Этот документ представляет хирургический метод для рассечения дрозофилы куколки сетчатки наряду с протоколами для обработки ткани для иммуногистохимии, Западный анализ и извлечение RNA.
Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.
Методическая статья
Этот документ представляет хирургический метод для рассечения дрозофилы куколки сетчатки наряду с протоколами для обработки ткани для иммуногистохимии, Западный анализ и извлечение RNA.
Куколки сетчатки дрозофилы обеспечивает отличную модель системы для изучения морфогенетических процессов во время разработки. В этой статье мы представляем надежный протокол для диссекции деликатный дрозофилы куколки сетчатки. Хирургический подход использует инструменты легко доступные microdissection для открытия куколок и точно извлекать глаз мозг комплексов. Эти можно фиксированной, подвергается иммуногистохимии и сетчатки затем монтируется на скольжениях микроскопа и образы, если цель заключается в том, чтобы обнаружить сотовой или внутриклеточных структур. В качестве альтернативы нефиксированных сетчатки может изолированы от мозговой ткани, лизированы в соответствующие буферы и используются для извлечения электрофореза или мРНК белка гель (оценить выражение протеина или гена, соответственно). Значительные практика и терпение может потребоваться освоить microdissection протокол описал, но как только освоил, протокол позволяет относительно быстро изоляции главным образом неповрежденных сетчатки.
Дрозофилы Сетчатка состоит из примерно 750 фасеточном окружении пигментных клеток, расположенных в3,2,1,решетка соты4. Каждый Омматидий содержит восемь фоторецепторных нейронов, четыре линзы секретирующих колбочек и два первичных клеток пигмента. Каждый Омматидий окружают пигментных клеток решетки и сенсорные щетиной групп. Благодаря своей пост митотическая природы и стереотипных гексагональной куколки сетчатки дрозофилы обеспечивает отличную модель системы для изучения морфогенетических процессов, включая клетки адгезии5,6, 7,8,9,10 апоптоз11,12,13,,14и15.
Несколько опубликованных протоколов используют давление воздуха для извлечения глаз мозг комплексы из дрозофилы куколок16,17,18. Протокол, в описанный здесь вместо этого использует инструменты microdissection для тщательно и точно изолировать глаз мозг комплексы с целью получения неповрежденной ткани сетчатки. Это важно, если сетчатки должны быть использованы для морфологических, белка или экспрессии генов анализирует, так как повреждение сетчатки может привести к клеточного стресса или смерть, которые могут изменить клеточных фенотип или ген выражение. Кроме того после практики, 6-10 глаз мозг комплексы могут быть изолированы в 10-15 мин, содействие цели минимизации изменчивости в возраста и стадии развития расчлененных глаз ткани.
Фиксации, иммуноокрашивания и целом гора протокол описанные ниже подходит для подготовки дрозофилы глаза для флуоресцентной микроскопии. Сетчатки могут быть инкубирован с антителами против протеинов интереса. Например антитела к adherens соединения компонентов могут быть использованы для визуализации апикальной окружностей клеток, так что характеристики, включая тип клеток, форму и расположение может быть начисленных19. До фиксации глаза можно вместо расщепляется от головного мозга с целью извлечения белков для западного анализа, или РНК для использования в qRT ПЦР или РНК последовательности.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
1. Подготовка тканей
2. рассечение глаз мозг комплексов
3. обработка ткани для иммунофлуоресценции
4. подготовка ткани глаза для западный Blotting:
5. подготовка ткани глаза РНК добыча:
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Куколки глаз является легко доступной ткани, которая служит прекрасной моделью для изучения процессов развития, диск морфогенеза. Здесь, мы расчленены сетчатки и используются иммунофлюоресценции для обнаружения апикальной adherens соединения (рис. 3A, C) или caspase Dcp-1 (рис. 3D), который активируется во время апоптоз (рис. 3)25. Эти подходы позволяют четко соблюдать клетки во время ключевы...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Метод дрозофилы куколки глаз рассечение описанных здесь позволяет для изоляции 6-10 глаз мозг комплексов в течение 10-15 мин. Однако терпение и практика имеют важное значение для того, чтобы освоить технику рассечения и улучшить качество и скорость вскрытия. Этот короткий рассечение время гарантирует, что каждый глаз примерно же стадии развития, снижение изменчивости в выражении фенотип или гена сетчатки в наборе данных. Хотя альтернативные протоколы могут требовать менее практике освоить, наш протокол предназна...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Авторы не имеют ничего сообщать.
Мы благодарим Zack барабан и наши рецензенты за полезные замечания по рукописи. Эта работа была поддержана R15GM114729.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| Adobe Photoshop | Программное обеспечение для обработки изображений | Adobe | |
| Бамбуковые шины, 6" | Ted Pella Inc | 116 | |
| Бета меркаптоэтанол | Sigma-Aldrich | M3148 | |
| Бета-глицеринфосфат | Sigma-Aldrich | 50020 | |
| Черная препарирующая тарелка | Стеклянная чашка Петри, наполненная до краев SYLG170 или SYLG184 (окрашена в черный цвет с мелко измельченным порошком древесного угля). Оставьте при комнатной температуре на 24-48 ч для полимеризации. | ||
| Держатель лезвия | Fine Science Tools | 10053 | |
| Бычий сывороточный альбумин | Sigma-Aldrich | A7906 | |
| cOmplete, коктейльные таблетки ингибитора протеазы без ЭДТА | Roche | 4693132001 | |
| Конфокальный микроскоп (Zeiss LSM 501) | Carl Zeiss | или аналогичный микроскоп | |
| Диэтилпирокарбонат (DEPC) | Sigma-Aldrich | 40718 | |
| Двухсторонний скотч | 3M | 665 | |
| Drosophila пищевые среды, богатые питательными веществами | 7,5% сахароза, 15% глюкоза, 2,5% агар, 20% пивные дрожжи, 5% пептон, 0,125% MgSO4.7H2O, 0,125% CaCl2.2H20 | ||
| Drosophila пищевые среды, стандартный | рецепт кукурузной муки Bloomington Drosophila Stock center. (https://bdsc.indiana.edu/information/recipes/bloomfood.html) | ||
| Этилендиаминтетрауксусная кислота | Sigma-Aldrich | E6758 | |
| Фиксирующий раствор | 4% формадихида в PBS, pH 7,4. | ||
| Флуоресцентный микроскоп (микроскоп TCS SP5 DM) | Leica Microsystems | или аналогичный микроскоп | |
| Щипцы | Щипцы Fine Science Tools | 91150-20 | следует часто затачивать. |
| Формальдегид | Thermo Scientific | 28908 | |
| Стеклянная 9-луночная посуда | Corning | 7220-85 | Также известен как 9-луночные посуды |
| Стеклянные покровные стекла (22 x 22 мм) | Fisher Scientific | 12-542-B | |
| Стеклянные предметные стекла для микроскопа (25 x 75 x 1 мм) | Fisher Scientific | 12-550-413 | |
| Стеклянная чашка Петри | Corning | 3160-100BO | |
| Глицерин | Sigma-Aldrich | G5516 | |
| Версия программного обеспечения Image Studio 5.2.5 | LI-COR Biosciences | Программное обеспечение для обработки изображений для количественного определения вестерн-блотов. | |
| Образец буфера Laemmli | Bio-Rad | 161-0737 | 2X концентрированный белковый буфер для образцов, добавка с бета-меркаптоэтанолом в соответствии с инструкциями производителя. |
| Уменьшение буфера для выборки маркера полосы | ThermoFisher Scientific | 39000 | 5X буфер для образцов концентрированного белка. |
| Микроцентрирные трубки | Axygen | MCT-175-C | |
| Ножницы для микродиссекции | Fine Science Tools | 15000-03 | |
| Лотки для микролунок (72 x 10 &; L лунок) | Nunc | 438733 | |
| Монтажная среда | 0,5% N-пропилгаллата и 80% глицерина в PBS | ||
| N-пропилгаллат | Sigma-Aldrich | P3130 | |
| Нуклеаза PBS (PBS в 0,1% DEPC, pH 7,4) | Добавьте соответствующий объем DEPC в PBS, хорошо перемешайте и инкубируйте в течение ночи при комнатной температуре при постоянном перемешивании. Автоклав не менее 20 минут. Хранить по адресу 4° C | ||
| PBS (фосфатно-солевой буфер pH 7,4) | Sigma-Aldrich | P5368 | Приготовьте в соответствии с инструкциями производителя |
| PBS+pi (PBS плюс ингибиторы протеазы и фошатазы) | 10mM NaF, 1mM бета-глицеринфосфат и 1mM Na<суб>3VO<суб>4 в PBS, pH 7,4. | ||
| PBT | 0,15% TritonX и 0,5% бычьего сывороточного альбумина в PBS, pH 7,4 | ||
| Держатель булавок | Fine Science Tools | 26016-12 | |
| Первичное антитело: козий анти-GAPDH | Imgenex | IMG-3073 | Для вестерн-блоттинга. Используется в 1:3000 |
| Первичное антитело: кролик против расщепления Dcp-1 | Клеточная сигнализация | 9578S | Для иммунофлуоресценции. Используется в 1:100 |
| Первичное антитело: крысы анти-DEcad | Developmental Studies Hybridoma Bank | DCAD2 | Для иммунофлюоресценции. Использовано в 1:20 |
| Первичное антитело: крыса анти-DEcad | DOI: 10.1006/dbio.1994.1287 | DCAD1 | Подарок от Тадаси Уэмуры. Использовано в масштабе 1:100. |
| Набор для экстракции РНК: Набор для экстракции РНК Relia Prep Miniprep kit | Promega | Z6110 | |
| Реагент для обеззараживания рназы (РНКаза Away) | Molecular BioProducts | 7002 | |
| Лезвия скальпеля | Fine Science Tools | 10050 | Отломите небольшой кусочек лезвия и закрепите в держателе лезвия. |
| Вторичное антитело: 488-конъюгированный ослиный антикрысиный IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 712-545-153 | Для иммунофлуоресценции. Использовано в 1:200 |
| Вторичное антитело: cy3-конъюгированный козий анти-кроличий IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-165-144 | Для иммунофлуоресценции. Используется в соотношении 1:100 |
| Вторичное антитело: HRP-конъюгированная козья антикрысиная IgG (H+L) | Технология передачи сигналов | 7077 | Для вестерн-блоттинга. Используется в 1:3000 |
| Вторичное антитело: HRP-конъюгированный кролик против козьего IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 305-035-003 | Для вестерн-блоттинга. Используется в 1:3000 |
| Хлорид натрия | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| Фторид натрия | Sigma-Aldrich | 215309 | |
| ванадат натрия | Спектрофотометр Sigma-Aldrich | 50860 | |
| (NanoDrop) | ThermoFisher Scientific | 2000c | |
| Стерео препарирующий микроскоп (M60 или M80) | Leica Microsystems | или аналогичный микроскоп | |
| Sylgard (черный) | Dow Corning | SYLG170 | |
| Sylgard (прозрачный) | Dow Corning | SYLG184 | Цвет черный с мелко измельченным порошком шарколя |
| Ткань: Kimwipes | KIMTECH | 34120 | |
| TritonX | Sigma-Aldrich | T8787 | |
| Trizma hydrochloride pH7.5 | Sigma-Aldrich | T5941 | |
| Вольфрамовая игла, тонкая | Fine Science Tools | 10130-10 | Вставка в держатель штифта |
| Вольфрамовая игла, прочная | Fine Science Tools | 10130-20 | Вставка в держатель штифтов |
| WTLB (буфер для лизиса западных тканей) | 150 мМ NaCl, 1,5% Triton X-100, 1 мМ ЭДТА, 20% глицерин, 10 мМ NaF, 1 мМ бета-глицеринфосфата и 1 мМ Na<суб>3VO<суб>4 в 50 мМ Tris-HCl (pH 7,5). Дополните одним коктейльным столиком cOmplete protease на 10 мл раствора. | ||
| Дрожжевая | паста (местный супермаркет) | Примерно 2 столовые ложки дрожжей Fleischmann's ActiveDry (или аналогичные), растворенные в ~20 мл дистиллированной H2O |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.