Митохондрии участвуют в клеточном энергетическом метаболизме и используют кислород для производства энергии в форме аденозинтрифосфата (АТФ). Дифференциальное центрифугирование на низких и высоких скоростях обычно используется для выделения митохондрий из тканей и культивируемых клеток. Сырые митохондриальные фракции, полученные методом дифференциального центрифугирования, используются для респирометрических измерений. Метод дифференциального центрифугирования основан на разделении органелл в соответствии с их размером и скоростью осаждения. Выделение митохондрий проводится сразу после забора тканей. Ткань погружают в ледяную гомогенизирующую среду, измельчают ножницами и гомогенизируют в стеклянном гомогенизаторе с помощью неплотно прилегающего пестика. Метод дифференциального центрифугирования является эффективным, быстрым и недорогим, а митохондрии, полученные при дифференциальном центрифугировании, достаточно чисты для проведения респирометрических анализов. Некоторые ограничения и недостатки изолированных митохондрий, основанных на дифференциальном центрифугировании, заключаются в том, что митохондрии могут быть повреждены во время процедуры гомогенизации и выделения, а также в том, что для выделения митохондрий требуется большое количество биопсии ткани или культивируемых клеток.