IFN. Кроме того, все реагенты должны быть свободны от ЛПС или других потенциальных эндотоксинов. Точно так же, мониторинг МНПК и PDCs также важно, так как образцы человека часто может быть загрунтованы с помощью основных текущих инфекций, которые могут повлиять на нормальное зондирование. Мы рекомендуем всегда включать предлагаемые отрицательных контролей, такой отсутствие клеток-мишеней, а также сопутствующих культур с ложно инфицированных клеток. Жизнеспособность инфицированных клеток также имеет важное значение для правильного PDC зондирования, поскольку типа I IFN не производится после совместного культивирования с апоптотических клеток 2,14.
Одним из важных ограничение метода является необходимость свежевыделенных первичных клеток. Эта процедура непротестированы с использованием МНПК или PDCs, которые были либо ранее замороженные или хранятся в культуре. Изоляция МНПК является трудоемким и эти клетки имеют очень ограниченный срок службы. Кроме того, стандартные протоколы для защиты от через кровь возбудителя следует использовать при работе с кровью человека. Есть часто несколько источников изменчивости, связанные с работой с участием Свежевыделенные клетки человека. Среди них различные процедуры, осуществляемые изолировать эти клетки, и унаследовал изменчивость встречающиеся из донора-на-донора. В то время как это невозможно, чтобы избежать вариабельность донора, использование предложенных положительного контроля, таких как измерения ответ на известных агонистов TLR7 и TLR9 путей, обеспечит важную внутреннего контроля для этих экспериментов. Мы заметили, что надежный ответ на агонисты TLR9 пути может быть связано со здоровым PDC ответ, в то время отзывчивый TLR7 путь необходим для правильного ответа против ВИЧ-1 3.
На основании наблюдений, сделанных нами и другими 2, обогащение PDCs от МНПК часто не нужны. Однако, если опытно-конструкторских требует (например, в условиях, когда истощение конкретных PDC поверхностных маркеров необходимо) негативной селекции является более предпочтительным, чем позитивной селекции, а клетки остаются свободными антител после отбора. Изолированные PDCs подвергаются быстрому апоптоза в культуре. Для экспериментов, которые требуют эти клетки культивировали в течение быть длительного периода времени, питательные среды может быть дополнена IL-3. Этот цитокин индуцирует пролиферацию PDC и ингибирует их апоптоз 16. Тем не менее, Ил-3 использование должно быть жестко контролируется, так как это может привести к PDC созревания или дифференциации.
Метод, описанный здесь сочетает в себе цель ВИЧ-1-инфицированных клеток с свежевыделенных МНПК или PDCs для того, чтобы воссоздать исходные этапы во врожденной зондирования. Этот метод, несомненно, будет полезна для Explorе ранние врожденной иммунной события, связанные с ВИЧ-инфекцией. Хотя связанные протоколы направлены на измерение типа I IFN, они легко могут быть изменены для измерения других биологически активных молекул, освобожденных из PDCs после признания инфицированных клеток. Они могут включать: типа III ИФН (ИФН-λ), провоспалительных цитокинов (таких как TNF-a и IL-6) и хемокинов, CXCL10 CCl4 и CCL5 17.