$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Обеспечение нативного состояния белка означает особое внимание используемых буферов и хранения образца необходимы. Не могут быть использованы все методы хроматографии или методы подготовки образца. Важно, что буферы, используемые в пробоподготовки и хроматографии, лишены металлических энтеросорбенты и используют буферы, которые имитируют физиологические концентрации рН и соли. Другие условия , чтобы избежать включают нагревание образца или добавление белка денатурирующих (например, мочевина). Крайне важно, чтобы свести к минимуму количество циклов замораживания-оттаивания. Способность выбранного буфера для связывания двухвалентных металлов также имеет важное значение и является причиной того, что Трис или аммония нитрата буферы выбираются через буферы на основе фосфатов.
Низкое разрешение и пик емкость вытеснительной хроматографии по сравнению с другими формами хроматографии является основным ограничением этого метода. Тем не менее, нежная природа вытеснительной хроматогPHY важно поддерживать естественное состояние белка и, таким образом, сохранить относительно слабые металл-белковых связей. Требование , чтобы сохранить естественное состояние белков требует особого внимания к обработке образцов , включая ограничение числа циклов замораживания - оттаивания, избегая металлических энтеросорбенты (например, ЭДТА) или хаотропные соли и моющих средств.
Это низкое разрешение этой методики воздействий способность определить количество металла, связанного с конкретным белком, если он находится в сложном образце, что и пики видно будет содержать более одного белка. Таким образом, количество металла, определяется с использованием пиковой интеграции может быть показателем общего количества металла, связанного со всеми белками элюирование в этот момент времени, а не только один конкретный белок. Для того, чтобы преодолеть это ограничение интересующий белок должен был бы быть дополнительно очищен при нативных условиях. Это позволило бы квантификацииметалл, связанный с этим белком, чтобы сообщаться с более высокой степенью certainity. Еще одним потенциальным недостатком этой методики было бы потери белка из-за необратимое связывание с колонкой. Для того, чтобы определить, является ли это происходит эксперимент восстановления следует проводить в результате чего количество белка при элюировании из колонки анализируют, чтобы определить, совпадает ли этот объем впрыскиваемого. То же самое можно сделать путем измерения содержания металла элюции материала и исходный материал и навальным ICP-MS. Восстановление столбца может отличаться в зависимости от используемых условий, но было показано , что полное восстановление белков из колонки вытеснительной возможно 9. Таким образом, важно, чтобы проверить, действительно ли существует какой-либо потери в рабочих условиях используется.
Изменения в протоколе могут быть связаны со стандартами металлопротеины, которые используются, а также анализируемых элементов. Тип металлопротеины стандарт СШАе изд будет отличаться в зависимости от элементов, представляющих интерес. Для таких элементов, как Cu, Fe и Zn белков, СОД и ферритина используются. Любые другие металлопротеины, которые имеют известные stoichometries также могут быть использованы и несколько примеров было показано здесь.
Одним из основных осложнений, которые могут возникнуть в результате использования этого метода является нарастание кристаллов соли в факелом ICP-MS. Для того, чтобы предотвратить накопление кристаллов соли, факел промывают дистиллированной водой каждые 500 - 1000 мл буфера, который был пропущен через систему или когда определено путем визуального осмотра, что факел должны быть вымыты. Другая проблема, которая может возникнуть является более быстрое снижение чистоты образца и экстракции конусов. Их необходимо регулярно чистить следующие протоколы производителя.
Первоначальная подготовка образца является самым важным шагом в протоколе. Если есть какие-либо изменения в белке - металлический комплекс РСМДormation генерируется не будет действительным. Это одно из основных ограничений техники; Кроме того, использование низкого разрешения, колонка эксклюзионной дает ограниченное детальное представление об истинной сложности металлопротеинов в биологии.
Техника, описанная здесь, позволяет расширить знания metalloproteome организма. Bulk анализ дает только грубую индикацию изменения в количестве металла в образце. Помимо общих соображений, которые необходимо принимать во внимание, этот метод дает инструмент, который может быть использован для количественного определения количества металла, связанного с белками, а также определения металлопротеинов, которые отличаются путем сравнения полученных следов. Использование этого метода может быть использована, чтобы определить различия между болезненными состояниями. Выявленные металлопротеиды затем могут быть дополнительно исследованы, чтобы помочь определить роль, которую они играют в процессах болезни. Применение дефис ICP-MS имеет растущуюбудущее, чтобы определить роль лекарственных средств, имеющих гетероатом, такой как платина, йод или медь в качестве ИСП-МС может быть использован для идентификации белков, который связывает лекарственное средство.