Вся обработка животных и сбор урожая ткани проводили в соответствии с руководящими принципами университета Массачусетс медицинской школы Комитета Уходу за животными использования (IACUC), следуя утвержденной протокол № A1506 (Меликян, PI).
Обязательные решения
Искусственный спинномозговой жидкости (ACSF) - Сделать свежий ежедневно
125 мм NaCl, 2,5 мМ KCl, 1,2 мМ NaH 2 PO 4, 1,2 мМ MgCl 2, 2,4 мМ CaCl 2, 26 мМ NaHCO 3, и 11 мм глюкозы
Примечание: Подготовка ACSF в виде исходного раствора 10x, за исключением NaHCO 3 и глюкозы. Сделать 1x рабочие растворы ежедневно с 10-кратным складе, дополняя свежего NaHCO 3 и глюкозы.
Сахароза-дополняется ACSF (SACSF) - Сделать свежий ежедневно
250 мМ успешнорозы, 2,5 мМ KCl, 1,2 мм NaH 2 PO 4, 1,2 мМ MgCl2, 2,4 мм CaCl 2, 26 мМ NaHCO 3, и 11 мМ глюкозы
Примечание: Подготовка SACSF в виде исходного раствора 10x, за исключением NaHCO 3 и глюкозы. Сделать 1x рабочие растворы ежедневно с 10-кратным складе, дополняя свежего NaHCO 3 и глюкозы.
Сульфо-N-hydroxysuccinyl-SS-биотин (сульфо-NHS-SS-биотин, Pierce Chemical Company)
Маточные растворы должны быть 200 мг / мл в ДМСО и устойчивы к нескольких циклов замораживания / оттаивания. Аликвоты хранили при -20 ° С. Сукцинил эфир быстро гидролизуется в водном растворе, так рабочие растворы следует готовить непосредственно перед нанесением на ломтики.
Кусочек Quench Решение
ACSF дополнен 100 мМ глицина
РИПА Lysis Buffeг
10 мМ Трис, рН 7,4, 150 мМ NaCl, 1,0 мМ ЭДТА, 1% Triton-X-100, 0,1% SDS, 1% Na деоксихолат
РИПА с ингибиторов протеазы (РИПА / PI) - Сделать свежий ежедневно
RIPA с добавлением 1 мкМ лейпептина, 1 мкМ пепстатина, 1 мкМ апротинина и 1 мМ фенилметил сульфонил фторид.
1. Подготовка мозга фрагменты
- Сделать свежий 1x SACSF и 1x ACSF
- Холод SACSF на льду в небольшой стакан. Эта информация будет использоваться для хранения свежесобранных мозг мыши.
- Пропитайте ACSF и SACSF с кислородом путем пропускания с 95% / 5% O 2 / CO 2, 20 мин на льду.
- P30-38 мыши должны использоваться для оптимальной жизнеспособности ткани. Жертвоприношение животных путем смещения шейных позвонков и обезглавливания, и быстро удалить мозги в prechilled, насыщенный кислородом SACSF.
- Использование вибрирующий микротом, составит 300 срезы головного мозга мкм в интересующей области.
- При желании, ломтики могут быть дополнительно расчлененные до восстановления для обогащения конкретных областях мозга или отдельной правым и левым полушариями, чтобы использовать как контрольной и экспериментальной ломтиками, соответственно.
- Использование огневой полировкой пипетки Пастера, передать ломтиками, чтобы сетка дном камеры, установленные в 24-луночных планшетах.
- Разрешить кусочки, чтобы восстановить в течение 40 мин, 31 ° С в ACSF кислородом, при непрерывном барботировании, нежный.
2. Лечение наркотиками (в случае необходимости) и ломтик Биотинилирование
- После восстановления, мыть ломтики 3x в нагретого (37 ° C), насыщенный кислородом ACSF пузырьков постоянно с 95% / 5% O 2 / CO 2.
- Добавить тестируемых соединений и инкубировать с непрерывным оксигенации.
- Для удобства, добавьте 1/10 объема 10х концентрированного препарата, и смешать, аккуратно переворачивая.
- Взболтать слегка пластины в водяной бане при желаемой температуре.
- После медикаментозного лечения, быстрохолод ломтики промывкой 3 раза в ледяной ACSF.
3. Biotinylate поверхностных белков
- Подготовка 1,0 мг / мл сульфо-NHS-SS-биотин в ледяной ACSF непосредственно перед маркировкой.
- Добавить 0,75 мл сульфо-NHS-SS-биотин, чтобы ломтики и инкубировать ломтиками на льду, 45 мин.
- Промыть ломтики три раза быстро ледяной ACSF, затем инкубируют в течение 10 мин в ледяной ACSF на льду.
- Вымойте ломтики три раза ледяным буфером ломтик закалки и инкубировать с 0,75 мл ломтик резкого буфера два раза, 25 мин, на льду, чтобы утолить бесплатно сульфо-NHS-SS-биотин.
4. Подготовка Tissue лизаты
- Вымойте ломтики три раза в ледяной ACSF и передать каждый ломтик в микроцентрифужных трубки с помощью огневой полировкой пипетки Пастера.
- Аккуратно осаждения кусочек путем центрифугирования 200 мкг, 1 мин и тщательно аспирации оставшиеся ACSF.
- Добавить 400 мкл ледяной RIPA / PI и разбить ткани с помощью пипетки вверх и вниз, как только через P200 пипсEtte.
- Передача диссоциируют среза / RIPA в свежую пробирку и инкубируют 30 мин, 4 ° C, вращение, чтобы завершить лизис.
- Гранул распада клеток путем центрифугирования, 18000 XG, 15 мин, 4 ° С
- Определение концентрации лизата белка с помощью анализа белка ВСА, с бычьим сывороточным альбумином (BSA) в качестве стандарта.
5. Изолировать Биотинилированные Белки
- Оптимизация / общее соотношение белка бисера.
Примечание: индивидуальные уровни экспрессии белка может варьироваться в широких пределах в разных областях мозга. Если все биотинилированного белка в данном количестве тканей лизата не захвачен, это не возможно точно определить любые потенциальные изменения в экспрессии поверхности. Поэтому крайне важно, чтобы эмпирически определить оптимальный / общее соотношение белка шарик для конкретного региона белок / мозга, до начала работы на новом исследовании ломтик биотинилирования. - Выдержите 25 мкл стрептавидин агарозном бисером с увеличением количествас тканевой лизата (примерный диапазон 25-200 мкг), а затем действуйте, как описано ниже для связывания, стиральные и элюирования шаги.
- Количественная полученные иммунореактивные группы и выбрать соотношение шарик / лизата в линейном диапазоне связывания которые позволят обеспечить точный количественный анализ либо увеличивается или уменьшается выражение поверхности белка.
- Подготовка Стрептавидин-агарозы
- Определение общего объема шарика, необходимую для всех образцов. Подготовка достаточный объем шарик на эту сумму плюс одна посторонняя (т.е. 4 образцов при 25 мкл / образец = 100 мкл бисер + один дополнительный = 125 мкл бисером.
- Vortex Стрептавидин шарик акции и пипетки из требуемого объема. При использовании P200 пипетки, отрезать конец наконечника для предотвращения блокировки или шарик ущерб.
- Вымойте бисером 3 раза в 0,5-1,0 мл RIPA / PI удалить консервантов, вихревание после каждого RIPA того и коллекторов бусы между моет путем центрифугирования 18000 мкг, 1 мин, при комнатной нравратура.
- Аспирируйте от буфера между стирок с использованием стекла пипетки Пастера, прикрепленный к вакуумной колбе. Пластиковая P200 наконечник прикреплен к концу стекло пипетки Пастера обеспечивает более точное управление при аспирации. Это не обязательно, чтобы удалить абсолютно все буфера в течение первых двух стирок, так как он рискует аспирационные бусы в пипетку. После последней промывки, удалить как можно больше избыточный буфер, насколько это возможно без аспирации шарики.
- Добавить RIPA / PI довести шарики обратно к своему первоначальному объему, пипетки вверх и вниз, чтобы ресуспендируют. Избегать вихревание в этой точке, как бисер будет прилипать к стенке трубы.
- Алиготе шарики в микроцентрифужных пробирок с помощью Р200 с наконечником отрезаны. Внесите вверх и вниз несколько раз между выборки для обеспечения шарики остаются равномерно приостановлено и рассеянный между трубками.
- Привязка биотинилированные белки со стрептавидином шарики
- Распределить клеточных лизатов в пробирки, содержащие агарозном бисером. Для экспериментов Whe вновь сравниваются несколько образцов, не забудьте использовать такое же количество белка для каждого образца для точных сравнений.
- Добавить дополнительную RIPA / PI довести до образцов к 200 мкл минимальном объеме. Это гарантирует, что образцы будут смешивать адекватно во время инкубации, а также объединяет концентрации белка по образцам.
- Поместите трубки в трубчатой ротатора и смешивать в течение ночи при 4 ° С.
- В отдельных трубок, обойтись эквивалент общего объема лизата, используемой для каждого образца. С другой стороны, если образец высоких объемах, часть от общего объема лизата могут быть зарезервированы вместо этого, чтобы приспособить максимальных объемов нагрузка на ПААГ с ДСН. Они будут использоваться для нормализации поверхностной экспрессии к общему количеству белка.
- Добавить либо равным объемом 2х или 1/5 объема 6x SDS-PAGE образца буфера и либо инкубировать при температуре 4 ° С, параллельно с образцами шариков или хранить при -20 ° С до образцы не анализировали.
ove_title "> 6. Элюировать и анализ проб
- Гранул бусы путем центрифугирования 18000 мкг, 2 мин, при комнатной температуре.
- Аспирируйте супернатантные и мыть шарики три раза 0,75 мл RIPA. Чтобы свести к минимуму потери шарик, оставить небольшой объем головы буфера выше бисером между стирок. После последней промывки, удалить как можно больше RIPA, насколько это возможно, без нарушения шарик гранул.
- Элюции биотинилированные белки стрептавидином шариков за счет уменьшения дисульфидную связь. Добавьте 25 мкл 2x SDS-PAGE уменьшая образец буфера, вихрь также и вращать образцы 30 мин, комнатной температуры.
Примечание: Многие мембранные белки имеют высокую тенденцию к агрегации при кипячении в SDS-PAGE образца буфера, сильно ухудшая их электрофоретической подвижности. Если это имеет место для белка под следствием, во избежание нагрева образцов и, вместо этого, элюируют медленно при комнатной температуре. Если кипящей абсолютно необходимо (например, если другой белок оценивали параллельно требуется кипячение), SAMPLе буфер может быть дополнена 2 М мочевины (конечная концентрация) для сведения к минимуму агрегации. В то время как эффективность в снижении агрегации в некоторых случаях, мочевина часто ставит под угрозу появления полос. - Анализ образцов с помощью иммуноблот.
- Оттепель всего образцы лизатов и поверните параллельно с образцами Бисера, 30 мин, комнатной температуры.
- Отдельные белки на ПААГ с ДСН.
- Определить белок (ы) интересов иммуноблоттингом.
- Убедитесь, что полосы обнаружены в линейном диапазоне обнаружения для правильного количественного определения.
- Чтобы гарантировать, что биотинилирование реагент не получил доступ к внутриклеточных белков с помощью поврежден / скомпрометированных клеток. Это лучше всего достигается иммуноблоттингом параллельно для внутриклеточного белка, характерные для этого типа клеток, ведется расследование.
- Количественная плотность диапазона и рассчитать относительную белка поверхностную плотность в процентах от общего уровня экспрессии белка.