RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Здесь описана платформа для твердофазной микроэкстракционно-газовой хроматографии для быстрой, надежной и полуавтоматизированной идентификации летучих веществ и количественной оценки в спелых плодах черной смородины. Этот метод может быть использован для увеличения знаний о фруктовом аромате и для отбора сортов с улучшенным вкусом с целью селекции.
Растет интерес к измерению летучих органических соединений (ЛОС), выделяемых спелыми плодами, с целью селекции сортов или сортов с улучшенными органолептическими характеристиками и, таким образом, повышения потребительского признания. Недавно были разработаны высокопроизводительные метаболомные платформы для количественной оценки широкого спектра метаболитов в различных растительных тканях, включая ключевые соединения, ответственные за вкус и качество аромата фруктов (волатиломики). Метод, использующий твердофазную микроэкстракцию пространства над головой (HS-SPME) в сочетании с газовой хроматографией-масс-спектрометрией (GC-MS), описан здесь для идентификации и количественной оценки ЛОС, испускаемых спелыми плодами черной смородины, ягодой, высоко оцененной за ее вкус и пользу для здоровья.
Спелые плоды растений черной смородины (Ribes nigrum) собирали и непосредственно замораживали в жидком азоте. После гомогенизации тканей для получения мелкодисперсного порошка образцы размораживали и сразу же смешивали с раствором хлорида натрия. После центрифугирования супернатант переносили в стеклянный флакон, содержащий хлорид натрия. Затем ЛОС экстрагировали с использованием твердофазного микроэкстракционного волокна (SPME) и газового хроматографа, соединенного с масс-спектрометром ионной ловушки. Летучую количественную оценку проводили на полученных ионных хроматограммах путем интеграции пиковой области с использованием определенного m/z иона для каждого ЛОС. Правильная аннотация ЛОС была подтверждена путем сравнения времени удержания и масс-спектров чистых коммерческих стандартов, работающих в тех же условиях, что и образцы. Более 60 ЛОС были идентифицированы в спелых плодах черной смородины, выращенных в контрастных европейских местах. Среди идентифицированных ЛОС ключевые ароматические соединения, такие как терпеноиды и летучие вещества C6, могут быть использованы в качестве биомаркеров качества плодов черной смородины. Кроме того, обсуждаются преимущества и недостатки метода, в том числе перспективные улучшения. Кроме того, было подчеркнуто использование средств контроля для коррекции партий и сведения к минимуму интенсивности дрейфа.
Вкус является важной чертой качества для любого фрукта, влияя на принятие потребителями и, таким образом, значительно влияя на конкурентоспособность. Восприятие вкуса включает в себя сочетание вкусовой и обонятельной систем и химически зависит от наличия и концентрации широкого спектра соединений, которые накапливаются в съедобных частях растений или, в случае ЛОС, выделяются спелыми плодами1,2. В то время как традиционная селекция была сосредоточена на агрономических признаках, таких как урожайность и устойчивость к вредителям, улучшение качества фруктов, включая вкус, долгое время игнорировалось из-за генетической сложности и трудности правильного фенотипирования этих характеристик, что приводит к недовольству потребителей3,4. Последние достижения в области метаболомных платформ были успешными в выявлении и количественной оценке ключевых соединений, ответственных за вкус и аромат фруктов5,6,7,8. Кроме того, сочетание профилирования метаболитов с геномными или транскриптомными инструментами позволяет прояснить генетику, лежащую в основе фруктового аромата, что, в свою очередь, поможет селекционным программам разрабатывать новые сорта с улучшенными органолептическими характеристиками2,4,9,10,11,12,13,14.
Ягоды черной смородины (Ribes nigrum) высоко ценятся за их вкус и питательные свойства, широко культивируемые в умеренных зонах Европы, Азии и Новой Зеландии15. Большая часть продукции перерабатывается для пищевых продуктов и напитков, которые очень популярны в скандинавских странах, в основном из-за органолептических свойств ягод. Интенсивный цвет и вкус фруктов являются результатом сочетания антоцианов, сахаров, кислот и ЛОС, присутствующих в спелых плодах16,17,18. Анализ летучих веществ черной смородины восходит к 1960-м годам19,20,21. Совсем недавно несколько исследований были сосредоточены на ЛОС черной смородины, выявлении важных соединений для восприятия аромата фруктов и оценке влияния генотипа, окружающей среды или условий хранения и обработки на содержание ЛОС5,17,18,22,23.
Из-за своих многочисленных преимуществ методом выбора для высокопроизводительного летучего профилирования является HS-SPME/GC-MS24,25. Кремнеземное волокно, покрытое полимерной фазой, монтируется на шприцевом устройстве, что позволяет адсорбировать летучие вещества в волокне до достижения равновесной фазы. Экстракция из пространства над головой защищает волокно от энергонезависимых соединений, присутствующих в матрице24. SPME может успешно изолировать большое количество ЛОС, присутствующих в сильно варьирующихся концентрациях (от частей на миллиард до частей на миллион)25. Кроме того, это метод без растворителей, который требует ограниченной обработки образцов. Другими преимуществами HS-SPME являются простота автоматизации и ее относительно низкая стоимость.
Однако его успех может быть ограничен в зависимости от химической природы ЛОС, протокола экстракции (включая время, температуру и концентрацию соли), стабильности пробы и наличия достаточного количества плодовой ткани26,27. В данной статье представлен протокол для ЛОС черной смородины, выделенных HS-SPME и проанализированных газовой хроматографией в сочетании с масс-спектрометром ионной ловушки. Был достигнут баланс между количеством растительного материала, стабильностью образца и продолжительностью экстракции и хроматографии, чтобы иметь возможность обрабатывать большое количество образцов черной смородины, некоторые из которых представлены в этом исследовании. В частности, в качестве примеров данных будут представлены и обсуждены профили ЛОС и/или хроматограммы пяти сортов ("Андега", "Бен Трон", "Бен Гэрн", "Бен Тирран" и "Тихоуп"). Кроме того, этот же протокол был успешно внедрен в практику для измерения ЛОС у других видов фруктовых ягод, таких как клубника (Fragaria x ananassa), малина (Rubusidaeus) и черника (Vaccinium spp.).
1. Сбор фруктов
2. Подготовка образцов фруктов и реагентов
3. Пробоподготовка
4. Сбор данных HS-SPME/GC-MS
5. Анализ хроматограмм профиля GC-MS: идентификация ЛОС и полукватинификация
Для точного аромафенотипирования необходимо высокопроизводительное профилирование ЛОС в большом наборе плодовых культур, выращенных в различных условиях или местах или принадлежащих к различным генотипам. Здесь представлена быстрая и полуавтоматизированная платформа HS-SPME/GC-MS для относительной количественной оценки ЛОС в сортах черной смородины. Обнаружение и идентификация ЛОС были основаны на библиотеке, которая была разработана для профилирования видов ягодных фруктов (таблица 1). Типичный спелый летучий профиль плодов черной смородины (общая ионная хроматограмма), полученный HS-SPME/GC-MS в вышеупомянутых условиях, показан на рисунке 1А. В общей сложности было идентифицировано 63 ЛОС, принадлежащих к нескольким химическим классам, большинство из которых являются эфирами (27), альдегидами (12), спиртами (8), кетонами (7), терпенами (5) и фуранами (3) (таблица 1).
Было описано, что терпеноидные соединения, сложные эфиры и соединения C6 доминируют в волатиломе черной смородины и важны для аромата свежих фруктов5,17. В соответствии с этими предыдущими исследованиями, некоторые из наиболее распространенных пиков, наблюдаемых на рисунке 1А, соответствуют двум монотерпенам (линалоол и терпинеол) и двум соединениям C6 ((E)-2-гексеналь и (Z)-3-гексеналь). Примеры масс-спектров, полученных из профилей черной смородины, и их сравнение со спектрами чистых коммерческих эталонов показаны для (Е)-2-гексенала и терпинеола на Фиг.1В и Фиг.1С соответственно.

Рисунок 1: Репрезентативные хроматограммы из спелых плодов черной смородины, полученные HS-SPME/GC-MS (из сорта 'Andega'). (A) Общая ионная хроматограмма. (Z)-3-гексенальный (время удержания 14,33 мин), (E)-2-гексенальный (15,86 мин), линалоол (21,65 мин) и терпинеол (24,01 мин) пики обозначаются числами 1, 2, 3 и 4 соответственно. (B) Масс-спектр, соответствующий (E)-2-гексенальному пику из профиля черной смородины и сравнение с чистым коммерческим стандартом. (C) Масс-спектр, соответствующий пику терпинеола из профиля черной смородины и сравнение с чистым коммерческим стандартом. Аббревиатура: HS-SPME/GC-MS = твердофазная микроэкстракция пространства над головой в сочетании с газовой хроматографией-масс-спектрометрией. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
В то время как терпены были изображены как индикаторы свежести плодов черной смородины, соединения C6 известны как «летучие вещества зеленых листьев», придавая «зеленые» ноты фруктовому и овощному аромату34. Таким образом, полукватерификация этих ЛОС, выделяемых спелыми плодами различных сортов черной смородины, может стать первым шагом в улучшении вкусовых признаков. Кроме того, поскольку окружающая среда и условия роста растений сильно влияют на содержание лос в плодах, что является одним из основных недостатков для аромабридирования, одной из целей этого исследования было подтверждение гипотезы о том, что полукватерификация идентифицированных ЛОС в тех же сортах («Бен Трон», «Бен Гэрн», «Бен Тирран» и «Тихоуп») была воспроизводимой в диаметрально противоположных европейских местах, таких как Польша и Шотландия. Как и ожидалось, анализ главных компонентов (PCA) профилей ЛОС четырех различных сортов черной смородины показал, что окружающая среда сильно влияет на содержание летучих веществ, поскольку основной компонент (ПК) 1 разделяет образцы на основе их местоположения (рисунок 2). Тем не менее, эффект генотипа можно наблюдать с PC2, так как 'Ben Tirran' четко отделен от остальных сортов (рисунок 2).
На рисунке 3 показано относительное содержание линалоола и (Е)-2-гексенала в четырех оцененных сортах черной смородины. Для обоих мест содержание ЛОС было нормализовано до одного и того же контрольного образца, для которого полуквантовая оценка подтвердила, что содержание линалоола в Польше, как правило, выше, чем в Шотландии, тогда как (E)-2-гексеналь показывает противоположную тенденцию (рисунок 3). Этот результат демонстрирует воздействие на окружающую среду содержания ЛОС в плодах черной смородины, хотя доля двух летучих веществ, присутствующих в четырех оцененных сортах, была постоянной, причем сорта "Бен Тирран" и "Бен Трон" показали наибольшее количество линалоола и (Е)-2-гексенала, соответственно (рисунок 3). Взятые вместе, эти результаты указывают на то, что предложенный метод действителен к содержанию ФЕНОтипа ЛОС и в сочетании с генетическими подходами может быть использован с целью селекции качества плодов.

Рисунок 2: PCA для оценки дисперсии между профилями ЛОС в четырех сортах черной смородины, выращенных в Польше и Шотландии. PC1 (окружающая среда) объясняет 46,2% изменчивости, в то время как PC2 (генотип) вносит 24,8% дисперсии в набор данных. Сокращения: PCA = анализ главных компонентов; PC1 = первый основной компонент; PC2 = второй основной компонент; ЛОС = летучее органическое соединение. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Относительное содержание двух репрезентативных ЛОС в аромапрофилях черной смородины - линалоол и (Е)-2-гексеналь, собранных в Шотландии и Польше. Были оценены четыре различных сорта черной смородины («Бен Гэрн», «Бен Тирран», «Бен Трон» и «Тихоуп»). Столбцы представляют средние значения двух биологических реплик, а полосы ошибок представляют стандартное отклонение. Статистические сравнения проводились с помощью одностороннего ANOVA, за которым последовал пост-специальный тест Туки для определения значительных различий в содержании ЛОС между сортами и странами. Для содержимого ЛОС с одинаковыми строчными буквами (a, ab, b) не наблюдалось существенных различий при P < 0,05. Сокращения: ЛОС = летучие органические соединения; ANOVA = дисперсионный анализ. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Таблица 1: Перечень ЛОС, идентифицированных HS-SPME/GC-MS в плодах черной смородины. Указывается время удержания (мин), выбранный м/з ион для идентификации и полуквафинификации ЛОС, описание аромата, химический класс и формула, а также номер CAS. Сокращения: HS-SPME/GC-MS = твердофазная микроэкстракция пространства над головой в сочетании с газовой хроматографией-масс-спектрометрией; ЛОС = летучие органические соединения; КРИ = индекс удержания Коваца; Номер CAS = регистрационный номер службы рефератов по химическим веществам. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить эту таблицу.
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Здесь описана платформа для твердофазной микроэкстракционно-газовой хроматографии для быстрой, надежной и полуавтоматизированной идентификации летучих веществ и количественной оценки в спелых плодах черной смородины. Этот метод может быть использован для увеличения знаний о фруктовом аромате и для отбора сортов с улучшенным вкусом с целью селекции.
Авторы благодарят Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación из Университета Малаги за измерения HS-SPME/GC-MS. Мы признаем помощь Сары Фернандес-Паласиос Кампос в количественной оценке волатильности. Мы также благодарим членов консорциума GoodBerry за предоставление фруктового материала.
| Флаконы с завинчивающейся крышкой 10 мл Thermo | Scientific | 10-HSV | |
| 18 мм Винтовая крышка Силикон/ПТФЭ | Thermo Scientific | 18-MSC | |
| 5 мл Пробирка с завинчивающейся крышкой из полиэтилена высокой плотности | VWR | 216-0153 | |
| Центрифуга | Thermo Scientific | 75002415 | |
| Метанол для ВЭЖХ | Merck | 34860-1L-R | |
| N-пентадекан (D32, 98%) | Кембриджские изотопные лаборатории | DLM-1283-1 | |
| Хлорид натрия | Merck S9888 | ||
| SPME волокно PDMS/DVB | Merck | 57345-U | |
| Нержавеющие шлифовальные банки для тканейLyser | Qiagen | 69985 | |
| TissueLyser II | Qiagen | 85300 | Может быть заменен ступкой и пестиком или криогенной мельницей |
| Trace GC газовый хроматограф-ITQ900 ионная ловушка масс-спектрометр | Thermo Scientific | ||
| Triplus RSH автосамплер с автоматизированным устройством SPME | Thermo Scientific | 1R77010-0450 | |
| Вода для ВЭЖХ | Merck | 270733-1L | |
| Xcalibur 4.2 SP1 | Thermo Scientific | программное обеспечение |