Методическая статья

Подавление

9K просмотров

DOI:

10.3791/52849

12 августа 2015 г.

В этой статье

Краткое содержание

Сайленсинг генов с помощью миРНК представляет собой удобную экспериментальную стратегию для анализа BRCA2-зависимых биологических функций с немедленными последствиями для лучшего понимания биологии рака. Представлен метод эффективного подавления BRCA2, а также экспериментальная процедура обнаружения и количественной оценки изменений экспрессии белка BRCA2 методом иммуноблоттинга в клеточных линиях человека.

Аннотация

Подавление в BRCA2 белка-супрессора опухоли и ее детектирования обычными биохимических анализов представляют собой большую техническую проблему из-за большого размера человеческого белка BRCA2 (приблизительно 390 кДа). Мы сообщаем модификации стандартных киРНК трансфекции и иммуноблоттинга протоколов, чтобы заставить замолчать человека BRCA2 и выявления эндогенной BRCA2 белок, соответственно, в клеточных линиях человека эпителиальных. Основные шаги включают в себя высокую миРНК соотношение реагентов трансфекции и два последующих раундов миРНК трансфекции в пределах того же эксперимента. Используя эти и другие модификации стандартного протокола мы последовательно достичь более 70% молчание гена BRCA2 человека, о чем судили с помощью иммуноблоттинга анализ с анти-антителами BRCA2. Кроме того, денатурации клеточных лизатов при 55 ° С вместо обычных 70-100 ° С и других технических оптимизации процедуры иммуноблоттинга позволяют обнаружение интактного белка BRCA2 даже WHан очень низких количеств исходного материала доступны, или когда уровни экспрессии белка BRCA2 очень низки. Эффективное глушение BRCA2 в клетках человека предлагает ценную стратегию, чтобы разрушить функцию BRCA2 в клетках с интактным BRCA2, в том числе опухолевых клеток, для изучения новых молекулярных путей и клеточные функции, которые могут быть затронуты патогенных мутаций BRCA2 в опухоли. Адаптация этого протокола для эффективного молчания и анализа других «больших» белков, таких как BRCA2 должны быть легко достижимы.

Введение

BRCA2 (рак молочной железы ген восприимчивости-2) ген кодирует белок-супрессор опухоли, который играет решающую роль в восстановлении ДНК двухцепочечной разрывы путем регулирования функцию рекомбиназы фермента Rad51 1. BRCA2 также вовлечен в модулирование транскрипции и в контроле клеточного цикла 2. Зародышевой линии мутации в гене BRCA2 вызывают аутосомно-доминантный восприимчивость к рака груди и яичников у женщин и рака простаты у мужчин, а также предрасположенность к другим типам рака 3,4. Тем не менее, несмотря на повышенный риск развития рака в BRCA2 мутации, которые подавляют или уменьшить функцию BR....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

1. Готовят растворы миРНК

  1. Ресуспендируют 5 нмоль зашифрованным (Ctrl) и 5 нмоль BRCA2 миРНК высушенных гранул в 100 мкл РНКазы воды (конечная концентрация миРНК: 50 мкм). Это запас миРНК и должны храниться при -20 ° C в 10 мкл аликвоты.
  2. Возьмем аликвоту 10 мкл из запаса миРНК и добавить 40 мкл РНКазы свободной воды, чтобы получить рабочий раствор 10 мкМ миРНК. Это разбавление необходимо хранить при температуре -20 ° С до использования.
    ПРИМЕЧАНИЕ: рабочий раствор миРНК не должны подвергаться замораживанию / размораживания более чем в 3 раза.

2. Посев человека эпителиальных клеточных линиях

    ....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

Прежде чем приступить к биологической / биохимической анализе для изучения влияния BRCA2 молчания на клеточных функций, первым шагом является подтверждение специфичности молчания, используя зашифрованный миРНК (ненацеливании миРНК) бок о бок с BRCA2 миРНК (рис 1A ). Важно выполнить второй раунд миРНК трансфекции с высокой степенью миРНК / трансфекции, чтобы получить высокую эффективность BRCA2 молчания. Действительно, выполняя только один раунд миРНК трансфекции или с использованием ме.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Потому что зародышевые мутации гена BRCA2 приводят к увеличению риска некоторых видов рака, в том числе женского и мужского рака молочной железы, рака яичников, рака предстательной железы, рака поджелудочной железы, меланомы и 3,4, ряд исследований были предприняты, чтобы понять биологическую функцию белка BRCA2. Большинство из этих исследований являются генетическими основе, главным образом, из-за технических трудностей в анализе гигантский белок BRCA2, как. Метод, описанный здесь для глушителей и а.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Авторам нечего раскрывать.

Благодарности

Эта работа была поддержана грантами FIRB-Merit RBNE08YFN3_005 и RBNE08HWLZ_012, а также Министерством экономики и финансов Италии для CNR для проекта "FaReBio di Qualità".

....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
BRCA2 siRNADharmaconL-003462-00SMARTpool: ON-TARGETplus BRCA2 siRNA
Ctrl siRNADharmacon  D-001810-10-05ON-TARGETplus Реагент для нецелевого пула
липофектамина RNAiMAX Life Technologies13778075Реагенттрансфекции
OPTI-MEM I Reduced Serum MediumLife Technologies31985-070Среда для процедуры трансфекции
NuPAGE Tris-Acetate 3-8% 1,5 мм Гель сборныйLife TechnologiesEA0378Гель для электрофореза белка
NuPAGE LDS Образец буфера Life TechnologiesNP0007Реагент для электрофореза белка
NuPAGE Sample Redagent (10x)Life TechnologiesNP0004Реагент для электрофореза белка
NuPAGE AntioxidantLife TechnologiesNP0005Реагент для электрофореза белка
HiMark Предварительно окрашенный белок стандартLife TechnologiesLC5699Предварительно окрашенный маркер для геля электрофорез
XCell SureLoc Mini-Cell  SystemLife TechnologiesEI0002Оборудование для электрофореза/переноса белков
NuPAGE Tris-Acetate SDS Running BufferLife TechnologiesLA0041Реагент для вестерн-блоттинга
PVDF мембранаMilliporeIPVH00010Реагент для вестерн-блоттинга
NuPAGE Transfer BufferLife TechnologiesNP0006-1Реагент для вестерн-блоттинга
BRCA2 H-300 кроличье поликлональное антителоSanta Cruz Biotechnologysc-83261:300 разведение
Бета-тубулин моноклональное антителоSigma AldrichT4026-100UL1:1,000 разведение
обезжиренного сухого молокаSigma Aldrich70166Реагент для вестерн-блоттинга
Tween-20Sigma AldrichP1379Реагент для вестерн-блоттинга
SuperSignal West Pico/Femto Хемилюминесцентный субстратPierce Thermo Scientific34080/34096Хемилюминесцентная система
PNT1A клеткиSIGMA Aldrich (для ECACC)95012614PNT1A человек, нормальный эпителий предстательной железы увековечен с помощью клеток SV40
NthySIGMA Aldrich (для ECACC)90011609Nthy-ori 3-1 Клеточная линия человека, клетки фолликулярного эпителия щитовидной железы
Пролиферация клеток Kit I (MTT)Roche11465007001Набор для анализа пролиферации клеток
для

Ссылки

  1. Thorslund, T., West, S. C. BRCA2: a universal recombinase regulator. Oncogene. 26, 7720-7730 (2007).
  2. Yoshida, K., Miki, Y. Role of BRCA1 and BRCA2 as regulators of DNA repair, transcription, and cell cycle in response to DNA damage. Cancer Sci. 95<....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE

Запросить разрешение

Теги

BRCA2siRNAsiRNA

Похожие статьи