Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Фракционирование резолюции растворимых и нерастворимых гентингтина видов

9.2K просмотров

⸱

DOI:

10.3791/57082

⸱

27 февраля 2018 г.

В этой статье

Краткое содержание

Для фракционирования растворимых и нерастворимых мутант гентингтина видов от мыши мозга и клетки культуры описан метод. Метод, описанный полезен для характеристик и количественной оценки потока белок гентингтин и СПИДа в анализе белка гомеостаза в патогенезе заболевания и при наличии возмущений

Аннотация

Накопление смятых протеинов имеет центральное значение для патологии в болезни Гентингтона (HD) и многих других нейродегенеративных расстройств. В частности ключевой особенностью патологических HD это ненормальное накопление Мутантный белок HTT (mHTT) в высокой молекулярной массой комплексов и внутриклеточные включения органы, состоящие из фрагментов и других белков. Традиционные методы измерения и понять, что вклад различных форм mHTT содержащих агрегаты включают микроскопии флуоресцирования, Западный анализ помаркой и фильтра улавливания анализов.

Однако большинство из этих методов являются конформации конкретным и поэтому не может разрешить полное состояние потока белка mHTT из-за сложного характера агрегатные растворимость и резолюции.

Для определения совокупных mHTT и различных модифицированных форм и комплексов разделения и солюбилизация клеточных агрегатов и фрагменты является обязательным. Здесь мы описываем метод, чтобы изолировать и визуализировать растворимых mHTT, мономеры, олигомеры, фрагменты, и нерастворимые высокомолекулярные (HMW) накопленных mHTT видов. HMW mHTT треки с прогрессирования заболевания, соответствует мыши поведения отсчетов и было выгодно модулированные некоторых терапевтических вмешательств1. Этот подход может использоваться с мыши мозга, периферических тканях и культуру клеток, но могут быть адаптированы к другие модели систем или болезни контекстах.

Введение

Разрушение белка контроля качества сетей, которые обеспечивают надлежащего складные и деградации клеточных белков — вероятно, центральное место в патологии в болезни Альцгеймера (AD), болезнь Паркинсона (PD), болезнь Гентингтона (HD) и другие «сворачиванию белков» расстройства,2,3. Глубокое понимание proteostasis сетевые компоненты и их вклад в патологии Поэтому решающее значение для разработки более терапевтических вмешательств. HD это вызвано ненормальное расширение CAG повторять в течение HD гена, что приводит к расширенный участок polyglutamines (polyQ) в белок гентингтин (НТТ)4. По....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

-Животных этики заявление эксперименты проводились в строгом соответствии с руководством для ухода и использования лабораторных животных протокола институциональный уход животных и использование Комитета (утвержденных исследований на животных и национальных институтов здравоохранения IACUC) Калифорнийского университета в Ирвине, АААЛЖ аккредитованные учреждения. Были предприняты все усилия для сведения к минимуму страдания животных.

1. Подготовка буфера Lysis

  1. Подготовка «Растворяется» буфера lysis (10 мм трис рН 7,4, 1% тритон-X 100, 150 мм NaCl, 10% глицерина) и стерильного фильтра через 0,22 мкм фильтром.
    1. Для работы «Рас....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

Резолюция растворимых и нерастворимых lysates клетки после фракционирование могут быть обнаружены с помощью западных анализа и фильтрации отсталости анализов (рис. 2). Например, HEK293T клетки были transfected с помощью трансфекции реагента (например, lipofectamine 2000), с HTT экзона 1 кодирования cDNA, содержащие 97 глютамина повторяет15 следуют поли пролина богатый регион, и эти клетки было разрешено Экспресс для 44 h. клет.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Некоторые меры предосторожности необходимы для вышеуказанных протоколов для обеспечения последовательного и количественных результатов. Во-первых, mHTT в обеих фракций спонтанно образуют агрегаты со временем на несколько циклов замораживания-оттаивания, особенно когда в высокой концентрации. Таким образом, имеет решающее значение для замораживания аликвоты парфюмерные белка и размораживать только необходимый объем до запуска assay, как описано в протоколе выше. Кроме того если нерастворимых фракция дает белый осадителя п.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Авторы не имеют ничего сообщать.

Благодарности

Эта работа была поддержана NIH (RO1-NS090390). Мы также хотели бы поблагодарить д-ра Джоан Steffanfor технической помощи и обсуждения в ходе разработки этот assay.

....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Стерильный фильтрMilliporeSCGP505REЗавинчивающаяся крышка, стерильный вакуумный фильтр
1 мл Тканевый измельчитель, DounceWheaton357538
SonicatorQsonicaModel Q125
DC Protein AssayBiorad5000111сравним с анализом Lowry Tris
1M буферный растворAlfa AesarJ60636
Triton X-100FisherBP151-100
NaCl 5M растворTeknovaS0251
ГлицеринFisherBP229-1
20% SDS растворTeknovaS0295
N-этилмалеимидSigmaE1271
Фенилметилсульфони фторидSigmaP7626создать 100 мМ стоковый раствор в 100% EtOH, хранить по адресу 4° C
Ортванадат натрияSigmaS6508Создать 0,5М стоковый раствор в воде
ЛейпептинSigmaL2884Создать 10 мг/мл стоковый раствор в воде
АпротининSigmaA1153Создать 10 мг/мл стоковый раствор в воде
Фторид натрияSigmaS4504Создать 500 мМ стоковый раствор в воде
Anti-HTTMilliporeMAB5492Используйте 1:1000 для вестерн-блоттинга, 1:500 для анализа задержки фильтра
Anti-GAPDHNovus BiologicalsNB100-56875Используйте 1:1000 для растворимого вестерн-блоттинга

Ссылки

  1. Ochaba, J., et al. PIAS1 Regulates Mutant Huntingtin Accumulation and Huntington's Disease-Associated Phenotypes In Vivo. Neuron. 90 (3), 507-520 (2016).
  2. La Spada, A. R., Taylor, J. P. Repeat expansion disease: progress and puzzles in dis....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Теги

Белок хантингтинфракционирование белковразделение на растворимую и нерастворимую фракциивысокая молекулярная массавестерн-блот-анализЭлектрический форез в ПААГ с SDSанализ содержания белкализис клетокцентрифугированиесоникация