Методическая статья

Атомно-силовая микроскопия для измерения хрящей в интактных и регенерирующих конечностях аксолотля

DOI:

10.3791/66946

⸱

11 октября 2024 г.

 ,  ,  ,  , 
1Department of Internal Medicine III, Center for Healthy Aging, University Hospital Carl Gustav Carus, Technische Universität Dresden (TUD), 2Center for Regenerative Therapies Dresden (CRTD), Center for Molecular and Cellular Bioengineering (CMCB), Technische Universität Dresden (TUD), 3Biotechnology Center, Center for Molecular and Cellular Bioengineering (CMCB), Technische Universität Dresden (TUD), 4Paul Langerhans Institute Dresden, Helmholtz Centre Munich, University Hospital Carl Gustav Carus, Technische Universität Dresden (TUD)

* These authors contributed equally

В этой статье

Краткое содержание

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

В этом протоколе мы показываем, как подготовить ткань аксолотля для атомно-силовой микроскопии (АСМ) и выполнить измерения вдавливания в неповрежденном и регенерирующем хряще конечности.

Аннотация

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Механические силы дают важные сигналы для нормального функционирования клеток и формирования паттернов в развивающихся тканях, и их роль широко изучена в ходе эмбриогенеза и патогенеза. Сравнительно мало известно об этих сигналах во время регенерации животных.

Аксолотль является важным модельным организмом для изучения регенерации, учитывая его способность полностью восстанавливать многие органы и ткани после травмы, включая отсутствующие хрящи и кости. В связи с его важнейшей ролью в качестве основной опорной ткани в организме позвоночных, восстановление скелетной функции во время регенерации требует как восстановления отсутствующих структур, так и их механических свойств. Этот протокол описывает метод обработки образцов конечностей аксолотля для атомно-силовой микроскопии (АСМ), которая является золотым стандартом для исследования механических свойств клеток и тканей с высоким пространственным разрешением.

Используя регенеративные способности аксолотля, в этом исследовании измерялась жесткость хряща конечности во время гомеостаза и двух стадий регенерации конечностей: гистолиз тканей и конденсация хряща. Мы показываем, что АСМ является ценным инструментом для получения информации о динамической реструктуризации тканей и механических изменениях, происходящих во время регенерации.

Введение

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Скелет, особенно хрящи и кости, обеспечивает основную механическую поддержку мягких тканей тела у позвоночных. Поэтому любые повреждения в скелетной системе, скорее всего, сильно поставят под угрозу функциональность и даже выживаемость. У людей переломы костей являются одними из наиболее распространенных травматических повреждений1, большинство из которых восстанавливаются в течение нескольких недель, но 5-10% из них имеют задержки в заживлении или никогда полностью не восстанавливаются 2,3. Более того, человек не способен восстановиться после обширной потери костей или хрящей 4,5. Некоторые саламандры, однако, могут регенерировать различные структуры тела, в том числе полные конечности, что делает их идеальной моделью для изучения регенерации скелета.

Аксолотль (Ambystoma mexicanum) — вид саламандры, у которого широко изучена регенерация конечностей. Этот процесс происходит в четырех основных последовательных, но перекрывающихся фазах: 1) заживление раны, 2) воспаление/гистолиз, 3) образование бластемы и 4) разрастание/дифференцировка бластемы (рассмотрено в 7,8). После ампутации кератиноциты, граничащие с местом повреждения, быстро мигрируют, закрывая рану и образуя эпителий раны (ЭП). Во время последующего воспаления и гистолиза патогенные микроорганизмы устраняются, мусор и поврежденные клетки очищаются, а внеклеточный матрикс (ВКМ) под поверхностью ампутации ремоделируется9. Гистолиз тканей необходим для регенерации конечностей10, где секреция протеолитических ферментов имеет решающее значение не только для общего ремоделирования ВКМ, но и для высвобождения клеток, вызывающих бластему, и для высвобождения биоактивных молекул, изолированныхв самой ВКМ. Фактически, исследования во многих регенеративных контекстах и модельных организмах показали, что уникальные свойства материала ВКМ во время гистолиза способны индуцировать процессы дедифференцировки или направлять миграцию клеток к месту повреждения (рассмотрено в11). Кроме того, резорбция кальцинированной ткани на поздних стадиях гистолиза показала себя ключевой для правильной интеграции новообразованных скелетных элементов конечностей12. После стадии гистолиза бластема формируется под раневым эпителием (ВЭ) в виде скопления недифференцированных, многолинейных предшественников, полученных в результате дедифференцированных зрелых клеток тканей или резидентных стволовых клеток. Клетки бластамы пролиферируют и дифференцируются во все типы отсутствующих клеток. Наконец, происходит морфогенез конечностей, при котором скелетная ткань регенерируется путем конденсации хондропрогениторов, полученных из клеток перискелета и трансдифференцированных дермальных фибробластов 13,14,15.

Несмотря на то, что многие биохимические сигналы, регулирующие изменения в идентичности клеток и составе ВКМ, были идентифицированы 10,13,14,16,17,18, механические свойства тканей на различных этапах регенерации конечностей, а также их влияние на регенерацию остаются в значительной степени неизученными. Многие исследования показали, что клетки воспринимают и интегрируют механические сигналы, которые регулируют их судьбу и поведение в нескольких контекстах (рассмотрено в19,20). Таким образом, дополнение наших клеточных и молекулярных знаний о регенерации конечностей механическими измерениями тканей значительно улучшит наше понимание этих процессов.

Были разработаны различные методы, которые позволяют определять механические характеристики и манипулировать биологическими образцами21. Среди этих методов золотым стандартом механобиологии стала атомная силовая микроскопия (АСМ), в которой вязкоупругие свойства биологических образцов исследуются с высоким пространственным разрешением путем индентирования с помощью сверхчувствительного датчика силы — кантилевераАСМ 22. Поскольку этот метод требует прямого контакта с образцом, как правило, образуются срезы ткани, что в некоторых случаях может быть сложной задачей. Таким образом, условия подготовки должны быть адаптированы и оптимизированы для каждого конкретного образца таким образом, чтобы он мог оставаться как можно ближе к физиологическим условиям и генерировались минимальныеартефакты23. В этом протоколе описывается, как измерить жесткость тканей в конечностях аксолотля с помощью АСМ, уделяя особое внимание хрящевым тканям в неповрежденных условиях, во время гизолиза и на стадиях конденсации хряща (рис. 1 и рис. 2). Этот метод может быть расширен и для измерения других типов тканей.

Протокол

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Аксолотли (Ambystoma mexicanum) были выращены в Аксолотле Центра регенеративной терапии Дрездена (CRTD) Дрезденского технологического университета (TUD). Полное описание условий содержания можно найти встатье 24. Вкратце, в комнатах поддерживалась температура 20-22 °C с циклом день/ночь 12/12 часов. Все манипуляции и хирургические процедуры проводились в соответствии с руководящими принципами местного комитета по этике и были одобрены Земельным управлением Саксонии, Германия.

В этом исследовании для всех экспериментов использовались белые (d/d) аксолотли, встречающийся в природе мутантный штамм, лишенный пигментации тела (мало или вообще без меланофоров и ксантофоров), с иридофорами только в радужной оболочке глаз. В этом исследовании использовались аксолотли размером 8-15 см от морды до хвоста (возраст 5-7 месяцев) без смещения по признаку пола.

1. Подготовка

  1. Приготовьте 10% (w/v) исходный раствор бензокаина, который будет использоваться для анестезии и эвтаназии аксолотлей (см. ниже). Для этого нужно смешать в объемном флаконе 50 г бензокаина со 100% этанолом до достижения предела в 500 мл.
  2. Приготовьте 0,03% (масс./об.) исходный раствор бензокаина.
    1. На 1 л смешайте 50 мл 10-кратного трис-буферного физиологического раствора (TBS) с 30 мл 10% бензокаина и 5 мл 4000% раствора Хольтфретера с 915 мл дистиллированной воды и перемешайте в течение ночи с помощью магнитной мешалки.
    2. На 1 л 10x раствора TBS смешайте 24,2 г основы Trizma и 90 г NaCl с 990 мл деионизированной воды. Хорошо перемешайте с помощью магнитной мешалки. Затем добавьте примерно 10 мл концентрированной HCl (12 М или 37%) и отрегулируйте pH до 8.
    3. На 1 л 4000% (w/v) раствора Хольтфретера смешать 158,4 г NaCl, 11,13 г MgSO4·7H2O, 5,36 г CaCl2·2H2O и 2,88 г KCl с деионизированной водой до 1 л.
  3. Приготовьте рабочее разведение бензокаина на 0,01% (масс./об.) в воде для хранения для анестезии, разбавив 0,03% (масс./об.) исходный раствор в соотношении 1:3.
    1. На 1 л раствора используйте 333 мл стокового раствора бензокаина плюс 666 мл воды из резервуара для хранения.
  4. Приготовьте стоковый раствор буторфанола тартрата в концентрации 5 мг/мл для обезболивания. Для этого смешайте 100 мг соли буторфанола (+)-тартрата с 20 мл сверхчистой воды. Хранить аликвоты при температуре 4 °C.
  5. В день ампутации приготовьте свежеприготовленный рабочий раствор буторфанола тартрата 0,5 мг/л для уменьшения боли животного после хирургических процедур, разбавив исходный раствор в соотношении 1:10 000 в воде резервуара.
    1. Для животных длиной менее 8 см смешайте 20 μл исходного раствора с 200 мл воды в резервуаре.
    2. Для более крупных животных смешайте 60 μл исходного раствора с 600 мл воды в резервуаре.
  6. Приготовьте стерильный амфибийный фосфатно-солевой буфер (APBS), 80% (v/v) раствор PBS, и поддерживайте его при комнатной температуре (RT), смешав 800 мл DPBS с 200 мл деионизированной воды.
  7. Приготовьте стоковый раствор инсулина в дозе 1 мг/мл. Для этого смешайте 250 мг порошка инсулина с 25 мл HCl 0,1 М и медленно перемешайте до растворения. Во время перемешивания добавьте 225 мл APBS до тех пор, пока раствор не станет прозрачным. Стерильно отфильтруйте и храните 4 мл аликвот при температуре -20 °C.
  8. Приготовьте стерильную питательную среду (все % (v/v): 62,5% L15 среды, 10% инактивированную при нагревании FBS, 1% пенициллин/стрептомицин, 1% инсулин, 1% L-глютамин) и хранить при температуре 4 °C до дня использования. В день эксперимента отбалансируйте до RT перед использованием.
    1. На 400 мл питательной среды используйте 250 мл среды L15, 40 мл инактивированного при нагревании FBS, 4 мл пенициллина/стрептомицина, 4 мл раствора инсулина (начиная с Шага 1.7), 4 мл L-глутамина и 98 мл деионизированной стерильной воды. Готовить в стерильных условиях и стерильном фильтре после смешивания всех компонентов. Подготовьте 15 мл аликвот.
  9. Приготовьте 2,5% и 3% (w/v) агарозу с низкой температурой плавления (lmp) в растворе APBS и нагрейте до 70 °C до полного растворения агарозы. Приготовьте аликвоты в пробирках объемом 1,5 мл и храните при температуре 4 °C до дня использования.
    1. Для 20 мл 2,5% (w/v) lmp-агарозы смешайте 0,5 г lmp-агарозы с 20 мл APBS в пробирке объемом 50 мл и нагрейте на водяной бане при 70 °C до полного расплавления агарозы. Решение должно стать понятным и прозрачным. Приготовьте аликвоты, пока они еще теплые.
    2. Для 20 мл 3% (w/v) lmp-агарозы смешайте 0,6 г lmp-агарозы с 20 мл APBS и действуйте, как указано выше.
    3. (Необязательно): Для 20 мл 1% (по объему) lmp-агарозы смешайте 0,2 г lmp-агарозы с 20 мл APBS и действуйте, как указано выше.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Время плавления зависит от концентрации lmp-агарозы и может составлять примерно 15-40 минут.
  10. Для ампутации и крепления тканей используйте светлопольный стереоскоп.
  11. Соберите пластиковые чашки Петри диаметром 100 мм, щипцы, скальпель и хирургические ножницы для ампутаций и сбора тканей.
  12. Подготовьте пластиковые чашки Петри диаметром 35 мм для измерения вдавливания.
  13. Подготовьте цилиндры длиной ~1 см и диаметром ~1 см. Для этого нагрейте картонорез под пламенем горелки Бунзена и отрежьте нагретым лезвием трубку объемом 15 мл.
  14. Вырежьте небольшие 1 см2 квадрата из парапленки и уберите на хранение.
  15. Приготовьте металлический или холодный блок при температуре -20 °C, оставив его в морозильной камере минимум на 1 час.
  16. Подготовьте пластиковые пастеровские пипетки.
  17. (Необязательно): Приготовьте фиксирующий раствор MEMFa (3-(N-морфолино)пропансульфоновая кислота [MOPS] 0,1 М pH 7,4, этиленгликоль-бис (2-аминоэтиловый эфир)-N,N,N',N'-тетрауксусная кислота [EGTA] 2 мМ, MgSO4·7H2O 1 мМ, 3,7% формальдегид). Для этого добавьте 10,465 г MOPS, 0,123 г MgSO4·7H2O, 2 мл 0,5 M EDTA pH 8,0 и добавьте воды до 45 мл. Добавьте 5 мл формальдегида 37% (по массе) к общему объему 50 мл.

2. Реактивы

  1. Реагенты, используемые для этой работы, см. в Таблице материалов , но могут быть использованы и другие коммерческие поставщики.

3. Ампутация аксолотля и регенерация конечностей

  1. Перед всеми экспериментальными процедурами обезболивайте животное в 0,01% (w/v) бензокаина, разведенного в воде резервуара для хранения (шаг 1.3) в течение 20 минут, убедившись, что животные глубоко обезболены и не реагируют на тактильные раздражители.
  2. Извлеките аксолотль из наркоза и положите его поверх 100-миллиметровой чашки Петри, содержащей бумажную салфетку, смоченную водой, содержащей анестезию. Ориентируйте конечность перпендикулярно оси тела и поместите пластину под стереоскоп для лучшей визуализации.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Здесь был использован стереоскоп с компактной лампой «гусиная шея».
  3. Ампутируйте конечность острым стерильным скальпелем непосредственно дистальнее кальцинированной области зевгоподиальной области (лучевая/локтевая кость) (рисунок 1А).
    ПРИМЕЧАНИЕ: Придерживаясь принципа благополучия животных 3R, рекомендуется использовать конечности, которые были первоначально удалены в результате ампутации, в качестве неповрежденного контроля.
  4. Оставьте животное на миске и накройте его влажной папиросной бумагой, смоченной в воде, содержащей бензокаин, на 15 минут, чтобы обеспечить свертывание крови и закрытие раны.
  5. Верните животных в резервуар со свежей водой для хранения с анальгетиками (буторфанол тартрат, 0,5 мг/л, начиная с шага 1.5).
  6. Переместите животных в их первоначальный аквариум со свежей водой через 24 часа после послеоперационного обезболивающего лечения.
  7. Дайте животным восстановиться до желаемой стадии интереса.
    Анализируемые конечности были собраны в день ампутации для интактной фазы и через 5 дней после ампутации (DPA) для фазы гитолиза у 5-месячных животных. Стадия конденсации хряща была измерена при 21 дПа у 7-месячных животных.

4. Монтаж и обработка тканей для измерений

  1. Нагрейте пробирки объемом 1,5 мл, содержащие 2,5% или 3% (по объему) lmp-агарозы (начиная с шага 1.9) на термоблоке при температуре 70 °C до полного расплавления агарозы. Замените трубки на другой термоблок при температуре 37 °C и дайте температуре выровняться перед использованием.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Здесь 2,5% lmp-агарозы использовали для измерения регенерирующих тканей и 3% для интактных тканей.
  2. Накройте одну сторону цилиндров длиной 1 см (из шага 1.13) одним из кусков парапленки (шаг 1.14) так, чтобы они были полностью закрыты на дне.
  3. Уравновесьте 15 мл аликвот питательной среды к RT (с шага 1.8)
  4. Обезболите животных, погрузив их в воду, содержащую анестетик (0,01% бензокаина, разведенного в воде резервуара) не менее чем на 20 минут.
  5. Визуализируйте конечности под стереоскопом с помощью программного обеспечения, позволяющего проводить количественные измерения. Измерьте длину исследуемой структуры и рассчитайте, сколько ткани необходимо удалить с дистального конца конечности, пока не будет достигнут интересующий участок.
  6. Для регенерации конечностей соберите их, разрезав скальпелем и/или хирургическими ножницами на уровне локтя и рассекая лишнюю ткань из конечности. Оставьте ткань в растворе APBS на время подготовки к следующему этапу. Убедитесь, что разрез поперечный (90°) по отношению к оси нижнего рычага, чтобы создать ровную поверхность. Для неповрежденных конечностей удалите руку, разрезав запястную область.
  7. Усыпьте животных, подвергнув их воздействию смертельной дозы анестезии (0,1% бензокаина) в течение не менее 20 минут. Для этого добавьте необходимый объем 10% (w/v) раствора бензокаина до достижения 0,1% (w/v) концентрации.
    1. Если животные были обезболены в 100 мл 0,01% (w/v) раствора бензокаина, добавьте 900 мкл 10% (w/v) раствора бензокаина.
  8. Промойте конечности, погрузив их в раствор APBS.
  9. Убедитесь, что пипетки Пастера и термоблок (стабилизированный при 37 °C с агарозными аликвотами) находятся рядом с рабочей станцией. Достаньте холодный блок из морозильной камеры при температуре -20 °C и положите цилиндр на него концом, покрытым парапленкой, вниз.
  10. Возьмитесь за рассеченную конечность и аккуратно удалите лишнюю жидкость с помощью папиросной бумаги. Положите конечность на чистую тарелку, добавьте сверху расплавленную lmp-агарозу и кратковременно переместите конечность в агарозе, чтобы вытеснить остатки APBS с поверхности кожи.
  11. Работая быстро, поместите конечность внутрь цилиндра, убедившись, что она ориентирована вертикально, а область интереса — вверх.
  12. Аккуратно удерживая конечность щипцами, добавьте lmp-агарозу внутрь цилиндра до полного покрытия ткани. Аккуратно снимите щипцы до того, как агароза застынет.
  13. Снимите цилиндр с холодного блока и дайте агарозе полностью застыть при RT в течение примерно 30 с.
  14. Тканесодержащий агарозный блок немедленно отнесите в вибратомную комнату вместе со стерильной питательной средой аликвотами и APBS во время лучевой терапии.
  15. Снимите парапленку со дна цилиндра и прикрепите агарозу, содержащую ткань, к вибратомной стадии с помощью цианоакрилатного клея. Убедитесь, что и агароза, и образец приклеены к предметному столику.
  16. Погрузите столик в APBS для секционирования.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Неповрежденные ткани включают более жесткую кость/хрящ, в то время как регенерирующие ткани более мягкие. Поэтому параметры вибратома должны быть соответствующим образом отрегулированы. В данном исследовании использовались следующие параметры: Интактные ткани (амплитуда 1,2 мм и скорость 0,1 мм/с) и регенерирующие ткани (амплитуда 0,9 мм и скорость 0,4 мм/с).
  17. Начинайте секционирование агарозы короткими шагами (например, с шагом 100 мкм) до тех пор, пока не будет достигнут кончик ткани. Затем разрежьте тканевый блок до тех пор, пока дистальная часть ткани (рассчитанная на шаге 4.5) не будет удалена. Таким образом, поперечное сечение области интереса будет легко доступно.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Удаленный участок ткани будет содержать непосредственно прилегающую поверхность к поверхности, прощупываемой с помощью АСМ, и может служить эталоном для структуры ткани. Поэтому его можно использовать для прямого дополнительного анализа или фиксировать для последующего окрашивания (см. раздел 6).
  18. Аккуратно удалите тканесодержащий блок со стадии вибратома лезвием бритвы и удалите все следы клея. Немедленно приклейте блок на пластиковую чашку Петри диаметром 35 мм с помощью клея для хирургической ткани и добавьте примерно 2 мл питательной среды при температуре RT, чтобы убедиться, что ткань полностью покрыта.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Обнаженная тканевая поверхность в агарозном блоке является поверхностью, подлежащей исследованию.

5. Измерения с помощью АСМ

  1. Не менее чем за 1 день до измерений подготовьте консоль к измерениям.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Для этой работы силиконовые консоли без наконечника были функционализированы полистирольными шариками (диаметр 20 мкм), а соединение шарик-кантилевер было оставлено для укрепления по крайней мере на 1 день перед использованием для измерений вдавливания.
    1. Прикрепите бусины к консолям с помощью эпоксидного клея со временем обработки 5 мин.
    2. Быстро опустите консоль с минимальным контактом на покрытое клеем предметное стекло так, чтобы на его конце образовалась небольшая капелька клея, и сразу после этого приведите ее в контакт с подходящей бусиной.
    3. Удерживайте контакт консоли с бортом в течение ~10 минут, прежде чем поднять консоль со связанным бортом от поверхности.
  2. Откалибруйте консоль перед измерениями.
    Модифицированный кантилевер калибровался перед каждой серией экспериментов методом теплового шума с использованием встроенных процедур программного обеспечения АСМ.
  3. Вставьте чашку Петри с тканевым блоком (из шага 4.18) и питательную среду в держатель чашки Петри АСМ и получите обзорное изображение в светлопольной микроскопии (рис. 1B).
    ПРИМЕЧАНИЕ: Для испытаний на вдавливание используется установка, оснащенная подставным столиком на вершине вертикального светового микроскопа. Установите головку АСМ и расположите кантилевер над тканью и приблизьте кантилевер к поверхности.
  4. Выберите конкретную область интереса и запишите массив кривых сила-расстояние (рис. 2A).
    ПРИМЕЧАНИЕ: Уставки относительных сил 2-25 нН использовались для достижения сопоставимой глубины вдавливания ~1-4 мкм для тканей различной жесткости, со скоростью приближения и втягивания 7,5 мкм/с, длиной z 50 мкм, размером сетки 70 мкм x 70 мкм с 3 x 3 точками.
  5. Для каждой зондируемой области получите изображение светлопольной микроскопии, чтобы связать полученные значения с каждой конкретной областью в области конечности.
  6. Для всех образцов исследуйте не менее 3 различных областей для каждого типа ткани.
    Примечание: Во всех случаях в этом исследовании измеряли 4 области в центре хряща и 3 области на периферии хрящевой области и держали ткань под микроскопом не более 1 часа.
  7. После завершения измерений вдавливания выбросьте или зафиксируйте ткань для дальнейшего анализа.
    Примечание: Образцы фиксировали после завершения измерений путем помещения их в 2 мл пробирки, содержащие раствор MEMFa, и фиксировали на ночь при 4 °C. Использовали MEMFa (шаг 1.17), но также можно использовать 4% раствор формальдегида (w/v) в PBS.

6. (По желанию) Обработка прилегающих участков тканей

  1. Если соседние срезы тканей используются для последующего окрашивания, поместите их сразу после срезов в небольшую пробирку объемом 2 мл, содержащую фиксатор, и зафиксируйте на ночь при температуре 4 °C.
    1. Для выявления архитектуры тканей через мечение актина, цитоскелета и ядер необходимо 3 раза промыть PBS в течение 5 мин для удаления фиксатора и окрашивать раствором, содержащим конъюгированный фаллоидин Alexa Fluor 488 (1:250) и Hoechst 33258 (1:10000) в PBS в течение 1 ч в РТ на качающейся платформе.
    2. Затем иммобилизуйте окрашенные образцы на верхней части посуды со стеклянным дном, используя 1% (масс./об.) lmp-агарозы в APBS, стабилизированной при 37 °C (начиная с шага 1.9). Убедитесь, что интересующая поверхность обращена к стеклу. Как только агароза затвердеет, накройте образцы PBS, чтобы предотвратить обезвоживание.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Образцы интакта и гитолза визуализируются с помощью инвертированного конфокального микроскопа (10-кратное увеличение и оптические срезы 8 мкм). Изображения на рисунке 1C представляют собой максимальные проекции из 8 оптических сечений.
  2. Если прилегающий участок ткани используется для немедленного последующего анализа, требующего свежей ткани (например, экстракция РНК, инкубация с живыми красителями и т. д.), убедитесь, что вы работаете быстро и используете среду для культивирования клеток (начиная с шага 1.8), чтобы обеспечить максимально возможную целостность ткани.

7. Анализ и отображение данных

  1. Чтобы рассчитать кажущийся модуль Юнга, проанализируйте кривые сила-расстояние, используя модель Герца/Снеддона (уравнение 1) для сферического индентора с помощью программного обеспечения для обработки данных JPK/Bruker, предполагая, что коэффициент Пуассона равен 0,5.
    figure-protocol-1(Уравнение 1)
    где R: радиус индентора, E: модуль упругости, ν: коэффициент Пуассона, a: радиус круговой зоны контакта между индентором и образцом, δ: глубина вдавливания.
  2. Для вязкоупругого анализа проанализируем подходные участки кривых сила-вдавливание в PyJibe 0.15.0 с расширением "Модель Герца, скорректированная на вязкоупругость с использованием уравнения Кельвина-Фойгта-Максвелла (KVM)" (автор Пауль Мюллер, https://github.com/AFM-analysis/PyJibe)25. Функция аппроксимации основана на модели, описанной Абухаттумом и др.26, интегрирующей элементы модели Кельвина-Фойгта-Максвелла.
    1. Предварительно обработайте кривые вдавливания силы для оценки точки контакта с помощью кусочно-правильной аппроксимации с линией (базовой линией) и полиномиальной функцией аппроксимации для подходящей части.
    2. Подгонка кривых силы-вдавливания к модели "Модель Герца, скорректированная на вязкоупругость с использованием модели Кельвина-Фойгта-Максвелла (KVM)". Из подгонки получите неослабленный модуль Юнга, кажущийся модуль Юнга и кажущуюся вязкость. Модель также дает Максвеллу время для расслабления и вдавливания.
      Примечание: В нескольких проанализированных кривых вдавливания силы (в частности, в неповрежденной ткани) время релаксации Максвелла было значительно больше или меньше времени вдавливания, что указывает на скорее упругое поведение или механическое поведение Кельвина-Фойгта, соответственно.
  3. Экспортируйте все измерения в электронную таблицу и рассчитайте медианные видимые модули Юнга для каждого типа ткани и образца.
  4. Стройте графики и статистически анализируйте данные с помощью соответствующего программного обеспечения.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Здесь используется GraphPad Prism, и при описании результатов исследование ссылается на среднее значение ± SD медианы видимых модулей Юнга на образец (показано на рисунке 2D-F).
  5. Отображайте оптические срезы из конфокальных изображений, проецируя их с помощью функции максимальной проекции Фиджи. Отрегулируйте яркость и контрастность каждого отдельного канала для оптимальной визуализации флуоресцентных окрашиваний.
  6. Сгенерируйте панель рисунков с помощью соответствующего программного обеспечения.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Для создания панелей используется Affinity Designer, а модель на рисунке 1A рисуется с помощью Affinity Designer.

Результаты

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Используя описанный выше протокол, мы измерили кажущийся модуль Юнга для тканей хрящевых конечностей аксолотля в гомеостатических («интактных») условиях, во время раннего гистолиза хряща и более поздних стадий конденсации хряща (рис. 1A). Мы также исследовали механические свойства скелетных элементов в различных областях, включая их центр и периферию, как показано на изображениях, изображающих положение кантилевера (рис. 1B). Чтобы отобразить архитектуру ткани и соотнести ее с измерениями жесткости, либо поперечные срезы ткани, либо тканевый блок, где проводились измерения, фиксировали и окрашивали актиновые филаменты и ядра конъюгированными фаллоидином Alexa Fluor 488 и Hoechst соответственно (рис. 1C). У интактных конечностей лучевая кость явно больше локтевой кости, но оба хрящевых скелетных элемента имеют сходную морфологию, с равномерно распределенными круглыми ядрами в центре, окруженными кольцом уплощенных ядер, соответствующих перихондрию24. Во время фазы гистолиза были обнаружены драматические изменения в архитектуре тканей с дезорганизованными и менее плотно упакованными ядрами внутри скелетных элементов. На более поздней фазе конденсации хряща ядра снова организуются, с четким разграничением между вновь формирующимся хрящом и окружающими регенерирующими тканями. Однако на этой стадии большинство ядер уплощены, и четких морфологических различий между центром и периферией нет.

При измерении поперечных срезов обоих скелетных элементов, присутствующих в зевгоподиальной области (лучевой и локтевой костей), были обнаружены неразличимые кажущиеся модули Юнга в интактных конечностях со срединными значениями 10,95 ± 11,69 кПа и 15,71 ± 6,49 кПа соответственно (рис. 2D, слева), что согласуется с их анатомическим сходством (рис. 1C). Интересно, что анализ хрящевого центра по сравнению с периферией показал, что в неповрежденных условиях кажущиеся модули Юнга в центре были выше, чем на периферии, со средними значениями 16,48 ± 6,86 кПа против 7,53 ± 4,63 кПа соответственно (рис. 2E, слева). На 5-е сутки после ампутации, соответствующие фазе гистолиза, видимые модули Юнга в лучевой и локтевой кПа значительно снизились (0,03 ± 0,02 кПа и 0,13 ± 0,09 кПа соответственно, рисунок 2D, справа), но также исчезли различия между центром и периферией, при этом медианные модули Юнга составили 0,11 ± 0,07 кПа и 0,27 ± 0,34 кПа соответственно (рисунок 2E, справа). При анализе свойств хряща на более поздней стадии регенерации, в момент начала конденсации хряща, было обнаружено значительное увеличение кажущихся модулей Юнга, достигающее промежуточных значений между интактной и гистолитической фазами (0,77 ± 0,29 кПа, рис. 2F).

Как видно из приведенных примеров кривых (рис. 2B), гистерезис происходил между большинством пар кривых приближения и втягивания, что указывает на вязкоупругую реакцию ткани под действием силы. Далее мы решили более подробно проанализировать вязкоупругие свойства различных тканей. Поскольку осцилляторные измерения на нескольких частотах требуют времени и в некоторой степени критичны в отношении сохранения целостности тканей, особенно при картировании нескольких областей ткани, мы использовали ранее опубликованный метод Abuhattum et al., который позволяет подгонять подходящую часть кривых силы-расстояния перед немедленным втягиванием кантилевера26. Модель основана на элементах модели Кельвина-Фойгта-Максвелла и ранее применялась для анализа вязкоупругих свойств клеток и гидрогелей26, а также ткани поджелудочной железы27. Средние нерасслабленные модули (интактные: 23,05 кПа, гитолиз: 0,20 кПа и конденсирующиеся хрящи: 1,60 кПа) и кажущиеся модули Юнга (интактные: 17,54 кПа, гитолиз: 0,07 кПа и конденсирующиеся хрящи: 1,54 кПа), полученные для тканей на разных стадиях регенерации, показали значительные различия (рис. 2G-H). В целом, при выбранной скорости деформации наблюдалась преимущественно упругая реакция тканей на деформацию, что отражается в большом сходстве нерасслабленных и кажущихся модулей упругости (рис. 2G, H). Значительно более низкие медианные значения видимой вязкости были получены для гистолитической стадии (0,72 Па·с) по сравнению со стадией интактного (2,06 Па·с) и конденсационной хрящевой стадии (2,32 Па·с) (рис. 2I). Как и ожидалось, кажущиеся модули Юнга анализа PyJjibe (рисунок 2H) в значительной степени согласовывались со значениями, полученными программным обеспечением обработки данных JPK (рисунок 2F).

В заключение следует отметить, что механическая характеристика отражает динамическую реструктуризацию тканей в процессе регенерации. Эти измерения согласуются с анатомическими наблюдениями, где жесткость тканей уменьшается вместе с наблюдаемыми изменениями в архитектуре тканей (рис. 1C) и постепенно восстанавливается в процессе регенерации.

figure-results-1
Рисунок 1: Измерения вдавливания хряща конечности аксолотля во время регенерации. (A) Схематическое изображение стадий регенерации. Пунктирной линией обозначено приблизительное место поперечного сечения, созданного вибратомом, где проводились измерения. (B) Репрезентативные изображения центральных (вверху) и периферических (внизу) размеров хряща конечностей. Черный наконечник является консолью. Масштабная линейка: 100 мкм. (C) Тканевая архитектура в интактных конечностях (слева), ткань, подвергающаяся гитолизу (в центре) и конденсирующийся хрящ (справа). Зеленый: ядра (Hoechst), пурпурный: актиновые филаменты (Phalloidin). Масштабная линейка: 500 мкм. Увеличенная область C' очерчена на панели. Масштабная линейка: 100 μм. Сетки отступов размером 70 мкм x 70 мкм обозначены белыми (в центре) и желтыми (по периферии) пунктирными квадратами. На панелях B и C буквы R и U обозначают радиус и локтевую кость соответственно. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

figure-results-2
Рисунок 2: Измерение жесткости хряща во время регенерации конечности аксолотля с помощью АСМ. (A) Схемы эксперимента по вдавливанию АСМ показаны как сила как функция времени (вверху) и сила как функция расстояния между индентором и образцом (внизу). Кривые захода на посадку и втягивания отображаются синим и красным цветом соответственно. Точка контакта отображается черной вертикальной пунктирной линией. Кривые силы-вдавливания были подогнаны в пределах подходящей части кривой либо с использованием модели Герца/Снеддона (программное обеспечение для обработки данных JPK и Pyjibe), либо расширения вязкоупругой KVM-модели в Pyjibe. (B) Репрезентативные кривые силы-расстояния по результатам измерений АСМ в неповрежденных и регенерирующих конечностях на стадиях гистолиза и конденсации хряща. Процент анализируемых кривых (т.е. без артефактов) указывается в правом верхнем углу каждой кривой. (C) Примеры типичных артефактов на кривых сила-вдавливание, например, из-за неправильного контакта индентора с поверхностью. Показанные примеры соответствуют неповрежденным конечностям, но эквивалентные типы артефактов наблюдались во всех условиях. Для B-C: Репрезентативные кривые силы-расстояния были подобраны и отображены с помощью Pyjibe. Светло-голубая кривая изображает подходящую часть кривой, а светло-красная кривая — часть втягивания. Более темная синяя линия — это примененная посадка Герца/Снеддона для сферического индентора. Соответствующие остатки от посадки показаны ниже для нижних кривых силы-расстояния. Построенные на графике невязки представляют собой разницу между значениями подгонки и фактической силы. (D) Видимые модули лучевой и локтевой костей Юнга, измеренные в интактных конечностях и подвергающихся гистолизу. (E) Видимые модули Юнга между хрящевым центром и периферией (Peri) в интактных конечностях и во время гитолиза. (F) Видимые модули Юнга, измеренные для хрящевого центра на анализируемых стадиях регенерации. Для D-F: Каждая точка получается из одной успешно проанализированной кривой силы-расстояния, а более крупные точки соответствуют медианным значениям на образец. Кажущиеся модули Юнга были получены с использованием аппроксимации модели Герца/Снеддона программного обеспечения JPK Bruker. (Г-И) Модуль неослабления (G), кажущийся модуль Юнга (H) и кажущаяся вязкость (I) рассчитаны с помощью PyJibe (расширение KVM) на основе измерений хрящевого центра на анализируемых стадиях регенерации. Каждая точка является производной от одной успешно проанализированной кривой силы-расстояния. Линии соответствуют медианным значениям всех измерений для каждого условия. Для D-I: Крускал-Уоллис с тестом множественных сравнений Данна. Разными буквами обозначены условия, которые статистически отличаются друг от друга (p < 0,05). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Обсуждение

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Здесь мы демонстрируем методику измерения жесткости хряща в конечностях аксолотля с помощью АСМ. Тем не менее, этот метод может быть расширен и для зондирования других типов тканей. Ключевым этапом для успешных измерений АСМ является подготовка образцов, которая оказалась особенно сложной при работе с образцами аксолотлей. Мы обнаружили, что зондирование поверхности ткани, которая все еще была встроена в агарозный блок, было лучшим способом сохранения целостности ткани. Это связано с тем, что кожа аксолотля выделяет большое количество слизи на поверхность эпидермиса, что препятствует стабильному встраиванию срезанной части ткани в агарозу.

Некоторые образцы могут создавать дополнительные проблемы, такие как высокая адгезия. Мы столкнулись с этой проблемой, особенно в образцах на этапе гистолиза, которые были относительно податливыми и адгезивными. На этих образцах мы также наблюдали множественные кривые зависимости силы от расстояния, где вдавливающая часть имела «зубчатый» вид, что указывает на то, что валик деформирует поверхность образца ненепрерывным образом (рис. 2C), например, из-за того, что поверхность прогибается под напряжением. От таких кривых зависимости силы и расстояния пришлось отказаться, так как они не могли быть подогнаны к модели Герца-Снеддона. Для уменьшения адгезии может быть полезной пассивация индентора28, т.е. путем покрытия гранул индентора веществами, снижающими ее липкость, такими как полиэтиленгликоль (ПЭГ) или бычий сывороточный альбумин. Кроме того, можно использовать альтернативные модели для подгонки кривых сила-расстояние, например, модель JKR (Johnson-Kendall-Roberts)29. Поскольку проанализированные здесь ткани показали относительно большие вариации модулей упругости более чем на один порядок для соседних областей тканей и различных тестируемых условий, это затруднило выбор одной идеальной консоли/индентора (пружинной постоянной/размера индентора) сложной задачей. Довольно большие колебания жесткости тканей также требовали адаптации приложенной контактной силы, чтобы глубина вдавливания оставалась сопоставимой и находилась в подходящем диапазоне (около 5%-25% от диаметра индентора).

Еще одним важным параметром для сохранения механических свойств ткани как можно более физиологически является сохранение максимальной целостности ткани. Это было обеспечено путем измерения свежих образцов, которые были обработаны сразу после сбора и сохранены при подходящей температуре в среде для культивирования клеток, стабилизированной pH.

В последнее время другие группы выполнили измерения микроиндентирования в скелетных элементах аксолотля с использованием альтернативных способов обработки образцов30. Однако в этих экспериментах ткань была предварительно заморожена, а регенерирующие скелетные части были вручную отделены от окружающих тканей, чтобы измерить их на месте. Пока это не доказано эмпирически, неясно, влияют ли эти манипуляции на целостность хрящевой ткани и механические свойства. Также сообщалось об анализах мышц саламандры и бластемах31,32. В этих случаях, однако, кожа удалялась, а образцы не разрезались; Таким образом, была получена информация только с поверхности, находящейся непосредственно под удаленным эпителием. Хотя этот тип количественной оценки является точным, он скорее предоставляет информацию о боковой поверхности мышцы, тем самым игнорируя механическую информацию от внутренних мышечных слоев. Мы использовали индентор размером 20 мкм, что означает, что измерения были не объемными, как сообщалось о микроиндентациях 30,31,32, а скорее в клеточном и внеклеточном масштабе. Таким образом, мы получаем разрешение, отражающее механические сигналы, которым клетки фактически подвергаются, а также выявляющее неоднородность тканей (рисунок 2D-I).

В ходе измерений были обнаружены более низкие видимые значения модулей Юнга на периферии интактных скелетных элементов, что указывает на то, что перихондрий аксолотля более податлив, чем хрящ. Тем не менее, нельзя исключать, что ткани, прилегающие к скелетным элементам, также были исследованы из-за настройки сетки 70 μм x 70 μм. Во время гистолитической фазы таких различий не наблюдалось, что позволяет предположить, что гистлиз в регенерирующих конечностях аксолотлей может прогрессировать эквивалентно в хряще, окружающем его перихондрии и соседних тканях. Лучевая и локтевая кости имеют схожую структуру, но имеют значительные анатомические различия, такие как лучевая кость имеет больший диаметр и локтевая кость длиннее24. Тем не менее, о сравнительном анализе их жесткости до сих пор не сообщалось, за исключением их реакции на механическую нагрузку вмедицинских целях. Здесь мы описываем измерения вдавливания в поперечных срезах этих двух скелетных элементов в неповрежденных и регенерирующих конечностях. Мы показываем, что не существует существенных различий в жесткости между лучевыми и локтевыми костями у конечностей аксолотля, что согласуется с эквивалентной минеральной плотностью костной ткани, обнаруженной у человеческих аналогов34. Тем не менее, наблюдалась тенденция к снижению кажущихся модулей Юнга в радиусе, особенно во время гистолиза. Чтобы определить, является ли это наблюдение биологически значимым, было бы предпочтительно большее количество образцов. Основываясь на данных, полученных в этом исследовании, мы предлагаем минимум 5 образцов для каждого состояния. Во время фазы гистолиза оба элемента скелета становятся более податливыми, что согласуется с ремоделированием ВКМ, описанным на этой стадии9. Наконец, измерения, полученные в этом исследовании, подразумевают, что жесткость хряща постепенно увеличивается в течение более поздней фазы конденсации хряща. Эти наблюдения согласуются с недавно опубликованными измерениями вдавливания в интактных костях и конденсирующемся хряще29, а также с оценкой механических свойств хряща in vivo с помощью конфокальной микроскопии Бриллюэна35.

В целом, эта работа расширяет возможности АСМ как ценного инструмента для изучения механических свойств конечностей аксолотля. С помощью этой методики мы стремимся дополнить наши знания об экспрессии генов и траекториях трансдифференцировки клеток16,13, чтобы лучше понять, как механика тканей формирует и влияет на регенеративный процесс.

Раскрытие информации

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов

Благодарности

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Мы благодарим всех сотрудников лаборатории Сандовал-Гусман за постоянную поддержку и товарищество на протяжении всей этой работы. Мы также благодарны Ане Вагнер, Беате Груль и Джудит Конанц за их преданность уходу за аксолотлями. Мы также благодарим Пауля Мюллера за предоставление кодов для анализа данных АСМ. Эта работа была поддержана Центром световой микроскопии технологической платформы CMCB в Техническом университете Дрездена. АТ является научным сотрудником Центра ранней карьеры Милдред Шеель в Дрездене P2, финансируемого Немецкой организацией помощи больным раком (Deutsche Krebshilfe). RA финансируется за счет временной должности PI (Eigene Stelle) от Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, Немецкое научно-исследовательское общество) – AI 214/1-1.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Affinity DesignerAffinity  версия 1.10.4Для сборки рисунка
Agarose Low Melt Roth6351.1Для пробоподготовки
Alexa Fluor 488 PhalloidinInvitrogenA12379Для окрашивания тканей
AxiozoomZeissДля изображения образца под АСМ
BenzocaineSigma-AldrichE1501Для обезболивания животных
Буторфанол (+)-тартрат сольSigma-Aldrich  B9156В качестве анальгетика
КантилеверNanoWorldArrow TL1Для измерения вдавливания АСМ
Установка Cellhesion 200 оснащена моторстейJPK/BrukerДля измерения вдавливания АСМ
CellSense EntryДля визуализации в стереоскопе Olympus UC90
Dulbecco' s Фосфатно-солевой буфер (DPBS, 1x)Gibco14190-144Для очистки образцов и среза под вибратомом
FIJI (ImageJ2)https://imagej.net/software/fijiверсия 2.9.0/1.53tДля обработки изображений
GraphPad PrismGraphPad Software(версия 8.4.3)Для построения графиков и статистического анализа данных
Термоинактивированный FBSGibco10270-106Для клеток питательная среда
Гистоакриловый клей (2-бутил-цианоакрилат)BraunДля приклеивания образца к чашкам
Петри Hoechst 33258Abcamab228550Для окрашивания тканей
ИнсулинSigma-AldrichI5500Для среды для культивирования клеток
Инвертированный конфокальный микроскопZeiss780 LSMДля изображения срезов тканей
Инвертированный конфокальный микроскопZeiss980 LSMДля визуализации срезов тканей
Программное обеспечение для обработки данных JPK/BrukerJPK/BrukerSPM 6.4Для анализа кривых сила-расстояние
среды L15 (Leibovitz)SigmaL1518Для среды для клеточных культур
L-глутаминGibco25030-024Для среды для клеточных культур
Пенициллин/стрептомицинGibco15140-122Для клеточной среды питательная среда
полистирольные шарики ( 20 & микро; m диаметр); )microParticlesFor AFM indentation
measurement Pyjibeавтор Paul Mü ller https://github.com/AFM-analysis/PyJibe0.15.0Для вязкоупругого анализа
Стереоскоп Olympus SX10OlympusSX10Для ампутаций конечностей и крепления тканей
Стереоскоп Olympus UC90OlympusUC90Для визуализации
вибратома LeicaLeicaVT 1200SДля срезов тканей

Ссылки

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Mills, L. A., Aitken, S. A., Simpson, A. H. R. W. The risk of non-union per fracture: current myths and revised figures from a population of over 4 million adults. Acta Orthop. 88 (4), 434-439 (2017).
  2. Calori, G. M., et al. Non-unions. Clin Cases Miner Bone Metab. 14 (2), 186-188 (2017).
  3. Nandra, R., Grover, L., Porter, K. Fracture non-union epidemiology and treatment. Trauma. 18 (1), 3-11 (2016).
  4. Nauth, A., Schemitsch, E., Norris, B., Nollin, Z., Watson, J. T. Critical-size bone defects: Is there a consensus for diagnosis and treatment. J Orthop Trauma. 32 (3 Suppl), S7-S11 (2018).
  5. Schemitsch, E. H. Size matters: Defining critical in bone defect size. J Orthop Trauma. 31 (10), S20-S22 (2017).
  6. Joven, A., Elewa, A., Simon, A. Model systems for regeneration: Salamanders. Development (Cambridge). 146 (14), 0-2 (2019).
  7. Aires, R., Keeley, S. D., Sandoval-Guzmán, T. Basics of Self-Regeneration. Cell Engineering and Regeneration. , Springer. Cham. (2020).
  8. Stocum, D. L. Mechanisms of urodele limb regeneration. Regeneration. 4 (4), 159-200 (2017).
  9. Bassat, E., Tanaka, E. M. The cellular and signaling dynamics of salamander limb regeneration. Curr Opin Cell Biol. 73, 117-123 (2021).
  10. Vinarsky, V., Atkinson, D. L., Stevenson, T. J., Keating, M. T., Odelberg, S. J. Normal newt limb regeneration requires matrix metalloproteinase function. Dev Biol. 279 (1), 86-98 (2005).
  11. Godwin, J., Kuraitis, D., Rosenthal, N. Extracellular matrix considerations for scar-free repair and regeneration: Insights from regenerative diversity among vertebrates. International J Biochem Cell Biol. 56, 47-55 (2014).
  12. Riquelme-Guzmán, C., et al. Osteoclast-mediated resorption primes the skeleton for successful integration during axolotl limb regeneration. ELife. 11, e79966(2022).
  13. Gerber, T., et al. Single-cell analysis uncovers convergence of cell identities during axolotl limb regeneration. Science. 362 (6413), aaq0681(2018).
  14. Kragl, M., et al. Cells keep a memory of their tissue origin during axolotl limb regeneration. Nature. 460 (7251), 60-65 (2009).
  15. Currie, J. D., et al. Live Imaging of Axolotl Digit Regeneration Reveals Spatiotemporal Choreography of Diverse Connective Tissue Progenitor Pools. Dev Cell. 39 (4), 411-423 (2016).
  16. Qin, T., et al. Single-cell RNA-seq reveals novel mitochondria-related musculoskeletal cell populations during adult axolotl limb regeneration process. Cell Death Differ. 28 (3), 1110-1125 (2021).
  17. Sandoval-Guzman, T., et al. Fundamental differences in dedifferentiation and stem cell recruitment during skeletal muscle regeneration in two salamander species. Cell Stem Cell. 14, 174-187 (2014).
  18. Currie, J. D., et al. The Prrx1limb enhancer marks an adult subpopulation of injury-responsive dermal fibroblasts. Biol Open. 8, bio043711(2019).
  19. Wagh, K., Ishikawa, M., Garcia, D. A., Stavreva, D. A., Upadhyaya, A., Hager, G. L. Mechanical regulation of transcription: Recent advances. Trends Cell Biol. 31 (6), 457-472 (2021).
  20. d'Angelo, M., et al. The role of stiffness in cell reprogramming: A potential role for biomaterials in inducing tissue regeneration. Cells. 8 (9), 1036(2019).
  21. Akhtar, R., Sherratt, M. J., Cruickshank, J. K., Derby, B. Characterizing the elastic properties of tissues. Mater Today (Kidlington). 14 (3), 96-105 (2011).
  22. Krieg, M., et al. Atomic force microscopy-based mechanobiology. Nat Rev Phys. 1 (1), 41-57 (2019).
  23. El Kirat, K., Burton, I., Dupres, V., Dufrene, Y. F. Sample preparation procedures for biological atomic force microscopy. J Microsc. 218 (3), 199-207 (2005).
  24. Riquelme-Guzmán, C., et al. Postembryonic development and aging of the appendicular skeleton in Ambystoma mexicanum. Dev Dyn. 251 (6), 1015-1034 (2021).
  25. López-Alonso, J., Eroles, M., Janel, S., et al. PyFMLab: Open-source software for atomic force microscopy microrheology data analysis [version 2; peer review: 2 approved]. Open Res Europe 2024. 3 (187), (2024).
  26. Abuhattum, S., Mokbel, D., Müller, P., Soteriou, D., Guck, J., Aland, S. An explicit model to extract viscoelastic properties of cells from AFM force-indentation curves. iScience. 25 (4), 104016(2022).
  27. Glorieux, L., et al. In-depth analysis of the pancreatic extracellular matrix during development for next-generation tissue engineering. Int J Mol Sci. 24 (12), 10268(2023).
  28. Hiratsuka, S., et al. Power-law stress and creep relaxations of single cells measured by colloidal probe atomic force microscopy. Jpn J Appl Phys. 48 (8 PART 3), 08JB17(2009).
  29. Johnson, K. L., Kendall, K., Roberts, A. D. Surface energy and the contact of elastic solids. Proc R Soc Lond A. 324, 301-313 (1971).
  30. Kondiboyina, V., Duerr, T. J., Monaghan, J. R., Shefelbine, S. J. Material properties in regenerating axolotl limbs using inverse finite element analysis. J Mech Behav Biomed Mater. 150, 106341(2024).
  31. Calve, S., Simon, H. Biochemical and mechanical environment cooperatively regulate skeletal muscle regeneration. FASEB J. 26 (6), 2538-2545 (2012).
  32. Calve, S., Simon, H. G. Extracellular control of limb regeneration. IUTAM Symposium on Cellular, Molecular and Tissue Mechanics. IUTAM Bookseries. 16, Springer. Dordrecht. 257-266 (2010).
  33. Kaufmann, R. A., Kozin, S. H., Barnes, A., Kalluri, P. Changes in strain distribution along the radius and ulna with loading and interosseous membrane section. J Hand Surg Am. 27 (1), 93-97 (2002).
  34. Martin, A. R., et al. Measurement of distal forearm bone mineral density: Can different forearm segments be used interchangeably. J Clin Densitom. 2 (4), 381-387 (1999).
  35. Riquelme-Guzmán, C., et al. In vivo assessment of mechanical properties during axolotl development and regeneration using confocal Brillouin microscopy. Open Biol. 12 (6), 220078(2022).

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE

Запросить разрешение

Теги

Похожие статьи