Псевдотипированные вирусы (ФВ) — это молекулярные инструменты, используемые в микробиологии для изучения взаимодействий вируса-хозяина и патоген-патоген 1,2,3,4. PV состоят из внутренней части, вирусного ядра, которое защищает вирусный геном, и внешней части, гликопротеинов оболочки на поверхности вируса, которые определяюттропизм. Псевдовирус неспособен к репликации в клетке-мишени, потому что он не содержит всей генетической информации для генерации новых вирусных частиц. Такое сочетание специфических особенностей делает PV безопасной альтернативой вирусу дикого типа. Вирусы дикого типа, с другой стороны, высокопатогенны и не могут быть использованы в лабораториях BSL 2 для анализа6.
Инфекционность ФВ может контролироваться репортерным геном, обычно кодирующим флуоресцентный белок (GFP, RFP, YFP) или фермент, продуцирующий хемилюминесцентные продукты (люциферазу). Он содержится в одной из плазмид, используемых для производства ФВ, и включен в геном псевдовируса7.
В настоящее время существует несколько типов фотоэлектрических ядер, в том числе лентивиральные частицы, основанные на геноме ВИЧ-1. Большим преимуществом ПВ на основе ВИЧ-1 перед другими платформами является их внутренний процесс интеграции в геном клетки-мишени8. Несмотря на то, что ВИЧ-1 является высококонтагиозным вирусом и возбудителем СПИДа, эти лентивирусные векторы безопасны для использования благодаря обширным этапам оптимизации, которые были предприняты на протяжении многих лет. Оптимальные условия безопасности были достигнуты при введении 2-х лентивирусных векторовnd-го поколения, в которых вирусные гены истощались без влияния на трансдукционные возможности9. 3-е и4-е поколения способствовали повышению безопасности работы с лентивирусным вектором с дальнейшим расщеплением вирусного генома на отдельные плазмиды10,11. Последние поколения ФВ, как правило, используются для производства лентивирусных векторов для генной терапии.
PV могут быть использованы для изучения взаимодействия между вирусами и клетками хозяина, как на этапе производства, так и на этапе заражения. ФВ особенно используются в анализах на нейтрализацию псевдовирусов (ПВНК). ПВНК широко валидированы для оценки потенциала нейтрализации сыворотки или плазмы путем воздействия на вирусный гликопротеин на оболочке ЛП12,13. Нейтрализационная активность, выраженная как ингибирующая концентрация 50 (IC50), определяется как разбавление сыворотки/плазмы, которое блокирует 50% проникновения вирусных частиц14. В этом протоколе мы описали настройку ПВНА для проверки активности антител против тяжелого острого респираторного синдрома - коронавируса 2 (SARS-CoV-2) в сыворотках, собранных до и после получения бустерной дозы вакцины.