С помощью этих методов были визуализированы редкие популяции эпителиальных клеток в крови и костном мозге нормальных людей и мышей. При надлежащей компенсации и контроле, как описано, результаты, которые последовательно показали, что 4-5% клеток в костном мозге мыши были EpCAM +, независимо от того, сколько клеток было подсчитано, как показано на рисунке 4 и рисунке 5. В образцах крови мышей менее 0,5% клеток были EpCAM+, как показано на рисунке 6. В образцах костного мозга человека 2-5% клеток были EpCAM+, как показано на рисунках 7 и 8. В то время как 2-5% - это большой диапазон, проценты в каждом отдельном доноре были постоянными, поскольку подсчитывалось все больше клеток. В образцах крови человека около 0,3% клеток были EpCAM+, как показано на рисунке 9. Наши контрольные образцы (без окрашивания, контроль изотипа и FMO) дали очень мало ложноположительных результатов EpCAM+, как показано на рисунках 4 и 7. Клетки из групп EpCAM+ и EpCAM-, которые были отсортированы по предметным стеклам, показали положительное окрашивание на пан-цитокератин в образцах EpCAM+ и были отрицательными на пан-цитокератин в образцах EpCAM-, как показано на рисунке 10. Эти результаты указывают на то, что эксперименты были надлежащим образом спланированы и воспроизводимы.

Рисунок 1: Трансгенные мыши Krt14Cre;mTmG с постепенным подсчетом костного мозга. Костный мозг мышей Krt1-14;mTmG подсчитывали постепенно. GFP-положительные клетки указывают на экспрессию кератина 14 и были идентифицированы с помощью проточной цитометрии. По мере того, как подсчитывалось больше клеток костного мозга, эта кератиновая 14-положительная клеточная популяция была более легко идентифицирована. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Рабочий процесс для клеток EpCAM+ и цитокератина+. Клетки костного мозга и крови были сначала отсортированы с использованием флуоресцентной активированной клеточной сортировки (FACS) для разделения EpCAM+ и EpCAM-клеток. Эти клетки были отсортированы по двум разным пробиркам, а также по двум разным предметным стеклам. Клетки, отсортированные по пробиркам, были раскручены на предметных стеклах с помощью цитоцентрифуги. Затем предметные стекла окрашивали с использованием первичного антитела пан-цитокератина, а затем окрашивали вторичным антителом. Предметные стекла были проанализированы с помощью флуоресцентной микроскопии для наблюдения экспрессии панцитокератина. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Программное обеспечение для анализа проточной цитометрии. При анализе данных проточной цитометрии с использованием аналитического программного обеспечения для выбора интересующих клеток используется контроль отсутствия пятен. Клетки сначала отбираются с помощью SSC-A и FSC-A, которые показывают внутреннюю сложность и размер клеток. (A) Вокруг ячеек нарисованы многоугольники. (B) Одиночные клетки приобретаются путем стробирования SSC-A с помощью SSC-W. (C) Живые клетки приобретаются путем стробирования FSC-A по сравнению с DAPI. (D) Отрицательные клетки EpCAM исключаются путем стробирования справа от отрицательных клеток EpCAM. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4: Проточный цитометрический анализ клеток EpCAM+ в костном мозге мыши. Элементы управления без окрашивания, изотипа и FMO показаны на верхней панели, а добавочные счетчики 50 000, 100 000 и 500 000 ячеек показаны на нижней панели. Эти диаграммы визуализируют согласованность в процентах по счетчикам, несмотря на общее увеличение общего количества подсчитанных ячеек. Панели справа указывают на стратегию стробирования, как обсуждалось ранее в разделе анализа проточной цитометрии и как показано на рисунке 3. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 5: Клетки EpCAM+ в костном мозге мыши составляют 5,17% ± 0,001% населения. Были проанализированы клетки костного мозга трех отдельных мышей. Соответствующие средства контроля были включены для надлежащей научной строгости. Процент положительных клеток оставался неизменным во всех образцах из-за того, что мыши были генетически идентичны. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 6: Клетки EpCAM+ в крови мышей составляют 0,45% ± 0,0006% населения. Были проанализированы клетки крови двух отдельных мышей. Контрольные испытания были включены, чтобы показать, что для получения окончательных результатов была соблюдена надлежащая процедура. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 7: Проточный цитометрический анализ костного мозга человека EpCAM+. Элементы управления без окрашивания, изотипа и FMO отображаются на верхней панели, а добавочные счетчики 50 000, 100 000 и 500 000 ячеек отображаются на нижней панели. Эти диаграммы визуализируют согласованность в процентах по подсчетам, несмотря на общее увеличение общего количества подсчитанных ячеек. Панели справа указывают на стратегию стробирования, как обсуждалось ранее в разделе анализа проточной цитометрии и как показано на рисунке 3. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 8: Клетки EpCAM+ в костном мозге человека составляют 3,53% ± 0,006% населения. Были проанализированы три разных образца костного мозга человека. Были включены соответствующие меры контроля за научной строгостью. Процент положительных клеток варьируется из-за генетической гетерогенности среди людей. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 9: Клетки крови человека EpCAM+ составляют 0,18% ± 0,0004% населения. Были проанализированы три разных образца крови человека. Были включены соответствующие меры контроля за научной строгостью. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 10: Иммунофлуоресценция EpCAM+ и EpCAM-слайдов. FACS использовался для разделения EpCAM+ и EpCAM-клеток. Пан-цитокератин был окрашен для использования панцитокератинового антитела DAKO. Первичный контроль антител в нормальной сыворотке крови не использовался, так как пан-цитокератин является поликлональным антителом. Эти результаты подтверждают точность СУИМ. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
| Костный мозг или кровь человека |
| Антитело | Тюбик # | # ячеек | АБ Конк |
| Безупречный | 1 | 1х106 | X |
| Только DAPI | 2 | 1х106 | 1 мкл / мл |
| Контроль изотипа ПЭ | 3 | 1х106 | 1 мкл |
| CD49f-PE Контроль одиночных пятен | 4 | 1х106 | 20 мкл в 100мкл на 1x106 |
| Низкое титрование EpCAM-PE | 5 | 1х106 | 3 мкл в 100мкл на 1x106 |
| Среднее титрование EpCAM-PE | 6 | 1х106 | 4 мкл в 100мкл на 1x106 |
| Высокое титрование EpCAM-PE | 7 | 1х106 | 5 мкл в 100мкл на 1x106 |
| EpCAM-PE High Sort на слайдах | 8 | 10х106 | 50 мкл в 1 мл |
Таблица 1: Панель окрашивания методом проточной цитометрии. Пример панели окрашивания методом проточной цитометрии для мононуклеарных клеток крови или костного мозга. Включены элементы управления: только DAPI, контроль неокрашенных пятен и контроль одиночных пятен PE (PE-CD49f использовался в качестве лучшего положительного контроля). Флуоресценция минус один не включена в эту панель, так как это только один цвет (PE). При добавлении большего количества флуорофорных красителей, таких как изотиоцианат флуоресцеина (FITC) или аллофикоцианин (APC), FMO следует включать, исключая по одному флуорофору для каждого контроля FMO.
Дополнительный файл 1: Подсчет живых клеток с помощью гематоцитометра. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.