В этом протоколе мы используем меченые GFP клетки T-ALL данио-рерио, которые были ранее получены в штамме CG1 и, таким образом, могут быть непосредственно введены в реципиентную сингенную CG1данио-рерио 15. Вкратце, лейкемия была получена путем микроинъекции ДНК rag2:Myc и rag2:GFP в одноклеточные эмбрионы CG1 данио-рерио. За животными наблюдали на предмет развития лейкоза, начиная с 3 недель после инъекции, с помощью флуоресцентной микроскопии. GFP-положительные лейкозные клетки были выделены FACS и серийно трансплантированы реципиентным CG1 данио-рерио для получения клонов с высокой частотой LSC. Детали всего протокола описаны в работе Blackburn et al.15.
В качестве альтернативы, первичный Т-ОЛЛ, полученный из rag2:Myc, может быть получен путем микроинъекции ДНК эмбрионов рыбок данио-рерио17. Микроинъекция ДНК rag2:Myc с помощью флуоресцентного репортера rag2, управляемого rag2, такого как GFP, может привести к развитию B-клеток, Т-клеток и смешанных ALL18. Клоны лейкемии, используемые в этом протоколе, были ранее подтверждены как T-ALL15. Все экспериментальные процедуры с участием рыбок данио были рассмотрены и одобрены Комитетом по институциональному уходу за животными и их использованию Университета Кентукки, протокол 2019-3399.
1. Размножение клеток T-ALL рыбки данио рерио in vivo
- Разморозьте один флакон, содержащий 1 мл замороженных меченых GFP клеток T-ALL данио-рерио, на водяной бане при температуре 37 °C с легким встряхиванием до оттаивания. Как только оттает, переложите на лед.
- Медленно пипетируйте содержимое пробирки в коническую пробирку объемом 15 мл с 4 мл рыбной среды (0,9x PBS + 5% FBS), чтобы разбавить замораживающую среду.
- Отжим в течение 5 минут при 2 500 × g при 4 °C. Удалите среду из гранулы. Ресуспендируйте в 0,5 мл рыбьей среды и держите клетки на льду.
- Подсчитайте ячейки и при необходимости разбавьте их до 100 000 клеток/5 μл.
- Обезболите взрослую рыбку CG1, добавив 200 мкл анестетика 4 мг/мл (MS-222) в 25 мл воды рыбной системы в чашке Петри. Держите рыбу CG1 вентральной стороной вверх и введите 5-6 μL во внутрибрюшинное (IP) пространство с помощью микролитрового шприца Hamilton. Переместите животных обратно в аквариумы и следите за возвращением к нормальному плаванию, прежде чем возвращать их обратно в систему.
ПРИМЕЧАНИЕ: Взрослые рыбки данио-рерио в возрасте 60 дней и старше использовались для исследований трансплантации, описанных в этом протоколе.
- Контролируйте рост лейкемии один раз в неделю с помощью флуоресцентного микроскопа. Подробная информация о процедуре скрининга приведена в разделе 2 ниже.
2. Забор флуоресцентно меченых лейкозных клеток
- Примерно через 21-28 дней после трансплантации обезболите взрослую рыбку данио-рерио CG1, добавив 200 μл (4-5 капель) анестетика 4 мг/мл на 25 мл воды рыбьей системы в чашке Петри.
- Исследуйте данио-рерио CG1 на предмет бремени лейкемии, оценив процент меченых GFP лейкозных клеток у животного с помощью эпифлуоресцентного микроскопа, используя соответствующий фильтр для обнаружения флуоресценции GFP. GFP-положительный лейкоз готов к сбору, если он распространился на >70% животного.
- Усыпьте животное, добавив 1 мл анестетика 4 мг/мл в чашку Петри, содержащую 9 мл воды рыбной системы. Позвольте всем признакам жизни прекратиться; Например, понаблюдайте за рыбой на предмет прекращения оперкулярного движения (~5 мин).
- Переместите рыбок данио в новую чашку Петри и добавьте 1 мл рыбной среды, которая будет служить буфером для клеток. Используя новое лезвие бритвы, сначала обезглавьте рыбку данио, а затем размацерируйте ткань тем же лезвием бритвы. Пипетируйте вверх и вниз, чтобы вытеснить большие скопления клеток.
- Пропустите клетки через клеточный фильтр 40 мкм в коническую пробирку объемом 50 мл для диссоциации в одноклеточную суспензию. Держите клетки на льду.
3. Оптимизация концентрации красителя для пролиферации клеток (CellTrace Far Red) для окрашивания и жизнеспособности клеток рыбок данио
ПРИМЕЧАНИЕ: Для этого протокола, а также поскольку опухолевые клетки мечены GFP, мы использовали краситель для пролиферации дальних красных клеток (CellTrace Far Red), чтобы избежать спектрального перекрытия, которое будет называться CT-FR.
- Приготовьте 1 мМ раствор флуоресцентного красителя непосредственно перед использованием, добавив соответствующий объем ДМСО в соответствии с рекомендациями производителя. Имеют рабочие растворы 1 мМ, 0,5 мМ, 0,1 мМ, 0,01 мМ; Разбавляйте по мере необходимости в рыбных средах для проверки жизнеспособности клеток после окрашивания.
- Подсчитайте клетки и соберите 1 × 106 клеток в микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл.
- Центрифуга при 2 500 × г при 4 °C в течение 5 мин. Удалите жидкость и повторно суспендируйте клетки в 1 мл 0,9x PBS.
- Расщепите клеточную суспензию между четырьмя пробирками по 250 мкл каждая для лечения с помощью CT-FR.
- Добавьте 250 мкл 0,9x PBS, чтобы довести объем до 500 мкл каждая, имея примерно 250 000 клеток/пробирку.
- Добавьте необходимые количества рабочих растворов, описанных выше, в каждую из четырех пробирок для достижения следующих конечных концентраций 1 μМ, 0,5 μМ, 0,1 μМ и 0,05 μМ. Инкубируйте в течение 20 минут при 37 °С, защищенном от света месте.
- Гранулируйте ячейки, вращая при 2500 × г в течение 5 минут при комнатной температуре. Удалите жидкость и промойте клетки 500 μл рыбной среды, чтобы удалить излишки красителя.
- Снова смешайте гранулы, удалите жидкость и снова суспендируйте в 25 мкл рыбной среды. Используйте 1 мкл для подсчета клеток в разведении 1:10 в 50% трипановом сине.
- Исследуйте клетки под микроскопом на жизнеспособность клеток; живые клетки не сохраняют трипановый синий цвет и кажутся яркими под микроскопом, в то время как мертвые клетки впитывают краситель и кажутся темными. Сначала исследуйте клетки под соответствующим флуоресцентным каналом, чтобы идентифицировать опухолевые клетки, а затем используйте светлопольный канал для оценки жизнеспособности клеток.
- Выберите концентрацию, которая приводит к успешному окрашиванию при сохранении жизнеспособности клеток (>90% трипановых синеотрицательных клеток).
ПРИМЕЧАНИЕ: Для клеток T-ALL рыбок данио, протестированных в этом эксперименте, использовалась концентрация 1 мкМ для успешного окрашивания и >90% жизнеспособности клеток.
4. Размножение окрашенных CT-FR клеток T-ALL in vivo
- Используя оптимизированную концентрацию CT-FR из раздела 3, окрасьте клетки рыбок данио. Оставьте некоторые опухолевые клетки неокрашенными для генерации меченой GFP опухоли T-ALL в качестве GFP-положительного контроля во время сортировки FACS. Разбавьте как окрашенные, так и неокрашенные клетки до 50 000 клеток/5 мкл для трансплантации.
- Обезболите взрослую рыбку CG1, добавив 200 мкл анестетика 4 мг/мл в 25 мл воды рыбьей системы в чашке Петри.
- Введите 5 мкл клеточной суспензии в полость рерио-рерио, как описано в разделе 1, как для окрашенных, так и для неокрашенных клеток. Вводите 5-6 рыбок данио рерио в каждой группе, чтобы учесть потенциальную смертность после инъекции.
- Осматривайте животных с помощью флуоресцентной микроскопии под седацией 2 раза в неделю на предмет развития лейкемии.
ПРИМЕЧАНИЕ: Через ~10-14 дней лейкемия должна занимать около 30-40% этого тела. Планируйте сбор урожая лейкемии и последующую сортировку в течение этого времени. Ожидание, пока опухоль разрастется до больших размеров, может привести к большему разведению флуоресцентного клеточного красителя и трудностям в обнаружении его сигнала. Рассмотрим оптимизацию времени забора опухоли для выбранной модели опухоли. Кроме того, здесь рекомендуется более частый мониторинг опухоли, чтобы обеспечить захват желаемого размера опухоли.
5. Подготовка к сортировке окрашенных CT-FR клеток данио-рерио T-ALL
- Подготовьте следующие элементы управления для сортировки клеток: Без контроля цвета (неокрашенные, нетрансгенные, одноклеточные суспензии, полученные от дикого типа данио-рерио), GFP-меченые T-ALL клетки и недавно окрашенные CT-FR WT клетки данио-рерио (для установки максимального порога дальнего красного сигнала).
- Подготовка неокрашенных средств контроля и контроля CT-FR
- Соберите клетки рыб дикого типа (WT) путем усыпления нетрансплантированной рыбки данио-рерио CG1 путем добавления 1 мл анестетика 4 мг/мл в чашку Петри, содержащую 9 мл воды рыбной системы.
- Переместите рыбок данио в новую чашку Петри и добавьте 1 мл рыбной среды, которая будет служить буфером для клеток. Используйте новое лезвие бритвы, чтобы сначала обезглавить, а затем выжать рыбку данио, используя то же лезвие бритвы; Пипетка вверх и вниз для вытеснения крупных клеточных комков.
- Пропустите клетки через клеточный фильтр 40 мкм в коническую пробирку объемом 50 мл для диссоциации в одноклеточную суспензию. Держите клетки на льду.
- Для управления CT-FR перенесите 250 000 WT-клеток в микроцентрифужную пробирку и гранулируйте их путем центрифугирования при температуре 2 500 × г в течение 5 минут при комнатной температуре. Удалите рыбную среду и добавьте 500 μл 0,9x PBS + 1% FBS.
- Добавьте 0,5 мкл 1 мМ раствора красителя CT-FR до конечной концентрации 1 мкМ. Аккуратно пипетируйте с 1 000 мкл пипетки для смешивания. Выдерживать при температуре 37 °C в течение 20 минут в защищенном от света месте.
- Удалите жидкость и промойте клетки 500 μл рыбной среды, чтобы удалить излишки красителя.
- Снова гранулируйте элементы центрифугированием, удалите жидкость и повторно суспендируйте элементы в 500 μл 0,9x PBS + 1% FBS и пропустите через фильтрующий колпачок 35 μм в пробирку FACS. Держите на льду.
- Подготовка донорской пластины
ПРИМЕЧАНИЕ: Донорская пластина представляет собой 96-луночную пластину с V-образным дном, в которую будут отсортированы окрашенные CT-FR T-ALL клетки трансплантированных рыбок данио. Каждая лунка планшета содержит 5000 неокрашенных клеток WT CG1 в 50 мкл рыбной среды, которые служат носителем для гранулирования отсортированных клеток на последующих этапах.- Подсчитайте 500 000 WT клеток CG1 и перенесите их в коническую пробирку объемом 15 мл.
- Разбавьте этот клеточный запас до 100 клеток/μл, добавив 5 мл рыбной среды.
- Диспонируйте 50 мкл клеточной суспензии в каждую лунку 96-луночного планшета. Перемешивайте пробирку с клеточной суспензией после каждого ряда, чтобы поддерживать однородность клеточной суспензии. Держите тарелку при температуре 4 °C до сортировки.
- Подготовка пересаженных образцов рыб
- Отбирайте пересаженных рыб с нагрузкой 30-40% T-ALL. Соберите рыбу, пересаженную как с CT-FR-окрашенными клетками, так и с неокрашенными опухолевыми клетками GFP.
- Сборка клеток в соответствии с разделом 2.
Примечание: Поскольку ожидается, что клетки, удерживающие краситель, будут присутствовать в небольшом количестве, приготовьтесь к сортировке большого количества клеток из образца CT-FR GFP.
- Разбавьте до концентрации, подходящей для сортировки, ~3-5 ×10 6 клеток/мл в 0,9x PBS + 1% FBS и пропустите через фильтрующий колпачок 35 мкм в пробирку FACS. Добавьте DAPI (1 мг/мл) в соотношении 1:1000 в качестве жизненно важного красителя для исключения мертвых клеток. Держите на льду.
- Для неокрашенных опухолевых клеток GFP перенесите 250 000 клеток в микроцентрифужную пробирку и поместите гранулы в 2 500 × г в течение 5 минут при комнатной температуре. Удалите рыбный фильтрующий материал, добавьте 500 μL PBS и пропустите через фильтрующий колпачок 35 μm в пробирку FACS. Держите на льду.
6. Сортировка
ПРИМЕЧАНИЕ: Держите все пробирки и донорскую пластину на льду все время, за исключением случаев, когда они используются для сортировки.
- Для сортировки параметров и стробов начните с применения прямого и бокового стробирования рассеяния, чтобы идентифицировать интересующие клетки на основе их размера и удалить остатки клеток. Затем используйте высоту прямого рассеивания против области прямого рассеивания, чтобы исключить дубликаты ячеек и оставить только синглеты. Наконец, используйте элементы управления без цвета и одноцветные элементы управления, чтобы нарисовать квадранты для идентификации GFP-положительных и CT-FR-положительных популяций клеток.
ПРИМЕЧАНИЕ: Ожидается, что контроль CT-FR будет намного ярче, чем образцы для сортировки, поскольку окрашивание для контроля было сделано свежим, без клеточных делений; ожидается, что клетки из образцов CT-FR GFP появятся на нижнем конце положительного затвора CT-FR.
- Отсортируйте количество клеток, которые должны быть пересажены каждой рыбке, в одну лунку донорской пластины.
Примечание: Для этого эксперимента мы использовали анализ предельного разведения для оценки частоты стволовых клеток лейкемии в CT-FR High и CT-FR Low. В этом анализе использовалась доза в 25 клеток, пересаженных 3 животным, и доза в 10 клеток, пересаженная 10 животным. Типичный анализ предельного разведения с использованием T-ALL с использованием T-ALL на основе метода rag2:Myc будет включать группу с большим числом клеток (500 или 1000), поскольку частота LSC в этой модели оценивается как 1 LSC на сотни клеток. Однако в этом анализе мы используем один из клонов T-ALL, ранее описанных Blackburn et al.15. Частота LSC в использованном здесь образце составляет ~1 LSC в десятках ячеек; Мы прогнозируем выявление лейкемии у животных, трансплантированных в группу 25 клеток. При оптимизации этого анализа для вашей модели заболевания следует быть осторожным при выборе группы с более высоким числом клеток, чтобы обеспечить приживление опухоли.
- После сортировки держите тарелку на льду до готовности к пересадке.
ПРИМЕЧАНИЕ: Процедуры сортировки могут быть стрессовыми и влиять на жизнеспособность клеток. Перед проведением фактического эксперимента по предельному разбавлению был проведен пилотный эксперимент по сортировке. Отсортированные клетки трансплантировали, и развитие лейкемии контролировали, чтобы определить, наносит ли сортировка вред жизнеспособности клеток. В качестве альтернативы жизнеспособность клеток можно оценить, окрашивая отсортированные клетки трипановым синим и исследуя их под микроскопом перед трансплантацией.
7. Трансплантация отсортированных клеток при ограничении разведения и отслеживании начала опухоли
- Вращайте планшет с помощью большой настольной центрифуги при температуре 2 500 × г при 4 °C.
- Осторожно удалите 45 мкл надосадочной жидкости из каждой лунки, оставив 5 мкл жидкости и стараясь не касаться клеточной гранулы на дне лунки.
- Ресуспендируйте клетки с помощью пипетки объемом 20 μл. Повторно суспендируйте 2-3 лунки с помощью пипетки, а затем с помощью микролитрового шприца Гамильтона введите клеточные суспензии из каждой лунки в нужное количество CG1 данио-рерио с помощью IP-трансплантата. Затем повторно суспендируйте ячейки в следующей группе лунок, чтобы избежать повторного оседания ячеек.
- Осматривайте рыбок данио с помощью флуоресцентной микроскопии под седацией один раз в неделю на предмет развития Т-ОЛЛ в течение не менее 6 недель.
8. Определение частоты использования стволовых клеток лейкемии
- Запишите количество положительных животных на клеточную дозу и группу лечения через 6 недель после трансплантации, считая животных с любым количеством сигнала GFP положительными. Считайте, что животные имеют значительную нагрузку лейкемии, когда сигнал GFP занимает >50% тела.
- Используйте статистическое программное обеспечение ELDA (Extreme Limiting Dilution Analysis) (http://bioinf.wehi.edu.au/software/elda/)19 для расчета частоты LSC в каждой клеточной популяции.
ПРИМЕЧАНИЕ: Схематическая иллюстрация рабочего процесса представлена на рисунке 1.

Рисунок 1: Рабочий процесс использования окрашивания для отслеживания клеток для изоляции неподвижных клеток в модели T-ALL рыбки данио. Схематическая иллюстрация окрашивания клеток T-ALL рыбки данио с помощью окрашивания пролиферацией клеток, размножения в рыбку данио-рерио CG1 (верхняя панель) и сортировки клеток на основе удержания окрашивания пролиферацией клеток (средняя панель). Собранные клетки были использованы для анализа предельного разведения для определения частоты LSC (нижняя панель). Сокращения: T-ALL = Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз; LSC = лейкемические стволовые клетки; CT-FR = дальний красный цвет CellTrace; FITC = флуоресцеин изотиоцианат; ПЭ = фикоэритрин. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.