$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Измененный ответ на левамизол может идентифицировать гены, необходимые для постсинаптической холинергической сигнализации и мышечной функции. Протокол здесь описывает жидкий анализ левамизола, используемый для количественного определения зависимого от времени паралича в течение 1-часового периода времени. Студенты делают прогнозы о влиянии определенных генетических мутаций, проводят эксперимент с большим размером выборки, а затем количественно оценивают свои результаты. Этот анализ является простым и эффективным способом количественной оценки паралича, вызванного левамизолом, без отбора или подталкивания животных, что делает его подходящим для лабораторий бакалавриата, а также исследователей, изучающих нервно-мышечную передачу. Здесь обсуждаются некоторые из наиболее распространенных ловушек, ограничения анализа и вариация протокола, которая позволяет использовать его с животными RNAi; Здесь также обсуждается, как этот анализ может быть встроен в исследовательский опыт бакалавриата на основе курса.
Правильная подготовка плит из 24 скважин имеет важное значение. Во-первых, бактериальные газоны должны быть полностью сухими, прежде чем обнаружить животных L1 в колодцах. Если бактерии недостаточно высушены, они смешиваются с раствором левамизола во время анализа, превращая жидкость в мутную и не позволяя людям подсчитывать червей. Во-вторых, при синхронизации червей через подготовку отбеливателя животные не должны подвергаться воздействию раствора отбеливателя слишком долго, так как это приведет к распаду защитного покрытия на яйцах. В-третьих, крайне важно обнаружить только 20-30 L1s на скважину, так как слишком много червей в скважинах чрезвычайно затрудняет точный подсчет количества движущихся в отведенное время. Наконец, важно поддерживать асептическую технику во время подготовки пластин, так как загрязненные колодцы не могут быть проанализированы.
Есть несколько ограничений, которые необходимо учитывать при выполнении этого анализа. Во-первых, подсчет количества движущихся червей в каждой скважине каждые 5 минут может быть ошеломляющим для людей, у которых нет предыдущего лабораторного опыта, и это может привести к неточному сбору данных. Что касается других анализов, используемых для определения чувствительности к лекарственным средствам18,19, то этот эксперимент может быть выполнен с меньшим количеством временных точек. Во-вторых, покрытие голодающих L1, выделенных из отбеливателя, является простым методом получения синхронизированной популяции; однако необходимо внести коррективы, если сроки развития различаются между анализируемыми штаммами. Для этого анализа можно собрать животных поздней четвертой личиночной стадии (L4s) в 24-луночную пластину; однако при приготовлении многих тарелок это слишком трудоемко. В качестве альтернативы следует определить продолжительность времени, необходимого для достижения каждой деформацией L4, а затем поместить L1s в скважины в разное время, чтобы скорректировать различия в скорости созревания. Наконец, хотя этот анализ может быть использован для идентификации новых генов, важных для постсинаптической мышечной функции11, измененный ответ левамизола также может быть вызван мутацией или нокдауном RNAi пресинаптических генов12. Если наблюдается измененная чувствительность к левамизолу, необходимо провести дополнительные эксперименты для определения причины этого фенотипа.
Внеся несколько модификаций в 24-луночные пластины, описанный плавательный анализ левамизола также может быть выполнен на RNAi нокдаун животных11. Нокдаун гена через RNAi может быть достигнут путем питания бактерий C. elegans , которые экспрессируют двухцепочечную РНК, соответствующую интересующему гену20. Для приготовления пластин РНКи необходимо добавить 1 мл 1М ИПТГ и 1 мл 25 мг/мл карбенициллина на литр среды после удаления из автоклава. Бактериальные культуры выращивают путем сбора одной колонии в 3 мл бульона LB плюс 3 мкл 25 мг / млкарбенициллина и встряхивания при 37 ° C в течение ночи, и карта пластин составляется, когда различные бактерии обнаруживаются в колодцах. C. elegans синхронизируются путем подготовки отбеливателя, как описано; однако гиперчувствительный штамм RNAi eri-1(mg366) следует использовать вместо дикого типа для увеличения нокдауна генов. Нокдауны РНКи приводят к тем же фенотипам левамизола, которые наблюдаются у мутантов с потерей функции11.
Протокол, представленный здесь, может быть использован в лабораторных исследованиях, в качестве самостоятельного эксперимента в лаборатории бакалавриата или в первые недели продвинутого курса бакалавриата в качестве введения в основные методы C. elegans и нервно-мышечную функцию. В более продвинутом курсе, основанном на открытиях, студенты могут использовать этот анализ, чтобы определить, изменяет ли потеря C. elegans гомологов генов, мутировавших у людей с миастеническими синдромами, мышечными дистрофиями или миопатиями, чувствительность к левамизолам. В заключение, этот простой, недорогой анализ чувствительности левамизола обеспечивает практический подход к изучению сигнализации в NMJ и получению опыта работы с модельной системой C. elegans .