| Оборудование и расходные материалы: | | | |
| Breed боксы | Aquaneering | ZHCT100 | |
| высоковакуумной смазкой Dow Corning | Sigma или эквивалентным поставщиком | Z273554 | |
| колбами Эрленмейера (125 мл) | | | Для изготовления модифицированных колб Marc's Ringer (MMR) с антибиотиками для послеоперационной инкубации. |
| Тонкие щипцы - Dumont #5 | Fine Science Tools (FST) | 11252-20 | |
| Стеклянные пипетки Пастера | DWK Lifescience | 63A53 & 63A53WT | Для пипетирования эмбрионов и личинок. |
| Стеклянные предметные стекла для микроскопии | VWR или аналогичного поставщика | 48311-703 | Стандартные стеклянные предметные стекла для микроскопа можно заказать у многих различных поставщиков лабораторий. |
| Стеклянная посуда, включая градуированные бутылки и градуированные цилиндры, | | | для приготовления и хранения растворов. |
| 2-компонентный эпоксидный смола | ACE Hardware или другой эквивалентный поставщик клея Gorilla или эквивалентный | шприц 0,85 унции | https://www.acehardware.com/departments/paint-and-supplies/tape-glues-and-adhesives/glues-and-epoxy/1590793 |
| микроцентрифужной трубке (1,7 мл) | VWR или эквивалентный поставщик | 22234-046 | |
| Никелированный держатель штифта (длина 17 см) | Fine Science Tools (FST) | 26018-17 | Для удержания вольфрамовой проволоки во время заточки и выполнения операций/вскрытий. |
| Нейлоновое сетчатое ситечко для чая или эквивалент | Ali Express или эквивалент | | для сбора икры данио рерио после нереста; https://www.aliexpress.com/item/1005002219569756.html |
| Скрепка | | | для устройства для заточки вольфрамовых игл. |
| Чашки Петри 100 мм | Fischer Scientific или эквивалент поставщика | 50-190-0267 | |
| Чашки Петри 35 мм | Fischer Scientific или эквивалентный поставщик | 08-757-100A | |
| Дозатор | SP Bel-Art или эквивалент | F37898-0000 | |
| Гидроксид калия (KOH) | Sigma | 909122 | Для устройства для заточки вольфрамовых игл. Приготовьте 10% w/v раствор KOH в вытяжке, добавив гранулы в деионизированную воду. |
| Источник питания (переменное напряжение) | | | Для устройства для заточки вольфрамовых игл. Подойдет любой источник питания с переменным напряжением (даже тот, который используется для гелевого электрофореза). |
| Sylgard 184 Набор эластомеров | Dow Corning | 3097358 | |
| Вольфрамовая проволока (диаметр 0,125 мм) | World Precision Instruments (WPI) | TGW0515 | Заточка для удаления глаз и препарирования личинок. |
| Термоблок с регулируемой температурой | Лабораторный склад или эквивалентный поставщик | BSH1001 или BSH1002 | Установлено на 40-42 ° C опережает эксперименты. |
| Стеклянная банка с широким горлышком и крышкой (например, чистая банка из-под варенья или сальсы) | | | Для устройства для заточки вольфрамовых игл. |
| Провода с зажимом из кожи аллигатора Для | | | устройства для заточки вольфрамовых игл |
| <сильно>микроскопы: | | | |
| Препарирующий микроскоп | | | Подойдет любой тип, но предпочтительнее иметь регулируемый проходящий свет на зеркальном основании. |
| Рекомендуется лазерный сканирующий конфокальный микроскоп | | | High NA, 20-25-кратный объектив с погружением в воду. Здесь используется программное обеспечение для управления микроскопом и захвата изображений (NIS-Elements от Nikon), но подойдет любой конфокальный микроскоп. |
| <сильно>реагенты для операций и вскрытий: | | | |
| дигидрат хлорида кальция | Sigma | C7902 | для модифицированных рингеров Марка (MMR) и эмбриональной среды (E3). |
| HEPES | Sigma | H7006 | для модифицированных звонков Марка (MMR). |
| Низкая температура плавления агарозы | Invitrogen | 16520-050 | Сделайте 1% в среде эмбриона (E3) или Marc's Modified Ringers (MMR). |
| Магния хлорид гексагидрат | Sigma | 1374248 | Для эмбриональной среды (Е3). |
| Сульфат магния | Sigma | M7506 | для модифицированных рингеров Марка (MMR). |
| Параформальдегидная | электронная микроскопия Sciences | 19210 | Разбавить 8% (w/v) запас с 2x концентрированным PBS (разбавленным из 10x PBS запаса). |
| Пенициллин/стрептомицин | Sigma | P4333-20ML | Разведите 1:100 в модифицированных колпачках Marc's. |
| Фосфатно-солевой буфер (PBS) таблетки | Diagnostic BioSystems | DMR E404-01 | Сделать 10-кратный запас в деионизированной воде, автоклаве и хранить при комнатной температуре. Разбавьте до 1x рабочей концентрации. |
| Хлорид калия | Sigma | P3911 | для модифицированных кольцевых колец Марка (MMR) и эмбриональной среды (E3). |
| Хлорид натрия | Sigma | S9888 | для модифицированных Ringers Marc (MMR) и эмбриональной среды (E3). |
| Гидроксид натрия | Sigma | S5881 | Make 10 M и использовать для регулировки pH MMR до 7,4. |
| Сахароза | | Sigma S9378 | |
| Tricaine-S | Pentair | 100G #TRS1 | рецепт: https://zfin.atlassian.net/wiki/spaces/prot/pages/362220023/TRICAINE |
| Реагенты для иммуногистохимии: | | | |
| Alexafluor 568 помечено Вторичное антитело для обнаружения кролика IgG | Invitrogen | A-11011 | Использование при разведении 1:500 для целого иммуногистохимия. |
| DAPI или ToPro3 | Invitrogen | 1306 или T3605 | Составлять 1 мг/мл растворов в ДМСО; разведение 1:5000 для противоокрашивания. |
| Диметилсульфоксид (ДМСО) | Sigma | D8418 | Компонент иммуноблочного буфера. |
| Метанол (MeOH) | Sigma | 34860 | Смешивание MeOH с водными растворами, такими как PBST, является экзотермическим. Приготовьте растворы MeOH/PBST как минимум за несколько часов до начала использования или охладите их на льду перед использованием. |
| Нормальная козья сыворотка | ThermoFisher Scientific | 50-062Z | Компонент иммуноблок-буфера. Может быть аликвотирован в объемах 1-10 мл и храниться при температуре -20 °C. |
| Первичное антитело для обнаружения фосфогистона H3 | Millipore | 06-570 | Используйте в разведении 1:300 для полной иммуногистохимии. |
| Первичное антитело для обнаружения красного флуоресцентного белка (RFP; обнаруживает производные dsRed) | MBL International | PM005 | Используйте в разведении 1:500 для иммуногистохимии в масштабе 1:500. |
| Протеиназа K (PK) | Sigma | P2308-10MG | Составлять 10 мг/мл стоковых растворов в PBS и использовать при 10 & микро; г/мл. |
| Triton X-100 | Sigma | T8787 | Полезно для приготовления 20% (v/v) стокового раствора в PBS. |
| Software для анализа данных | | | |
| ImageJ (Fiji) | | | Бесплатное программное обеспечение для анализа изображений; https://imagej.net/software/fiji/ |
| RStudio | | | Freeware для статистического анализа и визуализации данных; https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/ |
| Adobe Photoshop или GIMP | | | Для компоновки фигур часто используются фирменные программы для обработки изображений (Adobe Photoshop и Illustrator). Бесплатной альтернативой является Gnu Image Manipulation Program (GIMP; https://www.gimp.org/) |
| Zebrafish strains. В этом исследовании использовались штаммы AB, TU, Tg[atoh7:RFP]. | | | Доступно из Международные ресурсные центры по данио-рерио в США (https://zebrafish.org/home/guide.php) или в Европе (https://www.ezrc.kit.edu/). Специализированные трансгенные штаммы, которые еще не были депонированы ни в одном из ресурсных центров, могут быть запрошены в отдельных лабораториях после публикации. |