Все эксперименты на животных были проведены в соответствии с руководящими принципами для ухода и использования лабораторных животных и были утверждены ответственные власти (Oberbayern фон Regierung, Мюнхен, Германия и Стэнфорд институциональный уход за животными и использовать Комитет, Стэнфорд, Калифорния, США). Список всех плазмиды для клонирования (шаг 1 до 4) предоставляется в дополнительной таблице S1.
1. клонирование трансген для экспрессии генов учредительного
- Дизайн праймеров для трансген амплификации13,14.
- Добавление места ограничения для Голд (TTAATTAA)' конец 5 праймера вперед. Добавьте ' конец 5 праймера обратный места ограничения для AscI (GGCGCGCC) или ФГОУ (GGCCGGCC).
- Усилить трансген методом ПЦР с использованием условий, оптимизированный для желаемого трансген14. Очищают, использование коммерчески доступных комплект очистки ДНК.
Примечание: Отжиг время зависит грунты, предназначенные на этапе 1.1., удлинение времени зависит от длины конструкции. Например для построения 1000 bp длины использования 60 s удлинение времени.
- Дайджест трансген и вектор для учредительного ген выражение15 с nucleases соответствующих ограничений (см. шаг 1.2) и буфер в суммарный объем 50 мкл при 37 ° C на ночь. Например, дайджест конструкция с 5 единиц Голд и 5 единиц ФГОУ при необходимости (см. шаг 1.2).
- Гель Очистить переваривается вектор и вставки с помощью набора извлечения коммерческих гель согласно инструкциям производителя. Выполнение стандартного лигирование 100 ng вектора и 100 – 1000 ng вставки с помощью 400 U T4 инактивирует лигаза на 14 ° C для 16 h. тепла при 65 ° C для 10 мин.
- Трансформировать компетентным бактерий, используя стандартный тепло шок протокол16.
- Плиты на агаре пластины содержащий ампициллина 100 мкг/мл. Инкубируйте на 30 ° C в течение 24 ч.
- Выбрать один колоний, очищают плазмида ДНК с использованием коммерческих алкалический комплекта согласно инструкциям производителя и проверить последовательность Сэнгер последовательности17 (секвенирование грунтовка: 5' TGCTGGAGTTCTTCGCC 3').
- Использование положительных колоний для макси масштаб амплификации плазмидной ДНК и очистить с помощью свободных эндотоксина плазмидные комплект подготовки18 согласно инструкциям производителя.
- Конструкция готова для инъекций, таким образом, перейдите к шагу 5.
2. клонирование трансген для экспрессии генов индуцибильный
- Дизайн праймеров для трансген амплификации13,14.
- Добавление места ограничения для SacI (GAGCTC), SpeI (ACTAGT) или KpnI (GGTACC)' конец 5 праймера вперед. Добавьте ' конец 5 праймера обратный места ограничения для персо (GCGGCCGC) или XhoI (CTCGAG).
- Усилить трансген методом ПЦР с использованием условий, оптимизированный для желаемого трансген14. Очищают с помощью коммерческого kit очистка ДНК.
- Дайджест очищенный трансген и 4 мкг вектора входа (pEN_TTmcs-вектор, смотрите Таблицу материалы)19 отдельно с соответствующим ограничением nucleases (см. шаг 2.2) и буфер в суммарный объем 50 мкл при 37 ° C в одночасье.
- Гель Очистить переваривается вектор и вставки с помощью набора извлечения коммерческих гель согласно инструкциям производителя. Выполнение стандартных перевязки с 100 ng вектора и 100 – 1000 ng вставки с помощью 400 U T4 инактивирует лигаза на 14 ° C для 16 h. тепла при 65 ° C для 10 мин.
- Трансформировать компетентным бактерий, используя стандартный тепло шок протокол16.
- Плиты на агаре пластины содержащего гентамицин 15 мкг/мл. Инкубируйте при 37 ° C для 16 h.
- Выбрать один колоний, очищают плазмида ДНК и проверить вставка последовательности17 с использованием pCEP вперед грунтовка: 5' AGAGCTCGTTTAGTGAACCG 3'.
Примечание: ПЦР на одной колонии могут выполняться без предварительной очистки с грунтовки pCEP вперед и обратного pCEP (5' Ага AAG КТГ GGT CTA Гат УВД ВРЧ 3'). Этот шаг может полезно для предварительного отбора положительных колоний.
- Перейдите к шагу 4.
3. клонирование из мир индуцируемый для Inducible Gene НОК-Даун
- Дизайн мир индуцируемый олигонуклеотиды согласно pSLIK клонирования19протокола. Отжиг и очищают олигонуклеотиды и разбавить 1:20 в ddH2O.
- Дайджест 3 мкг вектора входа с 5 U BfuAI при 50 ° C, 3 часа, затем инактивирует реакции при 65 ° C для 20 мин.
Примечание: Если совместное выражение зеленого флуоресцентного белка (КГВ), использование pEN_TTGmiRc19 как вектор входа, в противном случае использовать pEN_TTmiRc219.
- Гель Очистить переваривается вектор как шаг 2,5. Выполнение стандартных лигирование 100 ng вектора и 1 мкл очищенной и разбавляют индуцируемый олигонуклеотиды (шаг 3.1) с помощью 400 U T4 лигаза при комнатной температуре в течение 1 ч. тепловой инактивации при 65 ° C для 10 мин.
- Трансформировать компетентным бактерий, используя стандартный тепло шок протокол16.
- Плиты на агаре пластины содержащего гентамицин 15 мкг/мл. Инкубируйте при 37 ° C для 16 h.
- Выбрать один колоний, очищают плазмида ДНК и проверить Вставка, Сэнгер последовательности17 (секвенирование грунтовка: 5' TAGTCGACTAGGGATAACAG 3').
- Перейдите к шагу 4.
4. recombinational клонирования для создания клонов готова для инъекций
- Смесь 150 ng вектора входа (от шаг 2 и шаг 3) и 150 нг pTC тет вектор20.
- Добавьте буфер TE суммарный объем 8 мкл (рН = 8).
- Передача смеси ферментов LR-clonase II (см. Таблицу материалы) на лед, проинкубируйте 2 мин Vortex дважды.
- 2 мкл LR-clonase фермент смесь II реакции и инкубировать при 25 ° C в течение 1 ч.
- Остановите реакции, добавив 1 мкл протеиназы K-решения. Инкубируйте при 37 ° C за 10 мин.
- Преобразование Stbl3 компетентным бактерий с 2 мкл recombinational клонирования смешать с использованием стандартной тепло шок протокол16.
- Плиты на агаре пластины содержащий ампициллина 100 мкг/мл. Инкубируйте на 30 ° C в течение 24 ч.
- Выбрать один колоний, очищают плазмида ДНК с помощью свободных эндотоксина плазмидные комплект подготовки18 согласно инструкциям производителя и подтвердить целостность вектор Сэнгер последовательности17 (секвенирование грунтовка 5' AGGGACAGCAGAGATCCAGTTTGG 3').
- Конструкция готова для инъекций, перейдите к шагу 5.
5. Подготовка раствор для инъекции Вену гидродинамических хвост
Примечание: Подготовка конструкций для экспрессии генов учредительных и индуцибельной описаны в шаге 1, 2, 3 и 4.
- Подготовить стерильного 0,9% физиологического раствора для инъекций (делать не использовать PBS). Используйте том, соответствующий около 10% от массы тела мыши. Пример: для мыши, массой 20 г, подготовьте 2 мл раствора.
- Подготовьте инъекции векторов, которые были очищены с помощью свободных эндотоксина плазмидные очистки комплект18 (см. шаг 1.8 или 4,8, соответственно).
- Добавить 10 мкг или 15 мкг эндотоксинов бесплатно Спящая красавица конструкции вектора (из шага 1 использование 10 мкг, от шаг 4 Использование 15 мкг, соответственно) и 1 мкг эндотоксинов бесплатные pc-HSB521 мл стерильного физиологического раствора.
- Хранят раствор для до 4 ч при 4 ° C. Не замораживать.
6. выполнение гидродинамических хвост инъекции Вену
- Используйте фиксатор для инъекции Вену хвост (коммерческие или подготовленных от 50 мл Конические трубки с отверстиями для дыхания и хвост). Заполните нижней части трубки с папиросной бумаги.
- Для инъекций Используйте мышь около 8 – 10 недель возраста с весом 20-25 г.
- Взвешивание мышей до инъекции и подготовить объем впрыска в зависимости от веса (соответствует 10% от веса тела, см. шаг 5.1). Подготовьте стерильные 3 мл шприц с иглой 27 G для инъекций и залейте требуемый объем.
- Поместите указатель мыши в фиксатор. Регулировать количество папиросной бумаги (см. шаг 6.1) оставить только минимальное пространство для движения, но достаточно места для дыхания.
- Убедитесь, что мышь дышать регулярно.
- Теплый хвост, с помощью инфракрасных ламп для 30-60 s. тщательно следите за признаки перегрева.
- Очистите хвост с спиртом.
- Вставьте иглу почти горизонтально либо один из двух боковых хвост вен близко к основанию хвоста.
Примечание: Если установлен успешно, небольшое количество крови может вытекать обратно в конус иглы. Не рекомендуется активно аспирационная как любое дополнительное движение иглы может привести к его перемещения и/или травмы Вены.
- Придать общий объем в Вену хвост в течение 8-10 s.
- Немедленно удалите мышь из фиксатор. Сжимать инъекции раной для по крайней мере 30 s или до тех пор, пока любое кровотечение спадает.
- Поместите указатель мыши в отдельной клетке. Как только мышь оправился от процедуры (около 30-60 мин), передача мыши обратно в его оригинальной клетку. Проверить на мыши регулярно для последующих 24 часов.
Примечание: Умеренный седативный эффект мыши обычно наблюдается до 2 ч после инъекции.
- Прежде чем продолжить дальнейшие эксперименты (т.е., шаг 7), подождите 10-15 дней для оформления неинтегрированный векторов.
7. индукция Transfected CreER тамоксифен
Предупреждение: Тамоксифен вредно, могут быть злокачественными или нанести ущерб плодовитости. Пожалуйста, обратитесь к лист данным по безопасности.
- План тамоксифен внутрибрюшинной инъекции в течение трех дней подряд.
- День 1 Растворите 10 мг тамоксифен в 40 мкл этанола. Инкубируйте на 55 ° C для 10 min. Vortex несколько раз, пока не растворится тамоксифен.
- Добавление 960 мкл кукурузное масло. Инкубируйте на 5 минут при температуре 55 ° C. Вихревой несколько раз, чтобы получить ясное решение.
- Приготовляют раствор в 1-мл инсулина шприц с иглой 27 G.
- Загривок мыши, захватывая шею мыши тщательно с пальца и второй палец, фиксации хвост между база руки и четвертый и пятый палец.
- Inject 0,1 мл (= 1 мг тамоксифен) решения внутрибрюшинно в левом нижнем квадранте живота.
- Повторяйте инъекции на дни 2 и 3.
8. всасывание тетрациклина зависимых генов или индуцируемый выражение
Предупреждение: Доксициклин может быть вредным. Пожалуйста, обратитесь к лист данным по безопасности.
Примечание: В зависимости от вида и продолжительности эксперимента, Доксициклин может поставляться в питьевой воде (шаг 8.1) или Чоу (шаг 8.2)
-
Для краткосрочных экспериментов (< 10 дней) администрирование доксициклин через питьевую воду, используя следующий протокол.
- Растворяют 5 г сахарозы в 100 мл воды. Автоклав.
- Растворите 100 мг доксициклина гиклат в 5 мл раствора сахарозы (шаг 8.1.1) в 15 мл Конические трубки.
- С помощью 10-мл шприц, стерильные фильтр решение через фильтр 0.2 мкм. Добавьте в решение сахарозы, подготовленную на этапе 8.1.1.
- Поставка раствора сахарозы доксициклин качестве питьевой воды с помощью мыши. Проверьте ежедневно и заменить, когда решение становится мутным, указывающее бактериальных разрастание (заменить прозрачный раствор после трех дней позднее).
- Для долгосрочных экспериментов (> 10 дней) или эксперименты, чувствительных к метаболические изменения, используйте коммерческих доксициклин Чоу (например, доксициклин гиклат Чоу 0,625 г/кг) чтобы избежать обезвоживания и/или сахароза индуцированные изменения в печени лечение животных.
9. Подготовка мыши печени для анализа иммуноокрашивания
Предупреждение: Параформальдегида может быть вредным. Пожалуйста, обратитесь к лист данным по безопасности.
Примечание: Timepoint когда будут проанализированы мышей зависит от эксперимента. Рекомендуется для анализа тканей печени после не менее трех дней лечения доксициклин для обеспечения достаточной индукции трансген или индуцируемый выражения.
- Готовим 1 мл шприц с иглой 27 G с 1 мл 4% раствора параформальдегида (PFA).
- Усыпить мыши, соответствующий метод согласно утвержденным животных протокол.
Примечание: Руководящие принципы для соответствующих методов эвтаназии может варьироваться в зависимости от учреждения.
- Тщательно с использованием рассечения ножницы и анатомический пинцет, откройте брюшной полости с средний лапаротомия подвергать печени. Переместите в тонком кишечнике право подвергать воротной вены и нижней полой вены (IVC).
- Вставьте иглу подготовленный шприц (см. шаг 9.1) в МКВ и вырезать воротной вены. Inject 1 мл PFA медленно в МКВ perfuse ткани печени и удалить auto люминесцентные красные кровяные клетки (желательно, если будет выполняться immunofluorescent окрашивание).
- Удаление печени. Прополощите в воде и передача на 5 – 10 мл 4% раствора PFA.
- Для парафиновых срезах исправить ткани для 36-48 ч. ткани готова для обезвоживания и встраивание парафина.
-
Для замороженных секций, исправить ткани в 4% ПФА за 1 час.
- Для криозащиты передать раствор 10% сахарозы. Инкубируйте 60 мин.
- Переезд в 20% раствора сахарозы. Инкубируйте 60 мин.
- Переезд в 30% раствора сахарозы. Инкубировать 12 – 16 h. встроить в внедрение комплекса для замороженной секции и заморозить при температуре-20 ° C.