Здесь предлагается новый метод продольного отслеживания динамики и оборота митохондриальной системы в культивируемом астроците. В отличие от покадрового подхода на фиксированной группе клеток или одной отдельной клетке за раз (чаще всего используется в литературе)24,25,исследователи могут следить за эволюцией митохондриальной системы в течение нескольких дней на одних и тех же отдельных клетках. В отличие от визуализации в реальном времени с одной лункой, где требуются высокие уровни воздействия света, а выбор многих отдельных клеток менее осуществим, предлагаемый метод использует способность этого микроскопа визуализировать несколько различных клеток в разных областях скважины и возвращаться к тем же клеткам в разные моменты времени для их повторного изображения. Благодаря нормализации исходного уровня, проводимого для каждого измеренного критерия для каждой интересующей клетки, он учитывает сложность митохондриальной системы и исследует влияние лечения на каждую клетку относительно ее собственного базового изображения. Способность микроскопа автономно выполнять этот тип визуализации на 16 скважинах одновременно (визуализация 5 клеток на лунку) позволяет правильно учитывать гетерогенность митохондриальной системы во время анализа без экспериментальной изменчивости, которая приходит с визуализацией различных состояний в разные дни.
Качество культур, уровни вирусных инфекций, экспрессирующих биосенсор LV-G1-MitoTimer, тип микроскопа и цели, а также выбор подходящих клеток являются критическими переменными, которые должны оставаться максимально последовательными в этом протоколе. Плотность клеток, тип вектора и вирусные титры могут быть адаптированы в соответствии с вопросом. Хотя предыдущая работа показывает, что экспрессия LV-G1-MitoTimer не имеет вредных последствий для митохондриальной функции и динамики21,22,26,27,важно убедиться, что концентрация не токсична для клеток (например, хорошо проверить общее количество клеток в контроле). В качестве единой фокальной плоскости астроциты должны быть: (1) как можно более плоскими, (2) изолированными от других меченых клеток (для упрощения анализа в случае смещения в чашке) и (3) обладающими высокими уровнями флуоресценции. Поскольку клетки в культуре могут сильно варьироваться по морфологии, митохондриальная система может быть очень гетерогенной. В этом контексте анализ ROI (а не всей ячейки) компенсирует некоторые проблемные области, такие как периноядерные области, и снижает изменчивость. Важно сделать базовую линию на относительно похожих клетках и взять образец как можно большего количества клеток. Следовательно, идеально подходят микроскопы для сбора и анализа высокого содержания. Во время этого продольного мониторинга также важно не подвергать клетки воздействию света, чтобы избежать отбеливания биосенсора.
Этот метод визуализации не лишен своих сложностей, и по всему протоколу включено несколько примечаний, которые учитывают устранение неполадок, выполненных во время предыдущих тестов с микроскопом. Например, выбор используемого пластинчатого покрытия зависит от предполагаемого анализа, но рекомендации по наиболее подходящим вариантам для первичных культур астроцитов были включены. Кроме того, получение изображения должно выполняться по крайней мере на 5 клетках на каждое состояние из-за межклеточной изменчивости. Более конкретно, некоторые клетки, выбранные при базовой визуализации, умрут, некоторые выйдут из рамки назначенной области получения изображения, а некоторые изменят свою морфологию, что делает митохондрии очень трудными для индивидуализации при анализе. Визуализация многих клеток с самого начала увеличивает вероятность достаточно большого размера выборки клеток для анализа в конце эксперимента. В дополнение к более сложным аспектам этого метода визуализации, существуют некоторые прямые ограничения в отношении того, кто может извлечь выгоду из этого типа визуализации и анализа. Чтобы в полной мере воспользоваться преимуществами автоматизации получения изображений, используемый микроскоп должен иметь систему автофокусировки, которая может обрабатывать скорость временных интервалов между изображениями (т. Е. Каждые 3 с в этом протоколе) и может последовательно фокусироваться на рассматриваемой ячейке перед каждым снимком. Кроме того, без программного обеспечения JOBS, которое автоматизирует весь процесс получения изображений, этот метод становится трудным и потенциально невозможным в зависимости от количества визуализируемых клеток, поскольку для этого потребуется ручной поиск и визуализация каждой клетки снова в соответствующий момент времени. Наконец, этот метод визуализации не застрахован от проблемы фотоотбеливания. По этой причине, как и при любом долгосрочном методе получения, важно выбирать флуоресцентные маркеры, которые менее восприимчивы к фотоотбеливанию, и адаптировать получение изображения, чтобы избежать этой проблемы, насколько это возможно.
Этот метод отличается от других, используемых в настоящее время решающим образом. В отличие от других покадровых исследований, этот метод не требует визуализации в одном и том же положении в скважине все время, а также не требует ручного движения пластины для изображения других областей. Это позволяет исследователям получать изображения многих клеток во многих условиях за один 24-часовой таймфрейм. Следовательно, способность проводить эту визуализацию и анализ на многих клетках в каждой лунке дает ту же популяционную информацию, которую можно было бы получить от широкого изучения большой группы клеток, дополнительно предоставляя конкретные меры из каждой изображенной клетки. Хотя некоторые особенности этого метода могут не применяться к другим методам получения изображений (описанным выше), преимущества перевешивают сложности с типом анализа, возможные после получения. Этот метод позволяет исследователям увидеть точные последствия различных методов лечения митохондриальной системы и, следовательно, культивируемых астроцитов.
Кроме того, этот метод легко настраивается на множество различных научных вопросов, касающихся митохондриального поведения и ролей в конкретных контекстах. Здесь изложенный протокол касается конкретно культивируемых астроцитов. Тем не менее, многие другие типы клеток могут быть использованы, и методы лечения, которые могут быть протестированы, ограничены только исследуемыми вопросами. Этот тип визуализации имеет потенциал для продвижения коллективных знаний и понимания митохондриального поведения, основных механизмов, которые приводят к митохондриальной дисфункции, и влияния многих патологий на врожденную динамику, присутствующую в различных типах клеток.