Здесь представлен протокол генерации in vitro васкуляризированных эквивалентов кожи человека (VHSE) с использованием теломеразы обратной транскриптазы (TERT), увековеченных кератиноцитов (N/TERT-120,59),кожных фибробластов взрослого человека (hDF) и микрососудистых эндотелиальных клеток человека (HMEC-1)(рисунок 1). Кроме того, настраиваемый характер этого протокола подчеркивается демонстрацией генерации и стабильности VHSE при использовании общедоступных фибробластов легких (IMR90) вместо hDF. Генерация VHSE завершается на шагах 1-4, в то время как шаги 5-7 являются дополнительными методами обработки конечных точек и визуализации, которые были оптимизированы для этих VHSE. Важно отметить, что VHSEs могут быть обработаны в соответствии с конкретными исследовательскими вопросами, и шаги 5-7 не требуются для создания конструкции. Объемная визуализация, анализ и 3D-рендеринг были завершены для демонстрации метода объемного анализа. Эти протоколы подготовки и визуализации объемных конструкций сохраняют структуру VHSE как на микроскопическом, так и на макроскопическом уровнях, что позволяет проводить комплексный 3D-анализ.
Характеристики эпидермиса и дермы показывают соответствующие иммунофлуоресцентные маркеры для кожи человека в конструкциях VHSE(рисунок 2,3). Цитокератин 10 (CK10) является маркером кератиноцитов ранней дифференцировки, который обычно отмечает все надбазальные слои в кожных эквивалентах18,30,68 (Рисунок 2). Инволюкрин и филаггрин являются маркерами поздней дифференцировки в кератиноцитах и отмечают самые верхние надбазальные слои в кожных эквивалентах12,30,68,69 (рисунок 2). Для маркировки ядер как в эпидермисе, так и в дерме использовался дально красный флуоресцентный ядерный краситель (см. список материалов), причем Col IV маркировал сосудистую часть дермы(рисунок 2, рисунок 3, рисунок 4). Компоненты эпидермальной базальной мембраны (БМ) не всегда правильно экспрессируются в культурах НИУ ВШЭ15,16; и окрашивание БМ в кол IV не наблюдается последовательно с использованием этого протокола. Компоненты и структура БМ, ориентированные на исследования, выиграют от дополнительной оптимизации среды, клеток и изображений14.
Хотя конфокальная визуализация через большую часть культур VHSE часто дает изображения с высоким разрешением, достаточные для вычислительного анализа дермы и эпидермиса, описанный метод очистки позволяет более глубокую визуализацию тканей. Очистка улучшает глубину проникновения конфокального лазера, а эффективная визуализация в VHSEs может быть достигнута до более чем 1 мм для очищенных образцов (по сравнению с ~ 250 мкм для неочищеных). Описанная методика очистки (обезвоживание метанола и метилсалицилат) в достаточной степени соответствует индексу преломления по всей ткани образца УВШЭ61. Очистка VHSE позволила получить простую визуализацию всей конструкции без манипуляций (например, переориентировать конструкцию для изображения дермы и эпидермиса отдельно)(рисунок 3).
Объемные изображения позволяют генерацию 3D-рендеринга для отображения сосудистой области по всей конструкции(рисунок 4). Вкратце, конфокальные наборы изображений были взяты в кожной и эпидермальной ориентации нескольких подтомов VHSEs для обнаружения пятна коллагена IV (маркировка стенок сосудов) и ядер (отмеченных дально красным флуоресцентным ядерным красителем). Стеки изображений загружаются в вычислительное программное обеспечение (см. список материалов) и пользовательский алгоритм (основанный на этих источниках 48,70,71, 72,73,74,75)используется для 3D-рендеринга и количественной оценки, как описаноранее 48. Этот алгоритм автоматически сегментирует сосудистый компонент на основе пятна Col IV. Объемная сегментация передается алгоритму скелетонизации, основанному на быстром марше75,76,77. Скелетонизация находит окончательный центр каждого сосуда, отмеченного Col IV, и полученные данные могут быть использованы для расчета диаметра сосуда, а также сосудистой фракции(рисунок 4). Широкоугольная флуоресцентная микроскопия является доступным вариантом, если лазерная сканирующая микроскопия недоступна; сосудистая сеть и эпидермис могут быть изображены с помощью широкоугольной флуоресцентной микроскопии(Дополнительный рисунок 2). Трехмерная количественная оценка возможна с использованием широкоугольной визуализации VHSEs, а не лазерной сканирующей микроскопии, хотя она может потребовать большей фильтрации и деконволюции изображений из-за внеплощадного света.

Рисунок 1:Схематическая временная шкала генерации эквивалента васкуляризированной кожи человека. A) Показывает прогрессирование модели VHSE от 1) посева дермального компонента, 2) посева кератиноцитов к дермальному компоненту, 3) эпителиальной стратификации через интерфейс воздушной жидкости и поддержание культуры. Посткультурная обработка и объемная визуализация могут выполняться в конечной точке культуры. B) Изображения с камеры макроструктуры hDF VHSE во вставках языка и культуры в их конечной точке языка и ведения, 8 недель. Различные уровни сокращения являются нормальными для VHSEs; сокращение может быть уменьшено, как описано в протоколе. (1 & 2) Менее контрактные образцы. (3 & 4) Более сжатые образцы по-прежнему дают правильные элементы кожи. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2:Эпидермальная характеристика с помощью иммунофлуоресцентных маркеров. Все изображения были сделаны VHSEs в точке времени культуры 8wk с помощью конфокальной микроскопии. Соответствующие методы окрашивания описаны в протоколе на шаге 6. Правильные эпителиальные маркеры присутствуют как в hDF VHSEs (левый столбец), так и в IMR90 VHSEs (правый столбец). Инволюкрин и Филаггрин являются маркерами поздней дифференцировки кератиноцитов и демонстрируют, что эпидермис полностью стратифицирован в обоих типах VHSE. Цитокератин 10 является ранним маркером дифференцировки, который идентифицирует надбазальные слои в VHSEs. Ядра показаны в ортогональных видах жёлтым цветом. Изображения лица и ортогональной максимальной проекции визуализируются с помощью вычислительного программного обеспечения; Изображения индивидуально масштабируются с вычитанием фона и медианной фильтрацией для четкости. Шкала слитков 100 мкм. (Первичные и вторичные антитела с штатным блокирующим буфером приведены в таблице 3). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3:Сравнение неочищенным и очищенным VHSE. Этот VHSE был сгенерирован с помощью IMR90s, и изображения были сделаны в точке времени культуры 4wk с помощью конфокальной микроскопии. Коллаген IV показан в циановом; Ядра показаны пурпурным; пурпурный в очищенном 3D-рендеринге представляет собой консолидацию ядер в эпидермальном слое VHSE. Неочищенный VHSE-образ является примером лазерного затухания в более толстых конструкциях VHSE, благодаря очистке (метанол и метилсалицилат) вся конструкция может быть визуалирована с небольшим / без лазерного затухания с кожной стороны конструкции. Настройки изображения, включая лазерную линию, усиление и точечное отверстие, были снижены для очищенного VHSE, чтобы уменьшить перенасыщение. Очистка и визуализация были завершены, как описано в шагах 6 и 7 в протоколе. Ортогональные максимальные проекционные изображения и 3D-рендеринг были дополнены вычислительным программным обеспечением, 3D-рендеринг был сгенерирован из очищенных конструктных изображений. Изображения индивидуально масштабируются с вычитанием фона и медианной фильтрацией для четкости. Шкала 100 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4:Трехмерный анализ сосудистой азкулятуры в VHSEs. Объемные изображения, сделанные с помощью конфокальной микроскопии, позволяют количественно определять параметры сосудов в конечных точках культуры с помощью вычислительного анализа изображений. Из подобъемов VHSE обнаружение коллагенового IV пятна (циана) метит эндотелиальные стенки сосудистой системы и позволяет сегментировать сосуды на основе расположения коллагена IV; Затем данные сегментации скелетонизируются, и центр каждого судна находится (пурпурный). Примеры 3D-скелетонизации показаны для 4-недельных и 8-недельных образцов IMR90 VHSE, не очищенных. Полученные данные экспериментального набора IMR90 VHSE были использованы для расчета диаметров сосудов и сосудистых фракций для четырех подобъемов (каждый 250 мкм в z-направлении) в каждой конструкции, данные были усреднены по VHSE и далее усреднены по точке времени культуры. Эти данные показывают, что гомеостаз сосудистой сети охватывает 4 и 8 недель культуры с диаметрами, относящимися к коже человека in vivo78,и сосудистой фракцией в том же порядке, что и in vivo человеческая кожа79 (было показано, что сосудистая фракция в коллагеновых конструкциях настраиваема48 и может быть дополнительно оптимизирована для увеличения значений). Данные представляются в виде средств ± стандартного значения погрешности (S.E.M); n = 3 для каждой точки времени. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
| медиа | Компоненты |
| Клеточная линия дермального фибробластов человека (hDF) | ДМЕМ ХГ |
| 5% фетальная бытовая сыворотка (FBS) |
| 1% Пенициллин/Стрептомицин (P/S) |
| IMR90 Клеточная линия фибробластов | ДМЕМ/ХЭМ F12 50:50 |
| 10% ФБС |
| 1% P/S |
| HMEC-1 Эндотелиальная клеточная линия | MCDB131 Базовая среда |
| 10% ФБС |
| 1% P/S |
| L-глютамин [10 мМ] |
| Эпидермальный фактор роста (EGF) [10 нг/мл] |
| Гидрокортизон [10 мкг/мл] |
| N/TERT-1 Клеточная линия кератиноцитов | Медиабаза K-SFM |
| 1% P/S |
| Экстракт гипофиза крупного рогатого лова (BPE) [25 мкг/мл], из набора добавок K-SFM |
| Эпидермальный фактор роста (EGF) [0,2 нг/мл], из набора добавок K-SFM |
| CaCl2 [0,3 мМ] |
| Дифференциация эквивалента кожи человека (HSE) | 3:1 DMEM: Хэм F12 |
| 1% P/S |
| 0,5 мкМ Гидрокортизон |
| 0,5 мкМ изопротеренола |
| 0,5 мкг/мл инсулина |
Таблица 1: Медиа-рецепты. Приведены рецепты среды для 2D-культуры кожных фибробластов человека, фибробластов IMR90, кератиноцитов HMEC-1 и N/TERT-1. Эти рецепты использовались для расширения клеточных линий перед генерацией VHSEs. Для генерации VHSE используются среды дифференциации эквивалента кожи человека (HSE); приведен базовый рецепт, во время порций погружной культуры и индукции стратификации следует добавлять сужающиеся количества FBS, как описано в этапе 3 протокола. Рецепт НИУ ВШЭ основан на этих источниках11,80.
| Концентрациязапаса коллагена(C s): | 8 | мг/мл | | |
| Желаемый объем (Vf): | 1 | мл | | |
| Нормализация регулировки NaOH*: | 1 | икс | | |
| * Каждая партия коллагена должна быть проверена, чтобы определить количество NaOH, необходимое для установки pH 7 - 7,4 |
| | Желаемая концентрация коллагена (мг/мл) |
| 2 | 3 | 4 | 5 |
| 10X PBS (Vpbs) | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.1 |
| Коллагеновый запас (Vs) | 0.25 | 0.375 | 0.5 | 0.625 |
| 1N NaOH (VNaOH) | 0.00575 | 0.008625 | 0.0115 | 0.014375 |
| Медиа (Vносители) | 0.64425 | 0.516375 | 0.3885 | 0.260625 |
Таблица 2:Справочная таблица расчета коллагена. Справочная таблица дает обычно желаемые концентрации коллагена, рассчитанные исходя из концентрации коллагена 8 мг/мл и желаемого конечного объема 1 мл; все значения в мл. Уравнения, используемые для расчета этих сумм, приведены в шаге протокола 2.2. Важно проверить pH для каждого запаса коллагена; при необходимости следует добавить количество NaOH для достижения pH 7 - 7,4 (после добавления PBS, NaOH, коллагенового запаса, среды). Протокол был оптимизирован для VHSEs с использованием концентрации коллагена 3 мг/мл; изменения концентрации коллагена могут быть необходимы для различных клеточных линий/желаемых конечных результатов48.
| Первичное антитело | источник | концентрация | использование |
| Филаггрин (AKH1) мыши моноклональный IgG | Санта-Крус; sc-66192 (200 мкг/мл) | [1:250] | Маркер поздней дифференциации15
|
| Инволюкрин кролик поликлональный IgG | Протеинтех; 55328-1-AP (30 мкг/150 мкл) | [1:250] | Маркер поздней терминальной дифференциации15
|
| Цитокератин 10 (DE-K10) мышиный IgG, супернатант | Санта-Крус; sc-52318 | [1:350] | Надбазиальный эпидермальный маркер14,36,59
|
| Коллаген IV кролик поликлональный | Протеинтех; 55131-1-АП | [1:500] | Эндотелиальная сосудистая стенка67
|
| ДРАК 7 | Передача сигналов сотовой связи; 7406 (0,3 мМ) | [1:250] | Ядерный маркер |
| Вторичное антитело | источник | концентрация | использование |
| Коза против кроликов IgG DyLight™ 488 Конъюгированный | Инвитроген; 35552 (1 мг/мл) | [1:500] | Коллаген IV вторичный |
| Антитело против кролика IgG (H & L) (GOAT), DyLight™ 549 Конъюгированный | Иммунохимические вещества Рокленда; 611-142-002 | [1:500] | Инволюкрин вторичный |
| Коза против мыши IgG (H&L), DyLight™ 488 | Термо Научный; 35502 (1 мг/мл) | [1:500] | Филаггрин или Цитокератин 10 вторичный |
|
БЛОКИРУЮЩИЙ БУФЕР (500 мл) | |
| реагент | количество | | |
| ддН2О | 450 мл | | |
| 10 x PBS | 50 мл | | |
| Быцкий сывороточный альбумин (BSA) | 5 г | | |
| Анимация 20 | 0,5 мл | | |
| Холодноводный рыбный желатин | 1 г | | |
| Азид натрия (10% азид натрия в diH2O) | 5 мл (конечная концентрация 0,1 % ) |
Таблица 3: Первичные и вторичные антитела с блокирующим буфером рецепта. Перечисленные антитела и химические пятна использовались для окрашивания, показанного на рисунке 2, рисунке 3, рисунке 4. Окрашивание было завершено, как указано в шаге протокола 6, с использованием рецепта блокирующего буфера, указанного здесь. Может потребоваться некоторая оптимизация концентраций окрашивания и продолжительности в зависимости от выбранных методов культивирования и клеточных линий.
Дополнительная таблица 1: Перечень сокращений. Список сокращений включен для удобства читателя. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить эту таблицу.
Дополнительный рисунок 1:Техническая помощь VHSE для обработки. Обращение с VHSEs является сложной задачей, особенно во время фиксации, обработки и окрашивания. A-D соответствует инструкциям на шагах 5-7. A показывает техническое обращение с удалением пористой мембраны из культурального вкладыша для обеспечения надлежащего окрашивания. B показывает, как держать каждый VHSE под водой во время окрашивания и хранения. C показывает самый безопасный и простой способ перемещения конструкций в скважины PDMS. D показывает VHSE, сидящий в колодце PDMS-визуализации: PDMS хорошо приклеивается к стеклянному слайду внизу, создавая окно для визуализации, стеклянный слайд помещается сверху для поддержания влажности посредством длительных запусков изображения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.
Дополнительный рисунок 2:Стандартная широкоугольная флуоресцентная микроскопия может использоваться для оценки VHSEs. Широкоугольная визуализация может использоваться для объемной визуализации для рутинной оценки, когда лазерная сканирующая микроскопия недоступна. В качестве примера, визуализация VHSEs как из апикального, так и из базолатерального аспектов показана в виде грани и ортогональных (Ortho.) максимальных проекций. (Наверх) Эпидермис был изображен с использованием инволукрина и ядер в качестве маркеров. (Внизу) Кожная сосудистая асьм была изображена с использованием коллагена IV в качестве маркера. Изображения вычитаются из фона для ясности. Внеплосконный свет приводит к «полосатым» или «вспыхивающим» артефактам, очевидным в ортогональных видах. Широкоугольная визуализация может использоваться для количественной оценки, но может потребовать большей обработки изображений. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.