$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Протокол описывает выделение лимфоидных клеток из человеческого материала пациента и, следовательно, требует этическим нормам. Проделанная работа в данном исследовании был предоставлен Упсалы этического наблюдательного совета (DNR. 2013/387).
1. Выделение мононуклеарных клеток (МНК) из небных миндалин человека
ВНИМАНИЕ: Все неэкранированный материалы человеческого происхождения, такие как кровь, ткани или жидкости организма должны рассматриваться как потенциально инфицированным материалом. Таким образом, рекомендуемые практики биобезопасности для обработки тканей человека должны быть соблюдены.
Примечание: Чтобы избежать загрязнения, все решения и оборудование для культивирования клеток, должны быть стерильными. Все буферы и растворы должны быть предварительно охлаждены, и хранили на льду. Миндалины тканей и изолированных клеток должны храниться и обрабатываться на льду.
- Получить свежие миндалины из пациентов тонзиллэктомии или удаление миндалин (рисунок 2). Окунитесь в ткани ClumPS в 50 мл центрифужную пробирку, наполненную ледяной стерильной сбалансированным солевым раствором Хенкса (HBSS) с добавлением 5% фетальной бычьей сыворотки (FBS), 10 мМ глутамина, 0,05 мг / мл гентамицина и 1% антибиотиков-противогрибковое смеси (пенициллин, стрептомицина и амфотерицин).
- Держите трубки с погруженными образцами тканей миндалин во все времена на льду. Попробуйте обрабатывать миндалины, как только возможно, и не позднее, чем 3 часа после хирургического удаления.
- Поместите миндалину на 60 мм пластик клеток культуры пластины на льду и держать ткань, смоченную HBSS. Удалить видимые сгустки крови, жировой и соединительной ткани с чистыми щипцами с поверхности миндалин.
- Использование нового 60 мм культуральный планшет, содержащий 5 мл HBSS. Вырезать ткани миндалин комок в 3-10 мм фрагментов с использованием стерильного ножницы и / или скальпель.
- Подготовьте новый 60 мм культуральный планшет, содержащий 10 мл HBSS и поместить пластиковый клеточный фильтр 100 мкм в растворе HBSS.
- Передача DISSected миндалин фрагментов в ячейки фильтра стерильной щипцами. Использование конец плунжера пластиковый шприц, плавно сжать фрагментов ткани через ячейки сетчатого фильтра. Убедитесь, что фрагменты миндалины полностью погружены в HBSS.
- Отменить клеточный фильтр с тканью остатки и передавать полученную клеточную суспензию из 60 мм культуральный планшет в 50 мл пластиковые центрифужные пробирки. Оставьте пробирку на льду, а исходя с шагом 1,8 и 1,9.
- В случае больших миндалин, больше, чем 2 см в диаметре (Рисунок 2), выжать фрагменты миндалин в двух сотовых сетчатых, чтобы избежать засорения сетки в сито.
- Получение конечного объема 35 мл клеточной суспензии.
Примечание: На этом этапе можно приготовить суспензию клеток для криоконсервации (см раздел 2). - Добавьте 10 мл в градиенте плотности раствором, таким как Ficoll в новую 50 мл центрифужную пробирку. Аккуратно наложить клеточных suspensион (шаг 1,9) в верхней части градиента плотности раствора. Избегать смешивания клеточной суспензии и в градиенте плотности раствора.
Примечание: градиент плотности раствора должен быть разогрет до комнатной температуры. - Центрифуга клеточной суспензии в поворотно-откидной ротор 700 мкг на 20 мин при комнатной температуре. Не активируйте функцию тормоза на центрифуге в быстрого торможения может нарушить градиент. Кроме того, использовать низкие функцию ускорения доступной на центрифуге.
Примечание: После этого стадии центрифугирования, наблюдается МНК в виде пушистого белого слоя на границе, и эритроцитов (эритроцитов), фибробласты и клеточного дебриса в качестве осадка на дне пробирки. - Осторожно собрать слой МНК с помощью 10 мл пипетки. Поместите клеточной суспензии в новый 50 мл центрифужную пробирку.
- Добавить 25 мл охлажденной льдом PBS к клеточной суспензии, и спина трубки при 300 х г в течение 5 мин в поворотно-откидной ротор при 4 ° С.
- Удалить супернатант, используя 25 мл пипеткии повторить осадок клеток стиральной шаг два раза больше. Наконец ресуспендируют осадок клеток в 15 мл PBS.
Примечание: После окончательного этапа промывки, можно криоконсервируют клеточной суспензии (см раздел 2). - Применить 10 мкл клеточной суспензии в гемоцитометр клеток Счетной палаты и подсчитать количество клеток под микроскопом. Не включать соответствующее количество клеток (например, 2-3 х 10 7) в 15 мл центрифужную пробирку для последующего разделения борта магнитного. Держите эту аликвоту на льду до шага 3.2.
2. Криоконсервация клеток миндалин
- Подготовьте среду замораживания (90% FBS и 10% ДМСО) и держать его на льду. Для долговременного хранения держать замораживания средств массовой информации при -20 ° С.
- Определить общее количество клеток с использованием подсчета клеток гемоцитометр камеру (этап 1.15). Рассчитать необходимое количество замерзания среды в соответствии с требуемой плотностью замороженной клеточной (например, 10 7 клетокс / мл морозильной среде).
- Центрифуга клеточной суспензии в 300 мкг в течение 5 мин. Слейте супернатант, не нарушая клеточный осадок и ресуспендируют осадок клеток в ледяной замерзания среды (со стадии 2.1).
- Разливают по 1 мл аликвоты клеточной суспензии в стерильные флаконы, предназначенных для длительного хранения в жидком азоте. Замораживание ампул в изопропанол камеры и хранить их при температуре -80 ° CO / N. Для долгосрочного хранения передать флаконов в жидком азоте, содержащей резервуар или -140 ° C морозильник клеток.
- Для таять флаконы с замороженных клеток, согреть их быстро в С на водяной бане 37 °. Сразу при оттаивании, разогнать клеточной суспензии в 10 мл подогретого HBSS (с добавками, шаг 1.1) в 15 мл центрифужную пробирку. Спин трубку при 300 х г в течение 5 мин, удалить HBSS и ресуспендируют осадок клеток в желаемой плотности клеток в HBSS (с добавками, шаг 1.1).
Примечание: жизнеспособность AF МНКтер оттаивания имеет значение, так как присутствие мертвых клеток снизится окончательный выход очищенного В и Т-лимфоцитов.
Примечание: В соответствии с нашим опытом жизнеспособность клеток менее 80% снизит эффективность изоляции клеток.
3. Положительный Выбор Т-лимфоцитов из миндалин населения МНК
Примечание 1: Этот протокол основан на позитивной селекции человеческих CD3 + Т-лимфоцитов из миндалин МНК с использованием магнитных шариков, соединенных с антителом CD3. Можно начать этот раздел из свежих (раздел 1) или замороженных (раздел 2) МНК.
Примечание 2: Начните с 3 х 10 7 МНК. Не превышать это число клеток, так как разделительные колонны могут засорить и это приведет к снижению эффективности изоляции. Используйте большие колонки, если больше клеток будут обработаны. Объемы, используемые в этом протоколе были экспериментально оптимизирована для количества клеток насред в нашей экспериментальной установки.
- Подготовка буфера разделения [PBS (рН 7,2), 0,5% бычьего сывороточного альбумина (BSA) и 2 мМ ЭДТА]. Фильтр буфер разделения через фильтр и хранят 0,45 мкм при 4 ° С.
- Спин подвеску МНК (шаг 1,14) при 300 мкг в течение 5 мин при 4 ° С. Ресуспендируют полученный осадок клеток в 240 мкл (80 мкл на 10 7 клеток) охлажденного льдом буфера разделения. Передача клеточной суспензии в стерильную пробирку 2 мл.
- Добавьте 20 мкл антител CD3 магнитного к раствору клеток. Инкубировать пробирки в течение 1 часа при 4 ° С при непрерывном осторожном перемешивании, чтобы клетки в суспензии.
- Передача всех клеточной суспензии в 15 мл пробирку, содержащую 5 мл охлажденного льдом буфера разделения мыть клетки.
- Центрифуга трубки при 300 х г в течение 10 мин при 4 ° С в поворотно-откидной ротор.
- Между тем создание магнитного сепаратора и колонны. Прикрепите магнитный сепаратор к подставке, и поместите колонку в SEPARАТОР. Промыть колонку с применением 500 мкл охлажденного льдом буфера разделения. Откажитесь от потока через.
- Поместите новую пробирку 15 мл колонке ниже. Держите пробирку на льду.
- Удалите супернатант (этап 3.5) по пипетки и осторожно ресуспендируют осадок клеток в 500 мкл буфера разделения. Применение клеточной суспензии в верхней части предварительно промытой колонке и пусть это проходит через.
Примечание: скопления клеток может засорить колонку и тем самым уменьшить расход. Чтобы избежать этой проблемы, место 40 мкм пластиковый клеточный фильтр в верхней части колонны. Прохождение клеток через этот сетки будет весьма повысить эффективность этого метода. - Промыть колонку 4 раза с 1,5 мл буфера для разделения (500 мкл в течение 10 7 клеток). Подождите водохранилища столбца, чтобы быть пустым (жидкость не должна наблюдаться в колонке) перед нанесением следующего стиральной шаг.
Примечание: Получите немеченые клетки CD3, считаются лимфоцитов фракции, так как ониэлюировали в пробирки. - Удалить столбец из сепаратора и места в новой 15 мл пробирку. Пипетка 2 мл буфера для разделения на колонку. Использование поршень, прилагаемый к колонке элюирования положительно выбранные Т-лимфоциты, которые рассматриваются в качестве фракции лимфоцитов Т.
- Определить количество очищенных клеток (шаг 1,15), если это необходимо. Клеточные суспензии теперь готовы для последующих экспериментов.
4. проточной цитометрии изолированных миндалин B и Т-лимфоциты
ВНИМАНИЕ: Параформальдегид решение раздражителем и канцероген. Носить соответствующую защитную одежду, перчатки и средства защиты глаз / лица.
Примечание 1: Этот протокол описывает способ прямого окрашивания изолированной В- и Т-клеток с активацией флуоресценции сортировки клеток (FACS анализ). Основная цель этого этапа является оценка чистоты изолированной камере населения AFтер CD3 разделение магнитного антитела. Для этого, установленном В- и Т-клеточных маркеров, флуорофорные-сопряженных моноклональных антител CD20-FITC и CD2, APC-используются. Также включение управления изотипу антител рекомендуется различать неспецифический «фон» связывания антител CD2 и CD20 (см шаг 4,8).
Примечание 2: Можно не держать очищенные фракции клеточных в 1% параформальдегидом (PFA) раствор в темноте при 4 ° С до момента окрашивания (например, на следующий день.). Также же процедура применяется, если есть промежуток времени между окрашиванием и анализа FACS. Следует помнить, что в обоих случаях клетки должны быть вымыты должным образом с PBSA (PBS, содержащий 0,2% BSA) буфер перед окрашиванием или анализа FACS.
- Выньте 6 х 10 6 клеток МНК шагом 1,15 (перед нанесением на колонку), B-лимфоцитов фракции из стадии 3.9 и Т-лимфоцитов фракции со стадии 3.10.
- Спин ячейкиСуспензии при 300 х г в течение 5 мин при 4 ° С с использованием откидную ротора.
- Удалить супернатант с пипетки и мыть осадок клеток один раз 1 мл ледяного PBSA. Спин клеточные суспензии при 300 х г в течение 5 мин при 4 ° С. Удалить супернатант с пипетки и ресуспендируют Клетки в 600 мкл охлажденного льдом буфера. PBSA
- Добавить 100 мкл клеточной суспензии в нижней части трубки FACS.
- Добавить 100 мкл PBS, содержащего 10% инактивированной нагреванием человеческую сыворотку в каждую пробирку, хорошо перемешать и инкубировать в течение ~ 1 мин при комнатной температуре или 20 минут на льду.
Примечание: B-лимфоциты несут рецепторы Fc. Для того, чтобы блокировать Fc рецепторы очищенные фракции клеток инкубируют с 10% инактивированной нагреванием сыворотки крови человека. Сыворотки человека является инактивированной нагреванием инкубированием при 56 ° С в течение 1 часа. Разделите термоинактивированной сыворотку в малых аликвоты и хранить замороженные при -20 ° С. - Центрифуга клеточной суспензии в 300 мкг в течение 5 мин при 4 ° С в SWИн-из ротора.
- Удалить супернатант с пипетки и мыть осадок клеток с 1 мл PBSA. Повторите центрифугирования (300 мкг в течение 5 мин при 4 ° С).
- Добавить 100 мкл PBSA в каждую пробирку на льду. Добавить соответствующее количество флуорофора-сопряженных моноклональных антител, в соответствии с рекомендациями производителя (например, 20 мкл анти-CD20 и / или 5 мкл анти-CD2 антитела в 100 мкл PBSA). Примечание: Не забудьте установить достаточно трубы управления для анализа FACS. В этом протоколе должны быть включены следующие элементы управления: 1) клетки окрашивали антителами к CD2 и анти-CD20-отдельности, 2) клетки, окрашенные анти-CD2 и анти-CD20-контроля изотипа антител в отдельности и, 3) клетки без добавления антител.
- Кратко вихрь трубку и инкубировать в течение 30 мин при 4 ° С в темноте.
- Вымойте 2 раза PBSA. Добавляют 2 мл 1% раствора PFA с образцами. Пусть клетки остаются в растворе при 4 PFA76; С в темноте до момента анализа FACS.
- Непосредственно перед запуском образцов в машине FACS, промыть клетки 2 раза PBSA (300 мкг в течение 5 мин при 4 ° C). Образцы Ресуспендируйте в 1 мл PBS и держать при 4 ° С (или на льду), защищенном от света месте, до разделения на цитометра.
- Сделайте сортировку FACS следующий протокол от цитометра производителя.
5. ПЦР обнаружения аденовируса ДНК в изолированных миндалин B и Т-лимфоциты
Примечание 1: аденовирусные генные праймеры Hexon являются AdRJC1 (5'-GACATGACTTTCGAGGTCGATCCCATGGA-3 ') и AdRJC2 (5'-CCGGCTGAGAAGGGTGTGCGCAGGTA-3') 11. Эти праймеры генерируют ампликон 139 б.п.. Хост гена рРНК 18S могут быть обнаружены с праймерами tp206 (5'-CCCCTCGATGCTCTTAGCTG-3 ') и TP207 (5'-TCGTCTTCGAACCTCCGACT-3'). Ожидаемый размер ампликона составляет 300 б.п..
Примечание 2: Каждый ПЦРпробег включает в себя отрицательный контроль (дистиллированная H 2 O) и положительный контроль ДНК, полученной из клеточной линии человеческого (BJAB) инфицированного человека типа аденовируса 5 12.
- Извлечение ДНК (по крайней мере, 1 × 10 6 клеток, шаг 3.11) с использованием диоксида кремния мембраны способ очистки колонки на основе. Извлечение РНК с помощью фенола и гуанидинизотиоцианата решение 13.
- Добавить 100 нг ДНК из В- и Т-лимфоцитов в реакционной смеси, содержащей 1х HF буфер, 0,2 мМ дезоксинуклеотидтрифосфатов смеси (дНТФ), 0,25 мкМ каждого праймера и 1 ед Высококачественное ДНК-полимеразы в общем объеме 20 мкл.
- Выполнение ПЦР-амплификации при следующих условиях велосипедных: 30 сек денатурация при 98 ° С, затем 30 циклов 98 ° С в течение 10 сек, 67 ° С (Hexon) или 58 ° C (18S рРНК) в течение 30 сек и 72 ° С в течение 30 сек. Реакцию ПЦР закончился конечной стадии расширения 7 мин при 72 ° С.
- Отделите полученный ПЦР amplification изделия на 1,5% агарозном геле в 1X TBE буфер и визуализировать ожидаемых диапазонов окрашиванием красителем нуклеиновых кислот.