В этом протоколе описывается модель накопления липофусцина в высокодифференцированных и поляризованных культурах пигментного эпителия сетчатки человека (RPE) и улучшенный анализ фагоцитоза наружного сегмента (OS) для определения общей способности RPE потреблять/деградировать OS. Эти методы преодолевают ограничения предыдущих моделей липофусцина и классических анализов фагоцитоза наружного сегмента с погоней за пульсом.
Ежедневный фагоцитоз наружных сегментов фоторецепторов пигментным эпителием сетчатки (RPE) способствует накоплению внутриклеточного пигмента старения, называемого липофусцином. Токсичность липофусцина хорошо известна при болезни Штаргардта, наиболее распространенной наследственной дегенерации сетчатки, но более противоречива при возрастной макулярной дегенерации (ВМД), основной причине необратимой слепоты в развитых странах. Определение токсичности липофусцина у людей было затруднено, а животные модели Штаргардта имеют ограниченную токсичность. Таким образом, модели in vitro , имитирующие человеческий RPE in vivo , необходимы для лучшего понимания генерации, клиренса и токсичности липофусцина. Большинство моделей липофусцина клеточных культур до настоящего времени были в клеточных линиях или включали кормление RPE одним компонентом сложной смеси липофусцина, а не фрагментами/кончиками всего внешнего сегмента фоторецептора, что создает более полную и физиологическую модель липофусцина. Здесь описан способ индуцирования накопления липофусциноподобного материала (называемого неперевариваемым автофлуоресцентным материалом, или UAM) в высокодифференцированном первичном пренатальном RPE человека (hfRPE) и индуцированном плюрипотентном стволовом клеточном (iPSC), полученном RPE. УАМ накапливался в культурах при многократном кормлении обработанных ультрафиолетовым светом фрагментов ОС, поглощенных РПЭ посредством фагоцитоза. Также обсуждаются ключевые способы, которыми UAM аппроксимируется и отличается от липофусцина in vivo . Сопровождая эту модель липофусциноподобного накопления, представлены методы визуализации, позволяющие отличить широкий спектр аутофлуоресценции гранул UAM от одновременного окрашивания антителами. Наконец, для оценки влияния UAM на способность к фагоцитозу RPE был введен новый метод количественной оценки поглощения и разрушения фрагментов/кончиков внешнего сегмента. Этот метод, получивший название «общая потребительская емкость», преодолевает потенциальные неправильные интерпретации способности к фагоцитозу RPE, присущие классическим анализам внешнего сегмента «погони за пульсом». Представленные здесь модели и методы могут быть использованы для изучения путей генерации и клиренса липофусцина, а также предполагаемой токсичности.
Пигментный эпителий сетчатки (RPE) обеспечивает критически важную поддержку вышележащих фоторецепторов, включая ежедневное поглощение и деградацию кончиков или фрагментов внешнего сегмента фоторецептора (в этом протоколе аббревиатура OS означает кончики или фрагменты OS, а не целые внешние сегменты). Это ежедневное поглощение постмитотического RPE в конечном итоге перегружает фаголизосомальную способность и приводит к накоплению неперевариваемого автофлуоресцентного внутриклеточного материала, называемого липофусцином. Интересно, что несколько исследований также продемонстрировали, что липофусцин RPE может накапливаться без фагоцитозаОС 1,2. Липофусцин имеет много компонентов, в том числе сшитые аддукты, полученные из ретиноидов зрительного цикла, и может занимать почти 20% объема клеток RPE для людей старше 80 лет3.
Вопрос о том, токсичен ли липофусцин, горячо обсуждается. Болезнь Штаргардта представляет собой аутосомно-рецессивную дегенерацию фоторецепторов и RPE, при которой мутация в ABCA4 вызывает неправильную обработку ретиноидов зрительного цикла, содержащихся во внешних сегментах фоторецепторов. Неправильная обработка ретиноидов приводит к аберрантному сшиванию и образованию видов бис-ретиноидов, включая бис-ретиноид N-ретинилиден-N-ретинилэтаноламин (A2E). Исследования продемонстрировали несколько механизмов токсичности A2E 4,5. Липофусцин вносит свой вклад в сигналы аутофлуоресценции глазного дна во время клинической визуализации, и как у пациентов Штаргардта, так и у животных моделей наблюдается повышенная аутофлуоресценция глазного дна до дегенерации сетчатки, что свидетельствует о корреляции между уровнями липофусцина и токсичностью 6,7. Однако с возрастом липофусцин накапливается у всех людей, не вызывая дегенерации РПЭ. Кроме того, при возрастной макулярной дегенерации (ВМД), когда дегенерация RPE встречается только у пожилых пациентов, пациенты с ранними и промежуточными формами заболевания имеют меньше сигналов аутофлуоресценции глазного дна, чем люди того же возраста без заболевания8. Эти клинические данные были проверены и на гистологическом уровне 9,10.
Животные модели накопления липофусцина RPE также оставили некоторую двусмысленность в отношении токсичности липофусцина. Мышь с нокаутом ABCA4 не проявляет дегенерацию сетчатки на пигментированном фоне, тогда как на фоне альбиносов или при воздействии синего света11,12. Кроме того, токсичность липофусцина, полученного с помощью нокаута ABCA4, вероятно, отличается от более медленно накапливающегося липофусцина, который происходит при естественном старении, как видно из ВМД13.
Модели накопления липофусцина in vitro представляют собой альтернативу изучению влияния накопления липофусцина на здоровье РПЭ. Такие модели позволяют манипулировать компонентами липофусцина, от кормления отдельными ретиноидными компонентами до кормления ОС, и позволяют проводить исследования на людях, а не на животных. За последние пару десятилетий было разработано несколько методов моделирования липофусцина RPE в культуре. Наряду с другими группами, группа доктора Болтона ежедневно кормила бычью ОС в течение трех месяцев при прохождении от 4 до 7 первичных клеток RPE человека от доноров в возрасте от 4 до 85 лет14. Альтернативно, ингибирование аутофагии также приводило к накоплению липофусцина в пассажах 3–7 первичных культур РПЭчеловека 15. Однако сублетальное ингибирование лизосома в высокодифференцированных, проходящих 1, первичных пренатальных культурах RPE человека (hfRPE) не могло индуцировать липофусцин даже при повторном добавлении ОВ на ежедневной основе16.
В качестве более редукционистского подхода другие скармливали культурам отдельные компоненты липофусцина, особенно бис-ретиноид A2E 4,17. Такие исследования ценны тем, что они определяют потенциальные прямые механизмы токсичности для отдельных компонентов липофусцина, затрагивающие, например, лизосомальный холестерин и керамидный гомеостаз18. В то же время ведутся споры о токсичности A2E19, и подача его непосредственно в клетки обходит типичный путь накопления липофусцина, который включает фагоцитоз фоторецептора OS. В попытке доставить все компоненты липофусцина в культуры RPE, Болтон и Маршалл очистили липофусцин из глаз человека и скармливали его в проход с 4 по 7 первичные культуры RPE человека, полученные как от плодных, так и от пожилых доноров20. Несмотря на то, что этот метод является инновационным, он представляет собой ограниченный источник липофусцина для повторных экспериментов.
В то время как повторное кормление ОВ культурами RPE продуцирует липофусцин во многих системах, это не происходит в высокодифференцированных первичных культурах RPE16. Фотоокисляющая ОС индуцирует реакции сшивания, такие как образование бис-ретиноидов, которые естественным образом происходят при образовании липофусцина in vivo. Это может ускорить образование липофусциноподобных гранул в культуральных системах РПЭ, даже в высокодифференцированных и устойчивых к накоплению липофусцина16. Здесь представлен метод индуцирования накопления липофусциноподобных гранул в высокодифференцированном hfRPE и человеческом iPSC-RPE, модифицированный по сравнению с опубликованным протоколом21 Вильмарка. Преимущество этого метода заключается в том, что он индуцирует липофусциноподобные гранулы с использованием того же источника (фоторецепторного ОС) и пути (фаголизосомальное поглощение ОС), что и для липофусциногенеза in vivo. Кроме того, это делается на культурах РПЭ человека, которые высоко дифференцированы и подтверждены в многочисленных исследованиях для воспроизведения РПЭ человека in vivo22,23,24. Эти липофусциноподобные гранулы называются неперевариваемым автофлуоресцентным материалом (UAM) и предоставляют данные и обсуждение в этом протоколе, сравнивая UAM с липофусцином in vivo. Наряду с методами построения и оценки культур, нагруженных UAM, в высокодифференцированных РПЭ человека, также представлен обновленный метод оценки фагоцитоза СИЗО РПЭ. Было введено несколько отличных методов поиска импульсов для количественной оценки фагоцитоза ОВ, включая вестерн-блоттинг, иммуноцитохимию и FACS25,26,27. Однако на ранних этапах погони за импульсами ОС условия, которые приводят к плохому усвоению ОС, могут быть объединены с условиями, способствующими быстрой деградации интернализованной ОС. Представленный здесь метод измеряет общее количество введенных ОС, которое полностью потребляется/ухудшается RPE («Общая потребляемая емкость»), помогая устранить эту двусмысленность. Ожидается, что информация о токсичности липофусцина с использованием этих протоколов, включая влияние на частоту фагоцитоза ОВ с использованием метода «Общая потребительская емкость», будет использована, чтобы пролить свет на токсичность липофусцина in vivo.
Настоящий протокол, касающийся приобретения и использования тканей человека, был рассмотрен и одобрен Институциональным наблюдательным советом Мичиганского университета (HUM00105486).
1. Подготовка фотоокисленных наружных сегментных наконечников и фрагментов
ПРИМЕЧАНИЕ: Адаптированные к темноте сетчатки крупного рогатого скота были куплены и отправлены на льду (см. Таблицу материалов). Из этих сетчаток ОВ очищали в соответствии с ранее опубликованным протоколом23.
2. Построение липофусциноподобных гранул (УАМ) в культурах РПЭ
3. Оценка влияния липофусциноподобных гранул на фагоцитоз РПЭ: общая потребительская емкость
ПРИМЕЧАНИЕ: Обоснование измерения фагоцитоза ОВ с помощью протокола только импульса ОС, приведенное ниже, подробно описано в разделе репрезентативных результатов. Метод, который называется «Общая потребительская емкость», позволяет избежать двусмысленности в отношении эффективности фагоцитоза, которая может возникнуть при традиционных анализах фагоцитоза с погоней за импульсом ОС. Анализы проводятся на 24-луночных планшетах Transwell с использованием 50 мкл среды, содержащей 4 x 106 OS/мл.
В то время как липофусцин RPE изучался в течение десятилетий, его токсичность обсуждается 2,9,16,42. Учитывая неоднозначность в отношении токсичности липофусцина на животных моделях11, модели in vitro, использующие человеческий РПЭ, являются ценными. Был описан ряд моделей накопления липофусцина in vitro, но ни одна из них не использовала как кормление ОС, так и высокозрелые и дифференцированные культуры RPE человека. Эта комбинация представляет собой идеальную модель, поскольку кормление ОС повторяет метод накопления липофусцина in vivo, а высокозрелые культуры RPE человека лучше всего воспроизводят поведение RPE in vivo. Интересно, что при использовании высокодифференцированных культур hfRPE было обнаружено, что рутинное воздействие ОВ было недостаточным для индуцирования липофусциноподобного материала даже после повторных кормлений16. Таким образом, этот протокол ускоряет процесс накопления липофусцина путем фотоокисляющей ОС (OxOS) контролируемым образом. Подача OxOS в культуры iPSC-RPE и hfRPE человека приводила к активному накоплению липофусциноподобных гранул, которые называются неперевариваемым автофлуоресцентным материалом (UAM). Накопление UAM позволяет моделировать липофусцин в культуральных системах, имитирующих RPE здорового человека in vivo 22,23,29,43,44. Как в предыдущей публикации, так и в этом исследовании обширная характеристика UAM по сравнению с нативным липофусцином у здоровых пожилых людей демонстрирует как сходства, так и различия. UAM имитирует ультраструктуру липофусцина in vivo, включая тенденцию гранул липофусцина сливаться с гранулами меланина с образованием меланолипофускина16. Как UAM, так и липофусцин содержат существенные нейтральные липиды, не содержат родопсина и не обогащают холестерин (рис. 2A, B из нашей предыдущей публикации16, рис. 2A, B выше и неопубликованные данные). Мы также сравнили размер и спектр гранул нативного липофусцина с гранулами UAM (рис. 3 из нашей предыдущей публикации16). Гранулы UAM изначально немного крупнее и смещены в синий цвет по сравнению с нативным липофусцином, но в течение значительных периодов времени в культуре UAM компактируется до меньшего размера и красного смещения в их спектре излучения, становясь гораздо более похожими на размер и профиль спектров нативного липофуссина.
Модель OxOS UAM была использована для целого ряда применений, включая влияние индукторов аутофагии на профилактику и удаление гранул липофусцина50 и влияние липофусцина на полярность RPE и метаболизм16. Кроме того, было показано, что эти гранулы сохраняются в культивируемом РПЭ более года, что позволяет изучать эволюцию спектров, морфологии и поведения липофусцина в течение длительных периодов времени16. Другие приложения для модели включают изучение накопления липофусцина при активациикомплемента 51, лизосомальной стабильности и воспалительных реакций52 и митохондриальной компрометации53.
В этом протоколе есть несколько важных шагов. Во-первых, культуры РПЭ должны быть высокодифференцированными и зрелыми. Кормление OxOS следует начинать только после того, как RPE находился на Transwells в течение не менее 8 недель и приобрел все качества, характерные для высокозрелых RPE (5 ‘P, разработанные Finnemann et al. – полигональные по морфологии, постмитотические, пигментированные, поляризованные и фагоцитарные54). Во-вторых, ОС очень хрупкие, и с ними следует обращаться осторожно во время пипетирования. Чрезмерное пипетирование или замораживание-оттаивание разрушат ОС. Наконец, отношение ОВ к общему воздействию УФ-потока имеет решающее значение для генерации OxOS, которые остаются нетронутыми, но все еще могут вызывать UAM; Это соотношение было уточнено в настоящем протоколе. Слишком много ультрафиолетового света для данного количества ОС вызывает чрезмерное сшивание и разрушает критические химические структуры в ОС. Слишком мало ультрафиолетового света для данного количества ОС не сможет индуцировать UAM в культуре.
Изменения в протоколе в значительной степени связаны с изменением продолжительности кормления или концентрации OxOS. Эмпирически 20 кормлений в течение примерно 4 недель приводят к значительному накоплению UAM. Кормления, выходящие за рамки этого, могут постепенно увеличивать накопление UAM, в то время как меньшее количество кормлений, вероятно, вызовет только спорадическое накопление UAM. Количество кормлений можно регулировать в зависимости от цели, потребностей и ресурсов экспериментатора и экспериментатора. В менее дифференцированных культурах RPE (более высокое число пассажа, клеточные линии или культуры, демонстрирующие эпителиально-мезенхимальные переходные свойства) для надежной индукции UAM требуется меньшее количество кормлений и более низкие концентрации OxOS.
Протокол имеет несколько ограничений. Использование портативной УФ-лампы для фотоокисления ОС предотвращает точную количественную оценку общего радиационного облучения, доставляемого на ОС. Тем не менее, фотоокисление ОС с использованием ручной лампы было коррелировано в этом исследовании с гораздо более дорогим (но количественным) устройством УФ-сшивающего агента на рисунке 1 , чтобы помочь определить параметры радиационного воздействия. Экспериментаторам рекомендуется изменять продолжительность воздействия ультрафиолета до тех пор, пока рисунок сшивания / смазывания родопсина не будет имитировать тот, который виден в столбце УФ-лампы вестерн-блоттинга на рисунке 1C.
Второе ограничение метода заключается в том, что в нем, вероятно, отсутствуют многие особенности накопления липофусцина in vivo. Действительно, во всем этом протоколе липофусциноподобные гранулы называются неперевариваемым автофлуоресцентным материалом (UAM), чтобы прояснить это различие. Фотоокисляющая ОС повторяет некоторые естественные химические сшивки, которые происходят во внешних сегментах фоторецепторов при болезненных состояниях, но сшивание значительно ускоряется и, вероятно, более неспецифично в модели UAM. Кроме того, несмотря на почти месяц кормления OxOS, модель UAM по-прежнему представляет собой «острое» воздействие ОВ, индуцирующих липофусцин, по сравнению с десятилетиями, необходимыми для накопления липофусцина в организме человека. При более длительном накоплении липофусцина в культуре фенотипические эффекты могут быть меньше. Тем не менее, поскольку гранулы УАМ сохраняются более года в представленной здесь системе культивирования, есть возможность изучить их долгосрочное влияние на здоровье СИЗО16.
Ограничением метода «Общая потребительская емкость», представленного здесь для оценки способности к фагоцитозу RPE, является то, что он не позволяет различить, могут ли дефекты фагоцитоза быть связаны со связыванием ОС, поглощением или деградацией. Действительно, когда целью анализа фагоцитоза является механистическое понимание дисфункции конкретных этапов процесса фагоцитоза, более подходящими являются традиционные анализы с погоней за импульсом ОС. Измерение «общей потребительской емкости» следует использовать, когда цель состоит в том, чтобы просто однозначно измерить компетентность ОС фагоцитоза культуры РПЭ в контролируемых и экспериментальных условиях.
В заключение представлен протокол накопления липофусциноподобных гранул в высокодифференцированных культурах РПЭ человека. Этот метод объединяет физиологический процесс накопления липофусцина – повторное кормление фотоокисленной ОС – с моделями культивирования РПЭ, которые, как было показано в повторных исследованиях, сильно повторяют РПЭ человека in vivo. Полученные культуры, нагруженные липофусциноподобными гранулами, могут быть использованы для множества применений, начиная от оценки эффектов липофусцина на биологию RPE и заканчивая тестами малых молекул, генов и сигнальных путей, важных для модуляции накопления липофусцина.
The authors have nothing to disclose.
100 mm cell culture dish | Corning | #353003 | Others also work |
24-well Transwells | Corning | #3470 | |
Anti-LC3 antibody | Cell Signaling Technology | #4801S | 1:1000 dilution |
Anti-rhodopsin antibody 1D4 | Abcam | #5417 | 1:1000 dilution. Epitope is C-terminal. |
Anti-rhodopsin antibody 4D2 | EnCor Biotech | MCA-B630 | 1:5000 dilution for western blot, 1:1000 dilution for immunostaining. Epitope is N-terminal. |
Autofluorescence quencher | Biotium | #23007 | TrueBlack Lipofuscin Autofluorescence Quencher |
Autofluorescence quencher | Vector Laboratories | SP-8400 | Vector TrueVIEW Autofluorescence Quenching Kit |
Bodipy 493/503 | Life Technologies | D3922 | |
Cholesterol esterase | Life Technologies | From A12216 kit | |
Confocal microscope | Leica | Leica Stellaris SP8 with FALCON module | |
Dark-adapted bovine retinas | W. L. Lawson Company | Dark-adapted bovine retinas (pre-dissected) | Contact information:<br/> https://wllawsoncompany.com/<br/> (402) 499-3161<br/> stacy@wllawsoncompany.com |
Filipin | Sigma-Aldrich | F4767 | |
Flow cytometer | Thermo Fisher | Attune NxT | |
Flow cytometer analysis software | BD | FlowJo | |
Handheld UV light | Analytik Jena US | UVGL-55 | |
Human MFG-E8 | Sino Biological | 10853-H08B | |
Human purified Protein S | Enzyme Research Laboratories | HPS | |
Laemmli sample buffer | Thermo Fisher | J60015-AD | |
LDH assay | Promega | J2380 | LDH-Glo Cytotoxicity Assay |
Mounting media | Invitrogen | P36930 | Prolong Gold antifade reagent |
Nile red | Sigma-Aldrich | #72485 | |
Polytetrafluoroethylene-coated slides | Tekdon | Customized | Customized specifications: PTFE mask with the following "cut-outs" - 3 glass rectangles, each measuring 17 mm x 9 mm, oriented so that the 17 mm side is 4 mm from the top of the slide and 4 mm from the bottom of the slide, assuming a standard microscope slide of 25 mm x 75 mm. Each rectangle is spaced at least 6 mm away from other rectangles and the edges of the slide. Print PTFE mask on a slide with frosted glass on one side to allow for labeling of the slide. |
Protease inhibitors | Cell Signaling Technology | #5872 | |
Protein assay | Bio-Rad | #5000122 RC DC protein assay | |
TEER electrode | World Precision Instruments | STX3 | |
Trans-epithelial electrical resistance (TEER) meter | World Precision Instruments | EVOM3 | |
Ultraviolet crosslinker device | Analytik Jena US | UVP CL-1000 |