Erratum: Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development

Краткое содержание

An erratum was issued for Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development.

The human RCTEC/RCTE cell stocks used here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 were originally provided by Dr. Loghman-Adham (then at St. Louis University) to co-author Dr. Wandinger-Ness (University of New Mexico) through an MTA in 2001. The SV40 immortalized human RCTEC/RCTE cells were characterized as being of distal tubule cell line as detailed in Loghman-Adham et al., 2003. On the basis of recent short tandem repeat (STR) DNA sequencing (Performed by IDEXX BioResearch) of the earliest passages of the RCTEC/RCTE cell stocks it became evident the cells were of mixed lineage. Further analyses of PCR products using QIAxcel capillary electrophoresis demonstrated the presence of a canine product. The product was sequenced and established to be of canine origin. A set of canine specific STR markers were compared to the sample and showed that the sample had a genetic profile with 92% identity to the MDCK cell line.  Later cell stocks that were used in the present publication were STR profiled and showed drift to 100% MDCK lineage. Despite being of canine origin, rather than human as was previously thought, MDCK is similarly a distal tubule epithelial cell line. For this reason, previous interpretation and conclusions drawn using these cells here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 remain sound, but for purposes of rigor, reproducibility and experimental validation by others we report on this misidentification. This information will also be reported for listing on the International Cell Line Authentication Committee (ICLAC) database (http://iclac.org).

Аннотация

An erratum was issued for Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development.

The human RCTEC/RCTE cell stocks used here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 were originally provided by Dr. Loghman-Adham (then at St. Louis University) to co-author Dr. Wandinger-Ness (University of New Mexico) through an MTA in 2001. The SV40 immortalized human RCTEC/RCTE cells were characterized as being of distal tubule cell line as detailed in Loghman-Adham et al., 2003. On the basis of recent short tandem repeat (STR) DNA sequencing (Performed by IDEXX BioResearch) of the earliest passages of the RCTEC/RCTE cell stocks it became evident the cells were of mixed lineage. Further analyses of PCR products using QIAxcel capillary electrophoresis demonstrated the presence of a canine product. The product was sequenced and established to be of canine origin. A set of canine specific STR markers were compared to the sample and showed that the sample had a genetic profile with 92% identity to the MDCK cell line.  Later cell stocks that were used in the present publication were STR profiled and showed drift to 100% MDCK lineage. Despite being of canine origin, rather than human as was previously thought, MDCK is similarly a distal tubule epithelial cell line. For this reason, previous interpretation and conclusions drawn using these cells here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 remain sound, but for purposes of rigor, reproducibility and experimental validation by others we report on this misidentification. This information will also be reported for listing on the International Cell Line Authentication Committee (ICLAC) database (http://iclac.org).

Протокол

Было выпущено исправление (erratum) к статье Репопуляция эпителиальных клеток и приготовление каркасов из внеклеточного матрикса грызунов для развития почечной ткани.

Стоки клеток RCTEC/RCTE человека, использованные здесь, а также в работах Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015, были первоначально предоставлены доктором Loghman-Adham (тогда в Университете Сент-Луиса) соавтору доктору Wandinger-Ness (Университет Нью-Мексико) на основании MTA в 2001 году. Иммортализованные SV40 клетки RCTEC/RCTE человека были охарактеризованы как клеточная линия клеток дистальных канальцев, как подробно описано в Loghman-Adham et al., 2003. На основании недавнего секвенирования ДНК по коротким тандемным повторам (STR) (выполненного IDEXX BioResearch) ранних пассажей стоков клеток RCTEC/RCTE стало очевидно, что клетки имеют смешанную родословную. Дальнейший анализ продуктов ПЦР с использованием капиллярного электрофореза QIAxcel продемонстрировал наличие продукта собачьего происхождения. Продукт был секвенирован, и было установлено, что он имеет собачье происхождение. Набор специфических для собак STR-маркеров был сопоставлен с образцом, и было показано, что образец имеет генетический профиль с 92% идентичностью клеточной линии MDCK.  Более поздние стоки клеток, использованные в данной публикации, прошли STR-профилирование, которое выявило дрейф до 100% родословной MDCK. Несмотря на собачье, а не человеческое происхождение, как считалось ранее, MDCK также является эпителиальной клеточной линией дистальных канальцев. По этой причине предыдущие интерпретации и выводы, сделанные с использованием этих клеток здесь, а также в Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015, остаются обоснованными, однако в целях строгости, воспроизводимости и экспериментальной проверки другими исследователями мы сообщаем об этой ошибочной идентификации. Эта информация также будет передана для внесения в базу данных Международного комитета по аутентификации клеточных линий (ICLAC) (http://iclac.org).