Здесь мы представляем протокол для количественного определения и квалификацию каждого вида сфингомиелин, используя несколько мониторинг реакции и МС/МС/МС режим, соответственно.
Method Article
Здесь мы представляем протокол для количественного определения и квалификацию каждого вида сфингомиелин, используя несколько мониторинг реакции и МС/МС/МС режим, соответственно.
Мы представляем метод анализа сфингомиелин (SM) качественно и количественно жидкого хроматографии электроспрей ионизации тандем масс-спектрометрия (LC-ЭСИ-МС/МС). SM является общей Сфинголипиды, состоящий из фосфорилхолин и Церамид как компонент гидрофильные и гидрофобные, соответственно. Ряд видов SM присутствуют в клетках млекопитающих из-за разнообразия в сфингоидные длинной цепи базы (LCB) и N-ацил группу в составе Церамид. В настоящем докладе, мы показываем метод оценки количество углерода и двойных связей в LCB и N-ацил группу на основе их соответствующего продукта ионов в экспериментах MS/MS/MS (3МС). Кроме того мы представляем метод количественного анализа для SM с использованием двух стабильных гетерогенны помечены SM видов, что облегчает определение диапазона, используемые в SM количественный. Нынешний метод будет полезным при характеристике различных видов SM в биологических образцов и промышленных продуктов, таких как косметика.
Сфингомиелин (SM) является общим Сфинголипиды в mammalian клетках. SM-синтезированных внутриклеточно1 и настоящего как прекурсор для других Сфинголипиды, такие как сфингозин-1-фосфата и керамиды, которые имеют решающую роль в иммунной клетки оборота и кожи барьер гомеостаза, соответственно2, 3. Таким образом точный анализ метаболизма SM имеет важное значение для выяснения роли физиологических и патологических Сфинголипиды.
SM состоит из церамида и фосфорилхолин, что связано с 1-гидрокси группы Церамид, которая также состоит из сфингозин и N-ацил остаток. Различные количества углерода и двойную связь в сфингозин и N-ацил общие результаты количество Церамид (и SM) видов. Последние достижения в LC-ЭСИ-MS/MS позволило количественный и качественный анализ SM4,5. В качественном анализе количество углерода и двойные скрепления сфингоидные LCB SM была определена путем назначения продукта Ион спектры LCB. Однако структурная информация N-ацил остаток не было получено непосредственно, потому что его соответствующего продукта ионов не сообщалось и поэтому N-ацил постановление были выведены дифференциального анализа между ионами прекурсоров и ионы продукт, соответствующий LCB в обоих режимах положительных и отрицательных ионов4,5. В настоящем докладе, мы представляем метод для обнаружения продукта ионов LCB и N-ацил группу одновременно в режиме3 МС, с помощью тройной квадрупольного и квадрупольного линейной ионной ловушки масс-спектрометрии, который облегчает точное структурных спекуляции каждого вида SM6.
Ион подавления (или повышение) эффекты, вызванные матрицы в биологических образцах затрудняют точную количественную оценку в анализе LC-ЭСИ-MS, и поэтому, желательно строить калибровочные кривые для всех аналитов интерес в матрице идентичные в биологическом образце. Однако эта стратегия не возможно, потому что это почти невозможно для подготовки всех видов SM в биологических образцах, особенно в всеобъемлющего анализа. Таким образом это практично для построения калибровочной кривой и определения количественного диапазона с помощью представительных видов SM шипами в биологических образцах. Мы использовали два вида гетерогенны помечены SM для построения калибровочной кривой; один был использован для внутреннего стандарта и другой для соединения стандарта. Мы обнаружили небольшое количество гетерогенны помечены SM видов как стандартное соединение с шипами в биологических образцах и успешно получил калибровочной кривой и количественного диапазона6.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Консультации все соответствующие листы данных безопасности материалов (MSDS) перед использованием. Надевайте перчатки, чтобы свести к минимуму загрязнение образцов кожи производные SM. Настоящий Протокол применяется к клетки HeLa, выращенных в орла минимальных основных средних дополнена 10% плода бычьим сывороточным (ФБС), 2 мм L-глютамин, 1.000 U/L пенициллина и стрептомицина 100 мг/Л.
1. подготовка проб липидов
Примечание: Важно, что все стекла, включая пробирки с тефлоновым покрытием колпачки быть моющих средств бесплатно.
2. SM анализ LC-ESI-MS/MS
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Химически синтезированных d18:1 / см (рис. 1A) и d18:1 24:0 / 24:0 SM в образцах липидов, извлеченные из клеток HeLa (рис. 1Б) были проанализированы LC-ЭСИ-МС3 использованием [M + HCOO]– и [M-CH3]- как первый и второй прекурсоров ионы, соответственно. Обратите внимание, что интенсивность спектра деметилированное sphingosylphosphorylcholine (СПК) (m/...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
В настоящий качественный метод, мы получили MS3 продукта ионов SPC и N-ацил остаток. Важно, чтобы правильно назначить SPC и N-ацил остаток. В этой связи следует отметить, что другие молекулы, содержащие фосфорилхолин также могут быть обнаружены как MS3 продукта ионов. Diacyl фосфатидилхолин (PC) и Плазмалогены PC изобилии присутствуют в клетках млекопитающих, и их гидрофобность подобна SM. Таким образом diacyl- и Плазмалогены ПК с изотопом (обычно 13C) может быть теорети...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Авторы заявляют, что они имеют никакого конфликта интересов.
Эта работа была поддержана исследовательский грант от министерства образования, культуры, спорта, науки и технологии Японии (KAKENHI) для К.Х. (#15 K 01691), Ю.Ф (#15 K 08625), к.ю. (#26461532) и Грант для изучения сложных заболеваний проекта от министерства Здравоохранения, труда и социального обеспечения (к.ю. #201510032A). Мы благодарим группу Edanz (www.edanzediting.com/ac) для редактирования проекта этой рукописи.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| PBS | ThermoFisher | 10010023 | |
| 100 мм чашка для культуры | тканей IWAKI | 3020-100 | |
| Скребок | для клеток IWAKI | 9000-220 | |
| Силиконизированная пробирка 2,0 мл | Fisher Scientific | 02-681-321 | |
| Пробирка | IWAKI | TST SCR 16-100 | |
| Завинчивающаяся крышка с тефлоновой футеровкой | IWAKI | 9998CAP415-15 | |
| Одноразовая стеклянная трубка | IWAKI | 9832-1310 | |
| CAPCELL PAK C18 ACR 3 & m 1,5 мм I.D. x 100 мм | Shiseido | 92223 | Картридж Guard вставляется в держатель картриджа и соединяется с колонкой C18 |
| CAPCELL C18 MGII S-3 2,0 мм x 10 мм GUARD CARTRIDGE | Shiseido | 12197 | |
| Держатель картриджа | Shiseido | 12415 | |
| Ацетонитрил | Wako | 018-19853 | |
| 2-пропанол (изопропиловый спирт) | Wako | 161-09163 | |
| Метанол | Wako | 134-14523 | |
| Муравьиная кислота | Wako | 066-00466 | |
| 28% Аммиак вода | Wako | 016-03146 | |
| Ультразвуковая аппаратура (ванного типа) | SHARP | UT-206H | |
| Вихревой миксер для стеклянной пробирки | TAITEC | Mix-EVR | |
| 1,4 мл стеклянный флакон | Tomsic | 500-1982 | Образцы хранятся в стеклянном флаконе объемом 1,4 мл, запаянном завинчивающейся крышкой и перегородкой 8 мм при температуре -20°С; C |
| 8 мм перегородка | Tomsic | 200-3322 | При анализе образцов винтовые крышки заменяются на винтовые крышки с прорезью перегородки |
| Винтовая крышка для стеклянного флакона 1,4 мм | Tomsic | 500-2762 | |
| Винтовая крышка с прорезью перегородки | Shimadzu GLC | GLCTV-803 | |
| PVDF 0.22 &; m фильтр | Millipore | SLGVR04NL | |
| Тройная квадрупольная и квадрупольная линейная ионная ловушка масс-спектрометрия | SCIEX | QTRAP4500 | |
| Программное обеспечение для сбора данных и анализа ионных спектров продукта | SCIEX | Analyst | |
| Программное обеспечение для интеграции данных в количественный анализ | SCIEX | MultiQuant | |
| ВЭЖХ система | Shimadzu | Nexera | |
| Стеклянная бутылка | Sansyo | 85-0002 | |
| d18:1/24:0 сфингомиелин | Avanti Полярные липиды | 860592P | |
| Сфингозицилфосфорилхолин | Merck | 567735 | |
| фетальная бычья сыворотка | ThermoFisher | ||
| L-глютамин | ThermoFisher | ||
| Пенициллин и стрептомицин | Sigma | P4333 | |
| Eagle' s минимальная необходимая среда | Sigma | M4655 |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission