Несмотря на достижения в исследованиях стволовых клеток взрослых, выявление и изоляция стволовых клеток от образцов тканей остается серьезной проблемой. В то время как резидентные стволовые клетки относительно тихие с нишевыми удерживающими устройствами во взрослых тканях, они входят в клеточный цикл в трехмерной (3D) культуре и проходят как симметричное, так и асимметричное деление клеток, что приводит как к стеблю, так и к прародителю Клетки. Последние быстро размножаются и являются основной популяцией клеток на различных стадиях линии обязательств, образуя неоднородные сфероиды. С использованием первичных нормальных человеческих эпителиальных клеток простаты (HPrEC), сфероид основе, этикетки удержания асссбыл был разработан, что позволяет идентификации и функциональной изоляции сфероидов инициирующих стволовых клеток в одном разрешении клеток.
HPrEC или клеточные линии двухмерно (2D) культивируются с BrdU в течение 10 дней, чтобы позволить его включение в ДНК всех разделительных клеток, в том числе самообновляющихся стволовых клеток. Вымыть начинается после переноса в 3D-культуру на 5 дней, в течение которых стволовые клетки самообновляются через асимметричное деление и инициируют образование сфероидов. В то время как относительно тихие стволовые клетки дочери сохраняют родительскую ДНК, помеченную BrdU, потомки дочери быстро размножаются, теряя этикетку BrdU. BrdU можно заменить CFSE или Far Red pro-dyes, которые позволяют изоляцию стволовых клеток в реальном маштабе времени FACS. Характеристики стволовых клеток подтверждаются образованием сфероидов in vitro, анализами регенерации тканей in vivo и документированием их симметричных/асимметричных делений клеток. Изолированные этикетки удерживающих стволовых клеток могут быть тщательно допрошены вниз по течению молекулярных и биологических исследований, в том числе РНК-сек, ChIP-seq, одноклеточного захвата, метаболической активности, протеоме профилирования, иммуноцитохимии, органоидного образования, и in vivo ткани регенерации. Важно отметить, что этот подход, свободный от маркеров функциональной изоляции стволовых клеток, определяет стволовые клетки из свежих образцов рака и линии раковых клеток из нескольких органов, что свидетельствует о широкой применимости. Он может быть использован для выявления рака стволовых клеточных биомаркеров, экран фармацевтических препаратов ориентации рака стволовых клеток, и обнаружить новые терапевтические цели в раковых заболеваниях.