RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Конденсатная реакция Клейзена-Шмидта является важной методологией для генерации конъюгированных велосипедных ароматических соединений, спрягаемых на метане. Благодаря использованию базового варианта реакции алдола, ряд флуоресцентных и / или биологически соответствующих молекул могут быть доступны через в целом недорогой и оперативно простой синтетический подход.
Конъюгированные конъюгированные велосипедные ароматические соединения являются общими составляющими целого ряда биологически релевантных молекул, таких как порфирины, дипыриноны и фармацевтические препараты. Кроме того, ограниченное вращение этих систем часто приводит к высокой до умеренно флуоресцентных систем, как наблюдается в 3H,5H-dipyrrolo'1,2-c:2',1'-f'pyrimidin-3-ones, xanthoglows, pyrroloindolizinedione аналоги, BODIPY аналоги, и фенольные и imidazolinone кольцевых систем Зеленого флуоресцентного белка (GFP). Эта рукопись описывает недорогой и оперативно простой метод выполнения конденсата Клейзен-Шмидт для создания серии флуоресцентных рН зависимых пиразол / имидазол / изойндолон дипиринон аналогов. Хотя методология иллюстрирует синтез дипиринона аналогов, она может быть переведена для производства широкого спектра конъюгированных велосипедистических ароматических соединений. Используемая в этом методе конденсатная реакция Клейзена-Шмидта ограничена нуклеофилами и электрофилами, которые обнуляются в основных условиях (нуклеофиловая составляющая) и неоленоизуемыми альдегидами (электрофилическим компонентом). Кроме того, нуклеофильные и электрофильные реакционы должны содержать функциональные группы, которые не будут непреднамеренно реагировать с гидроксидом. Несмотря на эти ограничения, эта методология предлагает доступ к совершенно новым системам, которые могут быть использованы в качестве биологических или молекулярных зондов.
Ряд спряженных велосипедных систем, в которых два ароматических кольца соединены монометином мостом, проходят изомеризацию через вращение связи, когда возбуждаются фотоном(рисунок 1A)1,2,3,4,5. Возбужденный изомер, как правило, расслабиться до состояния земли через нелучающих процессов распада6. Если энергетический барьер для вращения связи увеличен до достаточно большой степени, можно ограничить или предотвратить фотоизомеризацию. Вместо этого, фотонический возбуждение приводит к возбужденным синглетным состоянием, которое часто расслабляется через флуоресценцию, а не нелучающий распад(рисунок 1B). Ограничение фотоизомеризации чаще всего достигается механически ограничивающим вращением связей путем привязывания двух ароматических кольцевых систем ковалентными связями, тем самым запирая молекулу в определенном изомеристом состоянии. Этот подход был использован для создания нескольких различных флуоресцентных трициклических дипирринон и дипиролеметан аналоги, такие как: 3H,5H-dipyrrolo-1,2-c:2',1'-f'pyrimidin-3-ones (1), xanthoglows (2)6,7, пирролоиндолизиндион аналоги (3)8, и BODIPYаналоги 9 (4, Рисунок 2), в котором пирролидин и / или пиррол кольцо системы привязаны с метиленом, карбонилом, или бор дифторо связующихся. Как правило, 1-4 обладают ΦF > 0,7 предполагая, что эти системы очень эффективны, как фторфор единиц.
Также можно ограничить фотоизомеризацию с помощью других средств, помимо ковалентной связи систем кольца. Например, кольца фенольных и имидазолинонов(рисунок 2)зеленого флуоресцентного белка (GFP) ограничиваются вращением белковой среды; ограничительная настройка увеличивает квантовую доходность на три порядка величины по сравнению с той же единицей хромофора в свободном растворе10. Считается, что белок эшафот GFP обеспечивает вращательное барьер через стерические и электростатические эффекты11. Недавно наша группа в сотрудничестве с группой Odoh в Университете Невады, Рено обнаружил другую систему флюорофора, которая несет структурное сходство с дипиринон основе ксантоглоу систем (Рисунок 2)12. Эти аналоги дипиринона, однако, отличаются от системы ксантогов в том, что внутримолекулярные водородные связи, а не ковалентные связи, сдерживают фотоизомеризацию и приводят к флуоресцентной велосипедной системе. Кроме того, пиразол, имидазол и изойндолон дипиринон аналоги могут водородной связи в протонированных и депротонированных состояний; депротонация приводит к смещению красных волн возбуждения и выбросов, что, вероятно, объясняется изменением электронного характера системы. Хотя водородные связи, как сообщается, увеличение квантовой урожайности, хотяограниченное вращение 13,14,15,16, мы не знаем о какой-либо другой флюорофорной системы, в которой ограниченная изомеризация служит режимом флуоресценции как в протонированных и депротонированных состояний молекулы. Таким образом, эти рН зависимых дипиринон фторфоры уникальны в этом отношении.
В этом видео мы сосредоточимся на синтезе и химической характеристике аналоговой серии флуоресцентных дипиринонов. В частности, особое внимание уделяется методологии конденсации Клейзен-Шмидт, которая использовалась для построения полной серии флуоресцентных аналогов. Эта реакция опирается на генерацию базового опосредованного винилогоя энолета, который атакует группу альдегидов, чтобы произвести алкоголь, который впоследствии подвергается ликвидации. Для аналоговой серии дипиринона пирролинон/изойндолон преобразуется в энолат для облегчения нападения на группу альдегидов, прикрепленную к пиразолу или имидазоловому кольцу(рисунок 3); после ликвидации образуется полностью конъюгированный велосипедная система, соединенная метан-мостом. Примечательно, что вся серия аналогов дипиринона может быть построена из легкодоступных коммерческих материалов и может быть произведена в одной последовательности реакции одного горшка, как правило, в умеренных и высоких урожаев (доходность варьируется от примерно 50-95%). Поскольку большинство аналогов дипиринона имеют высококристаллическую природу, для получения аналитически чистых образцов требуется очень мало очистки вне стандартных условий работы. Следовательно, эта система флюорофора требует лишь нескольких шагов для доступа из легкодоступных коммерческих материалов и может быть синтезирована, очищена и подготовлена для аналитических или биологических исследований в относительно короткие сроки.
1. Общая процедура синтеза дипыринона Аналоги 16-25
2. Процедурная очистка
3. Приобретение абсорбции молара и UV/VispK Исследования для аналогов 16-25
4. Квантовая доходность Приобретение и флуоресценция исследований
Конденсатная реакция Клейзена-Шмидта предоставила доступ к аналогам дипиринона(16-25, рисунок 4) с использованием процедурыодного горшка, описанной в разделе протокола (см. шаг 1). Аналоги 16-25 были все генерируется конденсации пирролинона 9, бромуаиноиндолон 10, или изойндолон 11 с 1 H-имидазол-2-carboxaldehyde (12), 1H-имидазол-5-карбоксалдехайд (13), 1H -пиразол-3-карбоксалде(14), или 1H-пиразол-4-карбоксалдегид(15); комбинации произвели десять различных аналогов, включая контрольное соединение, 19, который не способен сформировать внутримолекулярные водородные связи (Таблица 1). Время реакции обычно требовало 24 ч рефлюкса для завершения, однако, в случае 20 требовалось только 6 ч, в то время как для 23 и 24 немного больше времени 30 ч и 27 ч соответственно были необходимы. Урожайность продукции варьировалась от 41% до 96%, как показано в таблице 1, которые следуют традиционным тенденциям аналогичных реакций конденсата для дидырринона. Соединения 17, 18, 20-22, 24и 25, благодаря своей высококристаллической природе, были очищены простыми методами вакуумной фильтрации; только соединения 16, 19, и 23 требуется хроматография для очистки.
Фотофизические свойства соединений 16-25,полученные от выполнения шагов 3 - 4 в разделе протокола, обобщены в таблице 2. ЗНАЧЕНИЯPK, измеренные для каждого соединения, варьировались от 12 до > 13,5, предполагая, что для полного депротонирования каждого аналога дипиринона необходимы достаточно основные условия. Из-за различных фотофизических свойств в протонированных и депротонированных состояниях каждого соединения спектры приобретались с использованием нейтральных (pH 7.0 PBS) и основных (1.0 M NaOH) растворов 16-25. В нейтральном рН (протонированном состоянии) соединения 16-25 имеют максимальныйабс в диапазоне от 324 нм до 365 нм, которые все сине-сдвинутые на 10-37 нм по сравнению с депротонированными состояниями. Молярные абсорбции варьируются от 15000 до 30000, но, как представляется, существенно не отклоняются среди протонированных и депротонированных состояний данного аналога. Аналог 19 не отображал никакой обнаруживаемой флуоресценции, однако, 16-18 и 20-25 испускаемого света с максэм в диапазоне от 409 - 457 нм при нейтральном рН и 443 - 482 нм при базовом рН; аналогичная тенденция красного смещения к максимальной протонированной/депротонированной длине волн поглощения наблюдается также для длин волн излучения. Диапазон Φдиапазоне от 0,01 до 0,30 как в нейтральных, так и в базовых аквеальных решениях, которые значительно ниже сопоставимых ксантогов, но соединения 16, 20, и 25 падают в аналогичной области сильно используемых фторфоров, таких как родамин B (ΦF 0,23),20 акридин оранжевый (ΦF No 0 .36),21 пиронин Y (ΦF 0,22),20 и большая часть серии красителей цианина (обычно ΦF 0,12-0,28). 22 Года
Аналоги дипирринона 16-25 были химически охарактеризованы с использованием анализа тока плавления, ИК-спектроскопии, 1НМР и 13C nmR спектроскопии, а также высокой массы спектрометрии в дополнение к УФ/ Vis и флуоресценции спектроскопии эксперименты обобщены в таблице 2. Химическая характеристика и оригинальные 1H NMR и 13C NMR спектры можно найти изоригинального источника литературы, 12 однако, для удобства, характеристика соединений 16, 20, и 23, которые обладают крупнейшими квантовых урожаев сообщается ниже:
(К)-5-((1H-имидазол-2-ил)метилен)-3-этил-4-метил-1,5-дигидро-2H-пиррол-2-один (16). Разлагается при 160 градусах Цельсия; 1 год НМР (400 МГц, ДМСО-д6) δ 12,3 (brs, 1H), 9.87 (s, 1H), 7.13 (приложения, 2H), 5.93 (s, 1H), 2.23 (q, J и 7.5 Hz, 2H), 2.00 (s, 3H), 0.98 (t, J 7.5 Hz, 3H); 13 Лет С НМР (101 МГц, ДМСО- д6) δ 170,7, 144,8, 140,0, 139,6, 133,9, 130,2, 117,6, 94,1, 16,7, 13,6, 9,33; ИК (тонкая пленка) 3742, 3148, 3063, 2924, 2353, 1651, 1543, 1450, 771, 717 см-1; HRMS (ESI-TOF) m/z: «МЗД»и Calcd для C11H13N3ONa 226.0956, Найдено 226.0956.
(К)-5-((1H-пиразол-4-ил)метилен)-3-этил-4-метил-1,5-дигидро-2H-пиррол-2-один (19). Разлагается при 202 градусах Цельсия; 1 год H NMR (400 МГц, 20% CD3OD в CDCl3) δ 1НМР (400 МГц, Хлороформ-д) δ 7,74 (с, 2H), 6,01 (с, 1H), 2,27 (кв, J 7,4 Гц, 2H), 2,02 (ы, 3H), 1,02 (т, J 7,4 Гц, 3H); 13 Лет НМР (101МГц, CDCl3) δ 173,7, 141,9, 136,0, 133,0, 116,1, 105,0, 100,8, 16,9, 13,4, 9,61; ИК (тонкая пленка) 3163, 3117, 3048, 2963, 2362, 1674, 1558, 1512, 1396, 1257, 1157, 948, 871, 794, 702 см-1; HRMS (ESI-TOF) m/z: «МЗД»и Calcd для C11H13N3ONa 226.0956, Найдено 226.0955.
(К)-3-((1H-имидазол-2-ил)метилен)-5-бромуазойндолин1-один (20). Разлагается при 213 градусах Цельсия; 1 год НМР (400 МГц, ДМСО-д6) δ 7,97 (с, 1С), 7,59 (д, Д, Д 7,8 Гц, 1Н), 7,48 (д, Д, Д 8,0, 1Н), 7,06 (ы, 2Н), 6,57 (ы, 1H); 13 Лет C ЯМР (101 МГц, ДМСО-д6) δ 167,7, 146,6, 140,2, 134,5, 131,7, 129,1, 125,8, 125,03, 124,99, 123,6, 96,5; ИК (тонкая пленка) 3742, 3240, 2314, 1682, 1543, 1520, 1435, 1312, 1080, 826, 694 см-1; HRMS (ESI-TOF) m/z: «МЗД»и Calcd для C12H8BrN3ONa 311.9749, Найдено 311.9752.
(К)-3-((1H-имидазол-2-ил)метилен)изоиндолин-1-один (23). Разлагается при 228 градусах Цельсия; 1 год НМР (400 МГц, ДМСО-д6) δ 12,34 (с, 1С), 10,74 (с, 1Н), 7,90 (д, Д, 7,5 Гц, 1Н), 7,74 (д, J 7,6 Гц, 1H), 7,63 (dd, J 7,6, 7,2 Гц, 1H), 7,50 (dd, J 7,6, 7,3 Гц, 1H), 7,17 (ы, 2H), 6,46 (ы, 1H); 13 Лет C NMR (101 МГц, DMSO-d6) δ 167,3, 144,9, 137,3, 135,1, 132,8, 129,9, 129,3, 123,6, 121,0, 117,6, 92,9; ИК (тонкая пленка) 3741, 3201, 3086, 2361, 2322, 1682, 1543, 1520, 1119, 748, 687 см-1; HRMS (ESI-TOF) м/z: «МЗД»и Calcd для C12H9N3ONa 234.0643, Найдено 234.0641.
| вход | Пирролинон/изойндолон | альдегид | Доходность (%)b | Время (ч) | продукт |
| 1 | 9 | 12 | 80 | 24 | 16 |
| 2 | 9 | 13 | 41 | 24 | 17 |
| 3 | 9 | 14 | 79 | 24 | 18 |
| 4 | 9 | 15 | 61 | 24 | 19 |
| 5 | 10 | 12 | 96 | 6 | 20 |
| 6 | 10 | 13 | 70 | 24 | 21 |
| 7 | 10 | 14 | 66 | 24 | 22 |
| 8 | 11 | 12 | 49 | 30 | 23 |
| 9 | 11 | 13 | 49 | 27 | 24 |
| 10 | 11 | 14 | 94 | 24 | 25 |
Таблица 1. Условия и реакционной доходности для синтеза 16-25а
Реакции выполняются по 1 ммольной шкале в 5 мл EtOH. б Изолированный урожай.
| соединение | Абс. Макс (нм) | ε (M-1 см -1) | фтор. Макс (нм) | Φb | ПКа |
| 16 | 351 (384) | 24500 (22800) | 451 (482) | 0.30 (0.30) | 12.7 |
| 17 | 338 (380) | 18600 (18600) | 442 (462) | 0.01 (0.03) | 12.8 |
| 18 | 324 (349) | 29800 (25700) | 455 (465) | 0.01 (0.02) | 13 |
| 19 | 326 (358) | 29900 (21300) | –a | –a | 12.9 |
| 20 | 365 (378) | 15000 (15500) | 457 (475) | 0.22 (0.20) | 12.5 |
| 21 | 355 (380) | 15100 (16800) | 409 (443) | 0.03 (0.01) | 12.9 |
| 22 | 341 (363) | 19800 (23100) | 427 (452) | 0.02 (0.01) | >13,5 |
| 23 | 360 (373) | 29000 (21300) | 449 (474) | 0.25 (0.26) | 12 |
| 24 | 351 (373) | 17200 (19400) | 432 (454) | 0.07 (0.05) | 12.8 |
| 25 | 340 (357) | 20200 (23500) | 410 (449) | 0.02 (0.02) | >13,5 |
Таблица 2. Фотофизические свойства и значения pKa 6-14 и 22 в буфере pH 7.0 PBS и 1 M NaOH (с учетом скобки).
Флуоресценция не была обнаружена в течение 19. b Квинин (No 0,55)15 и антрацен (No 0,27)15,16 были использованы в качестве стандартов.

Рисунок 1: Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 2: Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 3: Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 4: Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Авторов нечего раскрывать.
Конденсатная реакция Клейзена-Шмидта является важной методологией для генерации конъюгированных велосипедных ароматических соединений, спрягаемых на метане. Благодаря использованию базового варианта реакции алдола, ряд флуоресцентных и / или биологически соответствующих молекул могут быть доступны через в целом недорогой и оперативно простой синтетический подход.
З.Р.В. и Н.B. благодарят NIH (2P20 GM103440-14A1) за щедрое финансирование, а также Jungjae Koh и Университет Невады, Лас-Вегас за помощь в приобретении 1H и 13C NMR. Кроме того, мы хотели бы поблагодарить студентов НСК визуальных средств массовой информации, Арнольд Placencia-Флорес, Обри Джейкобс, и Алистер Купер за их помощь в съемках и анимации процессов в кинематографических части этой рукописи.
| 3-этил-4-метил-3-пирролин-2-он | Combi-Blocks | [ 766-36-9] | Желтый твердый реагент |
| изоиндолин-1-он | АркФарм | [ 480-91-1] | Белый твердый реагент |
| 5-бромизоиндолин-1-он | Combi-Blocks | [ 552330-86-6] | Розовый твердый реактив |
| 2-формилимидазол | Combi-Blocks | [ 10111-08-7 ] | Белый твердый реактив |
| имидазол-4-карбальдегид | ArkPharm | [ 3034-50-2] | Твердый реагент |
| 1-H-пиразол-4-карбальдегид | Oakwood Chemicals | [ 35344-95-7] | Твердый реактив |
| 1-H-пиразол-5-карбальдегид | Matrix Scientific | [ 3920-50-1] | Твердый реагент |
| Твердые гранулы KOH | BeanTown Chemicals | [1310-58-3] | Белые твердые гранулы |
| Силикагель Siliflash | Scilicycle | R12030B | Мелкий белый порошок |
| Фосфатный буферный физиологический раствор (PBS) (x10) | Growcells | MRGF-6235 | Бесцветная полупрозрачная жидкость |
| Beckman Coulter DU-800 УФ/ВИД спектрофотометр и программное обеспечение | Beckman Coulter | Н/Д | Спектрометр и программное обеспечение |
| Флюоромакс-4 Спектрофлуориметр Horiba | Scientific | Н/Д | Спектрометрический прибор |
| FluorEssence Программное обеспечение для флуоретрии V3.5 | Horiba Scientific | Н/Д | Программное обеспечение для спектроскопии |
| Finnpipette II Микропипетка (размеры: 100-1,000, 20-200 и 0,5-10 &микро; L) | Fischerbrand | N/A | Оборудование |
| Wilmad-LabGlass Ротационный испаритель (модель: WG-EV311-V-PLUS) | SP Scienceware | N/A | Оборудование |
| DuoSeal Вакуумный насос (Модель: 1405) | Welch | N/A | Оборудование |
| GraphPad | Программное | обеспечение для анализа данных | |
| SympHony pH Meter (Модель: Sb70P) | VWR | N/A | Оборудование |