RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
В этой статье описывается протокол для определения различий в базальном окислительно-восстановительном состоянии и окислительно-восстановительных реакциях на острые возмущения в первичных нейронах гиппокампа и коры с помощью конфокальной живой микроскопии. Протокол может быть применен к другим типам клеток и микроскопам с минимальными модификациями.
Митохондриальный окислительно-восстановительный гомеостаз важен для жизнеспособности и функции нейронов. Хотя митохондрии содержат несколько окислительно-восстановительных систем, тиолдисульфидный окислительно-восстановительный буферный глутатион считается центральным игроком в антиоксидантной защите. Таким образом, измерение окислительно-восстановительного потенциала митохондрий глутатиона дает полезную информацию о митохондриальном окислительно-восстановительном статусе и окислительном стрессе. Glutaredoxin1-roGFP2 (Grx1-roGFP2) представляет собой генетически закодированный, основанный на зеленом флуоресцентном белке (GFP) ратиометрический индикатор окислительно-восстановительного потенциала глутатиона, который имеет два пика возбуждения, чувствительных к окислительно-восстановительному состоянию, при 400 нм и 490 нм с одним пиком излучения при 510 нм. В этой статье описывается, как выполнить конфокальную живую микроскопию митохондрий, нацеленных на Grx1-roGFP2 в первичных нейронах гиппокампа и коры. В нем описывается, как оценить устойчивый окислительно-восстановительный потенциал митохондриального глутатиона (например, для сравнения болезненных состояний или длительного лечения) и как измерить окислительно-восстановительные изменения при остром лечении (используя экситотоксический препарат N-метил-D-аспартат (NMDA) в качестве примера). Кроме того, в статье представлена совместная визуализация Grx1-roGFP2 и индикатора потенциала митохондриальной мембраны, тетраметилродамина, этилового эфира (TMRE), чтобы продемонстрировать, как Grx1-roGPF2 может быть мультиплексирован с дополнительными показателями для многопараметрического анализа. Этот протокол предоставляет подробное описание того, как (i) оптимизировать настройки конфокального лазерного сканирующего микроскопа, (ii) применять препараты для стимуляции с последующей калибровкой датчиков с диамидом и дитиотрейтолом и (iii) анализировать данные с помощью ImageJ / FIJI.
Несколько важных митохондриальных ферментов и сигнальных молекул подвержены окислительно-восстановительной регуляции тиола1. Кроме того, митохондрии являются основным клеточным источником активных форм кислорода и избирательно уязвимы к окислительному повреждению2. Соответственно, митохондриальный окислительно-восстановительный потенциал напрямую влияет на биоэнергетику, клеточную сигнализацию, митохондриальную функцию и, в конечном счете, жизнеспособность клеток3,4. Митохондриальный матрикс содержит большое количество (1-15 мМ) тиолдисульфидного окислительно-восстановительного буфера глутатиона (GSH) для поддержания окислительно-восстановительного гомеостаза и повышения антиоксидантной защиты5,6. GSH может быть ковалентно присоединен к целевым белкам (S-глутатионилирование) для контроля их окислительно-восстановительного статуса и активности и используется рядом детоксикационных ферментов, которые уменьшают окисленные белки. Поэтому окислительно-восстановительный потенциал митохондрийного глутатиона является высокоинформативным параметром при изучении митохондриальной функции и патофизиологии.
roGFP2 является вариантом GFP, который был сделан окислительно-чувствительным путем добавления двух поверхностно-открытых цистеинов, которые образуют искусственную пару дитиол-дисульфид7,8. Он имеет один пик излучения при ~ 510 нм и два пика возбуждения при ~ 400 нм и 490 нм. Важно отметить, что относительные амплитуды двух пиков возбуждения зависят от окислительно-восстановительного состояния roGFP2 (рисунок 1), что делает этот белок ратиометрическим датчиком. В датчике Grx1-roGFP2 человеческий глутаредоксин-1 (Grx1) был сплавлен с N-концом roGFP29,10. Ковалентное присоединение фермента Grx1 к roGFP2 обеспечивает два основных улучшения датчика: он делает отклик датчика специфичным для окислительно-восстановительной пары глутатиона GSH / GSSG (рисунок 1) и ускоряет эквивалентность между GSSG и roGFP2 в 100 0009 раз. Таким образом, Grx1-roGFP2 обеспечивает специфическую и динамическую визуализацию окислительно-восстановительного потенциала клеточного глутатиона.
Визуализация Grx1-roGFP2 может быть выполнена на широком спектре микроскопов, включая широкоугольные флуоресцентные микроскопы, вращающиеся дисковые конфокальные микроскопы и лазерные сканирующие конфокальные микроскопы. Экспрессия датчика в первичных нейронах может быть достигнута различными методами, которые включают липофекцию11, сопреципитацию ДНК/кальций-фосфат12, опосредованный вирусом перенос генов или использование трансгенных животных в качестве источника клеток (рисунок 2). Псевдотипизированные рекомбинантные аденоассоциированные вирусы (rAAV), содержащие соотношение 1:1 AAV1 и AAV2 капсидных белков 13,14, были использованы для экспериментов в этой статье. При этом векторе максимальная экспрессия датчиков обычно достигается через 4-5 дней после заражения и остается стабильной в течение не менее двух недель. Мы успешно использовали Grx1-roGFP2 в первичных нейронах гиппокампа и коры мышей и крыс.
В этой статье rAAV-опосредованная экспрессия митохондрий-таргетного Grx1-roGFP2 в первичных нейронах гиппокампа и коры крыс используется для оценки базального митохондриального окислительно-восстановительного состояния глутатиона и его острого возмущения. Для конфокальной визуализации в реальном времени предоставляется протокол с подробными инструкциями о том, как (i) оптимизировать настройки лазерного сканирования конфокального микроскопа, (ii) провести эксперимент по визуализации в реальном времени и (iii) проанализировать данные с помощью FIJI.
Все эксперименты на животных соответствовали национальным и институциональным руководящим принципам, включая Директиву Совета 2010/63/ЕС Европейского парламента, и имели полное этическое одобрение Министерства внутренних дел (Управление по защите животных Гейдельбергского университета и Regierungspraesidium Karlsruhe, лицензии T14/21 и T13/21). Первичные нейроны гиппокампа и коры были получены из новорожденных детенышей мышей или крыс в соответствии со стандартными процедурами и поддерживались в течение 12-14 дней, как описано ранее13.
1. Приготовление растворов
| Компонент | МВТ | Концентрация (М) | Количество (г) | Объем (мл) |
| НаКл | 58.44 | 5 | 14.61 | 50 |
| ККл | 74.55 | 3 | 1.12 | 5 |
| МгCl2· 6Н2О | 203.3 | 1.9 | 2 | 5 |
| CaCl2·2H2O | 147.01 | 1 | 1.47 | 10 |
| Глицин | 75.07 | 0.1 | 0.375 | 50 |
| Сахароза | 342.3 | 1.5 | 25.67 | 50 |
| Пируват натрия | 110.04 | 0.1 | 0.55 | 50 |
| ХЕПЕС | 238.3 | 1 | 11.9 | 50 |
| Глюкоза | 180.15 | 2.5 | 45 | 100 |
Таблица 1: Стандартные решения для буфера изображений.
| Компонент | Складское решение (M) | Конечная концентрация (мМ) | Объем (мл) |
| НаКл | 5 | 114 | 2.3 |
| ККл | 3 | 5.29 | 0.176 |
| МгCl2 | 1.9 | 1 | 0.053 |
| КаCl2 | 1 | 2 | 0.2 |
| Глицин | 0.1 | 0.005 | 0.005 |
| Сахароза | 1.5 | 52 | 3.5 |
| Пируват натрия | 0.1 | 0.5 | 0.5 |
| ХЕПЕС | 1 | 10 | 1 |
| Глюкоза | 2.5 | 5 | 0.2 |
Таблица 2: Состав буфера визуализации. Указанные объемы используются для приготовления 100 мл буфера визуализации.
2. Загрузка ячеек TMRE
ПРИМЕЧАНИЕ: В этом протоколе TMRE используется в режиме без закалки15 при конечной концентрации 20 нМ. В общем, следует использовать минимально возможную концентрацию TMRE, которая по-прежнему обеспечивает достаточную интенсивность сигнала на микроскопе по выбору. Из-за неравномерного испарения объем среды в разных скважинах может отличаться в многолетних первичных культурах. Чтобы обеспечить стабильную концентрацию TMRE во всех скважинах, не добавляйте TMRE непосредственно в скважины. Вместо этого замените среду в каждой скважине таким же количеством среды, содержащей TMRE. Приведенный ниже протокол предназначен для первичных нейронов в 24-луночных пластинах, содержащих ~1 мл среды на лунку.
3. Оптимизация настроек сканирующего конфокального микроскопа
ПРИМЕЧАНИЕ: Этот шаг направлен на поиск наилучшего компромисса между качеством изображения и жизнеспособностью клеток во время живой визуализации. В этом разделе описывается оптимизация параметров для создания образов roGFP. При проведении многопараметрической визуализации для дополнительных показателей необходимо выполнить аналогичную оптимизацию, включая проверку стабильного исходного уровня без признаков отбеливания или фототоксичности.
4. Оценка базального окислительно-восстановительного статуса
5. Живая визуализация острых методов лечения
ПРИМЕЧАНИЕ: Протокол ниже описывает визуализацию митохондриального окислительно-восстановительного ответа на лечение NMDA. Интервалы изображения и продолжительность эксперимента, возможно, потребуется скорректировать для других методов лечения.
6. Анализ данных

Количественная оценка различий в стационарном окислительно-восстановительном состоянии митохондрий после отмены фактора роста
Чтобы продемонстрировать количественную оценку стационарных различий в митохондриальном окислительно-восстановительном состоянии, первичные нейроны, выращенные в стандартной среде, сравнивали с нейронами, культивируемыми без факторов роста в течение 48 ч до визуализации. Отмена фактора роста приводит к гибели апоптотических нейрональных клеток после 72 h16. Клетки были визуализированы через 48 часов, чтобы проверить, предшествуют ли этому изменения в окислительно-восстановительном состоянии митохондрий. Первичные корковые нейроны крыс, выращенные на покрытых поли-L-орнитином покровах, были инфицированы rAAV-mito-Grx1-roGFP2 в дни in vitro 6 (DIV6) и были изображены на DIV12. Живая визуализация выполнялась при комнатной температуре в соответствии с разделом 4 этого протокола на инвертированном лазерном сканирующем конфокальном микроскопе, оснащенном водомерным объективом 40x/1.10. Конфокальными настройками были точечное отверстие 7 воздушных блоков, размер пикселя 568,7 нм (512 x 512 пикселей), скорость сканирования 600 Гц, мощность лазера 405 нм 3%, мощность лазера 488 нм 1%, полоса пропускания излучения 505-550 нм и среднее значение кадра 4. Не было никакой существенной разницы между необработанными соотношениями 405:488 нм двух условий (рисунок 3B). После нормализации данных в группе изъятия фактора роста было обнаружено подмножество клеток с повышенным соотношением 405:488 нм (рисунок 3C). Это указывает на то, что митохондриальные окислительно-восстановительные изменения могут предшествовать гибели нейронных клеток, и подчеркивает актуальность нормализации данных max/min для сравнения базальных окислительно-восстановительных состояний между группами.
Динамические изменения окислительно-восстановительного состояния митохондрий при лечении нейронов NMDA
Рецептор глутамата NMDA-типа (NMDAR) играет центральную роль в пластичности нейронов, но также может опосредуть повреждение нейронов и гибель клеток. Патологическая активация NMDAR приводит к нескольким неблагоприятным последствиям для митохондрий, которые включают перегрузку матричного кальция, митохондриальное окисление и фрагментацию, а также переход проницаемости митохондрий. В предыдущем исследовании вышеописанный протокол использовался для изучения причинно-следственной связи между NMDA-индуцированной перегрузкой митохондриального кальция и митохондриальным окислением13. Первичные нейроны гиппокампа крыс, выращенные на покрытых поли-D-лизином/ламинином покровах, были инфицированы rAAV-mito-Grx1-roGFP2 на DIV4 и изображены на DIV12. Живая визуализация выполнялась при 37 °C на инвертированном конфокальном микроскопе со вращающимся диском, оснащенном многоступенчатым объективом 20x/0.75 (использовалось погружение в воду) и системой инкубации на сцене. Mito-Grx1-roGFP2 последовательно возбуждался каждые 20 с с использованием лазерных линий 405 нм и 488 нм, а излучение собиралось с помощью эмиссионного фильтра 527/55 нм для обеих длин волн возбуждения. Лечение нейронов с NMDA 30 мкМ вызывало окисление митохондрий в течение нескольких минут (рисунок 4A,B). Примечательно, что NMDA-индуцированный митохондриальный ацидоз вызвал значительное гашение флуоресценции roGFP2 в соответствии с его хорошо известной pH-чувствительностью8. Чтобы подтвердить, что это pH-зависимое закалка не повлияло на соотношение 405:4889, митохондрии были полностью окислены DA до добавления NMDA в контрольном эксперименте. Предварительная обработка DA исключает дальнейшее окисление митохондрий NMDA и, соответственно, соотношение 405:488 не изменилось в этом эксперименте, несмотря на значительное гашение интенсивности флуоресценции roGFP2 (рисунок 4C).
Многопараметрический анализ NMDA-индуцированных изменений дендритных митохондрий
Для оценки временной последовательности NMDA-индуцированных изменений митохондриальной морфологии, мембранного потенциала и окислительно-восстановительного состояния была выполнена параллельная визуализация флуоресценции TMRE- и mito-Grx1-roGFP2 с высоким пространственным и временным разрешением. Первичные корковые нейроны крыс, выращенные на покрытых поли-L-орнитином покровах, были инфицированы rAAV-mito-Grx1-roGFP2 на DIV6 и изображены на DIV12. Живая визуализация выполнялась при комнатной температуре на инвертированном конфокальном лазерном сканирующем микроскопе с использованием масляного иммерсионного объектива 63x/1.40, скорости сканирования 600 Гц, размера пикселя 90,2 нм (1024 x 1024 пикселей при 2-кратном зуме сканирования), размера точечного отверстия 3 воздушных единиц и среднего кадра 2. Каждые 30 с записывались три изображения в последовательном режиме: возбуждение 405 нм/излучение 505-550 нм; возбуждение 488 нм/излучение 505-550 нм; Возбуждение 552 нм/эмиссия 560-600 нм. Лечение нейронов с NMDA 60 мкМ привело к потере сигнала TMRE и увеличению соотношения roGFP 405:488 нм, за которым последовало некоторое отсроченное округление митохондрий (рисунок 5).

Рисунок 1: Схематическое изображение функции Grx1-roGFP2 и спектров возбуждения roGFP2. (A) Окислительный стресс и действие систем антиоксидантной защиты окисляют клеточный пул глутатионов. Grx1 в слиянии белка Grx1-roGPF2 способствует быстрому уравновешиванию окислительно-восстановительного состояния roGFP2 с окислительно-восстановительным состоянием пула глутатионов. Окислительно-восстановительное состояние пула roGFP2 можно оценить путем мониторинга соотношения GFP-флуоресцентного излучения при 510 нм после возбуждения при 405 нм и 488 нм. Редуцированные виды показаны синим цветом; окисленные виды показаны красным цветом. (B) Спектры возбуждения полностью восстановленного (синего) и окисленного (красный) roGFP2. При окислении roGFP2 флуоресцентное излучение при возбуждении 400 нм увеличивается, тогда как излучение при возбуждении 490 нм уменьшается. Эта цифра была изменена по сравнению с предыдущей публикацией13. Спектры возбуждения в B были нарисованы на основе рисунка 1B из 8. Пунктирные линии в B указывают на длины волн обычно используемых лазерных линий 405 нм и 488 нм. Сокращения: GSH = глутатион; GSSG = окисленный глутатион; Grx = глутаредоксин; roGFP = окислительно-чувствительный зеленый флуоресцентный вариант белка. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Рабочий процесс метода. Экспрессия возбуждающе-ратиометрического окислительно-чувствительного флуоресцентного белка roGFP2 в нейронах может быть достигнута с помощью нескольких методов, которые включают трансфекцию, липофекцию, перенос вирусных генов и трансгенных животных. Датчик может быть использован для изучения окислительно-восстановительного состояния нейронов у культивируемых первичных нейронов, эксплантов ex vivo тканей и интактных животных. Визуализация roGFP2 может быть выполнена на различных микроскопах, которые включают широкоугольные флуоресцентные микроскопы, конфокальные микроскопы и 2-фотонные микроскопы. Анализ данных изображений roGFP2 может быть выполнен с помощью свободно доступного программного обеспечения ImageJ/FIJI. Аббревиатура: roGFP = окислительно-чувствительный зеленый флуоресцентный вариант белка. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Изъятие фактора роста вызывает окисление нейронных митохондрий. (A) Репрезентативное соотношение 405:488 нм изображений нейронов, культивируемых в присутствии (+ GF) или отсутствии (- GF) факторов роста в течение 48 ч до визуализации. Шкалы с цветовой кодировкой представляют собой ненормализованные соотношения 405:488 нм (более низкие соотношения соответствуют уменьшенному состоянию; более высокие соотношения соответствуют окисленному состоянию). Шкала баров = 50 мкм. (B) Количественная оценка соотношения 405:488 нм в отдельных нейронах. (C) Макс/мин калиброванное соотношение 405:488 нм для отдельных нейронов. Круглые символы представляют собой одиночные ячейки; bar представляет собой среднее значение. N = 40-44 клетки из 3 покровов одного препарата. Аббревиатура: GF = фактор роста. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4: NMDA-индуцированное окисление нейрональных митохондрий. (A) Репрезентативные изображения с соотношением 405:488 нм до и после обработки 30 мкМ NMDA и после максимальной/минимальной калибровки с DA и DTT. При этом увеличении сигнал roGFP в основном обнаруживается в соме и проксимальных дендритах. Шкала с цветовой кодировкой представляет собой ненормализованные соотношения 405:488 нм (более низкие соотношения соответствуют уменьшенному состоянию; более высокие соотношения соответствуют окисленному состоянию). Шкала баров = 50 мкм. (B) Количественная оценка пробега изображения, показанного в A. NMDA индуцирует быстрое и устойчивое митохондриальное окисление, которое может быть откалибровано с использованием DA и DTT. (C) NMDA-индуцированный митохондриальный ацидоз вызывает падение флуоресценции GFP при возбуждении как 405 нм, так и 488 нм (верхняя панель). Чтобы изолировать эффект, управляемый pH, и подтвердить, что соотношение 405:488 нм нечувствительно к pH, нейроны сначала максимально окислялись с использованием DA, а затем оспаривались NMDA в присутствии DA (нижняя панель). В этих условиях NMDA все еще вызывает митохондриальный ацидоз, но не дальнейшее митохондриальное окисление. Соответственно, хотя следы 405 нм и 488 нм показывают снижение интенсивности флуоресценции, вызванное pH, соотношение 405: 488 нм остается стабильным. Эта цифра изменена с 13. Сокращения: GFP = зеленый флуоресцентный белок; roGFP = окислительно-чувствительный зеленый флуоресцентный вариант белка; NMDA = N-метил-D-аспартат; DA = диамид; DTT = дитиотрейтол. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 5: NMDA-индуцированные изменения мембранного потенциала, окислительно-восстановительного состояния и морфологии дендритных митохондрий. (A) Три изображения с высоким увеличением из покадрового эксперимента, полученные при t = 1, 4 и 9 мин, показывающие дендритные и аксональные митохондрии. Окрашивание представляет интенсивность TMRE (см. калибровочный бар). (B) Изображения с соотношением roGFP 405:488 нм из того же покадрового эксперимента, что и в (A) при t = 1, 4 и 9 мин. Обратите внимание, что из-за ограниченной эффективности заражения AAV только подмножество нейронов экспрессирует mito-Grx1-roGFP2, и, следовательно, не все TMRE-положительные митохондрии являются roGFP-положительными. Калибровочный стержень с цветовой кодировкой представляет собой ненормализованные соотношения 405:488 нм (более низкие соотношения соответствуют уменьшенному состоянию; более высокие соотношения соответствуют окисленному состоянию). (C) Количественная оценка интенсивности TMRE, соотношения roGFP 405:488 нм и округлости одной митохондрии (обозначена стрелками в A, B). После 1 мин базовой записи к раствору ванны добавляли 60 мкМ NMDA. Шкала стержней = 5 мкм. Ось Y в C отображает отношение roGFP 405:488 нм относительно базового уровня T0 (зеленая пунктирная линия), интенсивность флуоресценции TMRE относительно базовой линии T0 (красная пунктирная линия) и дескриптор формы FIJI/ImageJ «округлость» (черная сплошная линия). Сокращения: GFP = roGFP = окислительно-чувствительный зеленый флуоресцентный вариант белка; mito-Grx1-roGFP2 = Глутаредоксин-1, сплавленный с N-концом roGFP; AAV = аденоассоциированный вирус; TMRE = тетраметилродамин, этиловый эфир; NMDA = N-метил-D-аспартат. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Авторы заявляют, что у них нет конфликта интересов.
В этой статье описывается протокол для определения различий в базальном окислительно-восстановительном состоянии и окислительно-восстановительных реакциях на острые возмущения в первичных нейронах гиппокампа и коры с помощью конфокальной живой микроскопии. Протокол может быть применен к другим типам клеток и микроскопам с минимальными модификациями.
Эта работа была поддержана Deutsche Forschungsgemeinschaft (BA 3679/5-1; ДЛЯ 2289: БА 3679/4-2). A.K. поддерживается стипендией ERASMUS+. Мы благодарим Айрис Бюнцли-Эрет, Риту Рознер и Андреа Шликсупп за подготовку первичных нейронов. Мы благодарим д-ра Тобиаса Дика за предоставление pLPCX-mito-Grx1-roGFP2. Эксперименты, показанные на рисунке 4 , были проведены в Центре визуализации Nikon Гейдельбергского университета. Рисунок 2 был подготовлен вместе с BioRender.com.
| <сильно>реагентысильно> | |||
| хлорид кальция (CaCl2· 2H2O) | Sigma-Aldrich | C3306 | |
| Diamide (DA) | Sigma-Aldrich | D3648 | |
| Dithiothreitol (DTT) | Carl Roth GmbH | 6908.1 | |
| Глюкоза (2,5 М стоковый раствор) | Sigma-Aldrich | G8769 | |
| Глюкоза | Sigma-Aldrich | G7528 | |
| Glycine | neoFroxx GmbH | LC-4522.2 | |
| HEPES (1 М стоковый раствор) | Sigma-Aldrich | 15630-080 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H4034 | |
| Хлорид магния (MgCl2· 6H2O) | Sigma-Aldrich | 442611-M | |
| N-метил-D-аспартат (NMDA) | Sigma-Aldrich | M3262 | |
| Хлорид калия (KCl) | Sigma-Aldrich | P3911 | |
| Хлорид натрия (NaCl) | neoFroxx GmbH | LC-5932.1 | |
| Пируват натрия (0,1 М стоковый раствор) | Sigma-Aldrich | S8636 | |
| Пируват натрия | Sigma-Aldrich | P8574 | |
| Сахароза | Carl Roth GmbH | 4621.1 | |
| Тетраметилродамин этиловый эфир перхлорат (TMRE) | Sigma-Aldrich | 87917 | |
| equipment | |||
| imaging камера | Life Imaging Services (Базель, Швейцария) | 10920 | Ludin Chamber Type 3 для & Ослаш; 12 мм покровные стекла лазерный |
| сканирующий конфокальный микроскоп, микроскоп | Leica | DMI6000 | |
| лазерный сканирующий конфокальный микроскоп, сканирующий блок | Leica | SP8 | |
| перистальтический насос | VWR | PP1080 181-4001 | |
| вращающийся диск конфокальный микроскоп, камера | Hamamatsu | C9100-02 EMCCD | |
| вращающийся диск конфокальный микроскоп, инкубационная система | TokaiHit | INU-ZILCF-F1 | |
| вращающийся диск конфокальный микроскоп, микроскоп | Nikon | Ti микроскоп | |
| вращающийся диск конфокальный микроскоп, сканирующий блок | Yokagawa | CSU-X1 | |
| software | |||
| FIJI | https://fiji.sc | ||
| плагин StackReg | https://github.com/fiji-BIG/StackReg/blob/master/src/main/java/StackReg_.java | ||
| Плагин | TurboReg | https://github.com/fiji-BIG/TurboReg/blob/master/src/main/java/TurboReg_.java |