Здесь мы представляем методы для изучения высок объём серии мексиканской cavefish поведения и жизненно важных окрашивание mechanosensory системы. Эти методы используют сценарии свободного программного обеспечения и по индивидуальному заказу, обеспечивая практическим и экономически эффективным методом для исследования поведения.
Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.
Методическая статья
Поведенческие отслеживания и Neuromast томографии мексиканской Cavefish
В этой статье
Краткое содержание
Аннотация
Местонахождения троглофильных животные эволюционировали ряд морфологических и поведенческих признаков адаптироваться к их вечно темных и продовольствия разреженные средах. Среди этих черт пищевое поведение является одним из полезных windows в функциональные преимущества поведенческих черта эволюции. Здесь представлены обновленные методы для анализа поведения притяжения вибрации (VAB: нагула адаптивной) и изображений из связанного mechanosensors пещера адаптированных тетра, Астианакт гракл. Кроме того методы представляются для отслеживания высок объём целого ряда дополнительных cavefish поведения, включая гиперактивности и потеря сна. Cavefish также показывают асоциальность, повторяющимся поведением и выше тревога. Таким образом cavefish служить животной модели для эволюционировали поведения. Эти методы используют свободного программного обеспечения и заказные сценарии, которые могут быть применены к другим видам поведения. Эти методы предоставляют практических и рентабельных альтернатив для коммерчески доступных отслеживания программного обеспечения.
Введение
Мексиканский tetra, Астианакт гракл (Костистые рыбы: Харациновые), является уникальной среди рыб за два радикально различных альтернативных морф - зрячим, поверхность жилище морфинг и слепой, местонахождения троглофильных морфинг, состоит из нескольких отдельных население1. Хотя разные по морфологии и физиологии, они по-прежнему interfertile2,3. Эти interfertile морф, как представляется, быстро развивались (~ 20000 лет)4, что делает их идеальной модели системы для изучения быстрой адаптации. Cavefish, как известно, имеют набор различных морфологических и....
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Протокол
Все процедуры выполняются следующие руководящие принципы, описанные в «Принципы лабораторных животных ухода» (Национальный институт здравоохранения публикация № 85-23, пересмотренный 1985 года) и утверждены Гавайев в Маноа институциональный уход животных и использования Комитет животных протокол 17-2560-3.
1. вибрации притяжения поведение (VAB) пробирного (≤ 10 мин для всей записи процедуры)
Примечание: Используйте чувствительной инфракрасной или построить инфракрасной камеры, изменяя USB веб-камера. Чтобы изменить веб-камера USB, увидеть подробное описание представлено в Keene лаборатории в этом выпуске cavefish в....
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Результаты
Представитель примерами чего могут быть приобретены с представленных методов являются результаты, представленные в настоящем документе. Таким образом результаты могут отличаться немного от тех, которые представлены здесь для cavefish и поверхности рыбы в зависимости от экспериментальных условий.
Вибрации притяжения поведение
Представитель результаты VA.......
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Обсуждение
Эти представленные методы легк к доступа, но может быть сложным для выполнения из-за характера его происхождение freeware. Поэтому настоятельно рекомендуется выполнить пробную анализов и анализов до любого фактического экспериментов.
Скорость генерации данных может быть быстрым, как только будут созданы экспериментальные и аналитических рамок. После того, как установлено, возможна запись две рыбы в 7 мин для VAB assay, 30 рыб в течение 24 часов для анализа активности/сна и одной рыбы в 2,5 – 3.......
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Раскрытие информации
Авторы не имеют ничего сообщать.
Благодарности
Мы благодарим всех членов Йошизава лаборатории, включая N. Cetraro, N. Simon, C. Valdez, C. Macapac, J. Чой, L. Lu, J. Нгуен, S. Подхорзера, H. Эрнандес, J. Фонг, J. Като и I. Лорд для рыб уход на экспериментальной рыб, используемых в этой рукописи. Мы также благодарим членов A. Keene лаборатории, включая P. Масек обучить мой собрать ИК CCD камеры. И наконец мы хотели бы поблагодарить Media Lab - факультет социальных наук - школа коммуникаций в Маноа Гавайев за их неоценимую помощь с созданием видео, особенно б. Смит, J. Lam и S. белый. Эта работа была поддержана Гавайский Фонд местного сообщества (16CON-78919 и 18CON-90818) и национального института здравоохранения N....
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Материалы
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| 4-Di-1-ASP (4-(4-(диметиламиностирил)-1-метилпиридиния йодид) | MilliporeSigma | D3418 | |
| 880 нм длина волны черный свет | Advanced Illumination | BL41192-880 | |
| avfs | бесплатное программное обеспечение | Версия 1.0.0.6 | http://turtlewar.org/avfs/ |
| Avisynth | бесплатное программное обеспечение | Версия 2.6.0 | http://avisynth.nl/index.php/Main_Page |
| Cygwin | freeware | Version 2.11.0 | https://www.cygwin.com/ |
| Цилиндрическая пробирная камера (стеклянная чашка Pyrex 325 мл) | Corning | 3140-100 | 10 см диаметр 5 см высота |
| Ethovision XT | Noldus Информация Технология, Вагенинген, Нидерланды | Версия 14 | https://www.noldus.com/animal-behavior-research/products/ethovision-xt |
| Аквариум для рыб Цилиндр Мягкая губка Каменный фильтр для воды, Черный | жардин (через Amazon.com) | NA | Губчатый фильтр для системы регистрации сна/гиперактивности |
| Класс А А, А, Абортика, Абортика | Креветки, прямая | BSEA16Z | |
| ImageJ | бесплатное программное обеспечение | Версия 1.52e | https://imagej.nih.gov/ij/ |
| macro 1.8/12.5-75mm C-mount зум-объектив | Toyo | NA | Прикрепите к USB веб-камере с помощью c-mount, который напечатан на 3-D принтере |
| Нейтральный регулятор | Seachem | NA | |
| Оптический литой пластик ИК длинночастотный фильтр | Edmund optics | 43-948 | Разрезан на небольшой кусочек для установки в ПЗС-маленькую камеру USB веб-камеры |
| pfmap | freeware | Сборка 178 | http://pismotec.com/download/ (на " Скачать архив" ссылка внизу) |
| Reef Crystals Reef Salt | Instant Ocean | RC15-10 | |
| SwisTrack | freeware | Version 4 | https://en.wikibooks.org/wiki/SwisTrack |
| USB веб-камера (LifeCam Studio 1080p HD Webcam) | Microsoft | Q2F-00013 | Вырез 2-2,5 см спереди |
| WinAutomation | freeware | Version 8 | https://www.winautomation.com/ (бесплатно автономно приложение для этой процедуры) |
| операционная система Windows | Microsoft | 7, 8 или 10 | https://www.microsoft.com/en-us/windows |
| x264vfw | freeware | NA | https://sourceforge.net/projects/x264vfw/ |
Ссылки
- Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. , Elsevier Inc. Amsterdam. (2015).
- Mitchell, R. W., Russell, W. H., Elliott, W. R.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Перепечатки и разрешения
