RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Этот протокол демонстрирует последовательную иммунофлуоресценцию и иммуногистохимию на криосекциях эмбрионов зебры на ранних стадиях, что позволяет проводить точные анализы колокализации в конкретных популяциях клеток.
Исследование межклеточных взаимодействий часто требует дискретной маркировки конкретных популяций клеток и точной локализации белка. Эмбрион зебры является отличным инструментом для изучения таких взаимодействий с моделью in vivo. Цельно-монтажные иммуногистохимические и иммунофлуоресцентные анализы часто применяются в эмбрионах зебры для оценки экспрессии белка. Однако в трехмерном пространстве может быть трудно получить точное отображение колокализованных белков. Кроме того, некоторые исследования могут потребовать использования двух антител, которые не совместимы с той же техникой (например, антитела 1 подходит только для иммуногистохимии и антитела 2 подходит только для иммунофлюоресценции). Целью описанного в настоящем году метода является проведение последовательной иммунофлуоресценции и/или иммуногистохимии на отдельных криосекциях, полученных из эмбрионов зебры на ранних стадиях. Здесь мы описываем использование последовательных раундов иммунофлуоресценции, визуализации, иммуногистохимии, визуализации для одного криосекции для достижения точной идентификации экспрессии белка на одноклеточном уровне. Эта методология подходит для любого исследования эмбрионов зебры на ранних стадиях, что требует точного определения нескольких белковых целей в отдельных клетках.
Зебрафиш является чрезвычайно надежной моделью организма, которая в настоящее время используется в самых различных дисциплинах в биомедицинских исследованиях. В частности, быстрое внешнее развитие и прозрачность эмбрионов зебры являются отличным инструментом для исследований in vivo. Здесь мы описываем метод последовательного иммунофлуоресценции (ИФ) и иммуногистохимический (IHC) анализ криосекционных эмбрионов зебры. Эта новая процедура использует последовательное применение двух антител на одном слайде, что позволяет точно идентифицировать colocalized белки на клеточном уровне при сохранении секций тканей. Этот протокол особенно полезен для исследований с моделью зебры, так как относительно небольшое количество антител было проверено для использования в приложениях IF and/or IHC в зебрафишах по сравнению с моделями мыши.
Наблюдение межклеточных взаимодействий является важным элементом во многих исследованиях, и может обеспечить ключевое понимание молекулярных механизмов, функционирующих на клеточном уровне, которые лежат в основе фенотипов на уровне организма. Кроме того, экспрессия белка может дать информацию о клеточной функции, особенно при изучении экспрессии нескольких белков одновременно внутри клетки (колокализация). Хотя цельномонтаж IHC и ЕСЛИ являются широко используемыми методамидля анализа экспрессии белка в эмбрионах зебры 1,2,3,5,целые процедуры крепления могут быть проблематичным для получения точных данных о колокализации. По нашему опыту, может быть трудно различать слои ткани и визуализировать экспрессию белка на одноклеточном уровне в цельномонтажных образцах. Воображение программ ных программ, как правило, не в состоянии различать поверхности окрашивания по сравнению с глубоким окрашивание. Неповерхностные протеиновые выражения могут быть скрыты более ярко выраженным выражением уровня поверхности, что приводит к неточностям в количественной оценке. Кроме того, большинство традиционных методов очистки зебры являются довольно токсичными6 и, таким образом, менее желательныдля для использования.
Методы на основе антител, такие как IF и IHC, часто используются для обнаружения экспрессии белка в секционированном материале, упрощая идентификацию популяций дискретных клеток, которые выражают определенный белок в сложных тканях. IHC обычно используется для колокализации, чаще всего с помощью двух различных антител, спряженныху разных видов хозяев и визуализированных с различными цветными хромогенами 4,7,8,9 , 10. Однако, использование нескольких хромогенов может привести к неспецифическим фоновым окрашиванием или несовместимости цветов11,12.
Мы разработали новый протокол для обнаружения нескольких белков последовательными IF и IHC на криосекционных эмбрионах зебры на ранней стадии. Криосекция особенно хорошо подходит для деликатных тканей, таких как эмбрионы зебры, и криосекции превосходят парафин встроенных разделов для флуоресценции на основе анализов13,14. Мы решили оптимизировать комбинированные IF и IHC, а не двухцветный IF или IHC, чтобы обойти проблему несовместимости антител для одного типа асссе. Эти проблемы особенно актуальны для исследований с участием зебры из-за ограниченного количества коммерчески доступных антител, которые проверяются для использования в зебрафиш. В самом деле, исследование четырех крупных компаний показали, что коммерчески доступные антитела для использования в мыши было около 112000 против около 5300 для использования в зебрафиш15. Наконец, мы решили разработать протокол, который может быть выполнен на одном криосекции, что имеет важное значение при работе с небольшими или ограниченными образцами тканей, такими как полученные из эмбрионов зебры.
Этот протокол был разработан для оценки пролиферативного поведения донорских клеток в 48 ч после оплодотворения эмбрионов химерных зебры, которые были созданы путем пересадки бластулы до бластулы, как описано Кармани-Рампе и Moens16. Эмбрионы доноров вводились на одноклеточной стадии с флуоресцентно помечены dextran конъюгировать до трансплантации донорских клеток в эмбрионы реципиента. Мы использовали иммунофлуоресценцию для S 10 фосфорилированных Histone H3 (pH3) для обнаружения размножающихся клеток, а затем иммуногистохимии для помечены dextran для обнаружения донорских клеток в химерных эмбрионов зебрафиш. Последовательное обнаружение pH3 и помеченного декеспна в пределах одной криосекции позволило нам определить и количественно определить отдельные клетки, которые выражали оба маркера.
Этот последовательный протокол IF/IHC для криосекционных зебр ыбры станет полезным инструментом для исследователей зебры, которые желают протокола колокализации для экспрессии белка. Проблемы, которые этот протокол был разработан для решения, такие как небольшие образцы тканей и ограниченной доступности антител, не являются уникальными для модели зебры. Таким образом, этот метод может быть поймем любому исследователю, желая выполнить последовательный IF/IHC.
ЗАЯВЛЕНИЕ ОБ ЭТИКЕ:
Все исследования на животных были одобрены Институциональным комитетом по уходу за животными и использованию, Университетом штата Северная Каролина, Роли, Северная Каролина, США.
1. Подготовка эмбрионов
2. Эмbedding и подготовка криосекций эмбрионов
3. Иммунофлуоресценция для pH3
4. Иммуногистохимия для маркированного Декентна
Мы разработали этот протокол для того, чтобы определить и проанализировать экспрессию белка в отдельных донорских клетках в 48 h после оплодотворения эмбрионов химерных зебры, которые были получены в результате пересадки бластулы до бластрула между эмбрионами зебры AB дикого типа. Успешный анализ экспрессии белка на одноклеточном уровне требовал подготовки криосекций с соответствующим ориентированными эмбрионами(рисунок 1 и рисунок2) и тщательного, последовательного применения методов IF и IHC к этим криосекции(рисунок 3 и рисунок4). Использование специфических антител для одновременного обнаружения размножающихся клеток (анти-pH3, Рисунок 5A, B) и донорских клеток (анти-маркированный декстран, Рисунок 5D)может быть использован для выявления и количественной оценки донорских клеток, которые активно размножаются ( Рисунок 5E). Для точной идентификации отдельных ячеек необходимо создавать высококачественные изображения как по if(рисунок 2A,B) и IHC (рисунок2D). Программа анализа изображений должна использоваться для выполнения наложения изображений(рисунок 5E). В зависимости от используемой программы анализа изображений, можно будет выполнять автоматизированные подсчеты помеченных ячеек, если будет желательна количественная оценка.

Рисунок 1: Приготовление замороженных блоков OCT. (A) 50x микроскопический вид эмбрионов в OCT в криогенной формы, подготовленной для замораживания. Красная стрелка указывает на положение эмбриона зебры на нижней поверхности плесени; черная стрелка указывает на хвост, указывающий на пользователя. (B) Пластиковые формы с эмбрионами и OCT размещены на охлажденной металлической платформе. (C) Пена льда ведро размещены над пластиковыми плесенью для создания замораживания камеры. (D) OCT становится белым от прозрачного, как только блок полностью заморожен. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 2: Криосекция замороженных блоков OCT. (A), Применение свежего OCT на криостатный диск и размещение замороженного блока на OCT, вращается на 180 градусов от замораживания ориентации блока. (B) Вид смота блока, замороженного на секционный диск. (C) Вид разделительного блока с рулонной пластиной в положении. (D) Пикап секций с помощью заряженного слайда с металлической платформы криостата. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 3: Просмотр подготовленных разделов после размещения на слайде. Стрелка указывает на гидрофобный барьер, а пунктирная линия разграничает зону, содержащую участки внутри барьерного периметра. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 4: Подготовка к применению хромогенного субстрата во время IHC. Слайд помещается на плоскую поверхность, покрытую полиэтиленовой пленкой, чтобы обеспечить равномерное применение хромогенного субстрата при одновременном содержании любого разлива опасного материала. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 5: Представитель IF и IHC маркировки криосекционных 48 л.с. химерных эмбрионов зебры, порожденных бластулой-к-бластулальной трансплантации между AB дикого типа эмбрионов зебры. (A) ЕСЛИ для обнаружения Ser 10 фосфорилированных Histone H3 (анти-pH3, 1:200) выражение в 48 л.с. химерных эмбрионов зебры. Красные и рН3-положительные клетки; синие и ядра. Желтые стрелки указывают на примеры положительных клеток. (B) Вычитание синего ядерного пятна в цифровом изображении (программное обеспечение ImageJ) повышает визуализацию pH3-положительных ячеек для количественной оценки и наложения изображения. (C) Отрицательный контроль (только вторичные антитела) для IF-исследования в криосекционном 48 л.с. химерного эмбриона зебры. Шкала бар представляет 50 мкм (применяется ко всем панелям). (D) IHC обнаружить помечены dextran (анти-маркированные dextran, 1:7,500) в химерных 48 л.с. зебрафиш эмбриона, порожденных бластулой-к-бластула трансплантации между AB дикого типа эмбрионов зебры. Эмбрионы доноров были введены с флуоресцентно помечены dextran конъюгировать на одноклеточной стадии до использования для blastula-к-blastula трансплантации. Красный цвет указывает на клетки, помеченные dextran conjugate; синий указывает на ядра. Желтые стрелки указывают на примеры положительных клеток. (E) Наложение панели B (IF для pH3) и панели C (IHC для помеченных dextran) показаны colocalization выражения pH3 и dextran маркировки в отдельных клетках. Желтые стрелки указывают на примеры двойных положительных клеток. (F) Отрицательный контроль (только вторичные антитела) для IHC асссев в криосекционном 48 л.с. химерного эмбриона зебры. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Авторам нечего раскрывать.
Этот протокол демонстрирует последовательную иммунофлуоресценцию и иммуногистохимию на криосекциях эмбрионов зебры на ранних стадиях, что позволяет проводить точные анализы колокализации в конкретных популяциях клеток.
Эта работа была поддержана грантом NIH 5K01OD021419-02 и Колледжем ветеринарной медицины Государственного университета ШТАТА Северная Каролина.
| 15/25 | Н/Д | Н/Д | 15% рыбий желатин/25% сахароза в/об., изготовлено в дН<суб>2суб>О |
| вторичное антитело Alexa 555 | Invitrogen | A21429 | используется в разведении 1:2,000 в блочном буфере для |
| разбавителя антител | ПЧ Dako | S3022 | |
| Background Buster | Innovex | NB306 | |
| блок-буфер (ЕСЛИ) | Н/Д | Н/Д Н/Д | 5% нормальной козьей сыворотки, 0,1% Triton X-100 в 1x PBS |
| программное обеспечение для визуализации cellSens | Программное обеспечение для визуализацииOlympus | cellSens | используется с составным световым микроскопом |
| химерные эмбрионы данио-рерио | Н/Д | Н/Д | AB химерные эмбрионы данио-рерио дикого типа проанализированы при 48 hpf |
| Составной световой микроскоп | Olympus | BX51 | используется с цифровой камерой и программным обеспечением для визуализации cellSens для захвата изображений после IHC |
| Конфокальный флуоресцентный микроскоп | Leica | DM 2500 | используется с цифровой камерой и программным обеспечением Leica Application Suite Advanced Fluorescence imaging для захвата изображений после ПЧ |
| Одноразовые пластиковые формы, 15 мм x 15 мм x 5 мм | Ted Pella | 27147-2 | |
| Цифровая камера, световой микроскоп | Olympus | DP27 | |
| Цифровая камера, флуоресцентный микроскоп | Leica | TCS SPE | |
| Этанол | Koptec | V1001 | |
| Рыбий желатин | Sigma | G7041 | |
| Предметные стекла | Fisher | 12-550-15 | |
| Перекись водорода, 30% | Fisher | H325-100 | |
| ImmPRESS HRP Набор для детектирования полимеров | Vector | MP-7401 | вторичное антитело против кролика, полимер |
| HRP Leica Application Suite Усовершенствованное программное обеспечение для флуоресцентной визуализации | Leica | LAS AF 2.3.6 | программное обеспечение для визуализации, используемое с конфокальным флуоресцентным микроскопом |
| Метанол | Fisher | A452-4 | |
| Модифицированный гематоксилин Мейера | Thermo | 72804 | |
| Нормальная козья сыворотка | MP Biomedical | 191356 | |
| среда ОКТ | Ткань-Tek/Fisher | 4583/4585 | |
| анти-Oregon Green | антитела Molecular Probes/Life Technologies | A889 | используется в разведении 1:7500 для IHC |
| Oregon Green Dextran | Invitrogen | P7171 | используется в концентрации 2,5% в 0,2 M KCl |
| параформальдегида, 4% | Acros Organics | 416780030 | изготовлен в лаборатории в 1x PBS |
| Permount | Fisher | SP15 | |
| 1x фосфатно-солевой буфер | произведен в лаборатории | N/A | 50 мл 10x PBS, объем до 500 мл с dH2O |
| 10x фоспат-буферизованный физиологический раствор | произведен в лаборатории | N/A | используется протокол Cold Spring Harbor |
| 1x PBSt | произведен в лаборатории | N/A | 50 мл 10x PBS, 1 мл 10% Tween 20, объем до 500 мл с dH2O |
| анти-Ser10 фосфорилированное антитело к гистону H3 | Santa Cruz | sc-8656-R | использовано в разведении 1:500 для IF |
| Scott's Tap Water | Electron Microscopy | Sciences 26070-06 | успешно использовали другие бренды в дополнение к EMS |
| Sucrose | Amresco | 335 | |
| Tween-20 | Fisher | BP337 | |
| TO-PRO3 | Invitrogen | T3605 | используется в соотношении 1:1,000 в 1x PBS для IF |
| 1x Трис-буферный физиологический раствор | производства в лаборатории | N/A | 50 мл 10x TBS, до 500 мл объема с dH2O |
| 10x Трис-буферный физиологический раствор | производства в лаборатории | N/A | 85 г NaCl, 61 г трис-основания, объем до 1 л с dH2O |
| 1x TBSt | произведено в лаборатории | N/ 50 | мл 10x TBS, 1 мл 10% Tween 20, объем до 500 мл с dH2O Triton |
| X-100 | Acros Organics | 327371000 | |
| Vectashield | Vector | H-1000 | незатвердевающий монтажный материал |
| Vector NovaRed субстрат | Vector | SK-4800 | HRP субстрат |
| Xylene | Fisher | X3P-1GAL |