В этом протоколе мы описываем, рост и создание стабильных трансгенных линий для модели extremophyte Schrenkiella parvula. Отличительной чертой любой универсальный генетический модели является наличие эффективной трансформации системы. Растения, которые процветают в экстремальных условиях, упоминаемый как extremophytes, обеспечивают жизненно важным ресурсом для понимания адаптации растений к экологическим стрессам. Schrenkiella parvula (ранее Thellungiella parvula и Eutrema parvulum) является одной из таких моделей extremophyte, с расширением геномных ресурсов1,2,3,4,5. Однако протоколы преобразования не пока не поступало для S. parvula в опубликованных исследованиях.
Геном S. parvula Геном первой опубликованной extremophyte в капустные (горчица капуста семьи) и показывает обширную общую генома synteny с не extremophyte модель, Arabidopsis thaliana1. Таким образом сравнительные исследования между A. thaliana и S. parvula выиграют от богатства генетических исследований, выполненных на A. thaliana сделать информативный гипотез о как развивалась и регулируется геном S. parvula по-разному справиться с экстремальных экологических подчеркивает5,6,7. S. parvula является одним из наиболее солевыносливых видов (основанный на почве NaCl LD50) среди известных диких сородичей A. thaliana8. В дополнение к терпимости NaCl S. parvula выживает и завершает свой жизненный цикл в присутствии нескольких соли ионов при высоких концентрациях токсичен для большинства растений7. В ответ к абиотическим стрессам, распространенных в своей естественной среде обитания она развивалась различные черты, среди которых несколько учился в биохимических и физиологических уровня 8,9,10, 11.
С 2010 года были более 400 публикаций сверстников reveiwed, которые использованы S. parvula как вид целевого или использовать его в сравнении с другими геномов растений. Однако ясно узким местом может быть отождествлен с пристальный взгляд какой тип исследований были проведены. Большинство этих сообщений обсуждают потенциальное использование S. parvula в будущих исследованиях или использовать его в сравнительной геномной или phylogenomic исследований. Из-за отсутствия доказательства в концепция преобразования протокола создана для S. parvula, он не был использован в функциональных геномных исследований, несмотря на то, что один из высокого качества завода геномов имеющейся на сегодняшний день (> 5 МБ contig N50) собрал и заметки в pseudomolecules хромосомы уровня1.
Agrobacterium опосредованной цветочные цинкования преобразования метод стал наиболее широко используемым методом для создания trasngenic линий в A. thalianaи развитие воспроизводимые системы трансформации было решающим фактором ее успеха как генетическая модель12,13. Однако не все виды капустные было показано, быть успешно преобразованы с помощью метода цветочные цинкования, разработанные для A. thaliana. Специально капустные Lineage II виды, которые включают S. parvula был непокорным цветочные цинкования на основе преобразования методов14,15.
Привычка роста неопределенного цветения S. parvula, в сочетании с его узкие листья морфология сделала сложно принять стандартный Agrobacterium опосредованной цветочные цинкования трансформации метода. В этом исследовании мы приводим измененный Протокол, который мы разработали для воспроизводимых трансформации S. parvula.