Методическая статья

Создание высокопроизводительного скрининга платформы для оценки гетерогенности амплификации гена HER2 в опухоли молочной железы

DOI:

10.3791/56686

⸱

5 декабря 2017 г.

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 
1Division of Pathology, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico, 2School of Medicine, University of Milan, 3School of Biology, University of Pavia, 4Division of Breast Surgery, Fondazione IRCCS Ca' Granda - Ospedale Maggiore Policlinico, 5Division of Medical Oncology, Fondazione IRCCS Ca' Granda - Ospedale Maggiore Policlinico, 6Department of Biomedical, Surgical, and Dental Sciences, University of Milan

В этой статье

Краткое содержание

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Гетерогенные распределение HER2-положительных клеток может наблюдаться в подмножестве рака груди и генерирует клинических дилеммы. Здесь мы представляем надежные и рентабельные протокол определить, количественно оценить и сравнить HER2 генетической гетерогенностью внутри опухоли в большой серии гетерогенно переработки молочной железы.

Аннотация

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Целевые терапии против человека эпидермального фактора роста рецепторов 2 (HER2) радикально изменили результаты у пациентов с раком груди HER2-положительных. Однако меньшинство случаев выводит гетерогенных распределение HER2-положительных клеток, который генерирует основных клинических проблем. На сегодняшний день, были предложены не надежных и стандартизированных протоколов для характеристик и количественной оценки HER2 гетерогенных амплификации генов в большой когорты. Здесь мы представляем высок объём методологии одновременно оценить HER2 статуса в различных топографических областях несколько случаев рака молочной железы. В частности мы иллюстрируем лабораторные процедуры для создания расширенной ткань microarrays (TMAs) Включение целевых сопоставление опухолей. Все параметры TMA был специально оптимизирован для серебра в situ гибридизация (SISH) формалин Исправлена парафин врезанных тканей молочной железы (FFPE). Иммуногистохимический анализ прогностические и интеллектуального биомаркеров (то есть, ER, PR, Ki67 и HER2) должны выполняться с помощью автоматизированных процедур. Настроить протокол SISH была выполнена разрешить высокого качества молекулярного анализа через нескольких тканей, которые прошли различные процедуры фиксации, обработки и хранения. В этом исследовании мы предоставляем доказательство из принцип что специфических последовательностей ДНК может быть одновременно локализованы в отдельных областях Топографическая множественных и гетерогенно обработанные молочной железы с использованием метода эффективной и рентабельной.

Введение

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

HER2 является протоонкоген, оверэкспрессировали и в 15-30% всех инвазивных груди Рак1,2. Гиперэкспрессия HER2 определяется наличием > 10% клеток с сильным мембраны иммуногистохимический (IHC) окрашивание (3 +), в то время как амплификации генов могут быть оценены когда либо соотношение HER2/центромер ≥2 или номер копии гена ≥6, на подсчет голосов на наименее 20 клеток в situ гибридизация (ISH)3.

Генетической гетерогенностью внутри опухоль была широко описана в молочной железы, потенциально неблагоприятных вклад биомаркеров оценки и лечения ответ4. Согласно колледж американских патологов (CAP), неоднородность HER2 существует если HER2 усиливается в > 5% и < 50% проникновения опухолевых клеток5. К сожалению фактическая заболеваемость пространственной гетерогенности рака груди HER2 остается предметом споров среди патологоанатомов, с некоторыми авторами, что поддержание это событие чрезвычайно редки, и другие о том, что до 40% случаев HER2-гетерогенных1,5,6,,78,9,10. Несмотря на биологические механизмы, лежащие в основе этого состояния не еще полностью уточняются, прогностические и клинических последствий неоднородности HER2 интра опухоли имеют решающее значение для больных раком молочной железы11.

Недавно ярко поле молекулярные методы, такие как хромогенных иш (CISH) и серебряные иш (SISH), появились как надежные методы для обнаружения HER2 гетерогенность в FFPE тканях, с некоторыми преимуществами по сравнению с флуоресцентные иш (рыба)12. К сожалению массового анализа единичных случаях остается непрактичным в больших когортных исследований. Несколько групп показали, что сочетание гистохимии, МХК и ISH с ТМА технологий может представлять ценные стратегии в исследовании рака биологии13,14,,1516. С этого широко распространенного метода образцы ткани из разных пациентов могут быть проанализированы одновременно, минимизации ткани и реагентов, используемых и способствуя единообразного анализа большой серии случаев14. Однако без протоколы доступны для одновременного высок объём молекулярные характеристики нескольких образцов тканей, которые прошли различные обработки с точки зрения реагентов, фиксации времени и методы сохранения занятости, таких как архивные блоки.

Учитывая прогностические и клинические последствия HER2 Пространственная гетерогенность рака молочной железы, мы разработали комплексную платформу молекулярной оценить его в большой серии гетерогенно переработанных случаев. Здесь мы изобразить Лаборатория стратегии для создания и анализа гетерогенности интра опухоль HER2 амплификации в высокодоходные TMAs рака молочной железы с помощью SISH. Следующий протокол был разработан для измерения опухоли > 5 мм (> pT1b согласно TNM 2017)17. Для небольших повреждениях мы рекомендуем проведение анализа на анфас последовательных участках. Наша процедура позволяет для одновременного анализа IHC и SISH рака груди до 30, охватывающих означает 6 различных областей (диапазон 4-8) для каждого случая. В общей сложности 180 сердечников ткани 1 мм в диаметре, с 500 мкм между ядрами и 2 мм между краями сетки и будет создаваться для каждого ТМА блока.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Это исследование было одобрено институциональные наблюдательные советы от IRCCS Ca' Granda фонд, больницы Поликлинико, Милан, Италия.

1. подбор больных и образцы тканей

  1. Извлечения архивных слайды всех случаев для анализа, включая все доступные гематоксилином и эозином (H & E) и IHC слайды из первоначального диагноза и, если присутствует, один H & E согласованы не неопластических груди ткани (например, хирургические маржа) .
  2. Выполните случае отзывов.
    Примечание: Для выполнения этой задачи, по крайней мере два патологоанатомов с опытом работы в патологии молочной железы следует обсудить диагностики слайды и урегулировать разногласия коллегиально. Используйте обычные микроскопа или переработанное инструменты (в пользу последнего в многоцентровые исследования). Если таковые имеются, исключите все несогласный случаев.
    1. Выполните гистологические реклассификации всех случаев согласно последней редакции классификации Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) опухолей груди18.
    2. Убедитесь, что нормальной ткани для каждого случая, если они присутствуют в архивных клинических образцов, включает по крайней мере не неопластические терминала протоковой лобулярного единицу.
    3. Идентифицировать все неопластических районы, которые показывают гетерогенных цитологическим, архитектурные, или IHC функции с помощью микроскопа ярко поле (совместно выполняться патологоанатом и technician(s), кто построит TMAs).
  3. Выделите области дискретных Топографическая с маркером на слайде стекла или с помощью надлежащего инструмента на цифровой слайд программное обеспечение (рис. 1A).
  4. На основании выбранных слайдов, извлечь соответствующие блоки FFPE из архивов.
    Примечание: Для оптимизации ТМА строительства, чтобы избежать истощения ткани и для сохранения ТМА удар структурной целостности, случаи с < 1 мм остаточной ткани должны быть исключены.

2. Проектирование и строительство TMAs, основанный на методе Кононен

  1. Создать и открыть новый файл электронной таблицы, включения записи из различных областей в каждом случае. Включить следующие данные по отдельным столбцам, о чем свидетельствует таблица 1: случай ID, идентификатор блока, идентификатор области, ткани типа (например, нормальные ткани, инвазивные компонент histotype, в месте histotype компонент), топографии (например, опухоль ядро, инвазивные фронт), морфологии (например, ядерный класс, архитектура, митозов, цитологические особенности), Биомаркеры статус (т.е., эстрогеновый рецептор (Эр), рецепторы прогестерона (PR), Ki67 и HER2) и все другие функции IHC.
    1. Сохраните документ.
  2. Создайте проект TMA.
    1. Установить и открыть ТМА дизайн программного обеспечения.
    2. Определение получателя ТМА блок: доступ через меню Файл > Новый > блок или с помощью CTRL + B.
    3. Щелкните в первом поле для заполнения или нажмите клавишу Tab и введите размеры блока парафин: ширина 35 (мм), высота (мм) 20. Тип «2» как «маржа» значение (то есть, расстояние от края парафина в мм) (рис. 1B). Сохраните данные, нажав кнопку надлежащего. Новый шаблон получателей блока теперь сохраняется и готов к использованию в новых шаблонах массив ткани.
    4. Создайте проект массив ткани: доступ к меню Файл > Новый > ткани массива или с помощью CTRL + T.
    5. Заполните имя массива ткани, комментарии и автора, а затем нажмите кнопку «Далее». Щелкните значок «Импорт», выберите файл шаблона блока получателей ранее созданные и нажмите кнопку «Далее».
    6. Выберите 1 мм как размер пятна, нажав на круглую кнопку. Выберите пятно интервал, который представляет собой пространство между двумя центрами соседних пятен 500 мкм. Нажмите на значок калькулятора рассчитать общее количество пятен создана, которая должна быть 231. Нажмите кнопку «Далее».
    7. Определите место нумерации режиме, нажав один раз на нем. Нажмите на кнопку «определить» для создания сеток и вложенных сетках. Удаление центральной линии (линия 6) и столбцы 8 и 15. Поддерживать 3 пятна 1 линии для ориентации. Окончательная карта должна охватывать общее количество 183 пятна, как представлено на рисунке 2.
    8. Определить список типов тканей: доступ через меню Файл > Новый > список типов ткани или с помощью CTRL + L.
    9. Вставьте ранее определенного описания ткани. Нажмите клавишу Стрелка вниз или нажмите на кнопку +, чтобы добавить строку.
    10. Определение проекта: доступ через меню Файл > Новый > руля проекта или с помощью CTRL + P.
    11. Заполните имя массива ткани, комментарии и автор, а затем нажмите кнопку «Далее». Импортируйте файл электронной таблицы, список типов ткани и ткани массив модель ранее созданные, нажав надлежащего значки.
    12. Нажмите кнопку «Выбрать все» и определить количество мест для каждого типа ткани; Нажмите на кнопку «матч», чтобы применить настройки. Появится таблица с перечнем общее количество ядер, которые будут выборки и переданы получателей блоки в этом проекте. Сохраните проект и закрыть программу.
  3. Подготовьте акцептора блок (рис. 1B).
    1. Наполнить очищенную металлические формы эластичные парафина на 65 ° C.
    2. Оставьте парафиновые блоки остыть при комнатной температуре на ночь внутри металлических форм.
    3. Извлечь парафиновые блоки из металлических форм. Если отказы происходят, отменить блока и повторите шаги 2.3.1-2.3.3.
  4. Постройте ТМА, с использованием автоматических или полуавтоматических arrayer19.
    1. Извлечение всех выбранных блоков FFPE и в соответствующих разделах H & E с аннотациями.
    2. Включите arrayer и вставьте блок акцептор на карусель arrayer.
    3. Откройте программное обеспечение управления станции arrayer, нажмите на «Новый массив ткани» и загрузить ранее созданный проект (рис. 1 c).
    4. Нажмите кнопку «Продолжить» и выберите позицию доноров блок из меню.
    5. Определите начальную позицию на каждого получателя блока: Используйте клавиши со стрелками для перемещения лазерного света и привести его в соответствие с левого верхнего края на парафин заблокированных получателей.
    6. Нажмите кнопку «Далее» и повторите для вертикального выравнивания.
    7. Нажмите «Далее», чтобы автоматически создать дыру в ранее определенные координаты получателя (акцептор) блока.
    8. Пустые удар.
    9. Поместите блок доноров для отбора проб и удалить основной ткани из области ранее аннотированный интересов.
    10. Основные ткани доноров вставьте в отверстие в блоке получателя (акцептор).
    11. Удалите блок доноров из arrayer.
    12. Повторите шаги 2.4.5-2.4.11, пока не завершится TMA.
  5. Надел стерильные пустой слайд стороне ткани недавно созданного блока ТМА и поместите их в лаборатории духовку на 45 ° C за 5 мин.
  6. Аккуратно нажмите блок на слайде 5 s расплющивать сердечников ткани. Повторите один раз (для в общей сложности 2 раза).
  7. Удалите блок ТМА вместе с слайд из духовки, флип их и осторожно Отсоедините блок от слайда.
  8. Покрытие поверхности ткани TMA с тонким слоем эластичные парафина на 65 ° C.
  9. Оставьте на TMA блок при комнатной температуре в течение 2 ч.
  10. Передача ТМА блок на 4 ° C в течение 24 ч.
    Примечание: В TMA блок может храниться при температуре 4 ° C до изнеможения.

3. гистохимические и Иммуногистохимический анализ

  1. Вырежьте ТМА секций.
    1. Место ТМА акцептор вышивки с парафином стороной вниз на поверхность-10 ° C на 10 минут для охлаждения парафина.
    2. Заполните ванну размещения с ультрачистая вода и установите тепла до 38 ° C.
    3. Место нового лезвия на поворотный микротома и вставьте блок в патрон микротом так воск блок сталкивается лезвие и выравнивается в вертикальной плоскости.
    4. Тщательно подход блок с лезвием и вырезать несколько тонких секций для обеспечения правильности позиционирования; При необходимости отрегулируйте.
    5. Вырежьте 3 мкм толстые секции.
    6. Подобрать разделов с помощью пинцета и их плавают на поверхности воды ванна.
    7. Выберите разделы из водяной бани на регулярной и МГС/иш стеклянных скольжениях.
    8. Поместите слайды на стойку и хранить их в духовку на 45 ° C на ночь.
      Примечание: После подготовки, ТМА секции следует витражи в течение 24 ч.
  2. Выполнять, гистохимические окрашивание (H & E) с помощью autostainer.
    1. Вставить слайды в стойке autostainer и разместить их на 60 ° C в течение 10 мин.
    2. Откройте раздел загрузки autostainer и вставить стойки с ТМА слайды в одной из станций нагрузки с стандартным H & E клип наружу.
    3. После того, как ящик закрыт, клип будет автоматически распознается системой и начнется следующий протокол: станция печи при 37 ° C (6 мин), ксилол (2 мин), ксилол (2 мин), 100% этанола (2 мин), 100% этанола (2 мин), этанола 95% (2 мин), этанола 95% (2 мин) , дистиллированной воды (4 мин), в Carazzi гематоксилином (9 min), низкого давления проточной водой (2 мин), 1% эозина (1 мин), низкого давления проточной водой (2 мин), этанол 95% (20 s), этанол 95% (20 s), этанол 95% (20 s), этанол 95% (20 s), 100% этанола (15 s), 100% этанола (15 s) , ксилол (30 s), ксилол (30 s).
    4. Выгрузите стойки из ящика и смонтировать слайд с крышки выскальзования.
      1. Собирать капли гору с пипетки и положил его на внешний край крышки слайд.
      2. Место в мокрой части крышки выскальзования на слайде и пусть горе сухой в течение 30 мин.
  3. Выполняют IHC пятная для ER, PR, Ki67 и HER2 с помощью автоматических immunostainer.
    Примечание: Перед началом окрашивание запуска, запуск системы и проверьте бутылки реагент расходных материалов (Таблица материалов) и отходы контейнеров.
    1. Место скольжениях TMA для анализа на 60 ° C в течение 10 мин.
    2. Запустите инструмент immunostainer и программного обеспечения.
    3. В представлении Главная нажмите кнопку протоколы и затем нажмите кнопку Создать/редактировать протоколы.
    4. Выберите стандартный DAB (3, 3'-диаминобензидин) IHC процедурой изменять базовый шаблон.
    5. Флаг «Депарафинизации» в списке и установите температуру среды при 72 ° C.
    6. Флаг cc1 демаскирующих решение, установите температуру среды при 95 ° C и время инкубации в 36 мин.
    7. Пометить поле основное антитело, вставить ID ER Встроенный дозатор (инструмент программного обеспечения будет распознавать распылитель на карусель реагент) и установите время инкубации в 16 мин.
    8. Пометить поле Counterstaining, выберите гематоксилином я и установить время инкубации в 12 мин.
    9. Нажмите кнопку «Сохранить как» и имя протокола.
    10. Повторите шаги 3.3.3-3.3.9 для оставшихся антител, используя следующее время инкубации первичного антитела: PR 16 мин, Ki67 16 мин и HER2 12 мин использовать предварительно разбавленного готовых к использованию (RTU) антител.
    11. В представлении Главная нажмите кнопку Создать ярлык.
    12. Нажмите кнопку протоколы и добавьте ER, PR, Ki67 и HER2 протоколов для каждого ТМА анализа.
    13. Нажмите кнопку Закрыть /Print.
    14. Как шаблон метки появится, введите идентификаторы TMA для метки.
    15. Нажмите кнопку Печать, чтобы распечатать наклейки, а затем применить их на скольжениях TMA.
    16. Щелкните значок инструмента и установите режим запуска инструмента как «Готово».
    17. Откройте капот, который охватывает Карусель реагентов, системы обнаружения и первичных антител, затем закройте капот.
    18. Нажмите кнопку фронт на слайд ящик, чтобы открыть его, загрузить скольжениях TMA и закройте ящик, нажав ту же кнопку.
    19. Установите режим запуска инструмента как «работает» и следуйте инструкциям.
    20. В конце выполнения, выгрузки, ТМА слайдов, нажав все ящики с кнопку завершения слайды на инструмент управления с слайд и промойте их в теплой мыльной водой, чтобы удалить любые оставшиеся реагентов.
    21. Вымойте слайды под низким давлением холодной воды, обезвоживает скольжениях TMA и применить к каждому слайду стекла coverslip.
  4. Выполнить анализ IHC ER, PR и HER2 после американского общества клинической онкологии (ASCO) / крышка руководящие принципы и Ki67 согласно рекомендации международного Ki67 в рак молочной железы Рабочей группы (таблица 2).
    Примечание: Этот анализ должен быть выполнена отдельно в дискретных ткани пятна патологоанатом с опытом работы в молочных желез.
    1. Оцените выражение ER как позитивные, если ≥ 1% ядер клеток опухоли иммунореактивных20,21,,2223.
    2. Оцените выражение PR как позитивные, если ≥ 1% ядер клеток опухоли иммунореактивных20,21,,2223.
    3. Оценить HER2 выражение как:) Оценка 3 + если окружная мембраны окрашивание, является полной и интенсивным, b) Оценка 2 + Если окрашивание продольных мембраны является неполной и/или слабого/умеренной и в > 10% клеток инвазивные опухоли или полная и Окружная мембраны окрашивание является интенсивным и ≤ 10% инвазивных раковых клеток, c) Оценка 1 + Если окрашивание неполной мембраны слабый едва уловимое и в > 10% клеток инвазивной опухоли, d) отрицательным, если не пятнать или мембраны Окрашивание является неполной и слабый едва уловимое, и в пределах ≤ 10% инвазивные опухоли клетки3,24.
    4. Оценить Ki67 индекс как процент клеток с ядерными окрашивание по меньшей мере 1000 неопластических клеток случайно выбранных более 10 мощных поля (увеличение, 400 X)25.

4. SISH анализ HER2

  1. Вырежьте ТМА секций (повторите шаг 3.1).
  2. Выполните SISH для HER2 с использованием автоматических immunostainer.
    1. Место скольжениях TMA для анализа на 60 ° C в течение 10 мин.
    2. Запустите инструмент immunostainer и программного обеспечения.
    3. В представлении Главная нажмите кнопку протоколы и затем нажмите кнопку Создать/редактировать протоколы.
    4. Выберите «U двойной ISH CKT» процедуру для изменения базового шаблона.
    5. Флаг «Сушка» в списке поле и установите температуру на 63 ° C в течение 20 мин.
    6. Флаг «Мобильные принадлежности» в списке поле, затем «мобильный кондиционер CC2» и установите температуру во время 86 ° C и инкубации на 4 мин.
    7. Флаг мягкий CC2 (1 цикл), стандарт (2 цикла) и расширенной (цикл 3) для 8 мин, 12 мин и 8 мин, соответственно.
    8. Флаг «Иш-протеазы 3» в списке поле и установите время инкубации в 16 мин.
    9. Выберите зонды, HER2DNP и CHR17DIG и задайте время инкубации в 6 ч.
    10. Установка мытье на 76 ° C 8 мин.
    11. Установите время инкубации multimer (SIL иш DNP ПХ) SISH в 32 мин.
    12. Установите время инкубации Серебряный хромогена (SIL иш DNP КПЧК) на 4 мин.
    13. Установите время инкубации красный multimer (красный иш КОПАТЬ AP) в 24 мин.
    14. Установите время инкубации хромогена красный (красный иш КОПАТЬ FR) на 8 мин.
    15. Флаг «Counterstaining» в списке поле выберите «ГЕМАТОКСИЛИНОМ II» и установите время инкубации в 8 мин.
    16. Флаг «пост Counterstaining» в списке поле, выберите «РАСТОЧИТЕЛЬНОСТЬ РЕАГЕНТ» и установите время инкубации в 4 мин.
    17. Повторите шаги от 3.3.11-3.3.15 (выберите изменение U двойной иш CKT протокол).
    18. Открыть капот, который охватывает реагентов карусель, мойки и систем обнаружения ISH, а затем закройте капот.
    19. Повторите шаги от 3.3.18-3.3.21.
  3. Анализ SISH для HER2: оценить амплификация гена HER2 как позитивные, если коэффициент /CEP17 HER2≥2.0 с средний HER2 копии номер ≥4.0 сигналов в клетку и отрицательным, если коэффициент /CEP17 HER2< 2.0 в среднем HER2 скопировать номер < 4.0 сигналов/ячейку3,24.
    Примечание: Аналогично IHC, этот анализ должен осуществляться отдельно в дискретных ткани пятна патологоанатом с опытом работы в молочных желез.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

В целом, 444 инвазивных молочной железы, рака были включены в 15 TMAs, специально оптимизированный для анализа иш. Среди отобранных 2,664 пятна 2,651 (99,5%) были представитель ранее выделенных областей и поэтому считается поддаются для последующего анализа. Интра опухоль гетерогенности был определен посредством IHC и SIH, с особым упором на гетерогенных дистрибутивов HER2-позитивных клонов в различных топографических областях опухоли. Таблица 3 изображает биологические х...

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Здесь мы подробно стратегии лаборатории для выполнения анализов SISH гена HER2 и его соответствующий центромер в высокодоходные TMAs гетерогенно переработки молочной железы. Этот метод является экономически эффективным и может осуществляться в большинстве лабораторий для исследования неоднородности амплификация гена HER2 в большой когорты груди Рак получены формы патологии архивов.

Благодаря клиническое значение HER2 тестирования в рак молочной железы и проблемы, порожденные ...

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Авторы имеют без конфликта интересов.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Surgipath ParaplastLeica Biosystems, Вецлар, Германия, ЕС39601006Среда для встраивания тканей, 56 ° C температура плавления
Eosin Y  1% водный растворBio Optica, Милан, Италия, ЕС510002Eosin желтоватый, водорастворимый
Carazzi' s гематоксилинBio Optica, Милан, Италия, ЕС506012Квасцы гематоксилин созревший с использованием йодата калия
Алмаз качестваLaboindustria, Arzergrande, Италия, ЕС3353326x76 мм предметные стекла для микроскопа
Leica CV MountLeica Biosystems, Вецлар, Германия, ЕС14046430011Монтажная среда, без мономеров, на основе полимеров бутилметакрилата в
предметных стеклах микроскопа FLEX IHCAgilent Technologies (Dako),  Санта-Клара, Калифорния, СШАK8020 Предметныестекла для микроскопа с покрытием для адгезии FFPE для использования в медицинской системе IHC
BenchMark ULTRAVentana, Тусон, Аризона, СШАN750-BMKU-FSСистема окрашивания предметными стеклами
CONFIRM антиэстрогенный рецептор (ER) (SP1) Моноклональное первичное антителокролика Медицинская система Ventana, Тусон, Аризона, США790-4324Первичное антитело, готовое к использованию
CONFIRM anti-Progesterone Ceptor (PR) (1E2) Rabbit Monoclonal Primary AntibodyVentana medical system, Tucson, AZ, США790-2223Первичное антитело, готовое к применению
CONFIRM anti-Ki-67 (30-9) Rabbit Monoclonal Primary АнтителоVentana медицинская система, Тусон, Аризона, США790-4286Первичное антитело, готовое к использованию
PATHWAY HER2 (4B5) Rabbit Monoclonal Primary Антителомедицинская система, Тусон, Аризона, США790-4493Первичное антитело, готовое к использованию
ultraView Universal DABDetection Kit Медицинская система Ventana, Тусон, Аризона, США760-500Непрямая, не содержащая биотина система для обнаружения мышиного IgG, мышиного IgM и кроличьих первичных антител
INFORM HER2 Dual ISH DNA Probe CocktailVentana медицинская система, Тусон, Аризона, США780-4422INFORM HER2 Dual ISH assay - Двухцветная гибридизация in situ одобрена FDA для определения статуса гена HER2 у пациентов с раком молочной железы 
ultraView Silver ISH DNP Detection KitVentana medical system, Tucson, AZ, США800-098
ultraView Red ISH DIG Detection KitVentana medical system, Tucson, AZ, США800-505
ISH Protease 3Ventana medical system, Tucson, AZ, США780-4149Используется в процессе ISH для удаления белка, который окружает целевые последовательности ДНК
гематоксилинМедицинская система Ventana, Тусон, Аризона, США760-2021Модифицированный реактив Гилла для противодействия гематоксилину
Гематоксилин II Противоокрашиваниемедицинской системы Ventana, Тусон, Аризона, США790-2208Модифицированный реактив Мейера для противодействия гематоксилину Реактив
Bluing реактивVentana медицинская система, Тусон, Аризона, США760-2037Водный раствор буферного карбоната лития для воронения окрашенных гематоксилиновых срезов на предметных стеклах
HybReadyVentana medical system, Tucson, AZ, США780-4409Буфер на основе формамида для анализов ISH
EZ Prep (10x)Ventana medical system, Tucson, AZ, США950-102Концентрат раствора для удаления парафина из образцов тканей во время реакций IHC и ISH, а также для разбавления 1:10.
SSC Buffer (10X)Ventana medical system, Тусон, Аризона, США950-110Буферный раствор хлорида натрия и цитрата натрия используется для строгих промывок и для промывки предметных стекол между этапами окрашивания, а также для обеспечения стабильной водной среды для реакций гибридизации in situ. Разбавляем 1:5.
Медицинская система ULTRA LCSVentana, Тусон, Аризона, США650-210Предварительно разбавленный (готовый к использованию) покровный раствор, используемый в качестве барьера между водными реагентами и воздухом для предотвращения испарения в реакциях ИГХ и ISH
Реакционный буфер (10x)Медицинская система Ventana, Тусон, Аризона, США950-300Буферный раствор на основе триса (pH 7,6 &mn; 0,2) для промывки предметных стекол между этапами окрашивания во время ИГХ и ISH. Разбавьте 1:10.
ULTRA Cell Conditioning (ULTRA CC2)Медицинская система Ventana, Тусон, Аризона, США950-223Этапы предварительной обработки образцов тканей во время ИГХ и ISH. Готов к использованию.
ULTRA Cell Conditioning (ULTRA CC1)Медицинская система Ventana, Тусон, Аризона, США950-224
ultraView Silver Wash IIМедицинская система Ventana, Тусон, Аризона, США780-003Готовое к использованию решение для полоскания предметных стекол между этапами окрашивания IHC и ISH
MicrotomeLeica Biosystems, Вецлар, Германия, ЕСRM 2255Автоматизированный ротационный микротомный
мультиокрашивательLeica Biosystems, Вецлар, Германия, EUST 5020Рабочая станция для автоматизированного окрашивания и слипания покрова
Minicore 1Alphelys, Plaisir, Франция, EU00-MICO-1Полуавтоматический массив для построения ТМА со встроенным программным обеспечением TMA Designer 2
Aperio ScanScope CS2Leica Biosystems, Вецлар, Германия, ЕСK080254 Устройство захвата изображений - цифровой сканер патологии
Tissue-Tek III Uni-CassetteSakura Finetek Europe B.V4135Кассета
Tissue-Tek Paraform Стандартная базовая формаSakura Finetek Europe B.V7055Форма из нержавеющей стали

Ссылки

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Allison, K. H., Dintzis, S. M., Schmidt, R. A. Frequency of HER2 heterogeneity by fluorescence in situ hybridization according to CAP expert panel recommendations: time for a new look at how to report heterogeneity. Am J Clin Pathol. 136 (6), 864-871 (2011).
  2. Montemurro, F., Scaltriti, M. Biomarkers of drugs targeting HER-family signalling in cancer. J Pathol. 232 (2), 219-229 (2014).
  3. Wolff, A. C., et al. Recommendations for human epidermal growth factor receptor 2 testing in breast cancer: American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists clinical practice guideline update. J Clin Oncol. 31 (31), 3997-4013 (2013).
  4. Ng, C. K., Pemberton, H. N., Reis-Filho, J. S. Breast cancer intratumor genetic heterogeneity: causes and implications. Expert Rev Anticancer Ther. 12 (8), 1021-1032 (2012).
  5. Vance, G. H., et al. Genetic heterogeneity in HER2 testing in breast cancer: panel summary and guidelines. Arch Pathol Lab Med. 133 (4), 611-612 (2009).
  6. Murthy, S. S., et al. Assessment of HER2/Neu status by fluorescence in situ hybridization in immunohistochemistry-equivocal cases of invasive ductal carcinoma and aberrant signal patterns: a study at a tertiary cancer center. Indian J Pathol Microbiol. 54 (3), 532-538 (2011).
  7. Ohlschlegel, C., Zahel, K., Kradolfer, D., Hell, M., Jochum, W. HER2 genetic heterogeneity in breast carcinoma. J Clin Pathol. 64 (12), 1112-1116 (2011).
  8. Chang, M. C., Malowany, J. I., Mazurkiewicz, J., Wood, M. 'Genetic heterogeneity' in HER2/neu testing by fluorescence in situ hybridization: a study of 2,522 cases. Mod Pathol. 25 (5), 683-688 (2012).
  9. Bartlett, A. I., et al. Heterogeneous HER2 gene amplification: impact on patient outcome and a clinically relevant definition. Am J Clin Pathol. 136 (2), 266-274 (2011).
  10. Seol, H., et al. Intratumoral heterogeneity of HER2 gene amplification in breast cancer: its clinicopathological significance. Mod Pathol. 25 (7), 938-948 (2012).
  11. Hanna, W. M., et al. HER2 in situ hybridization in breast cancer: clinical implications of polysomy 17 and genetic heterogeneity. Mod Pathol. 27 (1), 4-18 (2014).
  12. Sanguedolce, F., Bufo, P. HER2 assessment by silver in situ hybridization: where are we now? Expert Rev Mol Diagn. 15 (3), 385-398 (2015).
  13. Fusco, N., et al. The Contrasting Role of p16Ink4A Patterns of Expression in Neuroendocrine and Non-Neuroendocrine Lung Tumors: A Comprehensive Analysis with Clinicopathologic and Molecular Correlations. PLoS One. 10 (12), e0144923(2015).
  14. Albanghali, M., et al. Construction of tissue microarrays from core needle biopsies - a systematic literature review. Histopathology. 68 (3), 323-332 (2016).
  15. Navani, S. Manual evaluation of tissue microarrays in a high-throughput research project: The contribution of Indian surgical pathology to the Human Protein Atlas (HPA) project. Proteomics. 16 (8), 1266-1270 (2016).
  16. Fusco, N., et al. HER2 in gastric cancer: a digital image analysis in pre-neoplastic, primary and metastatic lesions. Mod Pathol. 26 (6), 816-824 (2013).
  17. Amin, M. B., et al. AJCC Cancer Staging Manual. , Eight, Springer International Publishing. (2017).
  18. Lakhani, S. R., Ellis, I. O., Schnitt, S. J., Tan, P. H., van de Vijver, M. J. WHO Classification of Tumours of the Breast. , 4th, IARC press. (2012).
  19. Kononen, J., et al. Tissue microarrays for high-throughput molecular profiling of tumor specimens. Nat Med. 4 (7), 844-847 (1998).
  20. Fusco, N., et al. Resolving quandaries: basaloid adenoid cystic carcinoma or breast cylindroma? The role of massively parallel sequencing. Histopathology. 68 (2), 262-271 (2016).
  21. Fusco, N., et al. Genetic events in the progression of adenoid cystic carcinoma of the breast to high-grade triple-negative breast cancer. Mod Pathol. 29 (11), 1292-1305 (2016).
  22. Fusco, N., et al. Recurrent NAB2-STAT6 gene fusions and oestrogen receptor-α expression in pulmonary adenofibromas. Histopathology. 70 (6), 906-917 (2017).
  23. Hammond, M. E., et al. American Society of Clinical Oncology/College Of American Pathologists guideline recommendations for immunohistochemical testing of estrogen and progesterone receptors in breast cancer. J Clin Oncol. 28 (16), 2784-2795 (2010).
  24. Fusco, N., Bosari, S. HER2 aberrations and heterogeneity in cancers of the digestive system: Implications for pathologists and gastroenterologists. World J Gastroenterol. 22 (35), 7926-7937 (2016).
  25. Dowsett, M., et al. Assessment of Ki67 in breast cancer: recommendations from the International Ki67 in Breast Cancer working group. J Natl Cancer Inst. 103 (22), 1656-1664 (2011).
  26. Dekker, T. J., et al. Determining sensitivity and specificity of HER2 testing in breast cancer using a tissue micro-array approach. Breast Cancer Res. 14 (3), R93(2012).
  27. De Sio, G., et al. A MALDI-Mass Spectrometry Imaging method applicable to different formalin-fixed paraffin-embedded human tissues. Mol Biosyst. 11 (6), 1507-1514 (2015).

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE

Запросить разрешение

Теги

in situHER2

Похожие статьи