Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Методика изучения горизонтальных генного переноса в

16.5K просмотров

DOI:

10.3791/55087

10 марта 2017 г.

* These authors contributed equally

В этой статье

Краткое содержание

Мы опишем здесь три различные протоколы для исследования в пробирке конъюгации, трансдукции и естественной трансформации в золотистый стафилококк.

Аннотация

Одной важной особенностью основных оппортунистических патогеном человека золотистый стафилококк является его исключительная способность быстро приобретают устойчивость к антибиотикам. Геномные исследования показывают , что S. стафилококк несет множество генов вирулентности и сопротивления , расположенные в мобильных генетических элементов, предполагая , что горизонтальный перенос генов (HGT) играет важную роль в эволюции золотистого стафилококка. Тем не менее, полное и подробное описание методологии , используемой для изучения HGT в золотистого стафилококка до сих пор отсутствует, особенно в отношении естественное преобразование, которое было недавно сообщалось в этой бактерии. Эта работа описывает три протокола, которые полезны для экстракорпоральное исследования ХГТ в золотистого стафилококка: конъюгации, трансдукции фагом и естественной трансформации. С этой целью, ген ЧФР (хлорамфеникол / сопротивления флорфеникол), которое дает Phenicols, Lincosamides, Оксазолидиноны, плевромутилины и стрептограминов А (PhLOPSА) -resistance фенотипом, был использован. Понимание механизмов , посредством которых золотистого стафилококка трансферты генетические материалы других штаммов имеет важное значение для осмысления быстрое приобретение сопротивления и помогает уточнить режимы распространения , представленные в программах наблюдения или для дальнейшего прогнозирования режима расширения в будущем.

Введение

Золотистый стафилококк является синантропных грамположительные бактерии , которые , естественно , населяет кожу и носовую полость человека и животных. Этот бактериальный вид является основной причиной внутрибольничных инфекций в больницах и медицинских учреждениях. Кроме того, его способность к развитию устойчивости к различным антимикробным соединений сделало управление инфекций, вызванных этой бактерией в глобальную озабоченность.

Два основных пути, участвующие в распространении фенотипов сопротивления известны: клонального распространение устойчивых генотипов и распространения генетических детерминант среди бактерий бассейна. ....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

Примечание: штаммы и материалы , используемые в этой работе, приведены в таблице 1 и таблице материалов, соответственно. В экспериментах по передаче, N315 и COL ЧФР -позитивных производные были использованы в качестве доноров СМО гена (N315-45 и Col-45). Эти штаммы были ранее получены путем конъюгации, с использованием в качестве донора клинической -положительным Staphyloccocus CFR эпидермидис штамм (ST2), в соответствии со стандартным протоколом сопряжению (см ниже). Этот штамм таил СМО ген на pSCFS7-подобной плазмиды 7.

1. Сопряжение Использ....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

Результаты , представленные здесь , были опубликованы ранее (адаптировано из ссылки 7 с разрешения издателя). Мы изучили возможные пути передачи гена ЧФР, что приводит к низкоуровневой линезолид сопротивление и экспрессию PhLOPSA сопротивления фенотипа 14, 15 штаммов золотистого стафилококка, исследуя три механизма ХГТ.

На

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Эта работа описывает три основных метода для изучения HGT генетических детерминант в золотистого стафилококка. Хотя трансдукции и конъюгации были изучены в течение многих десятилетий, существование естественной трансформации лишь недавно был признан 2. Таким образом, золотистого стафилококка оснащен всеми тремя основными режимами ХГТ, и тестирование всех из них требуется уточнить возможные пути распространения генетических детерминант. Целью данной работы является составле.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Авторам нечего раскрывать.

Благодарности

Эта работа была частично поддержана Takeda Science Foundation, Pfizer Academic Contribution и JSPS Postdoctoral Fellowship for Foreign Researchers (FC).

....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Триптический соевый бульон (TSB) Бектон Дикинсон 
Инфузия сердца для мозга (BHI)Бектон Дикинсон 
Питательный бульон No 2ОксоидCM0067
Агар овечьей кровиEiken Chemical Co., Ltd.E-MR96Триптический соевый агар с добавлением 5% (v/v) овечьей крови по заявлению производителя.
Порошок агараWako Pure Chemical Industries010-08725
Цитрат натрия (дигидрат цитрата тринатрия)Wako Pure Chemical Industries191-01785
Эфир целлюлозы сетчатый 0,45 μ L HAWG фильтрMerck MiliporeHAWG 02500
QIAfilter Plasmid Midi kitQIAGEN12243
211825211059

Ссылки

  1. Lindsay, J. A. Genomic variation and evolution of Staphylococcus aureus. IJMM. 300, 98-103 (2010).
  2. Morikawa, K., et al. Expression of a cryptic secondary sigma factor gene unveils natural competence for DNA transformation in Staphyloco....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Теги

Протокол конъюгациифаговая трансдукцияестественная трансформациягены устойчивости к антибиотикамколониальная ПЦРанализ МИКтриптический соевый бульонагар с кровью овцы