Этот протокол оптимизирует производство ретровирусных векторов и трансдукцию мышиных Т-клеток, способствуя эффективной генерации мышиных CAR-T-клеток.
Методическая статья
Этот протокол оптимизирует производство ретровирусных векторов и трансдукцию мышиных Т-клеток, способствуя эффективной генерации мышиных CAR-T-клеток.
Инженерная клеточная терапия с использованием химерных антигенных рецепторов (CAR)-T-клеток достигла замечательной эффективности у пациентов с гематологическими злокачественными новообразованиями и в настоящее время разрабатывается для лечения различных солидных опухолей. До сих пор предварительная оценка новых продуктов CAR-T-клеток проводилась преимущественно на моделях ксенотрансплантатов опухолей с использованием мышей с иммунодефицитом. Этот подход выбран для того, чтобы способствовать успешному приживлению CAR-T-клеток человека в экспериментальных условиях. Тем не менее, сингенные мышиные модели, в которых опухоли и CAR-T-клетки получены из одной и той же линии мышей, позволяют оценивать новые технологии CAR в контексте функциональной иммунной системы и комплексного опухолевого микроокружения (TME). Протокол, описанный здесь, направлен на оптимизацию процесса генерации мышиных CAR-T-клеток путем представления стандартизированных методов ретровирусной трансдукции и культуры ex vivo Т-клеток. Методы, описанные в этом протоколе, могут быть применены к другим конструкциям CAR, помимо тех, которые использовались в данном исследовании, чтобы обеспечить рутинную оценку новых технологий CAR в иммунокомпетентных системах.
Адоптивная Т-клеточная терапия, экспрессирующая химерные антигенные рецепторы (CAR), произвела революцию в области иммунотерапии рака, используя возможности адаптивной иммунной системы для специфического нацеливания и уничтожения антиген-позитивных раковыхклеток. В то время как успех терапии CAR-T-клетками, направленной на злокачественные опухоли В-клеток, был клинически подтвержден, доклинические исследования, проведенные на животных моделях, остаются жизненно важными для разработки новых CAR, нацеленных на солидные опухоли. Тем не менее, до сих пор была продемонстрирована ограниченная клиническая эффективность при солидных опухолях, и становится все более очевидным, что отдельные доклинические модели не могут точно предсказать фармакодинамику и клиническую эффективность живого лекарственного средства 2,3. Поэтому исследователи начали расширять доклинические исследования продуктов CAR-T-клеток, чтобы включить параллельные оценки в ксенотрансплантатах и сингенных моделях рака человека и мышей соответственно.
В отличие от ксенотрансплантатов, в которых человеческие опухоли и Т-клетки приживаются мышам с иммунодефицитом, сингенные модели позволяют исследовать реакцию CAR-T-клеток в контексте функциональной иммунной системы. В частности, иммунокомпетентные мыши с сингенными опухолями представляют собой систему для изучения взаимодействия между адоптивно перенесенными Т-клетками и контекстно-зависимыми средами, включая опухоль-ассоциированные макрофаги (TAM) и регуляторные Т-клетки (Tregs), которые, как известно, подавляют функцию Т-клеток в опухолевом микроокружении (TME)4,5,6. Кроме того, сингенные модели предлагают дополнительную платформу для оценки целевой и внеопухолевой токсичности и взаимодействия CAR-T-клеток с факторами хозяина, которые могут приводить к дополнительной токсичности, включая синдром высвобождения цитокинов7.
Несмотря на эти преимущества, количество исследований сингенных CAR-T-клеток остается ограниченным. Примечательно, что сингенные модели требуют аутологичной инженерии CAR-T-клеток из одной и той же линии мышей и, таким образом, представляют собой дополнительную проблему из-за отсутствия методологии для эффективной трансдукции мышиных Т-клеток и экспансии ex vivo 2,8. В этом протоколе описаны методы достижения стабильной экспрессии CAR за счет производства ретровирусных векторов и оптимизированной трансдукции Т-клеток. Схема всего процесса показана на рисунке 1. Использование данного подхода демонстрирует эффективную ретровирусную трансдукцию мышиных CAR-T-клеток и достижение высокой экспрессии CAR без необходимости концентрации вируса с помощью ультрацентрифугирования. Обсуждаются стратегии изменения антиген-специфичности конструкции CAR в дополнение к коэкспрессии дополнительных трансгенов.
Все процедуры на животных проводились с одобрения Институционального комитета по уходу за животными и их использованию (Колумбийский университет, протоколы AC-AABQ5551 и AC-AAAZ4470) с использованием 6-8-недельных самок мышей BALB/c или CF57BL/6 весом от 20 до 25 г. Животные были получены из коммерческого источника (см. Таблицу материалов). Этот протокол построен вокруг «дней после активации» мышиных Т-клеток, а выработка вируса начинается на 2-й день. Ретровирус может храниться при температуре -80 °C после первоначального производства, и для будущего использования этого протокола можно начать с шага 2, выделения и активации Т-клеток на 0-й день.
1. Производство ретровирусных векторов
ПРИМЕЧАНИЕ: Вирусные продукты стали дефектными для репликации путем разделения генов-упаковок на две отдельные плазмиды (см. таблицу материалов), что значительно снижает вероятность событий рекомбинации и непреднамеренного образования репликационно-компетентного вируса.
2. Выделение мышиных Т-клеток
3. Мышиная трансдукция Т-клеток
Протокол, описанный здесь, направлен на стандартизацию процесса трансдукции мышиных Т-клеток для получения мышиных CAR-T-клеток. На рисунке 1 приведено подробное описание необходимых шагов. Процесс начинается с производства ретровирусных векторов путем котрансфекции вирусных компонентов в клетки Phoenix Eco. На рисунке 2 представлено изображение оптимальной плотности клеток Phoenix Eco в день трансфекции. Затем изолированные Т-клетки активируются через 24 часа после трансфекции, или «День 0» по этому протоколу, для подготовки к трансдукции в 1-й день. После трансдукции CAR-T-клетки культивируют в присутствии рекомбинантных человеческих IL-7 и IL-15 для достижения достаточного расширения складки при сохранении популяций памяти стволовых клеток.
Использование рекомендуемого набора для выделения мышиных Т-клеток (см. таблицу материалов) с этим протоколом позволяет получить чистоту Т-клеток <98% до трансдукции, что определено с помощью проточной цитометрии (рис. 3A). Кроме того, с помощью этого протокола и ретровирусного вектора pMSCV, модифицированного для экспрессии конструкции CAR из промотора PGK, можно достичь воспроизводимых показателей экспрессии экспрессии CAR экспрессии в 65%-75% (рис. 3B, C). Определение титра ретровирусов выявляет титры до ~2 x 107 МЕ/мл и экспрессию CAR 74% при этом 1/3вирусной надосадочной жидкости получают после совместной трансфекции pMSCV с pCL-Eco (дополнительный рисунок 1).
Наконец, культивирование ex vivo с 10 нг/мл IL-7 и IL-15 приводит к примерно 15-кратному расширению, в результате чего к 10-му дню после активации из одной селезенки образуется ~150 x 106 Т-клеток (рис. 3D). Культивирование с IL-7 и IL-15 приводит к сопоставимым частотам CD8+ и CD4+ Т-клеток (рис. 3E) и сохраненным популяциям памяти стволовых клеток, определяемым экспрессией CD62L+CD44- после 10 дней культивирования ex vivo (рис. 3F).

Рисунок 1: Обзор протокола. Верхняя панель: схематический обзор временной шкалы протокола. Нижняя панель: Пошаговые инструкции по производству ретровирусных векторов и трансдукции мышиных Т-клеток. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Оптимальная плотность клеток для трансфекции. Светлопольное микроскопическое изображение клеток Phoenix Eco при оптимальной плотности перед трансфекцией pMSCV и pCL-Eco. Снято с помощью объектива с 10-кратным увеличением. Масштабная линейка = 200 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Производство мышиных CAR-T-клеток и культивирование ex vivo. (A) График проточной цитометрии, показывающий частоту выделения CD3+ клеток BALB/c после выделения мышиных Т-клеток. (B) Схематическое изображение ретровирусного вектора pMSCV, используемого для экспрессии GFP-CAR в мышиных Т-клетках. (C) Гистограммы проточной цитометрии, демонстрирующие поверхностную экспрессию CAR на мышиных Т-клетках после инкубации с очищенным sfGFP. УЗК, нетрансдуцированный. (D) Складчатое расширение CAR-T-клеток к 10-му дню после активации и культивирование с рекомбинантными человеческими IL-17 и IL-15. Примерно 8 x 106 мышиных Т-клеток активировались до трансдукции и достигали примерно 1,28 x 10,8 к 10-му дню после активации. (E) График проточной цитометрии, показывающий частоту CD8+ и CD4+ CAR-T-клеток на 10-й день после активации. (F) График проточной цитометрии, демонстрирующий частоту популяций памяти CD8+ Т-клеток, определяемую поверхностной экспрессией CD62L и CD44. Память стволовых клеток (TSCM) характеризуется CD62L+CD44-, центральная память (TCM) — CD62L+CD44+, а эффекторная память (TEM) — CD62L-CD44+. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этого рисунка.
Таблица 1: Рецептура питательных сред для клеточных культур. Подробная информация о рецептуре питательных сред для клеток, используемых в протоколе. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать эту таблицу.
Дополнительный рисунок 1: Поверхностная экспрессия CAR и титры ретровирусов. (A) Гистограммы проточной цитометрии, показывающие поверхностную экспрессию CAR на Т-клетках BALB/c после инкубации с очищенным sfGFP. Ретровирус был получен путем трансфекции клеток Phoenix Eco pMSCV_PGK_mGFP28z в комбинации с pCL-Eco и pMD2.G (I), pCL-Eco (II) или отдельно (III). Т-клетки трансдуцировали разбавленным ретровирусом, как указано. (B) Титры ретровирусов, определяемые поверхностной экспрессией трансдуцированных Т-клеток. Единицы измерения (TU)/мл рассчитывали по формуле: (N∙F∙D)/V, где N — количество трансдуцируемых клеток (1 x 105), F — частота клеток CAR+ , D — коэффициент разведения, V — объем трансдукции в мл (0,2 мл). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 1: последовательность векторов экспрессии pMSCV. Последовательность GFP28z CAR и фланговые последовательности (курсив) в векторе экспрессии pMSCV, при этом синим цветом выделены сайты ферментов NotI и BamHI. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Этот протокол описывает этапы и реагенты, необходимые для ретровирусной трансдукции мышиных Т-клеток для получения CAR-T-клеток для исследований in vivo . Оптимизация условий ретровирусной трансдукции позволяет достичь устойчивой экспрессии CAR без необходимости концентрации вируса с помощью ультрацентрифугирования или дополнительных реагентов. Тем не менее, существует множество модификаций, которые могут быть применены к этой методологии.
Несмотря на то, что этот протокол описывает пример генерации GFP-специфичного CAR, эти методы могут быть адаптированы для генерации мышиных CAR-T-клеток, нацеленных на любой интересующий внеклеточный антиген. Ретровирусный вектор pMSCV_PGK, использованный в данном исследовании, позволяет эффективно высвобождать GFP-специфичную последовательность нановируса путем ферментативного расщепления с NotI и BamHI и может быть заменен определяемым пользователем доменом распознавания антигена, таким как scFv, нанотело или лиганд-связывающий домен (Дополнительный файл 1). Для облегчения оценки альтернативной экспрессии CAR рекомендуется конструировать CAR с N-концевой эпитопной меткой, такой как метки Myc (EQKLISEEDL) или Flag (DYKDDDDK), которые могут быть обнаружены с помощью флуоресцентно конъюгированных антител12. Более того, настоящее исследование демонстрирует продукцию одного трансгена; однако включение саморасщепляющихся пептидов (последовательностей 2A) или внутренних сайтов входа рибосом (IRES) позволит совместно производить несколько трансгенов, включая дополнительные технологии для усиления функции Т-клеток in vivo 8,13,14.
Несмотря на то, что этот протокол был разработан для устранения необходимости в специализированном оборудовании за счет отказа от ультрацентрифугирования (24 000 x g, 2 ч, 4 °C), стоит отметить, что концентрация вирусной надосадочной жидкости позволяет достичь более высоких титров вируса и уменьшить объем вируса, необходимый для достижения высокой экспрессии CAR8. Этот протокол дополнительно оптимизирует производство ретровирусных векторов за счет достижения воспроизводимо высоких титров вируса (~2 x 10,7 МЕ/мл) и устойчивой экспрессии CAR без необходимости определения титра вируса перед использованием. Однако, помимо облегчения стандартизации, определение титра вируса до трансдукции Т-клеток может также повысить жизнеспособность Т-клеток за счет снижения потенциальной токсичности, вызванной чрезмерно высокими концентрациями вируса10,15.
Добавки с IL-7 и IL-15 рекомендуются для стимулирования экспансии Т-клеток и сохранения популяций памяти Т-клеток; однако рекомбинантный человеческий IL-2 может быть использован в качестве альтернативы для уменьшения количества необходимых реагентов для культуры ex vivo 16,17,18,19. Тем не менее, методы генерации CAR-T-клеток, описанные здесь, остаются ограниченными из-за относительно слабого распространения мышиных Т-клеток. Тем не менее, меры по улучшению жизнеспособности Т-клеток, о которых говорилось выше, могут быть дополнительно усилены путем включения дополнительных добавок и 2-ME в питательную среду мТКМ на протяжении всего процесса трансдукции20. Хотя эти модификации могут улучшить экспансию Т-клеток с 15 до 20раз, они могут привести к снижению эффективности трансдукции и уменьшению экспрессии CAR.
В конечном счете, производство мышиных CAR-T-клеток позволяет разрабатывать сингенные модели для оценки функции CAR-T-клеток в интактной иммунной системе, облегчая контекстно-зависимую оценку их эффективности, долговечности и безопасности. В то время как модели на мышах с иммунодефицитом позволяют проводить важные доклинические исследования человеческого Т-клеточного продукта, нацеленного на человеческий опухолевый антиген. Комбинация этих взаимодополняющих модельных систем будет незаменима для понимания сложности биологии CAR-T-клеток, оптимизации новых конструкций CAR-клеток и, в конечном итоге, для преобразования доклинических результатов в эффективные клинические методы лечения.
Конфликт интересов не декларируется.
Благодарим Л. Брокмана за критическое рецензирование рукописи. Эта работа была поддержана NIH 1R01EB030352 и UL1 TR001873.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| 0,45 мкм; m фильтры | MilliporeSigma | SLHVR33RS | |
| шприц объемом 1 мл | Fisher Scientific | 14-955-450 | |
| Микроцентрифужные пробирки 1,5 мл | Fisher Scientific | 05-408-135 | |
| Шприц 10 мл | БД | 14-823-16Э | |
| 100 m ситечко | Corning | 07-201-432 | |
| 15 см TC обработанные чашки для клеточных культур | ThermoFisher Scientific | ||
| 15 мл конические пробирки | Сокол | 14-959-70С | |
| 40 μ m ситечко | Corning | 07-201-430 | |
| Конические трубки 50 мл | Фалькон | 14-959-49А | |
| 70 μ m Сетчатый фильтр | Corning | 07-201-431 | |
| Проточный цитометр Attune NxT | ThermoFisher Scientific | ||
| BALB/C, 6-8 недель | Лаборатория Джексона | 651 | |
| B-меркаптоэтанол | Gibco | 21985023 | |
| бычья сыворотка альбумин | GOLDBIO | A-420-500 | |
| DMEM Medium | Gibco | 11965092 | |
| фосфатно-солевой буфер (PBS) Дульбекко, без кальция и магния | Gibco | 14-190-250 | |
| Магнит DynaMag-2 | Магнит Invitrogen | 12-321-D | |
| EasySep | Stemcell Technologies | 18000 | |
| EasySep Набор для изоляции Т-клеток | мыши Технологии стволовых клеток | 19851 | |
| FACS buffer | BD | BDB554657 | |
| Фетальная бычья сыворотка (FBS) | Corning | MT35011CV | |
| GlutaMAX | Gibco | 35-050-061 | |
| G-Rex6 | Wilson Wolf | 80240M | |
| Буферный раствор HEPES | Gibco | 15-630-080 | |
| Человеческий рекомбинантный IL-15 | Miltenyi Biotec | 130-095-765 | |
| Человеческий рекомбинантный IL-2 | Miltenyi Biotec | 130-097-748 | |
| Человеческий рекомбинантный IL-7 | Miltenyi Biotec | 130-095-363 | |
| Липофектамин 3000 | Invitrogen | L3000008 | |
| MEM Раствор заменимых аминокислот | Gibco | 11140-050 | |
| Мышь Anti-CD3 BV421 | Biolegend | 100228 | |
| Мышь Anti-CD3/CD28 Dynabeads | Gibco | 11-453-D | |
| Мышь Anti-CD4 BV605 | BD | 563151 | |
| мышь Anti-CD44 APC | Biolegend | 103011 | |
| Мышь Anti-CD62L PE-Cy7 | Tonbo | Артикул 60-0621-U025 | |
| Мышь Anti-CD8 APC-Cy7 | Tonbo | Артикул 25-0081-U025 | |
| Nikon Ti2 с камерой Prime 95B | Необработанные | ||
| Non-Reference | CytoOne | CC7672-7524 | |
| Opti-MEM | Gibco | 31-985-062 | |
| pCL-Eco | Addgene | #12371 | |
| Раствор пенициллина/стрептомицина | Gibco | 15-070-063 | |
| Phoenix Eco cells | ATCC | CRL-3214 | |
| pMDG.2 | Addgene | #12259 | |
| pMSCV_PGK_GFP28z | н/д | Производство R.LV. | |
| Очищенный sfGFP | Н/Д | производится компанией R.LV. | |
| RetroNectin («реагент для трансдукции») | Takara Bio | T100B | |
| RPMI 1640 | Gibco | 21875 | |
| Серологическая пипетка 10 мл | Fisher Scientific | 13-678-11E | |
| Серологическая пипетка 25 мл | Fisher Scientific | 13-678-11 | |
| Серологическая пипетка 5 мл | Fisher Scientific | 13-678-11D | |
| Пируват натрия | Gibco | 11-360-070 | |
| Обработанные TC 24-луночные планшеты | Corning | 08-772-1 | |
| Трипан синий | Gibco | 15-250-061 |