Этот assay Малахитовый зеленый с pT был использован для измерения активности PP2Ac, потому что это легче выполнить, чем классический метод, который использует 32P, меченного субстратов. Еще одно преимущество этой пробирного над радиоактивными анализов — что радиоизотопов представляют определенный риск и может быть дорогостоящим, особенно 32P, меченного молекулы, имеют короткий период полураспада, который ограничивает количество анализов, которые одно может выполнять до истечения реагентами. С помощью Малахитовый зеленый вместо радиоактивности также устраняет необходимость распоряжаться 32P отходов. Малахитовый зеленый анализов также весьма чувствительны при измерении активность фосфатаз Серин/треонин по сравнению с другой колориметрические assay который использует субстрата-p-nitrophenylphosphate (pNPP), который является неселективной, как это может быть dephosphorylated широкого ряда ферментов32.
Коммерческие Малахитовый зеленый комплекты для измерения активности PP2A были доступны в течение некоторого времени и ранее были использованы в лаборатории. Однако при выполнении многих Малахитовый зеленый анализов, такие комплекты стал слишком дорого. Кроме того коммерческие наборы для PP2A деятельности стабильны только за один год, в то время как имея реагентов в сухой форме и с надлежащего хранения, обеспечивают легко доступны пробирного компоненты, которые структурно стабильны для длительных периодов времени.
Перед тестированием, bSyn и gSyn, aSyn был использован в качестве позитивного элемента управления для стимулирования деятельности PP2Ac и определить количество PP2Ac, необходимых для анализов, а также подтвердить, что полученные данные остаются на шкале с калибровочной кривой (150-2400 пмоль PO4 ). Примечательно, что если aSyn стимулирует PP2Ac слишком сильно, хотя реакция обычно линейной, данных будет сходить масштаба и химических веществ в растворе MGT осадок, что делает невозможным для определения точной суммы выпущен бесплатно PO4 с тарелкой читатель.
Учитывая, что aSyn способствует PP2Ac активности в естественных условиях и в пробирке12,19,21,23,25, и что все synucleins имеют значительную гомологию, он был предположил, что все члены семьи synuclein могут быть способны стимулировать PP2Ac в ячейке бесплатные анализы. С помощью колориметрических assay описано здесь, было установлено, что действительно, все три рекомбинантных synucleins (aSyn, bSyn, gSyn) стимулируют PP2Ac активности, повышение возможности, что все три synucleins могут выполнять аналогичные функции в нервной системе. Однако, мозг от Паркинсона или слабоумия с телом Lewy дела имеют меньше PP2Ac активности в тканях, содержащих весьма агрегированных aSyn23. Мыши тканей, укрывательство Леви, тело как патологии также демонстрируют снижение PP2Ac активности25. Это, и новые данные на рисунке 3 , а также предыдущие данные от aSyn нокаут мышей12, настоятельно рекомендуем, что ни bSyn, ни gSyn не могут обычно компенсировать потери растворимых aSyn в мозг или, альтернативно, что те synuclein гомолог может не Свяжите с PP2Ac как сильно как aSyn как показано на рисунке (рис. 3). Атлас мозга Аллен показывает colocalization всех трех synuclein mRNAs во многих областях мозга, и хотя тройной synuclein нокаут мышей были созданные9,33, PP2Ac активность не были оценены в этой модели. Интересно, что aSyn, что фосфорилированных на Ser129 по поло как киназа 2, в меньшей степени способны активировать PP2Ac12, но доказательств, показанный здесь, для bSyn предлагаю что фосфорилирование bSyn вряд ли воздействие PP2Ac деятельности, как очень мало bSyn сошел с PP2Ac в мозг мыши (рис. 3). Взятые вместе, данные показывают, что эндогенного модуляторов активности PP2Ac, как aSyn, скорее всего, способствовать оздоровительный и болезней.
Протокол, изложенные здесь является простой, но мощный метод для определения способности PP2Ac для dephosphorylate phosphopeptide субстрата в ответ на различные косметические процедуры. Например эта же методология может использоваться для тестирования других PP2Ac активаторы, церамиды, а также потенциальных Роман терапии34, или для оценки влияния PP2Ac ингибиторов в пробирке. Важно также отметить, что подобные анализы можно измерить активность PP2Ac, который изолировал 1 d 6 иммунопреципитации от выдержек клетки или ткани организма, как описано ранее, авторы12,19, 25. будущее приложений для assay Малахитовый зеленый существуют вне определения PP2Ac активности, как активность АТФ может также определяться с помощью такого анализа.
Обратите внимание, что калибровочной кривой должны создаваться каждый раз для каждого независимого PP2Ac assay. Он является обязательным для обеспечения все реагенты используемые фосфат бесплатно, как свободный фосфаты искусственно увеличить фонового сигнала и ошибочных результатов. В день анализа важно подготовить достаточно свежий раствор MGT для всех образцов быть assayed. Кроме того MGT хороша только в день, что он производится и клонит осадить через несколько часов. PP2Ac, приобретенных у поставщика должен быть aliquotted и хранить замороженные вскоре после его получения для предотвращения циклов оттаивания замораживание, которые снижают свою активность. Как другие фосфатаз может dephosphorylate pT субстрата (например PP1 и PP535), при анализе экстрактов клетки или ткани, в которых PP2Ac не были изолированы по иммунопреципитации, образцы должны передаваться через столбцы для удаления бесплатно фосфаты и специфичные ингибиторы фосфатаз должны быть использованы для подтверждения фосфатазы специфики, как описано18.