Этот протокол описывает выделение эндотелиальных клеток мыши из целой поджелудочной железы.
Методическая статья
Этот протокол описывает выделение эндотелиальных клеток мыши из целой поджелудочной железы.
Поджелудочная железа является жизненно важным органом для поддержания метаболического баланса в организме, отчасти благодаря производству метаболических гормонов, таких как инсулин и глюкагон, а также пищеварительных ферментов. Поджелудочная железа также является сильно васкуляризированным органом, чему способствует сложная сеть капилляров поджелудочной железы. Эта обширная капиллярная сеть состоит из высокофенестрированных эндотелиальных клеток (ЭК), важных для развития и функционирования поджелудочной железы. Соответственно, дисфункция ЭК может способствовать дисфункции поджелудочной железы при таких заболеваниях, как диабет и рак. Таким образом, исследование функции ЭК поджелудочной железы (pECs) важно не только для понимания биологии поджелудочной железы, но и для развития ее патологий. Мышиные модели являются ценным инструментом для изучения метаболических и сердечно-сосудистых заболеваний. Тем не менее, не существует установленного протокола с достаточным подробным описанием для выделения ЭК мышей из-за относительно небольшой популяции ЭК и большого количества пищеварительных ферментов, потенциально высвобождаемых из ацинарной ткани, что может привести к повреждению клеток и, следовательно, к низкому выходу. Чтобы решить эти проблемы, мы разработали протокол обогащения и восстановления pEC мышей, сочетающий мягкую физическую и химическую диссоциацию и отбор, опосредованный антителами. Представленный здесь протокол обеспечивает надежный метод извлечения неповрежденных и жизнеспособных ЭК из всей поджелудочной железы мыши. Этот протокол подходит для нескольких последующих анализов и может быть применен к различным моделям мышей.
Поджелудочная железа, играющая ключевую роль в метаболическом контроле и гомеостазе, является сильно васкуляризированным органом. Поджелудочная железа выполняет как эндокринную, так и экзокринную функции, контролируя регуляцию уровня глюкозы в крови и пищеварительных ферментов соответственно. Эти два компартмента связаны между собой обширной сетью кровеносных сосудов поджелудочной железы, облегчающих обмен и транспортировку кислорода, гормонов и ферментов. Важно отметить, что эта плотная капиллярная сеть проникает в островок Лангерганса, скопление гормонорегулирующих клеток в поджелудочной железе, отвечающих за ее эндокринную функцию, состоящее из глюкагон-секретирующих альфа-клеток (α), инсулин-секретирующих бета-клеток (β) и соматостатин-секретирующих дельта-клеток (δ) 1,2. Хотя островки составляют всего 1-2% от массы поджелудочной железы, они получают 20% отобщего кровотока3, что подчеркивает важность сосудистой сети островков. Капилляры поджелудочной железы в основном состоят из высокофенестрированных эндотелиальных клеток (ЭК), которые окружены пристеночными перицитами. Эти капиллярные ЭК играют жизненно важную роль в развитии, созревании и (дис)функции островков и образуют тесные перекрестные связи с различными эндо- и экзокринными клетками4 (Рисунок 1).
Эндотелиальная дисфункция наблюдалась как при диабете 1, так и при диабете 2 типа, наиболее распространенных состояниях, вызванных дисфункцией островков поджелудочной железы 5,6. Плотность и морфология микрососудов островков могут быть изменены при сахарном диабете7. Кроме того, рак поджелудочной железы, высокоагрессивная опухоль, которая также может проявляться в виде сахарного диабета, характеризуется высокой микрососудистой плотностью при плохой перфузии8. Учитывая ключевую структурную и функциональную роль ЭК как в нормальной, так и в больной ткани поджелудочной железы, существует актуальная необходимость в изучении ЭК в развитии, физиологии и патологии, чтобы раскрыть механизмы, которые управляют здоровьем или болезнями.
Разработаны многочисленные протоколы для выделения ЭК у различных мышей (например, мозга 9,10, легких11, сердца12, печени13, скелетных мышц14 и жировых тканей15) и человека (например, мозга16, висцеральной жировой ткани17,18, периферических нервов19, легких 20,21,22 и брыжеечной артерии 23) тканей. Эти протоколы обычно включают использование ферментативных расщеплений (например, коллагеназой, трипсином24, диспазой 24,25 и либеразой26) с последующей стадией обогащения на основе антител. Кроме того, эти протоколы, как правило, основываются на длительной продолжительности переваривания в высоких концентрациях ферментов с энергичным перемешиванием при 37 °C (табл. 1). Из-за уникальных особенностей поджелудочной железы, в том числе из-за того, что она содержит множество эндогенных пищеварительных ферментов, эти существующие протоколы не могут быть непосредственно применены для выделения pEC. Во-первых, состав внеклеточного матрикса (ВКМ) поджелудочной железы отличается от других тканей. В то время как коллагеназа обычно используется для выделения ЭК, существует несколько подтипов с различными тканеспецифическими возможностями диссоциации, что требует оптимизации. Во-вторых, и это имеет решающее значение для выделения pEC, высвобождение и активация эндогенных ферментов поджелудочной железы может значительно замедлить процесс выделения. С этой целью необходимо соблюдать осторожность, чтобы свести к минимуму разрыв экзокринных ацинарных клеток (основного источника зимогенов, протеаз и РНКазы27), которые могут вызвать дальнейшее повреждение клеток и привести к низкой жизнеспособности клеток и общему эффекту восстановления 27,28,29.
Чтобы решить эти проблемы, мы адаптировали методы существующих протоколов изоляции КЭ и разработали новый протокол, подходящий для выделения КЭ из поджелудочной железы мыши. В частности, мы описываем здесь рабочий процесс (рис. 2) с использованием коллагеназы типа I (обычно применяемой для выделения ЭК легких), более низкой температуры пищеварения и отсутствия перемешивания (для предотвращения активации ферментов поджелудочной железы), а также добавок ДНКазы 30,31,32 (для предотвращения ДНК-индуцированного апоптоза и улучшения жизнеспособности клеток), а также антител к CD3133 (PECAM1, пан-EC маркер). В соответствии с описанным протоколом создаются популяции ЭК, выделенные из поджелудочной железы мышей, которые могут быть использованы для профилирования экспрессии генов и анализа белков.
Выделение тканей проводилось в соответствии с утвержденным протоколом исследования #17010 Институциональным комитетом по уходу и использованию животных (IACUC) Научно-исследовательского института Бекмана, Город надежды (Дуарте, Калифорния, США). Здесь мы используем Tie-2CreERT2; Линия мышей Rosa26-TdTomato в фоновом классе C57BL/6 в возрасте от 8 до 12 недель. В этой линии ЭК мечаются TdTomato при индуцировании тамоксифеном, как описано ранее34. Тем не менее, этот протокол может быть адаптирован для всех возрастов взрослых мышей с различными генотипами и генетическим фоном.
1. Забор тканей (ориентировочное время: 1-2 часа)
ПРИМЕЧАНИЕ: Ориентировочное время составляет 15 минут на животное, рекомендуется максимум 3 животных в одном образце диссоциации.
2. Препарат коллагеназы (ориентировочное время: 15-30 мин)
3. Пищеварение (ориентировочное время: 40 мин-1 час)
4. Обогащение эндотелиальными клетками (ЭК) (ориентировочное время: 2-3 часа)
5. Культивирование pEC
Следуя этому протоколу, можно получить примерно 2 x 106 живых клеток при объединении 3 поджелудочных желез мышей и 750 000 клеток из одной поджелудочной железы мыши. Чтобы подтвердить обогащение EC, мы провели следующие анализы: 1) количественная ПЦР: по сравнению с проточными образцами (FT) (т.е. фракциями, не связанными с антителами CD31), фракции EC имели значительно более высокие уровни Pecam1 (кодирующего CD31) и Kdr (кодирующего VEGFR2), двух генов-маркеров EC33, и более низкие уровни NK6 гомеобокса 1 (Nkx6.1), транскрипционного фактора в эндокринных клетках поджелудочной железы (рисунок 4A); 2) вестерн-блоттинг: обогащенные ЕС образцы из трех препаратов (pEC-1-3) показали сильные сигналы CD31 при ожидаемом размере (~130 кДа). Для сравнения, выборки на входе и FT показали минимальный сигнал CD31. В качестве положительного контроля лизаты клеток MS1, клеточной линии pEC, также показали сильный сигнал CD31 (рис. 4B); 3) окрашивание трипановым синим: мы обнаружили, что жизнеспособность изолированных клеток составляет около 50% (рисунок 4C); 4) проточная цитометрия в соответствии с опубликованным протоколом15 : с помощью гейтинга на популяции живых клеток (рисунок 4D) мы обнаружили, что клетки CD31+ были на 88%, а клетки TdTomato+ были на уровне 76%. Следует отметить, что большинство выделенных клеток совместно экспрессируют CD31 и TdTomato (рисунок 4E). В качестве отрицательного контроля, неокрашенные клетки MS1 и MS1, инкубированные с IgG, не показали живых клеток, помеченных CD31. В качестве положительного контроля, т.е. клетки MS1, окрашенные на CD31, показали почти 100% живых CD31+ клеток (рис. 4F). Мы также культивировали выделенные клетки, выполнили иммунофлуоресцентное окрашивание PECAM1 в соответствии с опубликованным протоколом36 и визуализировали TdTomato, который показал устойчивые сигналы обоих маркеров в выделенных клетках, что указывает на наличие EC (рис. 4G).

Рисунок 1: Иллюстрация васкуляризации поджелудочной железы и островков поджелудочной железы. Графическое изображение эндотелиальных клеток поджелудочной железы (ЭК) и внутриостровковых ЭК. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 2: Обзор рабочего процесса. 1) Вскрытие поджелудочной железы, 2) механическое расщепление, 3) инкубация ферментов, 4) центрифугирование, 5а) удаление надосадочной жидкости и 5б) вторичное коллагеназное расщепление клеточных гранул с растиранием для фильтрации в 6), 7) и 8) восстановление гранул и связывание антител, 9) инкубация микрогранул, 10) обогащение колонки MACS, 11) подсчет клеток на жизнеспособность и 12) последующий анализ. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 3: Этапы обработки тканей. Изображения (А) брюшной полости, (В) изолированной поджелудочной железы мыши и (В) обрезанной поджелудочной железы мыши. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 4: Валидация выделенных фракций EC из поджелудочной железы мыши. (A) qPCR образцов FT и обогащенной EC-фракции CD31 для обогащения. Pecam1 (CD31), Kdr (VEGFR2) и Nkx6.1 (специфический фактор транскрипции β-клеток поджелудочной железы)33. * обозначает p <0,05 по сравнению с FT на основе t-тестов . n = 3-4 объединенных образца, состоящих из 3 мышей в каждой. (B) Западный блоттинг CD31. pEC-1-3 указывают на обогащенные ЭК из 3 отдельных объединенных образцов мышей. На каждую дорожку загружали клеточные лизаты в дозе 30 мг с последующим окрашиванием по Понсо. (C) Подсчет клеток и окрашивание обогащенных pEC трипановым синим цветом для анализа жизнеспособности. (D) Стратегия гейтирования проточной цитометрии для pEC мышей, окрашенных антителами 4', 6-диамидино-2-фенилиндол (DAPI) и CD31. (E) Гистограммы проточной цитометрии неокрашенного MS1 (вверху слева), MS1, окрашенного вторичным антителом AlexaFluor-488 (контроль IgG; вверху справа), MS1, окрашенного CD31 (внизу слева), и выделенных мышиных pECs, окрашенных CD31 (внизу справа). (F) Процентное содержание живых клеток, количественно выраженное с помощью проточной цитометрии. (G) Иммунофлюоресценция экспрессии CD31 (зеленый) с противостоящим окрашиванием DAPI (синий) и эндогенным флуоресцентным репортером TdTomato (красный). Масштабная линейка = 100 μм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 5: Специфичность CD31 и CD144 в поджелудочной железе мыши. (A) Иммунофлюоресценция поджелудочной железы мыши с CD31 (пурпурный) и CD144 (голубой), с противостойным окрашиванием DAPI. Изображение снято с помощью 10-кратного объектива под широкопольным флуоресцентным инвертированным микроскопом. Масштабная линейка = 100 мкм. Пунктирными линиями обозначена территория островков. (B) Равномерная аппроксимация и проекция многообразия (UMAP), показывающая экспрессию Cdh5 и Pecam1 в островковых EC мышей C57BL6, обнаруженных с помощью scRNA-seq (GSE128565)37. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
| Фермент | Использование | Температура и время | Ссылка |
| Коллагеназа I | Диссоциация одиночных клеток, ЭК-обогащение всей поджелудочной железы | 37 °C, 20 мин | Этот протокол |
| Коллагеназа IV | Выделение островков и неферментативная диссоциация | 37 °C, 20 мин | 46 |
| Коллагеназа + Трипсин | Исследование протоковых клеток поджелудочной железы мышей | 37 °C, 30 мин | 47 |
| Коллагеназа В | Одноклеточная суспензия поджелудочной железы | 37 °C, 30 мин | 48 |
| Коллагеназа NBI | Изоляция островков | 37 °C, 30 мин | 49 |
| Коллагеназа | Ацинар жизнеспособная суспензия | 37 °C, 15 мин | 45 |
| Коллагеназа XI | Изоляция островков | 37 °C, 15 мин | 35 |
| Диспайз | Суспензия одиночных ячеек | 37 °C, 45 мин | 24 |
| Либерасе | Суспензия одиночных ячеек | 37 °C, 10 мин | 25, 48 |
| Трипсин | Одноклеточная диссоциация, вся поджелудочная железа | 4 °C, O/N | 28 |
Таблица 1: Краткое изложение различных протоколов, используемых для обработки образцов поджелудочной железы мыши.
В этой статье мы представляем протокол обогащения и изоляции pEC. Подобно предыдущим протоколам выделения КЭ из других тканей или органов, этот протокол состоит из трех основных процессов, а именно: физической диссоциации, ферментативного переваривания и обогащения ЭК на основе антител. Чтобы решить уникальные проблемы, связанные с обработкой поджелудочной железы, мы внедрили несколько ключевых адаптаций и критических этапов в рамках нашего протокола: 1) щадящее одноэтапное переваривание коллагеназы с коротким временем инкубации, 2) добавление более высокой концентрации ДНКазы и ингибитора трипсина для минимизации загрязнения ДНК и расщепления эндогенных ферментов, которые могут препятствовать связыванию антител и, таким образом, снижать обогащение и жизнеспособность ЕС, и 3) подсчет клеток после этапа переваривания для корректировки того, как в образец добавляют большое количество антител для оптимизации обогащения EC. В процессе оптимизации этого протокола мы протестировали другие ферменты, использованные в предыдущих исследованиях, например, трипсин28, коллагеназу типа IV31, и другие температуры пищеварения, например, 4 °C, а также различное время инкубации (Таблица 1). Мы обнаружили, что коллагеназа I типа, 20 мин, при 37 °C является оптимальным условием для выделения pEC у мышей и использовали его здесь. В то время как добавление антикоагулянта во время перфузии может улучшить общую жизнеспособность клеток, типичный антикоагулянт, например, ЭДТА или гепарин, может влиять на активность некоторых ферментов, например, коллагеназы для диссоциации клеток и обратной транскриптазы, используемой в количественной ПЦР. Для предотвращения неожиданного/нежелательного эффекта этих антикоагулянтов используется PBS (без Ca+ и Mg2+) для перфузии.
Мы сосредоточились на разработке протокола для обогащения популяции ЭК из целых поджелудочных желез мышей, который включал бы как внутриостровковые ЭК, так и ЭК в экзокринных тканях, что привело бы к более высокому выходу. В текущем протоколе мы объединили 3 животных на этапе диссоциации и в среднем получили суспензию одиночных клеток с примерно 2,0 x 106 жизнеспособными клетками. Мы также протестировали образцы из поджелудочной железы одной мыши, и удалось получить около 750 000 клеток. Стоит отметить, что при адаптации к обработке одного животного следует использовать меньше раствора диссоциации (3 мл диссоциации на поджелудочную железу). Важным шагом в протоколе является полная обрезка и удаление любого остаточного жира, который прикреплен к поджелудочной железе (Рисунок 3B). Контаминация жировой ткани при расщеплении коллагеназы будет препятствовать стадии диссоциации одиночных клеток поджелудочной железы, снижая жизнеспособность клеток на последующих стадиях обогащения38. Кроме того, для обогащения pEC мы использовали поверхностный маркер pan-EC PECAM1/CD31. Используя антитела PECAM1/CD31, мы смогли значительно обогатить фракции EC, о чем свидетельствует анализ экспрессии генов. При разработке этого протокола мы также проверили полезность антител к CD144, которые также обычно используются для выделенияЭК-13. Тем не менее, нам не удалось обогатить pEC (данные не показаны). Интересно, что иммунофлуоресцентное окрашивание показало, что в то время как CD31 экспрессируется во всех ЭК в ткани поджелудочной железы, антитела к CD144, по-видимому, окрашивают только внутриостровковые ЭК (рис. 5A). Кроме того, мы проанализировали общедоступные данные секвенирования РНК одиночных клеток от островков, выделенных от мышей C57BL/6 (GSE128565)37 , и обнаружили, что примерно 50% островковых EC демонстрируют экспрессию как Cdh5 (VE-Cad), так и Pecam1, но остальные островковые EC экспрессируют только Cdh5 или Pecam1 (рис. 5B). Таким образом, мы предполагаем, что антитела к CD31 более подходят для выделения pEC, и полезность антител CD144 для этой цели требует будущих исследований. Кроме того, существуют коммерчески доступные анти-CD31 конъюгированные с магнитными шариками, которые могут упростить двухступенчатый этап связывания антител до одного шага.
Как показано, мы выполнили кПЦР, иммуноблоттинг, проточную цитометрию и иммунофлуоресцентное окрашивание для валидации выделенной фракции ЭК. Можно предположить, что эти фракции могут быть подвергнуты другим анализам, таким как (sc)РНК-секвенирование и масс-спектрометрия. Ограничением этого протокола является то, что мы не смогли достичь устойчивой субкультуры и выполнить функциональные анализы. Учитывая, что субкультура изолированных мышиных ЭК оказалась сложной задачей, эта область требует дальнейших усилий. Одним из способов решения этой проблемы может быть введение большого Т-антигена, который был использован для увековечивания первичныхклеток.
Последние достижения и применение секвенирования скРНК позволили проводить профилирование с высоким разрешением клеток поджелудочной железы40 и особенно островковых клеток41. Тем не менее, большинство существующих исследований были сосредоточены на популяциях эндокринных клеток и использовали протоколы диссоциации тканей, которые не эффективно удерживают ЭК. В результате фракции ЭК часто оказываются дефицитными, составляя всего 3-5% от всех захваченных клеточных популяций 42,43,44. В недавнем протоколе используется двухступенчатое ферментативное расщепление и деактивация, а также этап сортировки флуоресцентно активированных клеток, в результате чего ЭК извлекаются в 12% отвсей популяции клеток поджелудочной железы. В дополнение к этому протоколу наш протокол обеспечивает упрощенный рабочий процесс, который может быть более экономичным и менее технически сложным, если в центре исследования находятся ЭК. Хотя этот протокол был протестирован только на поджелудочной железе мышей, он может быть масштабирован и адаптирован для выделения ЭК из других организмов, включая поджелудочную железу человека.
Авторам нечего раскрывать.
Авторы благодарят доктора Брайана Армстронга из «Города надежды» и Минди Родригес из Калифорнийского университета в Риверсайде за техническую помощь. Это исследование было частично профинансировано грантами от NIH (R01 HL145170 к ZBC), Фонда Эллы Фицджеральд (к ZBC), City of Hope (премия Артура Риггса за инновации в области метаболизма диабета и исследований) и гранта Калифорнийского института регенеративной медицины EDU4-12772 (к AT). Исследования, представленные в этой публикации, включали работу, выполненную в области световой микроскопии и цифровой визуализации при поддержке Национального института рака NIH под номером P30CA033572. Рисунок 1 и Рисунок 2 были сделаны с помощью BioRender.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| 1,5 мл eppendorf | США Scientific | 1615-5500 | |
| 10 см тарелка | Genesee Scientific | 25-202 | |
| 25G иглы | BD | 305145 | |
| 2X Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix | Vazyme | Q712-03-AA | |
| 5 мл eppendorf | Thermo Fisher | ||
| 6-луночный планшет | Greiner Bio-One | 07-000-208 | |
| 70 &микро; m ситечко | Fisher | 22-363-548 | |
| Anti-CD31-биотин | Miltenyi Biotech | REA784 | |
| Бычья сыворотка альбумин термический шок обработанный | Fisher | BP1600-100 | |
| CaCl2 | Fisher | BP510 | |
| Центрифуга | Eppendorf | ||
| Collagen Type 1, из телячьей кожи | Sigma Aldrich& НБСП; | C9791 | Реагент для присоединения в протоколе |
| Коллагеназа Тип 1 | Worthington Bio | LS004197 | |
| Countess Автоматический счетчик ячеек | Thermo Fisher | ||
| DAPI | Thermo Fisher | D1306 | иммунофлуоресцентные |
| одноразовые безопасные скальпели | Myco Instrumentation | 6008TR-10 | |
| DNAse I | Roche | 260913 | |
| D-PBS (Ca2+,Mg2+) | Thermo Fisher | ||
| Этанол | Fisher | BP2818-4 | |
| Фетальная бычья сыворотка | Fisher | 10437028 | |
| инкубатор | Kept at 37 ° C 5% CO2 | ||
| LS Колонки | Miltenyi Biotech | 130-042-401 | |
| M199 | Sigma | M2520-1L | |
| MACS MultiStand с сепаратором QuadroMACS | Miltenyi Biotech | 130-042-303 | |
| Medium 199 | Sigma Aldrich | M2520-10X | |
| Микрогранулы антибиотин | Miltenyi Biotech | 130-090-485 | |
| Микроскоп | Leica | Для оценки морфологии клеток | |
| Молекулярная вода | Corning | 46-000-CM | |
| NaCl | Fisher | S271-1 | |
| Нью-Брансуик Innova 44/44R Орбитальный шейкер | Eppendorf | ||
| PECAM1 (CD31) Антитело | Abcam | ab56299 | иммунофлюоресцентное |
| PECAM1 (CD31) | Антитело R& D Systems | AF3628 | |
| Фосфатный буферный физиологический раствор (10X) (без Ca2+, без Mg2+) | Genesee Scientific | 25-507-XB | |
| Primer 36B4 Forward mouse | IDT | AGATTCGGGATATGCTGTTGGC | |
| Primer 36B4 Revese mouse | IDT | TCGGGTCCTAGACCAGTGTTC | |
| Primer Kdr Forward mouse | IDT | TCCAGAATCCTCTTCCATGC | |
| Primer Kdr Обратная мышь | IDT | AAACCTCCTGCAAGCAAATG | |
| Primer Nkx6.1 Обратная мышь | IDT | CACGGCGGACTCTGCATCACTC | |
| Primer Nxk6.1 Forward mouse | IDT | CTCTACTTTAGCCCCAGCG | |
| Primer PECAM1 Forward mouse | IDT | ACGCTGGTGCTCTATGCAAG | |
| Primer PECAM1 Reverse | mouse IDT | TCAGTTGCTGCCCATTCATCA | |
| RNase ZAP | Thermo Fisher | AM9780 | |
| РНКаза водная | Takara | RR036B | |
| Стерильные 12" длинные щипцы | F.S.T | 91100-16 | |
| Стерильные тонкие щипцы | F.S.T | 11050-10 | |
| Стерильные тонкие ножницы | F.S.T | 14061-11 | |
| Чашки для культуры тканей 2 см | Genesee Scientific | 25-260 | |
| Реагент тризола | Fisher | ||
| Trypan Blue | Corning | MT25900CI | |
| Roche | 10109886001 | ||
| Tween-20 | |||
| VE-кадгерин антитело | Abcam | ab33168 | иммунофлуоресцентная |
| водяная баня |