$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Здесь представлены два простых, но эффективных протокола для выделения иммунных клеток из мозга и костного мозга черепа. Эти протоколы могут надежно получать большое количество жизнеспособных иммунных клеток, которые могут быть пригодны для различных последующих применений, в частности, для проточной цитометрии.
Для изучения нейровоспаления при различных заболеваниях мозга было разработано множество протоколов подготовки иммунных клеток из мозга, которые используются в различных лабораториях 15,16,17. Общие подходы включают в себя диссоциацию клеток на основе ферментов с последующим градиентным разделением. Как правило, в этих протоколах мозговую ткань измельчают, а затем инкубируют в ферментном растворе для расщепления, содержащем коллагеназу и ДНКазу, в течение 30-60 минут при 37 °C с легким встряхиванием. После расщепления клетки подвергаются дальнейшей диссоциации с помощью механического метода, такого как пипетирование или гомогенизация по методу Даунса. После прохождения через клеточный фильтр (например, 70 мкм фильтр) клетки затем подвергают градиентному центрифугированию (часто 30%/70% раствор градиента плотности) для удаления миелина, эритроцитов и мусора, а также для обогащения лейкоцитов. Однако этот подход требует длительной ферментативной инкубации при 37 °C, что может существенно изменить транскриптом и протеом иммунных клеток мозга. Действительно, систематическое исследование показало, что ферментативный подход вносит глубокие изменения в транскриптом и протеотип специфическихклеток мозга. Это может привести к артефактам в последующих транскриптомных анализах, таких как scRNA-seq. В отличие от этого, в протоколе, описанном здесь, используется подход механической диссоциации при низких температурах на протяжении всей процедуры, тем самым подавляя клеточный метаболизм. Это обеспечивает лучшее сохранение транскрипционного и протеомного состояния, сводя к минимуму потенциальные артефакты. Во время разработки протокола мы заметили, что использование большого гомогенизатора Dounce для гомогенизации мозговой ткани имеет решающее значение для достижения более высокого количества клеток с более низкой гибелью клеток. Вполне вероятно, что при гомогенизации Dounce массивное присутствие внеклеточных матриц, клеточного мусора и цитоплазматических компонентов токсично для клеток. Использование чрезмерного количества буфера помогает разбавить эти токсичные вещества и, таким образом, смягчает их вредное воздействие, что приводит к улучшению жизнеспособности клеток. Данные проточной цитометрии подтвердили примерно 85% жизнеспособность иммунных клеток, полученных по этому протоколу. Кроме того, следует отметить, что центрифугирование с использованием всего 30% градиентного раствора эффективно обогащает иммунные клетки мозга и удаляет миелин. Это также может снизить затраты на подготовку клеток.
Исследования иммунных клеток в костном мозге черепа все еще ограничены. Метод, обычно используемый для выделения клеток из черепа мыши, включает в себя разрезание черепа на мелкие кусочки, а затем механическое дробление кусочков пестиком. В действующем протоколе используется кратковременное центрифугирование. Этот метод адаптирован из опубликованного протокола препарирования костного мозга из бедренных и большеберцовых костей19. Для этих длинных костей нужно только отрезать один конец кости, чтобы собрать костный мозг с помощью центрифугирования. Для черепа этот шаг видоизменяется путем разрезания его на несколько небольших кусочков, чтобы открыть полость костного мозга. Рекомендуется использовать последовательную схему для резки черепа, чтобы получить воспроизводимое количество клеток. Более того, для максимального восстановления клеток костного мозга кусочки черепа могут быть подвергнуты 2-3 раундам центрифугирования с перемешиванием между каждым центрифугированием.
Оба протокола имеют ограничения. Во-первых, использование центрифугирования с градиентом плотности 30% может не эффективно удалять оставшиеся эритроциты в мозге, что может произойти из-за неполной перфузии. Более того, если структура миелина модулируется при определенных условиях, то 30% градиентный раствор плотности может не быть оптимальной концентрацией для их удаления. В этом случае необходимо установить другую рабочую концентрацию раствора градиента плотности. Во-вторых, хотя анализ проточной цитометрии указывает на хорошую жизнеспособность иммунных клеток мозга с использованием описанного протокола, его все еще необходимо оценить для других применений, таких как транскриптомный анализ, в котором может быть использован актиномицин D. В-третьих, кальвария используется для приготовления черепа, костного мозга. Однако следует отметить, что иммунные клетки существуют во многих других частях черепа. Наконец, мозговые оболочки, особенно твердая мозговая оболочка, содержат различные иммунные клетки и играют роль в гомеостазе и дисфункциимозга. Для иммунологического анализа мозговых оболочек может быть принят протокол, опубликованный в других документах 17,21,22,23.
Таким образом, описаны два надежных протокола для выделения иммунных клеток из мозга и черепа мыши. Ожидается, что эти протоколы будут полезны для получения большого количества высококачественных элементов, пригодных для различных последующих применений.