Экспериментальный протокол для работы с завод-индуцированной неоднородности почвы

Краткое содержание

Понимание роли экологической гетерогенности видового сосуществования обычно сосредоточены на виды неоднородности, которые внешними по отношению к видовому составу сообщества. Мы предоставляем новые подробные методы для создания почвы неоднородности процедуры с использованием почвы, подлежащих завод-почвенного обратной воздуха, или неоднородности внутренней составу сообщества.

Аннотация

Теория Сосуществование часто рассматривается экологической гетерогенности как не зависит от состава сообщества, однако биотические обратные связи, такие как завод-почвенных обратных связей (ФСФ) имеют большое влияние на производительность растений, а также создавать экологическую неоднородность, которая зависит от состава сообщества. Понимая важность PSF для сборки растительных сообществ требует понимания роли неоднородности в PSF, в дополнение к средней эффекты ФСФ. Здесь мы описываем протокол для управления завода-индуцированной неоднородности почвы. Два примера эксперименты представлены: (1) полевой эксперимент с 6-патч сетки почв для измерения растений ответов населения и (2) парниковых эксперимент с 2-патч почв для измерения индивидуальных реакцию растений. Почвы могут быть собраны из зоны корень влияния (почв от ризосфере и непосредственно примыкает к ризосфере) растений в области от конспецифичный и гетероспецифических видов растений. Репликация собиратьионы используются, чтобы избежать pseudoreplicating образцы почвы. Эти почвы помещают в отдельные участки для гетерогенных лечения или смешанная для гомогенизированный лечения. Следует проявлять осторожность, чтобы гарантировать, что гетерогенные и гомогенизированные лечения испытать такую ​​же степень возмущения почвы. Растения могут быть помещены в эти обработки почв для определения влияния растительного вызванной неоднородностью почвы на производительность растений. Мы демонстрируем, что растительные вызванной неоднородности результатов в различных результатов, чем предсказанные традиционных моделей сосуществования, возможно, из-за динамичного характера этих обратных связей. Теория, которая включает экологическую неоднородность зависит от сборки сообщества и дополнительной эмпирической работы, чтобы определить, когда неоднородность присуща сборочной сообщества приведет к разным результатам сборки по сравнению с неоднородности внешними по отношению к составу сообщества.

Введение

Одна из основных задач экологии сообществ является для объяснения и прогнозирования процессов, регулирующих сборку сообщества. Тем не менее, растительные сообщества, часто более разнообразны, чем предсказывает теория сосуществования ^1, и реставрационные экологи должны понимать механизмы сосуществования успешно восстановить различные родные общины ^2. Экологическая гетерогенность является теоретически важным механизмом, который может помочь объяснить высокие уровни сообщества разнообразия, но экспериментальные манипуляции неоднородности являются нечастыми ³ и сосредоточиться на абиотической неоднородности (например отзывы в Lundholm ^4). Теория, которая включает неоднородность обычно предполагает, что неоднородность внешними по отношению к сборочной сообщества. Внешняя неоднородность регулируется такими факторами, как ландшафтного типологии, которые не зависят от состава сообщества. Внешняя неоднородность может привести к сосуществованию через нишу разделения (Ревипоженились в Мельбурне и др.. ^3, например Пакала и Тильман ⁵ и Chesson ^6). Тем не менее, большая часть экологической неоднородности, имеющей отношение к растительных сообществ может быть присущи общине, развивается как община собирает и в зависимости от идентичности видов в сообществе. Внутренняя неоднородность может быть результатом биотических обратных связей, которые могут привести к сосуществованию через отрицательной частотной зависимости (например Бевер др.. ^7). Здесь мы описываем новый метод для манипулирования завод-индуцированной неоднородности почвы, тип неоднородности почвы, которая присуща сообщества и возникает из растительного грунта обратных связей.

Завод-почвенные отзывы (PSF) возникают, когда растения влияют на структуру почвы, химию, или биоты в манере, которая влияет на последующую производительность предприятия в этой почве, и PSF обладают большой длиной воздействие на производительность завода в родных растительных сообществ ⁸. Исследования PSF, как правило, либо собраны почв от области или условных почвы экспериментально, а потом спросил, как растения выполняют в конспецифической относительно почвы для гетероспецифических или стерилизовать почву ^9. Если растения лучше работать в конспецифической относительно почвы для ссылки почвы, то PSF положительны, в то время как если растения лучше работать в справочных почв, PSF отрицательны. Взаимное отрицательный PSF может привести к частотно-зависимого сосуществования видов ^7. В то время как средние эффекты PSF хорошо характеризуется ^8, эффекты пространственной неоднородности в PSF мало изучены ^10.

Потому что PSF происходят в масштабе отдельных предприятий ⁷ и потому растения часто неслучайно распределены в пространстве и времени, PSF, скорее всего, приведет к неоднородности почвы, которую мы называем завод-индуцированной неоднородности почвы. В отличие от многих других форм неоднородности (например пейзаж топологии), это heterogeneitу присуща сборочной сообщества и может таким образом влиять сборку сообщества иначе, чем более внешних форм неоднородности. Для того чтобы понять влияние этой формы неоднородности на производительность растений и сосуществования, мы должны экспериментальные методы, которые манипулируют завод-индуцированной неоднородности почвы. Здесь мы продемонстрировать такой способ, который использует почвы, обусловленные двух видов для создания гетерогенного лечение отдельные участки почвы от двух происхождения и однородной обработки, которая представляет собой смесь двух почвы происхождения. Это смешение почвы могут представлять по меньшей мере два возможных сценариев в области: (1) возмущений (например, грызунов, сельское хозяйство), который смешивает почвы различного происхождения или (2) растения двух видов, растущих в непосредственной близости, например, что их зоны корневой влияния смешиваются и гомогенизации.

Приведем два примера эксперименты, которые используют завода-индуцированной неоднородности почвы ответить на ключевые вопросы на разных Левелс из экологической организации: (1) популяции растений реагировать ли посадить вызванной неоднородность почвы? и (2) индивидуальные растения реагируют ли на завод-индуцированной неоднородности почвы? Мы описываем поле эксперимент с использованием 6 почвы патчи для решения первого вопроса и парниковый эксперимент с использованием 2 почвы патчи для решения второго вопроса. Количественная как население и индивидуальные реакции растений на неоднородности почвы имеет важное значение для понимания того, как узел неоднородность влияния сообщества.

Протокол

1. Сбор полей Грунты для производства продуктов гетерогенных и гомогенных обработки почв

1. Определите два cooccurring видов растений в подобных мест обитания и типов почв для исследования (например, рис 1а). Определить количество почвы необходимо на основе почвы размера пятна использовать в эксперименте (например, один третьей до половины первичной корневой зоне фокальной биологических видов или объема охваченной корневой ком) и количество патчей, необходимых для эксперимента (см. схемы 2 и 3, ниже).
   1. Для Румекс SPP. (Рис. 1а), использовать почвенные участки 10 см х 10 см х 18 см (длина х ширина х глубина) для приближенного корневой зоне 10 см радиусе от основания завода до 18 см глубиной (5655 см ³ почвы от этой определенной зоне корень влияние на один отдельного растения дает 3 почвы участки 1800 ³⁾ см.
2. Обследование поле сайт, чтобы найти взрослых особей двух координационных видов. Избегайте людей, чьи кенгурут зона всего перекрывается с другими координационных видов (например Rumex лица находится в пределах 0,25 м от других видов). Отметить количество лиц, необходимых для получения необходимого количества грунта с контактными флагов.
   1. Марк 20 случайно выбранных особей каждого Румекс SPP. в течение 20 экспериментальных установок (2 вида х 2 обработки почв х 5 повторов), что каждый требуют 3 почвы патчи от каждой тематической видов (как в Протоколе 2, ниже).
3. Стерилизовать почвы сбора оборудования (лопаты, перчатки, перевозящие контейнеры) с примерно 1:10 смеси хлорной извести (5-10% NaClO) и водой, чтобы удалить все частицы грунта. Сухой оборудование перед использованием, чтобы избежать отбеливания воздействие на почвенной биоты. На каждом часть оборудования с лабораторной ленты, чтобы указать фокусное видов, чьи почвы он будет собирать или транспортной, чтобы избежать перекрестного загрязнения (например метки одна лопатка для видового А и второй лопатой для видового B).
4. Проверьте погоду и Конди почвыTIONS перед началом сбора почвы для недавних событий осадков. Избегайте сбора почвы, которые являются слишком влажный (мутная или полностью насыщенный) или сбора почву во время осадков случае свести к минимуму уплотнение почвы. Избегайте сбора почвы, которые являются слишком сухой (очень трудно, и трудно вставить лопату в) для оказания помощи в отделении почву от корней.
5. Соберите поля почву от отмеченных лиц двух координационных видов в повторных партий, чтобы избежать pseudoreplication (например, одного образца почвы, содержащей редкие патоген время впоследствии смешанный через экспериментальных повторах).
   1. Выкопайте полную корневую зону индивида видового А (как определено в пункте 1.1) с соответствующим-меченого стерильной лопатой, удалить видимые грубые корни из почвы с соответствующим меченных стерильные перчатки, и поместите почву в соответствующим образом помечены стерильной транспортный контейнер (например, ведро). Для эксперимента с 4 экспериментальных установок в каждом блоке и 1 отдельного растения'Ы корневой зоны обеспечивая достаточно почву для 1 экспериментального блока (как в разделе 1.2.1), повторите эту процедуру в течение 3 дополнительных особей вида A.
   2. Повторите Раздел 1.5.1 для видов B.
   3. Транспорт реплику коллекцию почвы от обоих видов в экспериментальной площадки. Наведите почву в экспериментальных установок для блока 1 эксперимента (как в Протоколе 2 или 3, ниже), где блок содержит экспериментальную устройство от каждой комбинации лечения (то есть каждый вид х каждой обработки почвы).
   4. Повторите раздел 1.5.3.
   5. Повторите положений разделов 1.5.1-1.5.4 для остальных блоков в эксперименте. Сбор почву от групп лиц не менее 1 м на расстоянии от предыдущих местах сбора подписей для каждой параллельной коллекция минимизировать pseudoreplication.

Figurе 1. Пример поля опытно-конструкторских манипулирования завод-индуцированной неоднородности почвы. (А) Почвы собраны из зоны корневой влиянием горбачей (α) и heterospecifics (β) в области, в соответствии со стандартными протоколами для изучения эффектов растительного слоя почвы обратные связи ⁹ . (Б) Экспериментальные процедуры с гетерогенных почв, состоящих из почв от растений А (α почв) и почв от растений B ('β' почвы) расположены в сетке, и гомогенизированные лечения почвы создается с равным смеси почв от этих двух начал . В этом примере, сетки полевых почвах вставляются в горшках большого диаметра затонувших в землю и область вокруг каждой сетки наполняется крупным, стерилизованного песка. Эта цифра была изменена от Брандт и др. ^10.

2. Пример полевой эксперимент, Создание Сетки гетерогенных и гомогенных почвы измерить реакции популяций растений

1. Используйте почв от реплики с коллекции поле почвы (протокол 1) производить гетерогенную лечение (т.е. переменное ячейки сетки содержат почву, собранную из видов А или вида Б) и однородную лечение (то есть каждая ячейка сетки содержит смесь 1:1 почвы от видов А и В) (рис. 1б) для блока 1 эксперимента в следующих шагах.
   1. Стерилизовать оборудование для обращения почвы (мастерки, перчатки, пластиковую решетку) с примерно 1:10 смеси хлорной извести (5-10% NaClO) и водой, чтобы удалить все частицы грунта. Сухой оборудование перед использованием, чтобы избежать отбеливания воздействие на почвенной биоты. На каждом часть оборудования с лабораторной ленты, чтобы указать фокусное видов, чьи почвы он будет обрабатывать, чтобы избежать перекрестного загрязнения (например, этикетки один шпатель для видового А и второй шпатель для видового B) и пластиковую решетку, чтобы указать, будет ли использоваться это для гетерогенной или гомогенной обработки почвы.
   2. Поместите съемный пластиковую решетку вгоршок затонувшего в землю [или другой участок или контейнера, достаточно большой, чтобы разместить сетку] должны быть заполнены с собранной на местах почву (например, 1800 см ³ / ячейки сетки, как в пункте 1.1.1). С помощью пользовательского возведенных сетку желаемых размеров, например 2 х 3 сетки с 6 клетках размером определено на этапе 1,1 (рис. 1b).
      1. Для гетерогенной лечения переменного почвы типы патч, размещать spadefuls почвы от видового А в ячейках сетки для α почвы и почвы от вида B в клетки для β почвы (рис. 1b).
      2. Для однородной лечения, разместить чередующиеся spadefuls почв а и б в каждой ячейки сетки, заботясь, чтобы равномерно распределить два типа почвы и избежать образования слоев каждого типа почвы (рис. 1b). Для патча пример почвенной 1800 см ³ (раздел 1.1.1), поместите 900 см ³ каждого типа почвы в каждой ячейки сетки.
      3. Будьте сЮр, чтобы произвести одинаковое количество нарушений (т.е. разбить почвы комья в той же степени) при создании гетерогенных и гомогенных лечения почвы, чтобы избежать оправдав нарушение почвенного покрова с неоднородностью почвы.
   3. Если пустое пространство остается вокруг внешней части сетки в большом горшке, используемого (как на рисунке 1b), заполнить эту область стерильной песка. Стерилизовать песок, используя любой стандартный метод (например, автоклавирования, гамма-облучение).
   4. Поднимите пластиковую решетку вертикально из горшка, оставляя почвы патчи нетронутыми. Это позволяет корни от разных людей, чтобы взаимодействовать в почве и на каждом заводе, чтобы испытать несколько патчей, что очень важно для обеспечения возможности корни растений расти на несколько патчей почвы (т.е. ячеек).
   5. Повторите положений разделов 2.1.2-2.1.4 для второй пары экспериментальных установок для создания полного экспериментальный блок (т.е. сетка гетерогенной почвы, в которую посадить каждый Фокал видов и сетка однородной почве, в которую посадить каждый фокусное видов, в общей сложности 4 экспериментальных установок).
2. Повторите шаг 2.1 для оставшихся блоков в эксперименте с оставшейся почвы повторить коллекции (протокол 1). Случайно блоки и участки в пределах блоков, на протяжении экспериментального зоне, используя пейзаж ткани вокруг участков При желании сохранить затенение от внешнего растительности как минимум (не показан).
3. Семена растений координационных видов в каждой ячейки сетки каждого экспериментального горшок (2 координационных видов х 2 обработки почв). Используйте пула семя, чтобы избежать вмешивающихся генотипов растений или семян поверхности микробных сообществ с обработки почвы. Например, семена растений из каждой Румекс SPP. в банк для этого вида (рис. 1а) индивидуально приклеенной к пластиковых зубочисток водорастворимым клеем в 12 позиций посадки (2 положения в ячейке сетки), чтобы четко определить, посаженные лиц.
4. Измерьте Рез населенияponses экспериментальных единиц, таких как прорастание и выживание, через регулярной переписи человека отмечены места посадки семян (например, с помощью зубочистки, как в пункте 2.3). Свернуть нарушение почвы для любого ответа, измеренного, чтобы избежать смешивания почвы среди патчей.
   1. Определите соответствующие интервалы переписи на основе ожидаемой нормы реакции популяций для координационных видов. Например, проводить еженедельные переписей для Румекс SPP. , которые могут прорасти быстро.
   2. Продолжить эксперимент для соответствующей продолжительности, основанного на истории жизни координационных видов. Например, продолжить эксперимент не менее 2 лет для недолгой многолетних Румекс SPP. для получения данных о всех этапах жизни.

3. Пример парниковых Эксперимент с гетерогенной и усредненного почвы в горшках к измерению отдельных реакций растений

1. Используйте почв от реплики с поля коллекции почвы (протокол 1)производить гетерогенную лечение (то есть каждая половина горшок, заполненный почвой, полученной от видов А или вида Б) и однородную лечение (то есть банк содержит смесь 1:1 почвы от видов А и В) (рис. 2а) для блока 1 из эксперимента в следующих шагах.
   1. В транспортном контейнере (например, ковш) и перед заливкой, смешать, собранной на местах почву от каждого вида стерильной песка с получением смеси 1:01. Сделайте это, чтобы смягчить уплотнение почвы и улучшить дренаж в горшках, что особенно полезно для корней стиральных, облегчая отделение корней из почвы. Стерилизовать песок, используя любой стандартный метод (например, автоклавирования, гамма-облучение).
   2. Будьте уверены, чтобы произвести одинаковое количество нарушений (т.е. разбить почвы комья в той же степени) при смешивании каждую партию почвой с песком.
2. Стерилизовать оборудование для обращения почвы (мастерки, перчатки, фольга), с точкой доступаприближенно 1:10 смесь хлорки (5-10% NaClO) и воды, чтобы удалить все частицы грунта. Сухой оборудование перед использованием, чтобы избежать отбеливания воздействие на почвенной биоты. На каждом часть оборудования с лабораторной ленты, чтобы указать фокусное видов, чьи почвы он будет обрабатывать, чтобы избежать перекрестного загрязнения (например, этикетка один шпатель для видового А и второй шпатель для видового B) и каждую сторону жесткой пластиковый лист, чтобы указать, какие тип почвы будет сыгран на каждой стороне его в гетерогенной обработки почвы.
3. Создание гетерогенную обработку почвы, используя поле почвенно-песчаных смесей из двух координационных видов (из раздела 3.1.1).
   1. Поместите жесткий пластиковый лист в центре горшка, чтобы разделить его пополам (рис. 2а). Используйте горшок такой размер, что половина из них эквивалентна по объему до соответствующего размера патч почвы (этап 1.1). Например, можно использовать горшок диаметром 15 см и 18 см глубиной на Румекс SPP. на рисунке 1a (общий объем3181 см ^3).
   2. Есть два исследователя одновременно добавить, собранной на местах почву от каждого вида к соответствующему стороны горшка (например α почву от вида A) с соответствующим меченных мастерки, чтобы держать стороны, как раз когда горшок заполняется.
   3. Снимите пластиковый делитель, подняв ее вертикально из почвы, оставляя почвы патчи нетронутыми. Это позволяет растениям испытать оба пятна почвы в пределах горшок, необходимые для растений, чтобы испытать неоднородность.
   4. Повторите положений разделов 3.3.1-3.3.3 течение 3 дополнительных экспериментальных установок для создания полного блок гетерогенной обработки почвы (2 вида х 2 почвенные виды патч в гетерогенной лечения; рис. 2).
4. Создание однородную обработку почвы, используя поле почвенно-песчаных смесей из двух координационных видов (из раздела 3.1.1).
   1. Повторите раздел 3.3.1. Были два исследователя одновременно добавить как α и β почвы для обоихстороны горшок с соответствующим меченных мастерки, равномерно распределяя оба типа почвы в пределах каждого патча и избежать создания слоев. Повторите Раздел 3.3.3.
   2. Повторите разделе 3.4.1 на второй экспериментальной установки для создания полного блока однородной обработки почвы (один горшок для каждого из видов фокальной 2).
5. Повторите шаги 3.2-3.4 для оставшихся блоков в эксперименте с оставшейся почвы повторить коллекции (протокол 1). Случайно блоки и участки в пределах блоков, через парниковый скамейке.

Рисунок 2. Пример парниковых опытно-конструкторских манипулирования завод-индуцированной почвы неоднородность. (А) Почвы, собранные из зоны корневой влиянием видов A (α почв) и видового B (β почвы) в области являются местомг в каждой половине горшке (гетерогенная лечения) или смешивают на протяжении всего горшок (однородная лечения). (Б) Растения сорта а затем высаживают в эксперименте в каждого типа пластыря почвы в гетерогенной лечения и на одной стороне однородной обработки. Здесь только один вид (А) показан посажены в этой конструкции. Полностью обратная дизайн будет включать заводы вторых координационных видов (B), посаженных в каждой обработки почвы и типа патч в гетерогенной лечения.

6. Саженцы растений из фокальной видов А и В в каждом типе патч почвы в факторного плана (2 вида х 3 типа патч почвы [α почвы, β почвы и однородная смесь α и β почвы]; рис. 2б).
7. Измерьте любые индивидуальные реакцию растений, которые указывают производительность предприятия, такие как размер растений, производства биомассы, или функциональных признаков. Соответствующие черты для измерения будет зависеть от координационных видов и научных вопросахинтерес.
   1. Продолжить эксперимент, пока растения не появляются большой относительно почвы патчи (например примерно 1.5x ширину пластыря почвы для розеточных формирования разнотравья), чтобы обеспечить корни растений растут в обоих почвы патчей. Экспериментальная продолжительность, будет зависеть от темпов роста координационных видов.
   2. Урожай растений и / или ответы измерения перед растения становятся горшком (т.е. рост корней ограничена пределами горшка и корней круга в нижней части горшка), если реалистичные реакции на окружающую среду почвы желательны. Например, корни горшком растений, вряд ли корм по всей колонне почвы в аналогичным образом для растений в поле.

Результаты

Виды ответил посадить-индуцированный неоднородность почвы по-разному как на население и на индивидуальном уровне (рисунки 3 и 4), с соответствующими последствиями для сборки сообщества. Чтобы определить, является ли популяции растений реагировать на завод-индуцированной неоднородности почвы, эксперимент поле была создана, как и в Протоколе 2 с помощью трех одному роду пары видов. Популяций растений были учет численности в неделю в течение трех месяцев, а общая доля посаженных семян, кот...

Обсуждение

Завод-индуцированной неоднородности почвы весьма вероятно, в природных сообществах, потому что растения имеют большие и часто видовой специфическое воздействие на их почвенной среды и последующие растения, которые испытывают, что почва (например Петерман и др.. ^13). Тем не менее, наше понимание роли этого вида неоднородности на растительные сообщества минимальна ^10,14. Здесь мы представляем метод для манипулирования завод-индуцированной неоднородности почвы, используя почву от раз...

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье

Имя	Компания	Каталожный номер	Комментарии
Лопата(ы)	Любой	НА	Полезно иметь как минимум две лопаты, по одной для каждого вида почвы происхождения.
Мастерок(и)	Любой	NA	Необходимо иметь не менее двух совков одинакового размера, по одному для каждого вида почвенного происхождения.
Перчатки	Можно использовать любые	перчатки	NA
Разбавленный отбеливатель	Any	NA	Мы используем бытовой отбеливатель в соотношении ~1:10 (содержащий 5-10% NaClO) для стерилизации всего оборудования между сборами почвы.
Пластиковая сетка(ы)	Любая	НА	ЗАКАЗ. Для создания сетки, используемой в полевом эксперименте, мы использовали пластиковую пленку от строительства стен теплицы. Тем не менее, можно использовать любой жесткий пластик, с которым можно манипулировать. Полезно иметь три сетки для получения взаимных гетерогенных обработок и однородной обработки без необходимости стерилизации между каждой экспериментальной установкой.
Пластиковые разделители	любые	НА	ЗАКАЗ. Мы использовали жесткие листы пластика, нарезанные по размеру горшка минимальной ширины, чтобы они могли сползать на дно горшка для тепличного эксперимента. Полезно иметь по крайней мере два разделителя, один для гетерогенных и один для однородных обработок, если исследователи хотят рандомизировать порядок, в котором экспериментальные блоки в блоке заполняются, без необходимости стерилизации разделителя между каждым экспериментальным блоком.
Ковши или тачки	Any	NA	Любая емкость для транспортировки грунтов.
Семена	Any	NA	Собираем семена в поле вручную. При необходимости семена также можно заказать у поставщиков плодоовощной продукции.
Пластиковые зубочистки	Soodhalter Plastics, Inc.	805KP	Мы сажаем отдельные семена, наклеенные на зубочистку, в полевом эксперименте, чтобы облегчить контроль за всхожестью и выживаемостью особей.
Водорастворимый клей	Elmer's	Elmer's Glue-all	Любой водорастворимый клей можно использовать для приклеивания семян к пластиковым зубочисткам.
Горшки	Любой	размер горшка NA будет зависеть от используемых экспериментальных растений и количества желаемых участков почвы (например, 2 или 6).
Песок	Любой		крупнозернистый песок NA можно смешать с полевым грунтом для улучшения дренажа в горшках.
Лабораторная лента	Любая	лента NA	может быть использована для маркировки оборудования, используемого при обработке почв с видами происхождения.
Булавочные флажки	Любые	NA	могут быть использованы для идентификации людей в поле до сбора почвы.
Ландшафтная ткань	NA Любая	ландшафтная	ткань NA может быть использована в полевых условиях для минимизации роста растений за пределами экспериментальных участков.