$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae, пневмококк) является одной из основных причин заболеваемости и смертности во всем мире. До недавнего времени было обнаружено около 100 серотипов S. pneumoniae 1,2,3,4,5,6,7. Ежегодно инвазивная пневмококковая инфекция (ИПД) уносит около 700 000 смертей детей в возрасте до 5 лет8. S. pneumoniae является основной причиной бактериальной пневмонии, среднего отита, менингита и сепсиса во всем мире9.
В африканском менингитном поясе серотип 1 ответственен за вспышки менингита, где доминирует тип последовательности (ST) ST217, чрезвычайно вирулентный тип последовательности 10,11,12,13,14,15. Его значение в патологии менингита было сравнимо с значением Neisseria meningitidis в африканском менингитном поясе16. Серотип 1 часто является основной причиной ИПД; Однако он очень редко встречается в карете. Фактически, в Гамбии на этот серотип приходится 20% всех инвазивных заболеваний, но он был обнаружен только у 0,5% здоровых носителей14,17,18,19. Генетический обмен и рекомбинация у компетентных пневмококков происходит, как правило, при носительстве, а не при инвазивном заболевании20. Кроме того, было показано, что серотип 1 имеет одну из самых коротких частот носительства, описанных среди пневмококков (всего 9 дней). Поэтому было высказано предположение, что этот серотип может иметь гораздо более низкую скорость рекомбинации, чем другие21.
Необходимы углубленные исследования, чтобы понять причину низкой скорости носительства штаммов серотипа 1 и ее значение для инвазивных заболеваний в странах Африки к югу от Сахары.
Здесь мы сообщаем о протоколе, который позволяет проводить полногеномный мутагенез конкретного штамма серотипа 1, 519/43. Этот штамм может легко приобретать и рекомбинировать новую ДНК в свой геном. Этот метод еще не является межштаммовым, но он очень эффективен, когда выполняется в фоновом режиме 519/43 (другие мишени были мутированы, рукописи готовятся). Просто используя штамм 519/43 и используя его естественную компетенцию, а также заменяя способ обеспечения экзогенной ДНК, мы смогли мутировать ген пневмолизина (слой) в этом штамме серотипа 1. Этот метод представляет собой усовершенствование по сравнению с методом, представленным Harvey et al.22 , поскольку он выполняется в один этап без необходимости прохождения ДНК через другой серотип. Тем не менее, из-за межштаммовой изменчивости ни один метод не был стандартизирован для всех штаммов. Способность мутировать определенные гены и наблюдать за их эффектами позволит глубже понять штаммы S. pneumoniae серотипа 1 и даст ответы на вопросы о роли этих штаммов в менингите в странах Африки к югу от Сахары.